More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CA2559_01115 on replicon NC_014230
Organism: Croceibacter atlanticus HTCC2559



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014230  CA2559_01115  putative outer membrane transport/efflux protein  100 
 
 		 443 aa  891    Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1941  outer membrane efflux protein  49.03 
 
 		 432 aa  390  1e-107  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1671  outer membrane efflux protein  45.45 
 
 		 461 aa  384  1e-105  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0662  outer membrane efflux protein  30.08 
 
 		 483 aa  196  9e-49  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0384  outer membrane efflux protein  32.05 
 
 		 444 aa  187  3e-46  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.895564  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1203  outer membrane efflux protein  29.96 
 
 		 497 aa  169  6e-41  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0962  outer membrane efflux protein  28.05 
 
 		 464 aa  166  1.0000000000000001e-39  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  unclonable  0.000000066626  normal  0.118679 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2866  outer membrane efflux protein  27.16 
 
 		 480 aa  154  2.9999999999999998e-36  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.0685652 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0066  outer membrane efflux protein  26.58 
 
 		 436 aa  150  5e-35  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1667  outer membrane efflux protein  27.63 
 
 		 455 aa  147  4.0000000000000006e-34  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3126  outer membrane efflux protein  27.77 
 
 		 444 aa  139  8.999999999999999e-32  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4942  outer membrane efflux protein  29.5 
 
 		 449 aa  138  2e-31  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.755187  normal  0.782486 
 
 
-
 
NC_002950  PG0679  outer membrane efflux protein  25.88 
 
 		 444 aa  130  4.0000000000000003e-29  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.0368289 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1665  outer membrane efflux protein  27.1 
 
 		 464 aa  106  1e-21  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4897  outer membrane efflux protein  25.18 
 
 		 437 aa  103  7e-21  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0861249  normal  0.15922 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1633  outer membrane efflux protein  22.27 
 
 		 470 aa  92.4  1e-17  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.788464  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0120  outer membrane efflux protein  22.74 
 
 		 448 aa  89.4  1e-16  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  unclonable  0.00000000165447  hitchhiker  0.000000000000561163 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3465  Outer membrane efflux protein  22.48 
 
 		 441 aa  88.6  2e-16  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2630  Type I secretion outer membrane protein, TolC  24.35 
 
 		 489 aa  87.4  4e-16  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1482  outer membrane efflux protein  23.85 
 
 		 471 aa  86.3  0.000000000000001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.387043 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0986  outer membrane efflux protein, putative  23.6 
 
 		 484 aa  85.1  0.000000000000002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0058  putative type I toxin secretion system, outer membrane efflux protein  24.89 
 
 		 456 aa  84.3  0.000000000000003  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3801  outer membrane efflux protein  24.46 
 
 		 449 aa  82.8  0.00000000000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.233057 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01970  outer membrane efflux protein, putative  25.05 
 
 		 456 aa  78.6  0.0000000000002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.154405  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0364  outer membrane channel protein  22.63 
 
 		 500 aa  77.8  0.0000000000003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_2001  LipD protein, putative  24.18 
 
 		 445 aa  77.8  0.0000000000003  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.538795  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1177  outer membrane efflux protein  21.27 
 
 		 427 aa  77  0.0000000000007  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0831  outer membrane efflux protein  23.39 
 
 		 419 aa  77  0.0000000000007  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1531  outer membrane efflux protein  23.06 
 
 		 472 aa  73.9  0.000000000006  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1266  outer membrane efflux protein  22.81 
 
 		 444 aa  72.4  0.00000000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5878  TolC family type I secretion outer membrane protein  22.28 
 
 		 463 aa  72  0.00000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.539647  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4306  outer membrane efflux protein  24.66 
 
 		 447 aa  72.4  0.00000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4284  outer membrane efflux protein  24.89 
 
 		 447 aa  72  0.00000000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1351  outer membrane efflux protein  26.16 
 
 		 528 aa  71.2  0.00000000003  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.225814  normal  0.0380363 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3298  outer membrane efflux protein  21.74 
 
 		 418 aa  71.2  0.00000000003  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000000531453  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1333  outer membrane efflux protein, putative  23.3 
 
 		 463 aa  70.5  0.00000000006  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0366  outer membrane efflux protein  23.38 
 
 		 437 aa  70.5  0.00000000006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1725  TolC family type I secretion outer membrane protein  21.79 
 
 		 489 aa  68.9  0.0000000001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.736299  normal  0.0102072 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2027  outer membrane efflux protein  25.54 
 
 		 495 aa  69.3  0.0000000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000179084 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2200  outer membrane efflux protein  25.48 
 
 		 495 aa  68.6  0.0000000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0283  outer membrane efflux protein  24.45 
 
 		 439 aa  68.6  0.0000000002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00367785 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0617  outer membrane efflux protein  27.79 
 
 		 447 aa  67.8  0.0000000003  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0096  outer membrane efflux protein  23.89 
 
 		 441 aa  68.2  0.0000000003  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0381  TolC family type I secretion outer membrane protein  23.57 
 
 		 471 aa  67  0.0000000006  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3645  TolC family type I secretion outer membrane protein  23.57 
 
 		 471 aa  67  0.0000000006  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3343  type I secretion outer membrane protein, TolC family  23.11 
 
 		 452 aa  66.6  0.0000000008  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3409  outer membrane efflux protein  22.56 
 
 		 419 aa  66.6  0.0000000009  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000000155286  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2659  outer membrane efflux protein  23.86 
 
 		 436 aa  65.9  0.000000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3719  outer membrane efflux protein  23.3 
 
 		 444 aa  65.5  0.000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.633766  normal  0.0948534 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2662  outer membrane efflux protein  22.87 
 
