More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ppha_1633 on replicon NC_011060
Organism: Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011060  Ppha_1633  outer membrane efflux protein  100 
 
 		 470 aa  956    Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.788464  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1665  outer membrane efflux protein  58.11 
 
 		 464 aa  499  1e-140  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1531  outer membrane efflux protein  59.55 
 
 		 472 aa  477  1e-133  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1333  outer membrane efflux protein, putative  48.03 
 
 		 463 aa  413  1e-114  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1482  outer membrane efflux protein  49.12 
 
 		 471 aa  407  1.0000000000000001e-112  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.387043 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0986  outer membrane efflux protein, putative  50 
 
 		 484 aa  400  9.999999999999999e-111  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0066  outer membrane efflux protein  31.74 
 
 		 436 aa  146  6e-34  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0364  outer membrane channel protein  24.57 
 
 		 500 aa  132  2.0000000000000002e-29  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1671  outer membrane efflux protein  22.44 
 
 		 461 aa  99.4  1e-19  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3625  outer membrane efflux protein  24.52 
 
 		 525 aa  95.5  2e-18  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.262442  normal  0.276667 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01115  putative outer membrane transport/efflux protein  22.27 
 
 		 443 aa  92.4  2e-17  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0430  TolC family type I secretion outer membrane protein  23.29 
 
 		 436 aa  87.8  3e-16  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.0000114483  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1165  Outer membrane efflux protein  28.17 
 
 		 462 aa  86.3  0.000000000000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02621  outer membrane protein required for AvrXa21 activity C (raxC)  23.76 
 
 		 443 aa  85.9  0.000000000000001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0837  outer membrane efflux protein  24.79 
 
 		 462 aa  85.1  0.000000000000002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2367  outer membrane efflux protein  24.5 
 
 		 495 aa  85.1  0.000000000000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0679  outer membrane efflux protein  22.32 
 
 		 444 aa  85.1  0.000000000000003  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.0368289 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0662  outer membrane efflux protein  21.35 
 
 		 483 aa  84.7  0.000000000000004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_2069  TolC family type I secretion outer membrane protein  22.73 
 
 		 452 aa  84  0.000000000000006  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1177  outer membrane efflux protein  21.85 
 
 		 427 aa  83.2  0.00000000000001  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4181  outer membrane channel protein  22.8 
 
 		 449 aa  82  0.00000000000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2156  outer membrane export factor  22.47 
 
 		 452 aa  81.6  0.00000000000003  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2866  outer membrane efflux protein  20.21 
 
 		 480 aa  80.5  0.00000000000006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.0685652 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03690  outer membrane channel precursor protein  22.89 
 
 		 462 aa  79  0.0000000000002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  unclonable  0.0000344286  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3343  type I secretion outer membrane protein, TolC family  22.45 
 
 		 452 aa  77.8  0.0000000000004  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0278  outer membrane efflux protein  22.09 
 
 		 441 aa  77.4  0.0000000000005  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  unclonable  0.000000626538  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4268  outer membrane channel protein  24.6 
 
 		 497 aa  77  0.0000000000006  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.0102816 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1941  outer membrane efflux protein  21.35 
 
 		 432 aa  76.6  0.0000000000009  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS03674  putative outer membrane CHANEL lipoprotein  24.57 
 
 		 488 aa  74.7  0.000000000004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.119855 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0120  outer membrane efflux protein  21.65 
 
 		 448 aa  73.9  0.000000000005  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  unclonable  0.00000000165447  hitchhiker  0.000000000000561163 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0366  outer membrane efflux protein  21.23 
 
 		 437 aa  73.9  0.000000000005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5432  TolC family type I secretion outer membrane protein  23.65 
 
 		 553 aa  73.9  0.000000000005  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.199925  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_4004  acriflavin resistance protein  23.61 
 
 		 1470 aa  72.8  0.00000000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3126  outer membrane efflux protein  22.39 
 
 		 444 aa  72.4  0.00000000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0162  outer membrane efflux protein  23.11 
 
 		 433 aa  71.6  0.00000000003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1667  outer membrane efflux protein  22.93 
 
 		 455 aa  71.6  0.00000000003  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3626  outer membrane efflux protein  23.99 
 
 		 627 aa  71.6  0.00000000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0887926  normal  0.306741 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0833  outer membrane efflux protein  22.62 
 
 		 496 aa  71.2  0.00000000004  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3723  type I secretion outer membrane protein, TolC family  21.95 
 
 		 512 aa  70.9  0.00000000005  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4235  TolC family type I secretion outer membrane protein  23.28 
 
 		 463 aa  70.5  0.00000000006  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.902691  normal  0.529157 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3958  TolC family type I secretion outer membrane protein  23.49 
 
 		 491 aa  70.1  0.00000000007  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.753849  normal  0.338977 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2799  outer membrane efflux protein  21.95 
 
 		 435 aa  69.7  0.0000000001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  unclonable  0.0000000194078  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2350  outer membrane efflux protein  21.34 
 
 		 441 aa  69.3  0.0000000001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1727  type I secretion outer membrane protein, TolC family  23.33 
 
 		 452 aa  68.9  0.0000000002  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.000000826676  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0954  outer membrane efflux protein  21.4 
 
 		 463 aa  68.6  0.0000000002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0122  LipD protein, putative  22.02 
 
 		 413 aa  68.6  0.0000000002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2950  TolC family type I secretion outer membrane protein  24.35 
 
 		 479 aa  68.9  0.0000000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3628  TolC family type I secretion outer membrane protein  24.08 
 
 		 479 aa  68.2  0.0000000003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.93917  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1826  Type I secretion outer membrane protein, TolC  23.72 
 
 		 487 aa  68.2  0.0000000003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1085  RND efflux system outer membrane lipoprotein  23.46 
 
