67 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene JJD26997_0751 on replicon NC_009707
Organism: Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009707  JJD26997_0751  putative outer membrane component of efflux system  100 
 
 		 419 aa  816    Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1050  hypothetical protein  90.09 
 
 		 424 aa  706    Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0986  outer membrane component of efflux system  49.01 
 
 		 418 aa  369  1e-101  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.942426  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1272  hypothetical protein  38.72 
 
 		 421 aa  238  2e-61  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.0746699  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0688  L-seryl-tRNA(Sec) selenium transferase  34.72 
 
 		 421 aa  221  3e-56  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.207036  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0977  outer membrane efflux protein  29.79 
 
 		 410 aa  157  4e-37  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.0000084232  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0534  Outer membrane efflux protein  29.62 
 
 		 410 aa  132  1.0000000000000001e-29  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1275  hypothetical protein  25.65 
 
 		 411 aa  110  4.0000000000000004e-23  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.0000302349  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1442  Outer membrane efflux protein  25.35 
 
 		 408 aa  85.5  0.000000000000002  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  decreased coverage  0.00437405  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0685  putative periplasmic protein  25.35 
 
 		 411 aa  79.7  0.00000000000009  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.61811  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0849  outer membrane efflux protein  23.3 
 
 		 417 aa  63.9  0.000000005  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000450472  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0662  outer membrane efflux protein  22.99 
 
 		 483 aa  56.6  0.0000009  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3208  putative drug efflux lipoprotein  21.29 
 
 		 486 aa  55.1  0.000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0332853  normal  0.0695421 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6576  RND efflux system outer membrane lipoprotein  21.02 
 
 		 486 aa  55.5  0.000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.189309  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6290  RND efflux system outer membrane lipoprotein  21.02 
 
 		 486 aa  54.3  0.000004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00975739 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6141  RND efflux system outer membrane lipoprotein  21.79 
 
 		 486 aa  52  0.00002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1633  outer membrane efflux protein  25.91 
 
 		 470 aa  50.4  0.00006  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.788464  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3318  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT family  25.28 
 
 		 492 aa  50.4  0.00006  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1482  outer membrane efflux protein  20.63 
 
 		 471 aa  50.1  0.00008  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.387043 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1296  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT  21.97 
 
 		 486 aa  49.7  0.00009  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0398141  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6534  RND efflux system outer membrane lipoprotein  21.97 
 
 		 486 aa  49.7  0.00009  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.780445  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5656  RND efflux system outer membrane lipoprotein  24.35 
 
 		 501 aa  49.7  0.00009  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.162521  normal  0.0223313 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0057  outer membrane protein, putative  20.89 
 
 		 470 aa  48.5  0.0002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1131  outer membrane efflux protein  22 
 
 		 364 aa  47.8  0.0003  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03690  outer membrane channel precursor protein  19.15 
 
 		 462 aa  48.1  0.0003  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  unclonable  0.0000344286  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2457  type I secretion outer membrane protein, TolC family  19.8 
 
 		 449 aa  48.1  0.0003  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1203  outer membrane efflux protein  23.88 
 
 		 497 aa  47.8  0.0004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01115  putative outer membrane transport/efflux protein  24.19 
 
 		 443 aa  47.8  0.0004  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3443  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT  23.83 
 
 		 486 aa  47.8  0.0004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.267273  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3549  RND efflux system outer membrane lipoprotein  23.14 
 
 		 486 aa  47.4  0.0005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.504224  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0120  outer membrane efflux protein  19.7 
 
 		 448 aa  47  0.0006  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  unclonable  0.00000000165447  hitchhiker  0.000000000000561163 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1665  outer membrane efflux protein  21.95 
 
 		 464 aa  46.6  0.0007  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2756  outer membrane efflux protein  25.61 
 
 		 490 aa  45.8  0.001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.158368  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2191  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT  23.2 
 
