25 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Suden_0534 on replicon NC_007575
Organism: Sulfurimonas denitrificans DSM 1251



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007575  Suden_0534  Outer membrane efflux protein  100 
 
 		 410 aa  826    Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0977  outer membrane efflux protein  36.32 
 
 		 410 aa  234  3e-60  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.0000084232  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1442  Outer membrane efflux protein  27.47 
 
 		 408 aa  129  7.000000000000001e-29  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  decreased coverage  0.00437405  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0751  putative outer membrane component of efflux system  29.62 
 
 		 419 aa  129  1.0000000000000001e-28  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0986  outer membrane component of efflux system  29.26 
 
 		 418 aa  115  2.0000000000000002e-24  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.942426  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1050  hypothetical protein  27.43 
 
 		 424 aa  111  3e-23  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1272  hypothetical protein  24.34 
 
 		 421 aa  86.7  6e-16  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.0746699  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0688  L-seryl-tRNA(Sec) selenium transferase  26.56 
 
 		 421 aa  77  0.0000000000005  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.207036  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1275  hypothetical protein  21.65 
 
 		 411 aa  60.1  0.00000007  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.0000302349  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0831  outer membrane efflux protein  24.94 
 
 		 419 aa  56.6  0.0000009  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2629  outer membrane efflux protein  21.09 
 
 		 421 aa  55.1  0.000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.111539  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0242  outer membrane efflux protein  21.14 
 
 		 444 aa  54.3  0.000004  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.231209  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0278  outer membrane efflux protein  20.46 
 
 		 441 aa  52  0.00002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  unclonable  0.000000626538  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0903  outer membrane efflux protein  23.33 
 
 		 436 aa  51.6  0.00003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.331424  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1633  outer membrane efflux protein  21.39 
 
 		 420 aa  50.4  0.00005  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.159543  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0685  putative periplasmic protein  21.34 
 
 		 411 aa  48.5  0.0002  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.61811  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2633  outer membrane efflux protein  25.56 
 
 		 424 aa  47.4  0.0005  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1482  outer membrane efflux protein  20.85 
 
 		 426 aa  47  0.0007  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.979092  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1606  outer membrane efflux protein  20.36 
 
 		 421 aa  46.6  0.0008  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0096  outer membrane efflux protein  22.41 
 
 		 441 aa  46.6  0.0009  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4260  outer membrane efflux protein  23.32 
 
 		 438 aa  45.1  0.002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0207  outer membrane efflux protein  20.36 
 
 		 523 aa  43.5  0.007  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1203  outer membrane efflux protein  22.88 
 
 		 497 aa  43.1  0.008  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1086  RND efflux system outer membrane lipoprotein  20.17 
 
 		 482 aa  43.1  0.009  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.981132  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3626  outer membrane efflux protein  26.06 
 
 		 627 aa  42.7  0.01  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0887926  normal  0.306741 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>