186 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sdel_0977 on replicon NC_013512
Organism: Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013512  Sdel_0977  outer membrane efflux protein  100 
 
 		 410 aa  823    Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.0000084232  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0534  Outer membrane efflux protein  36.32 
 
 		 410 aa  234  3e-60  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0751  putative outer membrane component of efflux system  29.08 
 
 		 419 aa  147  2.0000000000000003e-34  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1050  hypothetical protein  27.55 
 
 		 424 aa  133  5e-30  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0986  outer membrane component of efflux system  28.19 
 
 		 418 aa  132  1.0000000000000001e-29  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.942426  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0688  L-seryl-tRNA(Sec) selenium transferase  26.37 
 
 		 421 aa  118  1.9999999999999998e-25  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.207036  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1272  hypothetical protein  26.49 
 
 		 421 aa  114  3e-24  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.0746699  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1442  Outer membrane efflux protein  26.84 
 
 		 408 aa  107  3e-22  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  decreased coverage  0.00437405  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3448  outer membrane channel protein  26.14 
 
 		 494 aa  90.9  4e-17  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.203909 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1727  type I secretion outer membrane protein, TolC family  26.26 
 
 		 452 aa  84  0.000000000000004  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.000000826676  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3619  outer membrane channel protein  25.56 
 
 		 469 aa  82.8  0.000000000000009  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3539  outer membrane channel protein  23.79 
 
 		 489 aa  77  0.0000000000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.735558  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3777  outer membrane channel protein  22.75 
 
 		 470 aa  76.6  0.0000000000007  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3444  outer membrane channel protein  23.56 
 
 		 489 aa  75.5  0.000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.606184  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3367  outer membrane channel protein  23.56 
 
 		 489 aa  75.5  0.000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3437  outer membrane channel protein  23.56 
 
 		 489 aa  75.5  0.000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3372  outer membrane channel protein  23.56 
 
 		 489 aa  75.5  0.000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.258775 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4268  outer membrane channel protein  23.76 
 
 		 497 aa  73.9  0.000000000005  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.0102816 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0313  outer membrane channel protein  23.48 
 
 		 463 aa  73.9  0.000000000005  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2883  TolC family type I secretion outer membrane protein  25.89 
 
 		 442 aa  70.5  0.00000000005  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.00170075  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0323  outer membrane channel protein  21.53 
 
 		 463 aa  68.9  0.0000000001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  unclonable  0.00000673159  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0284  outer membrane channel protein  25.21 
 
 		 465 aa  68.9  0.0000000001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0654  outer membrane channel protein  25.21 
 
 		 464 aa  69.7  0.0000000001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.945309  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2633  outer membrane efflux protein  24.25 
 
 		 424 aa  69.3  0.0000000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0573  outer membrane channel protein  25.21 
 
 		 464 aa  69.7  0.0000000001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3213  outer membrane channel protein  23.92 
 
 		 495 aa  68.9  0.0000000001  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00955114  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3499  outer membrane channel protein  23.92 
 
 		 495 aa  68.9  0.0000000001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0404091  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02907  outer membrane channel precursor protein  23.92 
 
 		 493 aa  68.9  0.0000000002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0665  type I secretion outer membrane protein, TolC family  23.92 
 
 		 493 aa  68.9  0.0000000002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3330  outer membrane channel protein  23.92 
 
 		 493 aa  68.9  0.0000000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02857  hypothetical protein  23.92 
 
 		 493 aa  68.9  0.0000000002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0662  outer membrane channel protein  23.92 
 
 		 493 aa  68.9  0.0000000002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.120975  normal  0.0171626 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2639  TolC family type I secretion outer membrane protein  21.77 
 
 		 461 aa  68.9  0.0000000002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4349  outer membrane channel protein  23.92 
 
 		 493 aa  68.9  0.0000000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.823303  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3468  outer membrane channel protein  23.66 
 
 		 495 aa  67  0.0000000006  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0175451  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3465  Outer membrane efflux protein  23.61 
 
 		 441 aa  65.5  0.000000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03690  outer membrane channel precursor protein  23.3 
 
 		 462 aa  63.9  0.000000004  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  unclonable  0.0000344286  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3926  Type I secretion outer membrane protein, TolC  24.08 
 
 		 441 aa  63.5  0.000000006  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1606  outer membrane efflux protein  21.05 
 
 		 421 aa  63.5  0.000000007  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1633  outer membrane efflux protein  24.7 
 
 		 420 aa  62.8  0.00000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.159543  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1203  outer membrane efflux protein  23.39 
 
 		 497 aa  62  0.00000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3360  type I secretion outer membrane protein, TolC family protein  21.66 
 
 		 444 aa  61.6  0.00000002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.21716  normal  0.12144 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02621  outer membrane protein required for AvrXa21 activity C (raxC)  25.26 
 
 		 443 aa  62  0.00000002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3457  type I secretion outer membrane protein, TolC family  25.92 
 
 		 434 aa  62.4  0.00000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2013  outer membrane channel protein  24.4 
 
 		 438 aa  61.2  0.00000003  Vibrio cholerae O395  Bacteria  unclonable  0.000000000000158125  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1304  Type I secretion outer membrane protein, TolC  23.31 
 
 		 446 aa  60.8  0.00000004  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000151154  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2629  outer membrane efflux protein  22.22 
 
 		 421 aa  60.8  0.00000005  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.111539  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1482  outer membrane efflux protein  22.54 
 
 		 426 aa  59.3  0.0000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.979092  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3004  TolC family type I secretion outer membrane protein  23.48 
 
 		 464 aa  59.7  0.0000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.599739 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0744  Type I secretion outer membrane protein, TolC  24.56 
 
 		 449 aa  58.9  0.0000002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.291612  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1884  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT family  25.28 
 
