23 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CCV52592_1272 on replicon NC_009715
Organism: Campylobacter curvus 525.92



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009715  CCV52592_1272  hypothetical protein  100 
 
 		 421 aa  841    Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.0746699  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0688  L-seryl-tRNA(Sec) selenium transferase  48.64 
 
 		 421 aa  383  1e-105  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.207036  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1050  hypothetical protein  38.24 
 
 		 424 aa  233  3e-60  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0751  putative outer membrane component of efflux system  38.72 
 
 		 419 aa  233  7.000000000000001e-60  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0986  outer membrane component of efflux system  36.17 
 
 		 418 aa  218  1e-55  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.942426  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1275  hypothetical protein  28.67 
 
 		 411 aa  140  3e-32  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.0000302349  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0685  putative periplasmic protein  27.36 
 
 		 411 aa  126  7e-28  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.61811  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0977  outer membrane efflux protein  26.49 
 
 		 410 aa  125  1e-27  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.0000084232  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0534  Outer membrane efflux protein  24.34 
 
 		 410 aa  101  3e-20  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1333  outer membrane efflux protein, putative  27.78 
 
 		 463 aa  57.8  0.0000004  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1442  Outer membrane efflux protein  24.43 
 
 		 408 aa  57.4  0.0000005  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  decreased coverage  0.00437405  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3619  outer membrane channel protein  22.48 
 
 		 469 aa  56.6  0.0000009  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3777  outer membrane channel protein  22.37 
 
 		 470 aa  56.2  0.000001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4182  outer membrane efflux protein  21.27 
 
 		 431 aa  47  0.0006  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.256436  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1531  outer membrane efflux protein  26.81 
 
 		 472 aa  47  0.0006  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1665  outer membrane efflux protein  25.18 
 
 		 464 aa  45.4  0.002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0183  outer membrane efflux protein  24.56 
 
 		 441 aa  45.8  0.002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5561  outer membrane efflux protein  21.82 
 
 		 431 aa  45.1  0.002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0986  outer membrane efflux protein, putative  22.34 
 
 		 484 aa  45.1  0.002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1633  outer membrane efflux protein  27.34 
 
 		 470 aa  43.9  0.005  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.788464  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0066  outer membrane efflux protein  28.82 
 
 		 436 aa  43.5  0.007  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2883  TolC family type I secretion outer membrane protein  22.03 
 
 		 442 aa  43.1  0.008  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.00170075  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03690  outer membrane channel precursor protein  22.31 
 
 		 462 aa  43.1  0.009  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  unclonable  0.0000344286  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>