19 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Suden_1442 on replicon NC_007575
Organism: Sulfurimonas denitrificans DSM 1251



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007575  Suden_1442  Outer membrane efflux protein  100 
 
 		 408 aa  807    Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  decreased coverage  0.00437405  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0534  Outer membrane efflux protein  27.47 
 
 		 410 aa  142  9.999999999999999e-33  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0977  outer membrane efflux protein  26.84 
 
 		 410 aa  115  2.0000000000000002e-24  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.0000084232  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0986  outer membrane component of efflux system  26.25 
 
 		 418 aa  93.2  8e-18  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.942426  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0751  putative outer membrane component of efflux system  25.06 
 
 		 419 aa  88.2  3e-16  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1050  hypothetical protein  24.94 
 
 		 424 aa  82  0.00000000000002  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0688  L-seryl-tRNA(Sec) selenium transferase  26.68 
 
 		 421 aa  63.9  0.000000005  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.207036  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1272  hypothetical protein  24.43 
 
 		 421 aa  55.1  0.000002  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.0746699  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2013  outer membrane channel protein  28.19 
 
 		 438 aa  53.1  0.000008  Vibrio cholerae O395  Bacteria  unclonable  0.000000000000158125  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004522  type I secretion TolC precursor  25.37 
 
 		 442 aa  50.8  0.00005  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.000000301167  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1217  outer membrane efflux protein  25.95 
 
 		 438 aa  49.3  0.0001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.87899  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1705  Outer membrane efflux protein  23.44 
 
 		 436 aa  49.3  0.0001  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.370592  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0430  TolC family type I secretion outer membrane protein  26.14 
 
 		 436 aa  47.8  0.0003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.0000114483  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00869  outer membrane channel protein  26.13 
 
 		 445 aa  47.8  0.0004  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0329  RND efflux system outer membrane lipoprotein  23.76 
 
 		 474 aa  45.4  0.002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0096  outer membrane efflux protein  25.54 
 
 		 441 aa  45.4  0.002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2262  Type I secretion outer membrane protein, TolC  30.34 
 
 		 497 aa  45.1  0.003  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0148702  normal  0.873765 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2283  Type I secretion outer membrane protein, TolC  21.18 
 
 		 480 aa  43.9  0.005  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3814  outer membrane efflux protein  27.01 
 
 		 493 aa  43.5  0.007  Shewanella baltica OS155  Bacteria  decreased coverage  0.0000440013  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>