More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Plut_0682 on replicon NC_007512
Organism: Chlorobium luteolum DSM 273



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007512  Plut_0682  Outer membrane protein-like  100 
 
 
443 aa  905    Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.111346  normal  0.263509 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2203  type I secretion outer membrane protein, TolC family  43.79 
 
 
441 aa  355  5.999999999999999e-97  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.917815  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0381  type I secretion outer membrane protein, TolC family  38.41 
 
 
445 aa  276  4e-73  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0230254  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1746  TolC family type I secretion outer membrane protein  37.83 
 
 
446 aa  269  7e-71  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0744  Type I secretion outer membrane protein, TolC  37.5 
 
 
449 aa  265  1e-69  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.291612  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1345  Type I secretion outer membrane protein, TolC  31.65 
 
 
455 aa  206  8e-52  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_48090  alkaline protease secretion outer membrane protein AprF precursor  28 
 
 
481 aa  166  5.9999999999999996e-40  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.0152412 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3356  TolC family type I secretion outer membrane protein  28.07 
 
 
442 aa  162  1e-38  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.431157  normal  0.886803 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4144  alkaline protease secretion protein AprF  27.38 
 
 
477 aa  159  9e-38  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0485622  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3157  TolC family type I secretion outer membrane protein  27.84 
 
 
442 aa  155  1e-36  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.262509 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2558  TolC family type I secretion outer membrane protein  27.61 
 
 
452 aa  153  7e-36  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.431388  normal  0.101058 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0585  TolC family type I secretion outer membrane protein  30.47 
 
 
456 aa  152  1e-35  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.449084  normal  0.127961 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2682  Type I secretion outer membrane protein, TolC  27.01 
 
 
451 aa  147  3e-34  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.829421  hitchhiker  0.000293137 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2697  type I secretion outer membrane protein, TolC  28.6 
 
 
437 aa  144  3e-33  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3159  Type I secretion outer membrane protein, TolC  26.39 
 
 
449 aa  143  6e-33  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.334096  normal  0.115011 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2905  type I secretion outer membrane protein, TolC family  27.68 
 
 
455 aa  142  9.999999999999999e-33  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3328  ABC transporter, permease protein  26.05 
 
 
456 aa  140  3.9999999999999997e-32  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.262756  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1642  TolC family type I secretion outer membrane protein  27.94 
 
 
446 aa  139  7.999999999999999e-32  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.779397 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1282  Type I secretion outer membrane protein, TolC  25.46 
 
 
465 aa  138  2e-31  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2711  Type I secretion outer membrane protein TolC  26.2 
 
 
493 aa  136  8e-31  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0430  TolC family type I secretion outer membrane protein  27.98 
 
 
436 aa  134  3e-30  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.0000114483  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1338  type I secretion outer membrane protein, TolC family  26.88 
 
 
456 aa  133  6e-30  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0728783  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1557  type I secretion outer membrane protein, TolC family  26.58 
 
 
455 aa  133  6.999999999999999e-30  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1407  type I secretion outer membrane protein, TolC family  26.35 
 
 
451 aa  133  7.999999999999999e-30  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2109  type I secretion outer membrane protein, TolC family  27.08 
 
 
466 aa  132  1.0000000000000001e-29  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3926  Type I secretion outer membrane protein, TolC  25.47 
 
 
441 aa  126  6e-28  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2534  Type I secretion outer membrane protein, TolC  25.43 
 
 
468 aa  127  6e-28  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1598  TolC family type I secretion outer membrane protein  27.17 
 
 
459 aa  126  9e-28  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.538573  normal  0.487426 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0749  Type I secretion outer membrane protein, TolC  24.88 
 
 
497 aa  125  1e-27  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2180  TolC family type I secretion outer membrane protein  26.91 
 
 
874 aa  124  5e-27  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  unclonable  0.00000461522  normal  0.954774 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1990  TolC family type I secretion outer membrane protein  28.48 
 
