More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene WD0068 on replicon NC_002978
Organism: Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_002978  WD0068  outer membrane protein TolC, putative  100 
 
 
407 aa  822    Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.896077  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_1020  putative outer membrane protein TolC  34.45 
 
 
423 aa  247  2e-64  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.808388  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0823  Outer membrane efflux protein  34.41 
 
 
432 aa  238  1e-61  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.0383439  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3004  TolC family type I secretion outer membrane protein  26.45 
 
 
464 aa  147  4.0000000000000006e-34  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.599739 
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0798  outer membrane efflux protein  26.38 
 
 
436 aa  129  8.000000000000001e-29  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  0.98637  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2243  TolC family type I secretion outer membrane protein  26.98 
 
 
455 aa  126  7e-28  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1798  Type I secretion outer membrane protein, TolC  26.25 
 
 
538 aa  126  8.000000000000001e-28  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.99988  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1725  TolC family type I secretion outer membrane protein  26.45 
 
 
489 aa  119  9.999999999999999e-26  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.736299  normal  0.0102072 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3945  putative outer membrane protein tolC precursor  23.58 
 
 
461 aa  115  2.0000000000000002e-24  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.8738  normal  0.222307 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3231  TolC family type I secretion outer membrane protein  26.33 
 
 
483 aa  111  2.0000000000000002e-23  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1003  TolC family type I secretion outer membrane protein  25.89 
 
 
462 aa  111  3e-23  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3257  Type I secretion outer membrane protein, TolC  25.18 
 
 
462 aa  110  4.0000000000000004e-23  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.30122  normal  0.885594 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1690  type I secretion outer membrane protein, TolC family  25.84 
 
 
478 aa  107  4e-22  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.522729 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1453  type I secretion outer membrane protein, TolC family  25.84 
 
 
480 aa  107  5e-22  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0652  TolC family type I secretion outer membrane protein  27.18 
 
 
428 aa  105  2e-21  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000000458305  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1569  TolC family type I secretion outer membrane protein  24.18 
 
 
461 aa  103  4e-21  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.151598  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2851  type I secretion outer membrane protein, TolC family  23.28 
 
 
463 aa  103  7e-21  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3004  putative outer TolC membrane protein  24.19 
 
 
469 aa  102  1e-20  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.833992 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2098  putative outer membrane protein tolC  24.46 
 
 
456 aa  102  1e-20  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0562  type I secretion outer membrane protein, TolC family  24.07 
 
 
450 aa  100  4e-20  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4235  TolC family type I secretion outer membrane protein  25.16 
 
 
463 aa  100  7e-20  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.902691  normal  0.529157 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2024  TolC family type I secretion outer membrane protein  30.1 
 
 
465 aa  99.8  7e-20  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0251  Outer membrane efflux protein  29.73 
 
 
466 aa  99.8  8e-20  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.608595  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3558  Type I secretion outer membrane protein, TolC  25.24 
 
 
472 aa  99.4  1e-19  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.445028  normal  0.560368 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1894  TolC family type I secretion outer membrane protein  29.73 
 
 
466 aa  98.2  2e-19  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.170185  normal  0.445756 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5161  type I secretion outer membrane protein, TolC family  23.43 
 
 
488 aa  98.2  2e-19  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.451764  normal  0.264948 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4696  TolC family type I secretion outer membrane protein  23.43 
 
 
497 aa  98.2  2e-19  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5432  TolC family type I secretion outer membrane protein  25.82 
 
 
553 aa  99  2e-19  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.199925  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2568  Type I secretion outer membrane protein, TolC  21.3 
 
 
464 aa  98.2  2e-19  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5878  TolC family type I secretion outer membrane protein  25.3 
 
 
463 aa  97.8  3e-19  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.539647  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1096  TolC family type I secretion outer membrane protein  27.54 
 
 
494 aa  97.8  3e-19  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.739146 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1149  TolC family type I secretion outer membrane protein  26.01 
 
 
456 aa  97.4  4e-19  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.435165  normal 
 
