55 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cla_0986 on replicon NC_012039
Organism: Campylobacter lari RM2100



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012039  Cla_0986  outer membrane component of efflux system  100 
 
 		 418 aa  820    Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.942426  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1050  hypothetical protein  50.12 
 
 		 424 aa  372  1e-102  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0751  putative outer membrane component of efflux system  49.39 
 
 		 419 aa  363  3e-99  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1272  hypothetical protein  36.71 
 
 		 421 aa  218  1e-55  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.0746699  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0688  L-seryl-tRNA(Sec) selenium transferase  35.44 
 
 		 421 aa  197  3e-49  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.207036  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0977  outer membrane efflux protein  29.14 
 
 		 410 aa  140  3.9999999999999997e-32  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.0000084232  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0534  Outer membrane efflux protein  30.07 
 
 		 410 aa  126  8.000000000000001e-28  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1442  Outer membrane efflux protein  26.81 
 
 		 408 aa  95.5  1e-18  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  decreased coverage  0.00437405  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1275  hypothetical protein  24.48 
 
 		 411 aa  80.5  0.00000000000005  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.0000302349  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0685  putative periplasmic protein  21.81 
 
 		 411 aa  57  0.0000006  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.61811  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1633  outer membrane efflux protein  23.68 
 
 		 470 aa  52.8  0.00001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.788464  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2639  TolC family type I secretion outer membrane protein  21.61 
 
 		 461 aa  52.8  0.00001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1531  outer membrane efflux protein  23.08 
 
 		 472 aa  49.3  0.0001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0986  outer membrane efflux protein, putative  27.36 
 
 		 484 aa  48.9  0.0002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1665  outer membrane efflux protein  21.23 
 
 		 464 aa  48.5  0.0002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3257  Type I secretion outer membrane protein, TolC  21.32 
 
 		 462 aa  47.8  0.0004  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.30122  normal  0.885594 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1085  RND efflux system outer membrane lipoprotein  23.77 
 
 		 486 aa  47  0.0006  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.377293  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3645  outer membrane efflux protein  23.01 
 
 		 514 aa  45.8  0.001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.784148  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4722  outer membrane efflux protein  23.01 
 
 		 514 aa  45.8  0.001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0674524  decreased coverage  0.00195148 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0979  outer membrane efflux protein  20.13 
 
 		 375 aa  45.8  0.001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.2318 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5578  outer membrane efflux protein  23.01 
 
 		 514 aa  45.8  0.001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0232692  hitchhiker  0.00628536 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3360  type I secretion outer membrane protein, TolC family protein  21.63 
 
 		 444 aa  45.8  0.001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.21716  normal  0.12144 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0499  RND efflux system outer membrane lipoprotein  19.69 
 
 		 546 aa  46.2  0.001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.16116  normal  0.32958 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3129  Outer membrane efflux protein  23.73 
 
 		 446 aa  45.1  0.002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.000215977  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3093  outer membrane protein  20.49 
 
 		 503 aa  45.4  0.002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  7.56103e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1522  RND efflux system outer membrane lipoprotein  24.02 
 
 		 485 aa  45.1  0.003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_10330  putative outer membrane protein precursor  22.04 
 
 		 471 aa  44.7  0.003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.339948  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1545  RND efflux system outer membrane lipoprotein  24.02 
 
 		 485 aa  44.7  0.003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.355658 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02857  hypothetical protein  21.02 
 
 		 493 aa  44.3  0.004  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0665  type I secretion outer membrane protein, TolC family  21.02 
 
 		 493 aa  44.3  0.004  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3499  outer membrane channel protein  21.02 
 
 		 495 aa  44.3  0.004  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0404091  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0662  outer membrane channel protein  21.02 
 
 		 493 aa  44.3  0.004  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.120975  normal  0.0171626 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3330  outer membrane channel protein  21.02 
 
 		 493 aa  44.3  0.004  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2799  RND efflux system outer membrane lipoprotein  22.86 
 
 		 495 aa  44.3  0.004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02907  outer membrane channel precursor protein  21.02 
 
 		 493 aa  44.3  0.004  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2883  TolC family type I secretion outer membrane protein  24.43 
 
 		 442 aa  44.3  0.004  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.00170075  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3448  outer membrane channel protein  21.83 
 
 		 494 aa  44.3  0.004  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.203909 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3213  outer membrane channel protein  21.02 
 
 		 495 aa  44.3  0.004  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00955114  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2604  Type I secretion outer membrane protein, TolC  20.3 
 
 		 442 aa  44.3  0.004  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4769  RND efflux system outer membrane lipoprotein  22.49 
 
 		 485 aa  44.3  0.005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.482827  normal  0.462892 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4349  outer membrane channel protein  21.02 
 
 		 493 aa  43.9  0.005  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.823303  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1450  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT  24.38 
 
 		 471 aa  44.3  0.005  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1949  RND efflux system outer membrane lipoprotein  25.1 
 
 		 459 aa  43.9  0.005  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0722  TolC family type I secretion outer membrane protein  19.55 
 
 		 449 aa  43.9  0.006  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.278359  normal  0.698539 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1333  outer membrane efflux protein, putative  21.08 
 
 		 463 aa  43.9  0.006  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0391  Outer membrane efflux family protein  24.14 
 
 		 437 aa  43.9  0.006  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3360  RND efflux system outer membrane lipoprotein  22.43 
 
 		 494 aa  43.5  0.007  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.414328  hitchhiker  0.00000000121747 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1054  outer membrane efflux protein  22.73 
 
 		 514 aa  43.5  0.007  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.000452487  normal  0.217723 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3212  putative outer membrane protein  22.67 
 
 		 494 aa  43.5  0.007  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3468  outer membrane channel protein  20.75 
 
 		 495 aa  43.1  0.008  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0175451  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0903  outer membrane efflux protein  20.19 
 
 		 436 aa  43.1  0.009  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.331424  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2443  RND efflux system outer membrane lipoprotein  25.29 
 
 		 544 aa  43.1  0.009  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.167735  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03690  outer membrane channel precursor protein  19.95 
 
 		 462 aa  43.1  0.009  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  unclonable  0.0000344286  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0945  secretion protein  21.29 
 
 		 472 aa  43.1  0.009  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2439  TolC family type I secretion outer membrane protein  18.6 
 
 		 443 aa  43.1  0.01  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.690734 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>