 		 445 aa  65.1  0.000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1617  outer membrane efflux protein  22.57 
 
 		 467 aa  65.1  0.000000003  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4153  outer membrane efflux protein  24.66 
 
 		 447 aa  64.7  0.000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1380  outer membrane efflux protein  26.37 
 
 		 425 aa  65.1  0.000000003  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02837  hypothetical protein  22.38 
 
 		 423 aa  64.3  0.000000004  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3004  putative outer TolC membrane protein  23.99 
 
 		 469 aa  64.3  0.000000005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.833992 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0935  Type I secretion outer membrane protein, TolC  22.79 
 
 		 469 aa  63.9  0.000000005  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.219048  normal  0.252651 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0881  outer membrane efflux protein  23.43 
 
 		 535 aa  63.9  0.000000005  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.705042  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4320  agglutination protein  23.35 
 
 		 471 aa  63.5  0.000000007  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3429  outer membrane efflux protein  23.62 
 
 		 442 aa  63.5  0.000000007  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.437271  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3723  type I secretion outer membrane protein, TolC family  22.09 
 
 		 512 aa  63.5  0.000000008  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0278  outer membrane efflux protein  22.08 
 
 		 441 aa  63.2  0.000000008  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  unclonable  0.000000626538  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2365  outer membrane efflux protein  26.77 
 
 		 482 aa  63.5  0.000000008  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.316372 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0833  outer membrane efflux protein  20.79 
 
 		 496 aa  62.8  0.00000001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2864  outer membrane efflux protein  23.88 
 
 		 476 aa  62.8  0.00000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3265  outer membrane efflux protein  23.88 
 
 		 476 aa  62.8  0.00000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3457  type I secretion outer membrane protein, TolC family  21.17 
 
 		 434 aa  62.8  0.00000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0943  TolC family type I secretion outer membrane protein  22.63 
 
 		 481 aa  63.2  0.00000001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.359214  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0802  TolC family type I secretion outer membrane protein  24.44 
 
 		 453 aa  62.8  0.00000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3124  outer membrane efflux protein  20.67 
 
 		 448 aa  62.4  0.00000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003047  type I secretion TolC precursor  22.28 
 
 		 423 aa  62  0.00000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6495  type I secretion outer membrane protein, TolC family  22.47 
 
 		 518 aa  62  0.00000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3908  type I secretion outer membrane protein, TolC family  25.15 
 
 		 473 aa  61.2  0.00000003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3985  TolC family type I secretion outer membrane protein  25.15 
 
 		 473 aa  61.2  0.00000003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4101  TolC family type I secretion outer membrane protein  24.85 
 
 		 472 aa  61.6  0.00000003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3627  outer membrane efflux protein  26.01 
 
 		 461 aa  60.8  0.00000004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.433273  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1664  Type I secretion outer membrane protein, TolC  23.08 
 
 		 453 aa  60.8  0.00000004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0379  TolC family type I secretion outer membrane protein  23.13 
 
 		 471 aa  61.2  0.00000004  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2799  outer membrane efflux protein  23.33 
 
 		 435 aa  60.8  0.00000005  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  unclonable  0.0000000194078  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1759  outer membrane efflux protein  22.22 
 
 		 738 aa  60.5  0.00000006  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03690  outer membrane channel precursor protein  22.05 
 
 		 462 aa  60.5  0.00000006  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  unclonable  0.0000344286  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0950  outer membrane efflux protein  23.22 
 
 		 424 aa  60.1  0.00000007  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2098  putative outer membrane protein tolC  24.89 
 
 		 456 aa  60.1  0.00000007  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1884  outer membrane efflux protein  22.79 
 
 		 483 aa  60.1  0.00000009  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4543  outer membrane efflux protein  23.32 
 
 		 430 aa  59.3  0.0000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.781416  normal  0.876595 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4007  TolC family type I secretion outer membrane protein  24.54 
 
 		 472 aa  59.3  0.0000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2013  outer membrane channel protein  24.04 
 
 		 438 aa  59.7  0.0000001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  unclonable  0.000000000000158125  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0849  outer membrane efflux protein  25.28 
 
 		 417 aa  59.3  0.0000001  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000450472  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02621  outer membrane protein required for AvrXa21 activity C (raxC)  24.71 
 
 		 443 aa  59.7  0.0000001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2664  outer membrane efflux protein  21.57 
 
 		 1496 aa  58.9  0.0000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4162  outer membrane efflux protein  23.84 
 
 		 443 aa  58.9  0.0000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  decreased coverage  0.00000533026  normal  0.288124 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2851  type I secretion outer membrane protein, TolC family  21.32 
 
 		 463 aa  58.9  0.0000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1304  Type I secretion outer membrane protein, TolC  22.67 
 
 		 446 aa  58.5  0.0000002  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000151154  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2352  TolC family type I secretion outer membrane protein  25.15 
 
 		 446 aa  58.5  0.0000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0242  outer membrane efflux protein  23.1 
 
 		 444 aa  58.9  0.0000002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.231209  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1642  TolC family type I secretion outer membrane protein  22.63 
 
 		 446 aa  58.5  0.0000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.779397 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004522  type I secretion TolC precursor  25.71 
 
 		 442 aa  58.5  0.0000003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.000000301167  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5432  TolC family type I secretion outer membrane protein  22.38 
 
 		 553 aa  58.2  0.0000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.199925  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0785  Outer membrane efflux protein  22.58 
 
 		 453 aa  58.2  0.0000003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1282  outer membrane efflux protein  23.57 
 
 		 446 aa  58.2  0.0000003  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.0406152  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3360  type I secretion outer membrane protein, TolC family protein  25.07 
 
 		 444 aa  58.2  0.0000003  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.21716  normal  0.12144 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>