 		 490 aa  46.6  0.001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.204067  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0430  TolC family type I secretion outer membrane protein  22.76 
 
 		 436 aa  45.8  0.001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.0000114483  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3004  putative outer TolC membrane protein  21.38 
 
 		 469 aa  45.8  0.001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.833992 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1745  NodT family efflux transporter outer membrane lipoprotein  23.15 
 
 		 498 aa  45.1  0.002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.134149  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1921  RND efflux system outer membrane lipoprotein  23.15 
 
 		 514 aa  45.1  0.002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.330678  n/a   
 
 
-
 
NC_013731  Slin_6757  heavy metal efflux pump, CzcA family  22.82 
 
 		 1480 aa  45.1  0.002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.603059  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1750  RND efflux system outer membrane lipoprotein  22.08 
 
 		 498 aa  45.4  0.002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0410029 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0066  outer membrane efflux protein  20.72 
 
 		 443 aa  45.4  0.002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1768  NodT family efflux transporter outer membrane lipoprotein  23.15 
 
 		 493 aa  45.1  0.002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2639  TolC family type I secretion outer membrane protein  19.87 
 
 		 461 aa  45.1  0.003  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1671  outer membrane efflux protein  20.28 
 
 		 461 aa  44.7  0.003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2485  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT  20.32 
 
 		 487 aa  44.3  0.004  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.072827  normal  0.13209 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2799  RND efflux system outer membrane lipoprotein  23.78 
 
 		 495 aa  44.7  0.004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3298  outer membrane efflux protein  21.43 
 
 		 418 aa  44.3  0.004  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000000531453  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1502  RND efflux system outer membrane lipoprotein  21.82 
 
 		 514 aa  43.9  0.005  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.370375  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1727  type I secretion outer membrane protein, TolC family  25.97 
 
 		 452 aa  43.9  0.006  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.000000826676  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2724  outer membrane efflux protein  18.86 
 
 		 440 aa  43.5  0.006  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.190068  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_2001  LipD protein, putative  20.61 
 
 		 445 aa  43.9  0.006  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.538795  normal  1 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0996  RND efflux system outer membrane lipoprotein  21.82 
 
 		 498 aa  43.5  0.007  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0170  RND efflux system outer membrane lipoprotein  21.82 
 
 		 498 aa  43.5  0.007  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0737823  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0574  outer membrane efflux protein  21.58 
 
 		 427 aa  43.5  0.007  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  decreased coverage  0.00000581742  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4230  outer membrane efflux protein  24.43 
 
 		 458 aa  43.5  0.007  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0431504  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2559  RND efflux system outer membrane lipoprotein  21.47 
 
 		 527 aa  43.5  0.007  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1056  RND efflux system outer membrane lipoprotein  21.82 
 
 		 498 aa  43.5  0.007  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.14613  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0366  outer membrane efflux protein  26.12 
 
 		 437 aa  43.5  0.007  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3155  TolC family type I secretion outer membrane protein  22.71 
 
 		 482 aa  43.5  0.008  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.267117  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1721  TolC family type I secretion outer membrane protein  22.71 
 
 		 482 aa  43.5  0.008  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.456925  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3620  TolC family type I secretion outer membrane protein  22.71 
 
 		 482 aa  43.1  0.009  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0046  TolC family type I secretion outer membrane protein  22.71 
 
 		 471 aa  43.1  0.009  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3375  RND efflux system outer membrane lipoprotein  27.39 
 
 		 517 aa  43.1  0.009  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0151483  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2822  TolC family type I secretion outer membrane protein  22.71 
 
 		 479 aa  43.1  0.009  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.390937  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0611  TolC family type I secretion outer membrane protein  19.68 
 
 		 464 aa  43.1  0.009  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2680  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT family  24.46 
 
 		 490 aa  43.1  0.01  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1217  outer membrane efflux protein  36.17 
 
 		 438 aa  43.1  0.01  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.87899  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>