62 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CJJ81176_1050 on replicon NC_008787
Organism: Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009707  JJD26997_0751  putative outer membrane component of efflux system  92.23 
 
 		 419 aa  706    Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1050  hypothetical protein  100 
 
 		 424 aa  827    Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0986  outer membrane component of efflux system  50.5 
 
 		 418 aa  382  1e-105  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.942426  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1272  hypothetical protein  38.24 
 
 		 421 aa  239  5e-62  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.0746699  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0688  L-seryl-tRNA(Sec) selenium transferase  34.31 
 
 		 421 aa  212  1e-53  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.207036  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0977  outer membrane efflux protein  28.27 
 
 		 410 aa  143  7e-33  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.0000084232  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0534  Outer membrane efflux protein  27.43 
 
 		 410 aa  114  3e-24  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1275  hypothetical protein  24.58 
 
 		 411 aa  98.2  2e-19  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.0000302349  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1442  Outer membrane efflux protein  25.42 
 
 		 408 aa  80.1  0.00000000000006  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  decreased coverage  0.00437405  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0685  putative periplasmic protein  24.83 
 
 		 411 aa  78.6  0.0000000000002  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.61811  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc3208  putative drug efflux lipoprotein  20.65 
 
 		 486 aa  53.9  0.000006  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0332853  normal  0.0695421 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6576  RND efflux system outer membrane lipoprotein  20.74 
 
 		 486 aa  52.4  0.00002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.189309  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6290  RND efflux system outer membrane lipoprotein  20.74 
 
 		 486 aa  51.6  0.00003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00975739 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6141  RND efflux system outer membrane lipoprotein  21.66 
 
 		 486 aa  50.8  0.00005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1296  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT  21.66 
 
 		 486 aa  49.7  0.0001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0398141  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6534  RND efflux system outer membrane lipoprotein  21.66 
 
 		 486 aa  49.7  0.0001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.780445  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0057  outer membrane protein, putative  20.42 
 
 		 470 aa  49.7  0.0001  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1671  outer membrane efflux protein  21.74 
 
 		 461 aa  49.3  0.0001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3318  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT family  21.02 
 
 		 492 aa  48.9  0.0002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0849  outer membrane efflux protein  21.35 
 
 		 417 aa  48.5  0.0002  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000450472  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1633  outer membrane efflux protein  25.91 
 
 		 470 aa  48.5  0.0002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.788464  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0120  outer membrane efflux protein  19.7 
 
 		 448 aa  48.5  0.0002  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  unclonable  0.00000000165447  hitchhiker  0.000000000000561163 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1921  RND efflux system outer membrane lipoprotein  21.52 
 
 		 514 aa  48.1  0.0003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.330678  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1745  NodT family efflux transporter outer membrane lipoprotein  21.52 
 
 		 498 aa  48.1  0.0003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.134149  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1768  NodT family efflux transporter outer membrane lipoprotein  21.52 
 
 		 493 aa  48.1  0.0003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1056  RND efflux system outer membrane lipoprotein  21.52 
 
 		 498 aa  47.8  0.0004  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.14613  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0996  RND efflux system outer membrane lipoprotein  21.52 
 
 		 498 aa  47.8  0.0004  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0170  RND efflux system outer membrane lipoprotein  21.52 
 
 		 498 aa  47.8  0.0004  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0737823  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1502  RND efflux system outer membrane lipoprotein  21.52 
 
 		 514 aa  47.8  0.0004  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.370375  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1665  outer membrane efflux protein  22.05 
 
 		 464 aa  47.4  0.0004  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0430  TolC family type I secretion outer membrane protein  22.12 
 
 		 436 aa  47.4  0.0004  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.0000114483  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5656  RND efflux system outer membrane lipoprotein  24.87 
 
 		 501 aa  47  0.0006  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.162521  normal  0.0223313 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2883  TolC family type I secretion outer membrane protein  23.9 
 
 		 442 aa  46.6  0.0008  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.00170075  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0662  outer membrane efflux protein  23.36 
 
 		 483 aa  46.6  0.0009  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01115  putative outer membrane transport/efflux protein  24.46 
 
 		 443 aa  45.8  0.001  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013731  Slin_6757  heavy metal efflux pump, CzcA family  23.3 
 
 		 1480 aa  46.2  0.001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.603059  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1482  outer membrane efflux protein  20.64 
 
 		 471 aa  46.6  0.001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.387043 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03690  outer membrane channel precursor protein  19.95 
 
 		 462 aa  45.8  0.001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  unclonable  0.0000344286  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4230  outer membrane efflux protein  24.73 
 
 		 458 aa  46.2  0.001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0431504  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2756  outer membrane efflux protein  22.05 
 
 		 490 aa  45.4  0.002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.158368  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3004  putative outer TolC membrane protein  20.38 
 
 		 469 aa  45.4  0.002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.833992 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2559  RND efflux system outer membrane lipoprotein  21.17 
 
 		 527 aa  45.4  0.002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3620  TolC family type I secretion outer membrane protein  21.74 
 
 		 482 aa  45.1  0.002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3549  RND efflux system outer membrane lipoprotein  22.96 
 
 		 486 aa  45.1  0.002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.504224  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1217  outer membrane efflux protein  24.63 
 
 		 438 aa  45.8  0.002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.87899  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2259  RND efflux system outer membrane lipoprotein  23.27 
 
 		 508 aa  45.4  0.002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.324035  normal  0.22709 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3257  Type I secretion outer membrane protein, TolC  21.02 
 
 		 462 aa  45.1  0.003  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.30122  normal  0.885594 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2822  TolC family type I secretion outer membrane protein  21.74 
 
 		 479 aa  44.7  0.003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.390937  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3155  TolC family type I secretion outer membrane protein  21.74 
 
 		 482 aa  45.1  0.003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.267117  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3443  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT  23.15 
 
 		 486 aa  44.7  0.003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.267273  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0046  TolC family type I secretion outer membrane protein  21.74 
 
 		 471 aa  45.1  0.003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1721  TolC family type I secretion outer membrane protein  21.74 
 
 		 482 aa  45.1  0.003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.456925  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1353  outer membrane efflux protein  24.66 
 
 		 451 aa  44.7  0.003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.678572  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1750  RND efflux system outer membrane lipoprotein  20.88 
 
 		 498 aa  45.1  0.003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0410029 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3628  TolC family type I secretion outer membrane protein  21.26 
 
 		 479 aa  44.3  0.004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.93917  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3298  outer membrane efflux protein  21.33 
 
 		 418 aa  44.3  0.004  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000000531453  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2950  TolC family type I secretion outer membrane protein  21.26 
 
 		 479 aa  43.9  0.005  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0903  outer membrane efflux protein  21.58 
 
 		 436 aa  43.5  0.007  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.331424  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3644  TolC family type I secretion outer membrane protein  21.26 
 
 		 471 aa  43.5  0.007  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2457  type I secretion outer membrane protein, TolC family  18.43 
 
 		 449 aa  43.5  0.007  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1427  RND efflux system outer membrane lipoprotein  20.94 
 
 		 498 aa  43.1  0.008  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.0987986 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1387  RND efflux system outer membrane lipoprotein  20.94 
 
 		 498 aa  43.1  0.01  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>