55 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CCC13826_0688 on replicon NC_009802
Organism: Campylobacter concisus 13826



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009802  CCC13826_0688  L-seryl-tRNA(Sec) selenium transferase  100 
 
 		 421 aa  827    Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.207036  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1272  hypothetical protein  49.16 
 
 		 421 aa  384  1e-105  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.0746699  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0751  putative outer membrane component of efflux system  34.93 
 
 		 419 aa  209  6e-53  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1050  hypothetical protein  35.08 
 
 		 424 aa  205  1e-51  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0986  outer membrane component of efflux system  35.52 
 
 		 418 aa  197  2.0000000000000003e-49  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.942426  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0977  outer membrane efflux protein  27.86 
 
 		 410 aa  127  3e-28  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.0000084232  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1275  hypothetical protein  29.19 
 
 		 411 aa  115  1.0000000000000001e-24  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.0000302349  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0685  putative periplasmic protein  27.48 
 
 		 411 aa  88.6  2e-16  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.61811  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0534  Outer membrane efflux protein  25.94 
 
 		 410 aa  83.2  0.000000000000008  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1442  Outer membrane efflux protein  27.42 
 
 		 408 aa  70.1  0.00000000008  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  decreased coverage  0.00437405  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3411  hypothetical protein  23.51 
 
 		 425 aa  59.7  0.00000009  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.527264  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3777  outer membrane channel protein  24.09 
 
 		 470 aa  58.9  0.0000001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3619  outer membrane channel protein  22.54 
 
 		 469 aa  58.5  0.0000002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0066  outer membrane efflux protein  25.26 
 
 		 436 aa  55.5  0.000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03690  outer membrane channel precursor protein  21.07 
 
 		 462 aa  54.3  0.000004  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  unclonable  0.0000344286  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0313  outer membrane channel protein  20.97 
 
 		 463 aa  53.5  0.000006  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_40250  putative outer membrane protein precursor  22.7 
 
 		 425 aa  53.5  0.000007  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.311034  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0483  type I secretion outer membrane protein, TolC  21.43 
 
 		 440 aa  51.6  0.00002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2663  RND efflux system outer membrane lipoprotein  21.98 
 
 		 496 aa  51.6  0.00003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1376  Outer membrane efflux protein  20.68 
 
 		 435 aa  51.2  0.00003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.109779  hitchhiker  0.00244241 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2630  Type I secretion outer membrane protein, TolC  18.58 
 
 		 489 aa  51.2  0.00003  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0323  outer membrane channel protein  19.74 
 
 		 463 aa  51.2  0.00004  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  unclonable  0.00000673159  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_48090  alkaline protease secretion outer membrane protein AprF precursor  20.76 
 
 		 481 aa  50.1  0.00007  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.0152412 
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4182  outer membrane efflux protein  19.89 
 
 		 431 aa  48.5  0.0002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.256436  normal  1 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0160  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  22.94 
 
 		 566 aa  48.9  0.0002  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.213741  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3563  outer membrane channel protein  21.61 
 
 		 434 aa  48.9  0.0002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  unclonable  0.0000000135514  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3539  outer membrane channel protein  21.62 
 
 		 489 aa  47  0.0007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.735558  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4144  alkaline protease secretion protein AprF  19.93 
 
 		 477 aa  47  0.0007  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0485622  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0278  outer membrane efflux protein  21.34 
 
 		 441 aa  47  0.0007  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  unclonable  0.000000626538  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4268  outer membrane channel protein  20.13 
 
 		 497 aa  46.6  0.0008  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.0102816 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3372  outer membrane channel protein  21.62 
 
 		 489 aa  46.6  0.0008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.258775 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3367  outer membrane channel protein  21.62 
 
 		 489 aa  46.6  0.0009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3437  outer membrane channel protein  21.62 
 
 		 489 aa  46.6  0.0009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3444  outer membrane channel protein  21.62 
 
 		 489 aa  46.6  0.0009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.606184  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02857  hypothetical protein  20.07 
 
 		 493 aa  45.8  0.001  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0665  type I secretion outer membrane protein, TolC family  20.07 
 
 		 493 aa  45.8  0.001  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02907  outer membrane channel precursor protein  20.07 
 
 		 493 aa  45.8  0.001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0662  outer membrane channel protein  20.07 
 
 		 493 aa  45.8  0.001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.120975  normal  0.0171626 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0682  Outer membrane protein-like  21.88 
 
 		 443 aa  46.2  0.001  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.111346  normal  0.263509 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3499  outer membrane channel protein  20.07 
 
 		 495 aa  45.8  0.001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0404091  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3213  outer membrane channel protein  20.07 
 
 		 495 aa  45.8  0.001  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00955114  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3468  outer membrane channel protein  20.07 
 
 		 495 aa  45.4  0.002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0175451  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4349  outer membrane channel protein  20.07 
 
 		 493 aa  45.4  0.002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.823303  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1333  outer membrane efflux protein, putative  27.74 
 
 		 463 aa  45.4  0.002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1665  outer membrane efflux protein  27.86 
 
 		 464 aa  45.1  0.002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1671  outer membrane efflux protein  22.02 
 
 		 461 aa  44.7  0.003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3225  outer membrane channel protein  21.49 
 
 		 432 aa  44.7  0.003  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0000000929322  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3343  type I secretion outer membrane protein, TolC family  22.74 
 
 		 452 aa  44.7  0.003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1598  TolC family type I secretion outer membrane protein  22.58 
 
 		 459 aa  44.7  0.003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.538573  normal  0.487426 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0430  TolC family type I secretion outer membrane protein  22.77 
 
 		 436 aa  44.3  0.004  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.0000114483  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0887  RND efflux system outer membrane lipoprotein  36.17 
 
 		 586 aa  44.3  0.004  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000421492  hitchhiker  0.0000263613 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3330  outer membrane channel protein  19.74 
 
 		 493 aa  44.3  0.004  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0384  outer membrane efflux protein  25 
 
 		 444 aa  43.5  0.006  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.895564  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0985  outer membrane efflux protein  26.24 
 
 		 435 aa  43.9  0.006  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.146892  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS05506  putative outer-membrane drug efflux protein  28.57 
 
 		 508 aa  43.1  0.01  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>