More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene HY04AAS1_0849 on replicon NC_011126
Organism: Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011126  HY04AAS1_0849  outer membrane efflux protein  100 
 
 		 417 aa  838    Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000450472  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1380  outer membrane efflux protein  27.34 
 
 		 425 aa  144  4e-33  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0961  Outer membrane protein-like  25.62 
 
 		 491 aa  106  8e-22  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0234127  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1376  Outer membrane efflux protein  23.82 
 
 		 435 aa  105  1e-21  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.109779  hitchhiker  0.00244241 
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4182  outer membrane efflux protein  23.56 
 
 		 431 aa  105  2e-21  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.256436  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2704  outer membrane efflux protein  22.82 
 
 		 423 aa  100  4e-20  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1482  outer membrane efflux protein  23.86 
 
 		 426 aa  100  5e-20  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.979092  n/a   
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5561  outer membrane efflux protein  23.12 
 
 		 431 aa  97.8  3e-19  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0574  outer membrane efflux protein  29.43 
 
 		 427 aa  97.8  3e-19  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  decreased coverage  0.00000581742  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2441  outer membrane efflux protein  22.2 
 
 		 453 aa  96.7  6e-19  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2799  outer membrane efflux protein  25.06 
 
 		 435 aa  92.4  1e-17  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  unclonable  0.0000000194078  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3129  Outer membrane efflux protein  23.27 
 
 		 446 aa  91.3  3e-17  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.000215977  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1990  outer membrane efflux protein  22.86 
 
 		 471 aa  89.4  1e-16  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.154832  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2365  outer membrane efflux protein  24.63 
 
 		 482 aa  87.8  3e-16  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.316372 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2633  outer membrane efflux protein  27.93 
 
 		 424 aa  87.8  3e-16  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0391  Outer membrane efflux family protein  22.12 
 
 		 437 aa  85.5  0.000000000000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3627  outer membrane efflux protein  21.98 
 
 		 461 aa  85.5  0.000000000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.433273  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1749  outer membrane efflux protein  25.4 
 
 		 458 aa  82.4  0.00000000000001  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1884  outer membrane efflux protein  21.72 
 
 		 483 aa  82.8  0.00000000000001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3801  outer membrane efflux protein  22.33 
 
 		 449 aa  82  0.00000000000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.233057 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0057  outer membrane protein, putative  23.53 
 
 		 470 aa  80.1  0.00000000000007  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0627  outer membrane efflux protein, putative  21.63 
 
 		 470 aa  79.7  0.00000000000009  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.173588  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0224  outer membrane efflux protein  21.93 
 
 		 419 aa  78.6  0.0000000000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.000720591  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0837  outer membrane efflux protein  21.51 
 
 		 462 aa  77  0.0000000000006  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3496  outer membrane efflux protein  22.25 
 
 		 565 aa  76.6  0.0000000000007  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0283  outer membrane efflux protein  22.28 
 
 		 439 aa  76.6  0.0000000000008  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00367785 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1633  outer membrane efflux protein  20.05 
 
 		 420 aa  75.9  0.000000000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.159543  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4230  outer membrane efflux protein  25.61 
 
 		 458 aa  75.9  0.000000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0431504  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1617  outer membrane efflux protein  22.52 
 
 		 467 aa  76.3  0.000000000001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1217  outer membrane efflux protein  25.68 
 
 		 438 aa  75.5  0.000000000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.87899  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1177  outer membrane efflux protein  23.16 
 
 		 427 aa  75.1  0.000000000002  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0833  outer membrane efflux protein  20.45 
 
 		 496 aa  74.7  0.000000000003  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1606  outer membrane efflux protein  22.68 
 
 		 421 aa  74.7  0.000000000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1525  outer membrane efflux protein  27.47 
 
 		 442 aa  73.9  0.000000000005  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.000580745  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0096  outer membrane efflux protein  22.7 
 
 		 441 aa  73.9  0.000000000005  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3853  outer membrane efflux protein  21.96 
 
 		 447 aa  73.6  0.000000000006  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0831  outer membrane efflux protein  21.33 
 
 		 419 aa  73.6  0.000000000006  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0546  TolC family type I secretion outer membrane protein  21.24 
 
 		 444 aa  73.6  0.000000000006  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1415  Type I secretion outer membrane protein, TolC  20.05 
 
 		 472 aa  73.2  0.000000000007  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.000000596226  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2629  outer membrane efflux protein  21.39 
 
 		 421 aa  73.2  0.000000000007  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.111539  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1390  outer membrane efflux protein  25.71 
 
 		 463 aa  73.2  0.000000000007  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.0182398  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003403  agglutination protein  23.08 
 
 		 436 aa  73.2  0.000000000008  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.000998881  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0733  outer membrane efflux protein, putative  20.72 
 
 		 463 aa  71.6  0.00000000003  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05030  outer membrane efflux protein  20.71 
 
 		 471 aa  71.2  0.00000000003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.691581  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0863  outer membrane efflux protein  22.38 
 
 		 476 aa  71.6  0.00000000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.0409869  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02379  hypothetical protein  21.03 
 
 		 436 aa  70.9  0.00000000005  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3409  outer membrane efflux protein  22.47 
 
 		 419 aa  69.3  0.0000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000000155286  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3937  outer membrane efflux protein  22.99 
 
 		 447 aa  69.3  0.0000000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00157367 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0063  outer membrane efflux protein  20.99 
 
 		 408 aa  68.6  0.0000000002  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.0180654  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1779  outer membrane efflux protein  23.44 
 