 
-
 
NC_004310  BR0945  outer membrane efflux family protein  25.43 
 
 
456 aa  97.1  5e-19  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.681331  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6495  type I secretion outer membrane protein, TolC family  25.95 
 
 
518 aa  97.1  5e-19  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0938  outer membrane efflux family protein  25.43 
 
 
452 aa  96.7  7e-19  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0744  Type I secretion outer membrane protein, TolC  25.07 
 
 
449 aa  96.3  8e-19  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.291612  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2577  Type I secretion outer membrane protein, TolC  21.13 
 
 
522 aa  96.3  8e-19  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00589159 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5239  type I secretion outer membrane protein, TolC family  24.06 
 
 
488 aa  95.9  1e-18  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2686  Outer membrane secretion protein  23.67 
 
 
472 aa  95.5  2e-18  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.553025  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3453  putative tolC outer membrane protein  23.9 
 
 
438 aa  94.4  4e-18  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.341393 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1907  Type I secretion outer membrane protein, TolC  23.88 
 
 
472 aa  94  4e-18  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1826  Type I secretion outer membrane protein, TolC  22.19 
 
 
487 aa  94  5e-18  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4205  TolC family type I secretion outer membrane protein  22.93 
 
 
431 aa  93.6  6e-18  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.668787  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0611  TolC family type I secretion outer membrane protein  24.64 
 
 
464 aa  92  1e-17  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1445  type I secretion outer membrane protein, TolC family  23.59 
 
 
460 aa  92.8  1e-17  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.40462 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1434  type I secretion outer membrane protein, TolC  24.7 
 
 
490 aa  92  2e-17  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.44207  normal  0.675589 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0685  TolC family type I secretion outer membrane protein  26.94 
 
 
405 aa  92  2e-17  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000000118649  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0430  TolC family type I secretion outer membrane protein  24.58 
 
 
436 aa  91.7  2e-17  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.0000114483  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2894  Type I secretion outer membrane protein, TolC  21.3 
 
 
460 aa  89.7  9e-17  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.386257  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4008  TolC family type I secretion outer membrane protein  22.6 
 
 
562 aa  89  1e-16  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4320  agglutination protein  23.56 
 
 
471 aa  88.2  2e-16  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0381  TolC family type I secretion outer membrane protein  23.33 
 
 
471 aa  88.6  2e-16  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3645  TolC family type I secretion outer membrane protein  23.33 
 
 
471 aa  88.6  2e-16  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2148  TolC family type I secretion outer membrane protein  25.66 
 
 
497 aa  87.4  4e-16  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.400858  normal  0.0489946 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2013  type I secretion outer membrane protein, TolC family  25.23 
 
 
472 aa  87.4  5e-16  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.226354  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0366  putative secretion protein  24.4 
 
 
454 aa  87  6e-16  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.676066  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03690  outer membrane channel precursor protein  22.95 
 
 
462 aa  85.9  0.000000000000001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  unclonable  0.0000344286  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1991  Type I secretion outer membrane protein, TolC  24.69 
 
 
473 aa  85.9  0.000000000000001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.533391  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2262  Type I secretion outer membrane protein, TolC  22.31 
 
 
497 aa  85.9  0.000000000000001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0148702  normal  0.873765 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0379  TolC family type I secretion outer membrane protein  22.86 
 
 
471 aa  85.9  0.000000000000001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3261  type I secretion outer membrane protein, TolC  22.05 
 
 
469 aa  85.5  0.000000000000002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.537181 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1746  TolC family type I secretion outer membrane protein  22.77 
 
 
446 aa  85.1  0.000000000000002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1781  TolC family type I secretion outer membrane protein  23.49 
 
 
517 aa  85.1  0.000000000000002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0863506  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0474  TolC family type I secretion outer membrane protein  24.11 
 
 
470 aa  85.1  0.000000000000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0171025  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3594  TolC family type I secretion outer membrane protein  23.25 
 
 
471 aa  84.3  0.000000000000003  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2630  Type I secretion outer membrane protein, TolC  23.84 
 