 		 486 aa  68.2  0.0000000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.377293  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0046  TolC family type I secretion outer membrane protein  24.08 
 
 		 471 aa  67.4  0.0000000005  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3737  outer membrane efflux protein  22.99 
 
 		 437 aa  67.4  0.0000000006  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.315415  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2822  TolC family type I secretion outer membrane protein  24.08 
 
 		 479 aa  67  0.0000000007  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.390937  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0283  outer membrane efflux protein  22.94 
 
 		 439 aa  67  0.0000000007  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00367785 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1721  TolC family type I secretion outer membrane protein  24.08 
 
 		 482 aa  67  0.0000000007  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.456925  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0366  putative secretion protein  22.79 
 
 		 454 aa  67  0.0000000007  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.676066  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3620  TolC family type I secretion outer membrane protein  24.08 
 
 		 482 aa  67  0.0000000007  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3155  TolC family type I secretion outer membrane protein  24.08 
 
 		 482 aa  67  0.0000000007  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.267117  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0384  outer membrane efflux protein  22.08 
 
 		 444 aa  67  0.0000000008  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.895564  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3231  TolC family type I secretion outer membrane protein  23.26 
 
 		 483 aa  66.6  0.000000001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3644  TolC family type I secretion outer membrane protein  23.82 
 
 		 471 aa  66.6  0.000000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2639  TolC family type I secretion outer membrane protein  25.08 
 
 		 461 aa  66.2  0.000000001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0447  Fis family transcriptional regulator  22.66 
 
 		 512 aa  66.6  0.000000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.818927 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1131  outer membrane efflux protein  22.32 
 
 		 364 aa  65.9  0.000000002  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5878  TolC family type I secretion outer membrane protein  24.21 
 
 		 463 aa  65.5  0.000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.539647  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1690  type I secretion outer membrane protein, TolC family  24.59 
 
 		 478 aa  65.5  0.000000002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.522729 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0242  outer membrane efflux protein  21.66 
 
 		 444 aa  65.5  0.000000002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.231209  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3777  outer membrane channel protein  25.07 
 
 		 470 aa  65.5  0.000000002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3056  outer membrane efflux protein  23.02 
 
 		 485 aa  64.7  0.000000003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.111107 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2441  outer membrane efflux protein  22.34 
 
 		 453 aa  64.7  0.000000003  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3853  outer membrane efflux protein  23.48 
 
 		 447 aa  64.7  0.000000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1884  outer membrane efflux protein  20.67 
 
 		 483 aa  64.7  0.000000003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0063  outer membrane efflux protein  21.73 
 
 		 408 aa  64.7  0.000000004  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.0180654  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1453  type I secretion outer membrane protein, TolC family  24.85 
 
 		 480 aa  63.9  0.000000005  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1761  hypothetical protein  23.9 
 
 		 576 aa  63.9  0.000000006  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4942  outer membrane efflux protein  24.65 
 
 		 449 aa  63.5  0.000000007  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.755187  normal  0.782486 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0733  outer membrane efflux protein, putative  19.86 
 
 		 463 aa  63.9  0.000000007  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00869  outer membrane channel protein  23.08 
 
 		 445 aa  63.5  0.000000008  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3619  outer membrane channel protein  23.71 
 
 		 469 aa  62.8  0.00000001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2026  TolC family type I secretion outer membrane protein  22.83 
 
 		 405 aa  62.8  0.00000001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.341805  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1041  type I secretion outer membrane efflux protein  22.15 
 
 		 451 aa  63.2  0.00000001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1217  outer membrane efflux protein  20.15 
 
 		 438 aa  62.4  0.00000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.87899  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2352  TolC family type I secretion outer membrane protein  22.84 
 
 		 446 aa  62  0.00000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0627  outer membrane efflux protein, putative  21.66 
 
 		 470 aa  62.4  0.00000002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.173588  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0313  outer membrane channel protein  23.11 
 
 		 463 aa  62  0.00000002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2517  Outer membrane efflux protein  22.29 
 
 		 455 aa  61.2  0.00000003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0940003  normal  0.677218 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6495  type I secretion outer membrane protein, TolC family  23.23 
 
 		 518 aa  61.6  0.00000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0183  outer membrane efflux protein  20.35 
 
 		 441 aa  61.6  0.00000003  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1804  TolC family type I secretion outer membrane protein  22.22 
 
 		 451 aa  61.2  0.00000003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.894432  normal  0.601876 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2659  outer membrane efflux protein  21.71 
 
 		 436 aa  61.6  0.00000003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2259  RND efflux system outer membrane lipoprotein  26.71 
 
 		 508 aa  61.2  0.00000003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.324035  normal  0.22709 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1364  RND efflux system outer membrane lipoprotein  26.92 
 
 		 500 aa  61.2  0.00000004  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0424146 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2818  TolC family type I secretion outer membrane protein  23.47 
 
 		 469 aa  61.2  0.00000004  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.282777  normal  0.979363 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1021  outer membrane efflux protein  21.58 
 
 		 528 aa  61.2  0.00000004  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2338  efflux ABC transporter outer membrane protein  26.09 
 
 		 470 aa  61.2  0.00000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3621  outer membrane efflux protein  22.66 
 
 		 477 aa  60.8  0.00000005  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.21353  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1203  outer membrane efflux protein  21.49 
 
 		 497 aa  60.8  0.00000005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2604  Type I secretion outer membrane protein, TolC  21.33 
 
 		 442 aa  60.8  0.00000005  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0814  outer membrane efflux protein  20.67 
 
 		 460 aa  60.8  0.00000005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3801  outer membrane efflux protein  24.18 
 
 		 449 aa  60.5  0.00000007  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.233057 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>