 
498 aa  121  1.9999999999999998e-26  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3077  Type I secretion outer membrane protein, TolC  25.59 
 
 
491 aa  122  1.9999999999999998e-26  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.762548  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2616  Type I secretion outer membrane protein, TolC  24.58 
 
 
450 aa  121  3e-26  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.930678  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2352  TolC family type I secretion outer membrane protein  25.72 
 
 
446 aa  120  7e-26  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2630  Type I secretion outer membrane protein, TolC  26.38 
 
 
489 aa  119  9.999999999999999e-26  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2047  type I secretion outer membrane protein  24.88 
 
 
616 aa  118  1.9999999999999998e-25  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4181  outer membrane channel protein  24.33 
 
 
449 aa  117  3e-25  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0139  TolC family type I secretion outer membrane protein  24.65 
 
 
616 aa  116  6.9999999999999995e-25  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4715  TolC family type I secretion outer membrane protein  24.47 
 
 
477 aa  116  6.9999999999999995e-25  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.133912 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0483  type I secretion outer membrane protein, TolC  25.73 
 
 
440 aa  116  8.999999999999998e-25  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1022  Type I secretion outer membrane protein, TolC  25.18 
 
 
489 aa  115  1.0000000000000001e-24  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.15714  normal  0.470087 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1664  Type I secretion outer membrane protein, TolC  24.26 
 
 
453 aa  116  1.0000000000000001e-24  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0943  TolC family type I secretion outer membrane protein  23.76 
 
 
481 aa  114  3e-24  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.359214  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03690  outer membrane channel precursor protein  25.62 
 
 
462 aa  114  4.0000000000000004e-24  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  unclonable  0.0000344286  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0491  Type I secretion outer membrane protein, TolC  25.6 
 
 
477 aa  113  5e-24  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.00611692  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4923  TolC family type I secretion outer membrane protein  24.16 
 
 
477 aa  112  1.0000000000000001e-23  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1126  TolC family type I secretion outer membrane protein  23.04 
 
 
450 aa  112  1.0000000000000001e-23  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0610  TolC family type I secretion outer membrane protein  26.23 
 
 
480 aa  111  2.0000000000000002e-23  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3468  outer membrane channel protein  26 
 
 
495 aa  111  3e-23  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0175451  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2013  outer membrane channel protein  26.6 
 
 
438 aa  111  3e-23  Vibrio cholerae O395  Bacteria  unclonable  0.000000000000158125  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02907  outer membrane channel precursor protein  25.77 
 
 
493 aa  110  5e-23  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0665  type I secretion outer membrane protein, TolC family  25.77 
 
 
493 aa  110  5e-23  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02857  hypothetical protein  25.77 
 
 
493 aa  110  5e-23  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3330  outer membrane channel protein  25.88 
 
 
493 aa  110  5e-23  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4349  outer membrane channel protein  25.77 
 
 
493 aa  110  5e-23  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.823303  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3213  outer membrane channel protein  25.77 
 
 
495 aa  110  5e-23  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00955114  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0662  outer membrane channel protein  25.77 
 
 
493 aa  110  5e-23  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.120975  normal  0.0171626 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4799  TolC family type I secretion outer membrane protein  23.92 
 
 
477 aa  110  5e-23  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.125067  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3499  outer membrane channel protein  25.77 
 
 
495 aa  110  5e-23  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0404091  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3777  outer membrane channel protein  25.47 
 
 
470 aa  110  6e-23  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2818  TolC family type I secretion outer membrane protein  25.43 
 
 
469 aa  110  6e-23  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.282777  normal  0.979363 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_20050  putative outer membrane protein  24.58 
 
 
451 aa  110  7.000000000000001e-23  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.7908  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0695  porin (omp) ABC transporter protein  24.15 
 
 
484 aa  108  1e-22  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0288188  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3457  type I secretion outer membrane protein, TolC family  27.29 
 
