More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Taci_1384 on replicon NC_013522
Organism: Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013522  Taci_1384  outer membrane efflux protein  100 
 
 
435 aa  858    Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.642492  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0162  outer membrane efflux protein  26.64 
 
 
433 aa  112  2.0000000000000002e-23  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0814  outer membrane efflux protein  27.44 
 
 
460 aa  108  2e-22  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2517  Outer membrane efflux protein  27.45 
 
 
455 aa  107  6e-22  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0940003  normal  0.677218 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2664  outer membrane efflux protein  27.45 
 
 
1496 aa  101  3e-20  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3496  outer membrane efflux protein  25.59 
 
 
565 aa  101  3e-20  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1749  outer membrane efflux protein  23.59 
 
 
458 aa  97.8  3e-19  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_4004  acriflavin resistance protein  27.07 
 
 
1470 aa  95.9  1e-18  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0364  outer membrane channel protein  24.55 
 
 
500 aa  91.7  2e-17  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2441  outer membrane efflux protein  23.29 
 
 
453 aa  91.3  3e-17  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1217  outer membrane efflux protein  26.45 
 
 
438 aa  89  1e-16  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.87899  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0096  outer membrane efflux protein  23.95 
 
 
441 aa  88.6  2e-16  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3409  outer membrane efflux protein  26.55 
 
 
419 aa  88.6  2e-16  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000000155286  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05030  outer membrane efflux protein  21.34 
 
 
471 aa  88.6  2e-16  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.691581  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2799  outer membrane efflux protein  24.69 
 
 
435 aa  87.8  4e-16  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  unclonable  0.0000000194078  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2365  outer membrane efflux protein  25.12 
 
 
482 aa  87.4  5e-16  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.316372 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0066  outer membrane efflux protein  25.62 
 
 
443 aa  84.7  0.000000000000003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1177  outer membrane efflux protein  22.46 
 
 
427 aa  84  0.000000000000004  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3465  Outer membrane efflux protein  25.52 
 
 
441 aa  84  0.000000000000005  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0498  type I secretion outer membrane protein, TolC family  26.46 
 
 
494 aa  83.2  0.000000000000008  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3627  outer membrane efflux protein  22.91 
 
 
461 aa  82.4  0.00000000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.433273  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0532  outer membrane efflux protein  24.41 
 
 
578 aa  81.6  0.00000000000003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.52231  normal  0.0114882 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0831  outer membrane efflux protein  25.72 
 
 
419 aa  81.3  0.00000000000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0515  outer membrane efflux protein  24.41 
 
 
578 aa  81.6  0.00000000000003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0762  outer membrane efflux protein  23.13 
 
 
446 aa  79.7  0.0000000000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3004  TolC family type I secretion outer membrane protein  25.41 
 
 
464 aa  79.3  0.0000000000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.599739 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0283  outer membrane efflux protein  24.37 
 
 
439 aa  79  0.0000000000001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00367785 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3801  outer membrane efflux protein  22.82 
 
 
449 aa  79.3  0.0000000000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.233057 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3157  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT family  22.22 
 
 
480 aa  78.2  0.0000000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0120  outer membrane efflux protein  21.6 
 
 
448 aa  77.4  0.0000000000004  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  unclonable  0.00000000165447  hitchhiker  0.000000000000561163 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0954  outer membrane efflux protein  26.61 
 
 
463 aa  77.8  0.0000000000004  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4447  outer membrane efflux protein  24.44 
 
 
459 aa  77.4  0.0000000000005  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0961  Outer membrane protein-like  25.37 
 
 
491 aa  77  0.0000000000006  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0234127  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0736  hypothetical protein  22.97 
 
 
455 aa  75.1  0.000000000002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0768  outer membrane channel protein  23.38 
 
 
435 aa  75.5  0.000000000002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  decreased coverage  0.00000309945  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3093  outer membrane protein  26.73 
 
 
503 aa  75.1  0.000000000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  7.56103e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4235  TolC family type I secretion outer membrane protein  29.43 
 
 
463 aa  75.5  0.000000000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.902691  normal  0.529157 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0071  outer membrane efflux protein  24.94 
 
 
441 aa  74.7  0.000000000003  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1015  Outer membrane efflux protein  25.43 
 
 
731 aa  73.9  0.000000000005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.0127212 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4008  outer membrane protein oprM  24.7 
 
 
468 aa  73.9  0.000000000006  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2950  TolC family type I secretion outer membrane protein  24.41 
 
 
479 aa  73.2  0.000000000008  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0224  outer membrane efflux protein  24 
 
 
419 aa  73.2  0.000000000009  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.000720591  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_02231  RND family outer membrane efflux protein  25.28 
 
 
577 aa  72.8  0.00000000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0754  hypothetical protein  22.82 
 
 
455 aa  72.4  0.00000000001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1761  hypothetical protein  24.94 
 
 
576 aa  73.2  0.00000000001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1727  type I secretion outer membrane protein, TolC family  26.63 
 
 
452 aa  72.4  0.00000000001  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.000000826676  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1569  TolC family type I secretion outer membrane protein  25.29 
 
 
461 aa  72.4  0.00000000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.151598  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3717  RND efflux system outer membrane lipoprotein  24.47 
 
 
468 aa  71.6  0.00000000002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1781  TolC family type I secretion outer membrane protein  23 
 
 
517 aa  71.6  0.00000000002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0863506  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2662  outer membrane efflux protein  22.7 
 
 
445 aa  72.4  0.00000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3584  outer membrane protein oprM  24.47 
 
 
468 aa  71.6  0.00000000002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008607  Ppro_3710  outer membrane efflux protein  22.6 
 