 		 464 aa  58.5  0.0000002  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  decreased coverage  0.0017284  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1096  TolC family type I secretion outer membrane protein  21.74 
 
 		 494 aa  58.9  0.0000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.739146 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1333  outer membrane efflux protein, putative  23.83 
 
 		 463 aa  57.8  0.0000003  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2156  outer membrane export factor  25.52 
 
 		 452 aa  57.4  0.0000005  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0068  outer membrane protein TolC, putative  31.95 
 
 		 407 aa  57  0.0000006  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.896077  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1384  outer membrane efflux protein  24.36 
 
 		 435 aa  57  0.0000006  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.642492  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0430  TolC family type I secretion outer membrane protein  23.15 
 
 		 436 aa  57  0.0000007  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.0000114483  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3343  type I secretion outer membrane protein, TolC family  25.56 
 
 		 452 aa  56.6  0.0000008  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1164  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT family  26.09 
 
 		 473 aa  56.2  0.0000009  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.0000188172  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3061  type I secretion outer membrane protein, TolC family  23.16 
 
 		 450 aa  55.8  0.000001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0722  TolC family type I secretion outer membrane protein  23.31 
 
 		 449 aa  55.8  0.000001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.278359  normal  0.698539 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1214  type I secretion outer membrane protein, TolC family  23.34 
 
 		 450 aa  55.8  0.000001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.227292  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2799  outer membrane efflux protein  24.68 
 
 		 435 aa  55.5  0.000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  unclonable  0.0000000194078  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4977  outer membrane efflux protein TolC, putative  21.5 
 
 		 479 aa  54.7  0.000003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3958  TolC family type I secretion outer membrane protein  23.14 
 
 		 491 aa  54.7  0.000003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.753849  normal  0.338977 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0381  type I secretion outer membrane protein, TolC family  25.18 
 
 		 445 aa  54.3  0.000003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0230254  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1145  anibiotic ABC transporter efflux pump  21.1 
 
 		 442 aa  54.3  0.000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0950506  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0986  outer membrane efflux protein, putative  30.08 
 
 		 484 aa  53.9  0.000005  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2675  outer membrane channel protein  23.63 
 
 		 441 aa  53.5  0.000006  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2558  TolC family type I secretion outer membrane protein  23.13 
 
 		 452 aa  53.9  0.000006  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.431388  normal  0.101058 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_2069  TolC family type I secretion outer membrane protein  25.26 
 
 		 452 aa  53.5  0.000007  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0498  type I secretion outer membrane protein, TolC family  21.88 
 
 		 494 aa  53.1  0.000009  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0543  Type I secretion outer membrane protein, TolC  21.5 
 
 		 479 aa  52.4  0.00001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.991736 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1345  Type I secretion outer membrane protein, TolC  23.63 
 
 		 455 aa  52.4  0.00001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2756  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT  22.96 
 
 		 469 aa  52  0.00002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0415066  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0066  outer membrane efflux protein  23.25 
 
 		 436 aa  52  0.00002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1162  outer membrane efflux protein  21.99 
 
 		 515 aa  51.6  0.00003  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  unclonable  0.0000199135  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0186  Type I secretion outer membrane protein, TolC  22.36 
 
 		 485 aa  51.2  0.00003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0483  type I secretion outer membrane protein, TolC  21.67 
 
 		 440 aa  51.2  0.00003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01115  putative outer membrane transport/efflux protein  23.37 
 
 		 443 aa  51.6  0.00003  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1407  RND efflux system outer membrane lipoprotein  22.14 
 
 		 488 aa  51.6  0.00003  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.380774 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6370  TolC family type I secretion outer membrane protein  28.57 
 
 		 456 aa  51.2  0.00003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.668018  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2350  outer membrane efflux protein  20.89 
 
 		 441 aa  51.2  0.00003  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6073  TolC family type I secretion outer membrane protein  28.57 
 
 		 457 aa  51.2  0.00003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.523429 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1871  RND efflux system outer membrane lipoprotein  23.37 
 
 		 485 aa  51.6  0.00003  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.97882  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3801  outer membrane efflux protein  23.22 
 
 		 449 aa  51.2  0.00003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.233057 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1296  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT  24.22 
 
 		 486 aa  50.8  0.00004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0398141  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6534  RND efflux system outer membrane lipoprotein  24.22 
 
 		 486 aa  50.8  0.00004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.780445  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1569  TolC family type I secretion outer membrane protein  20.33 
 
 		 461 aa  50.8  0.00005  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.151598  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4181  outer membrane channel protein  21 
 
 		 449 aa  50.1  0.00006  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3126  outer membrane efflux protein  32.69 
 
 		 444 aa  50.4  0.00006  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0453  Outer membrane efflux protein  20.72 
 
 		 470 aa  50.4  0.00006  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2367  outer membrane efflux protein  25.4 
 
 		 495 aa  50.4  0.00006  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3356  TolC family type I secretion outer membrane protein  21.82 
 
 		 442 aa  50.4  0.00006  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.431157  normal  0.886803 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3157  TolC family type I secretion outer membrane protein  22.48 
 
 		 442 aa  50.1  0.00007  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.262509 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2441  outer membrane efflux protein  19.74 
 
 		 453 aa  50.1  0.00008  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1494  type I secretion outer membrane protein, TolC family  24.23 
 
 		 450 aa  50.1  0.00008  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2606  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT  25.75 
 
 		 478 aa  49.7  0.00009  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  decreased coverage  0.0037798  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1307  type I secretion outer membrane protein, TolC family  19.85 
 
 		 484 aa  49.7  0.00009  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3645  outer membrane efflux protein  23.56 
 
 		 514 aa  49.3  0.0001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.784148  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>