 		 444 aa  68.9  0.0000000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0223897  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4162  outer membrane efflux protein  23.29 
 
 		 443 aa  68.9  0.0000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  decreased coverage  0.00000533026  normal  0.288124 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1143  outer membrane efflux protein  25.11 
 
 		 455 aa  67.8  0.0000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0286987  normal  0.128527 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0042  outer membrane efflux protein  21.66 
 
 		 454 aa  67.4  0.0000000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.293166 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3626  outer membrane efflux protein  22.33 
 
 		 627 aa  66.6  0.0000000007  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0887926  normal  0.306741 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0605  outer membrane efflux protein  22.61 
 
 		 470 aa  66.2  0.0000000009  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3429  outer membrane efflux protein  22.04 
 
 		 442 aa  66.2  0.000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.437271  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1475  outer membrane efflux protein  22.12 
 
 		 449 aa  65.9  0.000000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.236212  normal  0.298581 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3096  outer membrane efflux protein  18.6 
 
 		 497 aa  65.9  0.000000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6215  outer membrane efflux protein  22.36 
 
 		 493 aa  65.1  0.000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.811282  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0366  putative secretion protein  20.72 
 
 		 454 aa  65.1  0.000000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.676066  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3625  outer membrane efflux protein  19.73 
 
 		 525 aa  65.1  0.000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.262442  normal  0.276667 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1671  outer membrane efflux protein  21 
 
 		 461 aa  65.1  0.000000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2154  outer membrane protein CyaE, putative  20.98 
 
 		 453 aa  64.3  0.000000003  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5506  outer membrane efflux protein  21.25 
 
 		 451 aa  64.7  0.000000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.307266  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0532  outer membrane efflux protein  22.55 
 
 		 578 aa  64.7  0.000000003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.52231  normal  0.0114882 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0453  Outer membrane efflux protein  23.83 
 
 		 470 aa  64.7  0.000000003  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0515  outer membrane efflux protein  22.55 
 
 		 578 aa  64.7  0.000000003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1027  outer membrane efflux protein  21.89 
 
 		 452 aa  63.9  0.000000005  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0278  outer membrane efflux protein  19.27 
 
 		 441 aa  63.9  0.000000005  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  unclonable  0.000000626538  normal  1 
 
 
-
 
NC_008607  Ppro_3710  outer membrane efflux protein  20.95 
 
 		 419 aa  63.5  0.000000006  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1773  outer membrane efflux protein  24.25 
 
 		 435 aa  63.2  0.000000009  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0950  outer membrane efflux protein  21.64 
 
 		 424 aa  62.4  0.00000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2724  outer membrane efflux protein  21.05 
 
 		 440 aa  62.8  0.00000001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.190068  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0582  outer membrane efflux protein  22.34 
 
 		 464 aa  62.8  0.00000001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3465  Outer membrane efflux protein  22.52 
 
 		 441 aa  62.8  0.00000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1761  hypothetical protein  22.69 
 
 		 576 aa  62.4  0.00000001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0762  outer membrane efflux protein  21.98 
 
 		 446 aa  62.8  0.00000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1015  Outer membrane efflux protein  22.64 
 
 		 731 aa  62  0.00000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.0127212 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_4004  acriflavin resistance protein  20.15 
 
 		 1470 aa  61.2  0.00000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_5078  outer membrane efflux protein  22.6 
 
 		 635 aa  61.6  0.00000003  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.851054  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4090  outer membrane efflux protein  22.6 
 
 		 473 aa  61.2  0.00000004  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2021  outer membrane efflux protein  23.08 
 
 		 437 aa  60.8  0.00000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0066  outer membrane efflux protein  20.95 
 
 		 436 aa  60.5  0.00000005  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1875  type I secretion outer membrane protein, TolC family  24.16 
 
 		 476 aa  60.1  0.00000006  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4505  outer membrane efflux protein  19.95 
 
 		 972 aa  60.5  0.00000006  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.300614  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2692  outer membrane efflux protein  19.27 
 
 		 442 aa  60.1  0.00000007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.922433  normal  0.254416 
 
 
-
 
NC_002978  WD0068  outer membrane protein TolC, putative  22.36 
 
 		 407 aa  60.1  0.00000007  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.896077  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2630  Type I secretion outer membrane protein, TolC  19.94 
 
 		 489 aa  60.1  0.00000007  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1174  outer membrane efflux protein  20.54 
 
 		 457 aa  59.7  0.00000008  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.89041 
 
 
-
 
NC_002950  PG0538  outer membrane efflux protein  21.35 
 
 		 462 aa  59.7  0.00000009  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1462  Type I secretion outer membrane protein, TolC  19.67 
 
 		 452 aa  59.7  0.00000009  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2664  outer membrane efflux protein  19.6 
 
 		 1496 aa  59.3  0.0000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3165  outer membrane efflux protein  21.5 
 
 		 445 aa  58.9  0.0000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.391786  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0562  type I secretion outer membrane protein, TolC family  18.84 
 
 		 450 aa  59.7  0.0000001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2330  RND family outer membrane efflux protein  21.04 
 
 		 594 aa  59.7  0.0000001  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1181  Outer membrane protein-like  24.14 
 
 		 606 aa  59.3  0.0000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0751  putative outer membrane component of efflux system  23.6 
 
 		 419 aa  59.7  0.0000001  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3464  outer membrane efflux protein  22.26 
 
 		 489 aa  59.7  0.0000001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0487  outer membrane efflux protein  22.26 
 
 		 489 aa  59.3  0.0000001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3730  outer membrane efflux protein  23.18 
 
 		 477 aa  59.3  0.0000001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>