 
419 aa  72.4  0.00000000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5506  outer membrane efflux protein  22.07 
 
 
451 aa  72.4  0.00000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.307266  normal 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1525  outer membrane efflux protein  26.76 
 
 
442 aa  71.6  0.00000000003  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.000580745  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1380  outer membrane efflux protein  21.91 
 
 
425 aa  71.2  0.00000000003  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1231  RND efflux system outer membrane lipoprotein  32.95 
 
 
486 aa  71.2  0.00000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0812696  normal  0.324306 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0063  outer membrane efflux protein  20.72 
 
 
408 aa  70.9  0.00000000005  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.0180654  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1723  outer membrane efflux protein  25.52 
 
 
436 aa  70.5  0.00000000006  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0833  outer membrane efflux protein  22.89 
 
 
496 aa  70.1  0.00000000007  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0749  outer membrane efflux protein  25.47 
 
 
490 aa  70.1  0.00000000007  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0753  outer membrane channel protein  22.19 
 
 
435 aa  70.1  0.00000000007  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.00000555232  normal  0.0190145 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3706  outer membrane efflux protein  22.93 
 
 
447 aa  70.1  0.00000000007  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3236  outer membrane channel protein  22.19 
 
 
435 aa  70.1  0.00000000008  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.0000000456355  hitchhiker  0.0000511139 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2477  RND efflux system outer membrane lipoprotein  24.38 
 
 
484 aa  69.7  0.00000000009  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2110  outer membrane efflux protein  23.64 
 
 
437 aa  68.9  0.0000000001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.313002  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3444  RND efflux system outer membrane lipoprotein  25.96 
 
 
495 aa  69.7  0.0000000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.960604 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0863  outer membrane efflux protein  21.05 
 
 
476 aa  68.6  0.0000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.0409869  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3626  outer membrane efflux protein  28.76 
 
 
627 aa  68.6  0.0000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0887926  normal  0.306741 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2606  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT  25.12 
 
 
478 aa  68.2  0.0000000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  decreased coverage  0.0037798  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0066  outer membrane efflux protein  24.94 
 
 
436 aa  68.2  0.0000000003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4008  TolC family type I secretion outer membrane protein  25.26 
 
 
562 aa  68.2  0.0000000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_5078  outer membrane efflux protein  26.42 
 
 
635 aa  68.2  0.0000000003  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.851054  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0384  outer membrane efflux protein  24.24 
 
 
444 aa  68.2  0.0000000003  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.895564  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003403  agglutination protein  22.53 
 
 
436 aa  68.2  0.0000000003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.000998881  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0950  outer membrane efflux protein  26.7 
 
 
424 aa  67.4  0.0000000004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3904  outer membrane channel protein  23.28 
 
 
435 aa  67.8  0.0000000004  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2675  outer membrane channel protein  25 
 
 
441 aa  67.8  0.0000000004  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0806  outer membrane channel protein  21.72 
 
 
435 aa  67.8  0.0000000004  Shewanella baltica OS223  Bacteria  unclonable  0.0000000113836  hitchhiker  0.0000000000882186 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0046  TolC family type I secretion outer membrane protein  24.15 
 
 
471 aa  67.4  0.0000000005  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1629  outer membrane efflux protein  24.94 
 
 
438 aa  67.4  0.0000000005  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0546  TolC family type I secretion outer membrane protein  22.77 
 
 
444 aa  67.4  0.0000000005  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2243  TolC family type I secretion outer membrane protein  21.86 
 
 
455 aa  67.4  0.0000000005  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0725  outer membrane channel protein  21.95 
 
 
435 aa  67.4  0.0000000005  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00000245313  hitchhiker  0.000963429 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0302  outer membrane efflux protein  21.67 
 
 
431 aa  67  0.0000000006  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.019197  normal  0.0220531 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2822  TolC family type I secretion outer membrane protein  24.15 
 
 
479 aa  67  0.0000000006  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.390937  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3155  TolC family type I secretion outer membrane protein  24.15 
 
 
482 aa  67  0.0000000006  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.267117  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3628  TolC family type I secretion outer membrane protein  24.15 
 
 
479 aa  67  0.0000000006  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.93917  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3620  TolC family type I secretion outer membrane protein  24.15 
 
 
482 aa  67  0.0000000006  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0562  type I secretion outer membrane protein, TolC family  23.54 
 
 
450 aa  67  0.0000000006  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1721  TolC family type I secretion outer membrane protein  24.15 
 
 
482 aa  67  0.0000000006  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.456925  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0733  outer membrane efflux protein, putative  23.26 
 
 
463 aa  66.6  0.0000000007  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1955  outer membrane efflux protein  27.64 
 
 
476 aa  67  0.0000000007  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.223795  normal  0.557378 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3447  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT family  21.39 
 
 
477 aa  66.6  0.0000000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.689762 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0499  RND efflux system outer membrane lipoprotein  25.25 
 
 
485 aa  66.6  0.0000000008  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3225  outer membrane channel protein  21.31 
 
 
432 aa  66.6  0.0000000008  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0000000929322  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3096  outer membrane efflux protein  21.6 
 
 
497 aa  66.6  0.0000000008  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6515  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT family  25 
 
 
477 aa  66.6  0.0000000009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.0241936 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0627  outer membrane efflux protein, putative  21.8 
 
 
470 aa  66.6  0.0000000009  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.173588  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3644  TolC family type I secretion outer membrane protein  25.13 
 
 
471 aa  66.6  0.0000000009  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0781  outer membrane channel protein  21.45 
 
 
435 aa  66.2  0.000000001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  unclonable  0.000000000184345  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>