 
434 aa  109  1e-22  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2457  type I secretion outer membrane protein, TolC family  25.77 
 
 
449 aa  109  1e-22  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3343  type I secretion outer membrane protein, TolC family  25 
 
 
452 aa  109  1e-22  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0543  Type I secretion outer membrane protein, TolC  24.29 
 
 
479 aa  108  2e-22  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.991736 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4976  TolC family type I secretion outer membrane protein  23.15 
 
 
478 aa  108  2e-22  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4977  outer membrane efflux protein TolC, putative  24.35 
 
 
479 aa  108  3e-22  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0754  hypothetical protein  22.97 
 
 
455 aa  107  4e-22  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0573  outer membrane channel protein  24.11 
 
 
464 aa  107  5e-22  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0654  outer membrane channel protein  24.11 
 
 
464 aa  107  5e-22  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.945309  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0611  TolC family type I secretion outer membrane protein  23.68 
 
 
464 aa  107  5e-22  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0323  outer membrane channel protein  25.47 
 
 
463 aa  107  5e-22  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  unclonable  0.00000673159  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2639  TolC family type I secretion outer membrane protein  23.53 
 
 
461 aa  107  6e-22  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5705  outer membrane efflux protein  23.7 
 
 
481 aa  106  8e-22  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0736  hypothetical protein  22.89 
 
 
455 aa  106  1e-21  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4268  outer membrane channel protein  24.7 
 
 
497 aa  105  1e-21  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.0102816 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1726  secretion protein  23.86 
 
 
451 aa  105  1e-21  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.379002  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2604  Type I secretion outer membrane protein, TolC  25.78 
 
 
442 aa  105  1e-21  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1041  type I secretion outer membrane efflux protein  26.81 
 
 
451 aa  105  1e-21  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2675  outer membrane channel protein  25.76 
 
 
441 aa  105  2e-21  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_65750  putative outer membrane efflux protein precursor  23.88 
 
 
482 aa  105  2e-21  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0313  outer membrane channel protein  25.47 
 
 
463 aa  104  3e-21  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0781  outer membrane channel protein  25.95 
 
 
435 aa  103  4e-21  Shewanella baltica OS185  Bacteria  unclonable  0.000000000184345  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3578  outer membrane channel protein  25.95 
 
 
435 aa  103  4e-21  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000000408694  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0813  outer membrane channel protein  25.95 
 
 
435 aa  103  4e-21  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.000000621601  normal  0.257824 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0284  outer membrane channel protein  24.42 
 
 
465 aa  103  8e-21  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0768  outer membrane channel protein  25.23 
 
 
435 aa  103  8e-21  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  decreased coverage  0.00000309945  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3723  type I secretion outer membrane protein, TolC family  23.22 
 
 
512 aa  103  8e-21  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0258  TolC family type I secretion outer membrane protein  23.92 
 
 
539 aa  102  1e-20  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.17913  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3619  outer membrane channel protein  25.12 
 
 
469 aa  102  1e-20  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0806  outer membrane channel protein  25.63 
 
 
435 aa  101  2e-20  Shewanella baltica OS223  Bacteria  unclonable  0.0000000113836  hitchhiker  0.0000000000882186 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0544  outer membrane channel protein  23.87 
 
 
448 aa  101  2e-20  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  0.000000576987  normal  0.601769 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3367  outer membrane channel protein  25 
 
 
489 aa  101  3e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3372  outer membrane channel protein  25 
 
 
489 aa  101  3e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.258775 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3444  outer membrane channel protein  25 
 
 
489 aa  101  3e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.606184  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3539  outer membrane channel protein  25 
 
 
489 aa  101  3e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.735558  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3437  outer membrane channel protein  25 
 
 
489 aa  101  3e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0802  TolC family type I secretion outer membrane protein  26.09 
 
 
453 aa  101  3e-20  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>