 
489 aa  84.7  0.000000000000003  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3360  type I secretion outer membrane protein, TolC family protein  25.09 
 
 
444 aa  84.3  0.000000000000004  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.21716  normal  0.12144 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4142  TolC family type I secretion outer membrane protein  25.34 
 
 
472 aa  84.3  0.000000000000004  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00647616  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3542  type I secretion outer membrane protein, TolC family  22.79 
 
 
477 aa  84  0.000000000000004  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1228  agglutination protein  23.88 
 
 
445 aa  81.6  0.00000000000002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000902456  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2013  outer membrane channel protein  25.29 
 
 
438 aa  81.6  0.00000000000002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  unclonable  0.000000000000158125  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_48090  alkaline protease secretion outer membrane protein AprF precursor  22.94 
 
 
481 aa  81.3  0.00000000000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.0152412 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004522  type I secretion TolC precursor  25.34 
 
 
442 aa  80.5  0.00000000000005  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.000000301167  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0722  TolC family type I secretion outer membrane protein  23.62 
 
 
449 aa  80.5  0.00000000000005  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.278359  normal  0.698539 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3777  outer membrane channel protein  24.36 
 
 
470 aa  79.7  0.00000000000007  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3468  outer membrane channel protein  23.75 
 
 
495 aa  79  0.0000000000001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0175451  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02907  outer membrane channel precursor protein  23.44 
 
 
493 aa  78.6  0.0000000000002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0665  type I secretion outer membrane protein, TolC family  23.44 
 
 
493 aa  78.6  0.0000000000002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3213  outer membrane channel protein  23.44 
 
 
495 aa  78.6  0.0000000000002  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00955114  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4349  outer membrane channel protein  23.44 
 
 
493 aa  78.6  0.0000000000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.823303  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4268  outer membrane channel protein  23.08 
 
 
497 aa  78.6  0.0000000000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.0102816 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3330  outer membrane channel protein  23.44 
 
 
493 aa  78.6  0.0000000000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0381  type I secretion outer membrane protein, TolC family  20.94 
 
 
445 aa  78.6  0.0000000000002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0230254  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0634  type I secretion outer membrane protein, TolC family  24.92 
 
 
467 aa  78.2  0.0000000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  hitchhiker  0.0000541353  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02857  hypothetical protein  23.44 
 
 
493 aa  78.6  0.0000000000002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4101  TolC family type I secretion outer membrane protein  23.74 
 
 
472 aa  78.6  0.0000000000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3499  outer membrane channel protein  23.44 
 
 
495 aa  78.6  0.0000000000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0404091  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3448  outer membrane channel protein  24.14 
 
 
494 aa  78.6  0.0000000000002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.203909 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0662  outer membrane channel protein  23.44 
 
 
493 aa  78.6  0.0000000000002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.120975  normal  0.0171626 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2697  type I secretion outer membrane protein, TolC  21.95 
 
 
437 aa  78.2  0.0000000000003  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0433  type I secretion outer membrane protein, TolC family protein  22.97 
 
 
469 aa  77.8  0.0000000000003  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.462048  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02379  hypothetical protein  21 
 
 
436 aa  77.4  0.0000000000004  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3619  outer membrane channel protein  24.69 
 
 
469 aa  77  0.0000000000005  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0546  TolC family type I secretion outer membrane protein  22.16 
 
 
444 aa  76.6  0.0000000000007  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2727  TolC family type I secretion outer membrane protein  25.51 
 
 
464 aa  76.3  0.0000000000009  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.226974  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4144  alkaline protease secretion protein AprF  23 
 
 
477 aa  75.9  0.000000000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0485622  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0323  outer membrane channel protein  24.66 
 
 
463 aa  75.9  0.000000000001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  unclonable  0.00000673159  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2109  type I secretion outer membrane protein, TolC family  21.81 
 
 
466 aa  75.9  0.000000000001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0310  TolC family type I secretion outer membrane protein  24.88 
 
 
470 aa  75.9  0.000000000001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.952787  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003403  agglutination protein  21.67 
 
 
436 aa  75.9  0.000000000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.000998881  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>