More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sala_1450 on replicon NC_008048
Organism: Sphingopyxis alaskensis RB2256



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008048  Sala_1450  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT  100 
 
 
471 aa  920    Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3444  RND efflux system outer membrane lipoprotein  46.44 
 
 
495 aa  388  1e-106  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.960604 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3442  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT  47.23 
 
 
496 aa  384  1e-105  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.811835  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3424  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT family  44.52 
 
 
514 aa  376  1e-103  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0516  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT  47.19 
 
 
500 aa  377  1e-103  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0482869  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0009  drug efflux lipoprotein  44.56 
 
 
514 aa  375  1e-102  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.347699  normal  0.0645676 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3747  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT family  44.14 
 
 
514 aa  374  1e-102  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.846743  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2338  efflux ABC transporter outer membrane protein  47.9 
 
 
470 aa  372  1e-102  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2178  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT family  47.03 
 
 
479 aa  372  1e-102  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0549  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT family  47.14 
 
 
501 aa  367  1e-100  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.569542  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0169  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT  45.15 
 
 
493 aa  366  1e-100  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000204876 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2695  outer membrane efflux protein  44.89 
 
 
512 aa  364  2e-99  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0811  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT  45.55 
 
 
517 aa  363  4e-99  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000173561 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3590  RND efflux system outer membrane lipoprotein NodT  46.81 
 
 
491 aa  362  6e-99  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3497  RND efflux system outer membrane lipoprotein  44.14 
 
 
470 aa  362  7.0000000000000005e-99  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0545  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT family  46.1 
 
 
470 aa  360  3e-98  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.540838  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2885  RND efflux system outer membrane lipoprotein  46.1 
 
 
495 aa  359  5e-98  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.183945  normal  0.24109 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2052  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT  43.92 
 
 
499 aa  357  2.9999999999999997e-97  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3256  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT family  40.87 
 
 
525 aa  356  5e-97  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.865648 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0567  RND efflux system outer membrane lipoprotein  47.7 
 
 
483 aa  355  1e-96  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0480  RND efflux system outer membrane lipoprotein  42.36 
 
 
505 aa  352  8.999999999999999e-96  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.0104002 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0440  RND efflux system, outer membrane protein  46.3 
 
 
509 aa  348  8e-95  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2367  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT family  44.66 
 
 
474 aa  348  9e-95  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4088  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT  44.79 
 
 
489 aa  348  1e-94  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.947344  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3433  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT family  44.03 
 
 
477 aa  347  3e-94  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2037  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT  44.51 
 
 
489 aa  347  3e-94  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.248346  normal  0.0238408 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0710  RND efflux system outer membrane lipoprotein  42.71 
 
 
515 aa  346  4e-94  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.437206  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2064  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT  45.95 
 
 
499 aa  346  5e-94  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0499  RND efflux system outer membrane lipoprotein  44.47 
 
 
485 aa  346  6e-94  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3271  outer membrane efflux protein OprA  46.29 
 
 
467 aa  343  2.9999999999999997e-93  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0323  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT family  44.54 
 
 
496 aa  343  4e-93  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.501802  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3925  multidrug efflux system protein  45.34 
 
 
499 aa  342  8e-93  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.000000707781  normal 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5881  RND efflux system outer membrane lipoprotein  47.05 
 
 
497 aa  342  9e-93  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2963  putative outer membrane drug efflux lipoprotein  44.88 
 
 
487 aa  342  1e-92  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1686  RND efflux system outer membrane lipoprotein NodT  44.09 
 
 
516 aa  341  2e-92  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.108559  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2072  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT family  44.86 
 
 
495 aa  340  2.9999999999999998e-92  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0610186  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0121  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT family  42.08 
 
 
469 aa  340  2.9999999999999998e-92  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0329  RND efflux system outer membrane lipoprotein  40.94 
 
 
474 aa  339  5.9999999999999996e-92  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6609  RND efflux system outer membrane lipoprotein  43.16 
 
 
510 aa  339  7e-92  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.64888  normal  0.8754 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1851  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT family  44.03 
 
 
474 aa  338  8e-92  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.170655 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1195  RND efflux system outer membrane lipoprotein  43.78 
 
 
482 aa  338  9e-92  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.000171892  normal  0.38657 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2209  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT  45.43 
 
 
472 aa  338  9.999999999999999e-92  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0506  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT family  45.53 
 
 
492 aa  338  1.9999999999999998e-91  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5938  RND efflux system outer membrane lipoprotein  42.36 
 
 
507 aa  338  1.9999999999999998e-91  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0183223  normal  0.547092 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1416  RND efflux system outer membrane lipoprotein NodT  46.44 
 
 
469 aa  336  3.9999999999999995e-91  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1024  RND efflux system outer membrane lipoprotein  42.38 
 
 
484 aa  334  2e-90  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.484622  normal  0.130102 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2774  Outer membrane protein  44.95 
 
 
508 aa  334  2e-90  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0316  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT family  44.22 
 
 
481 aa  334  3e-90  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.464824  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0141  RND efflux system, outer membrane protein  44.95 
 
 
506 aa  333  4e-90  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2631  NodT family efflux transporter outer membrane lipoprotein  44.95 
 
 
508 aa  333  4e-90  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1312  NodT family efflux transporter outer membrane lipoprotein  44.95 
 
 
508 aa  333  4e-90  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1037  RND efflux system, outer membrane protein  44.95 
 
 
508 aa  333  4e-90  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2529  RND efflux system outer membrane lipoprotein  44.42 
 
 
485 aa  333  4e-90  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.918806  normal 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0168  NodT family efflux transporter outer membrane lipoprotein  44.95 
 
 
508 aa  333  4e-90  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0618806  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0761  RND efflux system outer membrane lipoprotein  47.46 
 
 
491 aa  333  5e-90  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4009  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT  42.41 
 
 
486 aa  332  7.000000000000001e-90  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0874069  normal  0.0174443 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6208  RND efflux system outer membrane lipoprotein  44.54 
 
 
497 aa  332  9e-90  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.842439  normal  0.408471 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3894  RND efflux system outer membrane lipoprotein  45.26 
 
 
476 aa  332  9e-90  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4472  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT  45.26 
 
 
476 aa  332  9e-90  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.621832  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3633  RND efflux system outer membrane lipoprotein  45.26 
 
 
476 aa  332  9e-90  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3717  RND efflux system outer membrane lipoprotein  44.13 
 
 
477 aa  331  1e-89  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_05550  major intrinsic multiple antibiotic resistance efflux outer membrane protein OprM precursor  43.71 
 
 
485 aa  331  2e-89  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.203755  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0775  RND efflux system outer membrane lipoprotein  41.54 
 
 
476 aa  330  3e-89  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2510  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT family  43.05 
 
 
465 aa  330  4e-89  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0527  outer membrane protein OprM precursor  43.71 
 
 
485 aa  330  5.0000000000000004e-89  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.71666  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2606  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT  41.23 
 
 
478 aa  329  7e-89  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  decreased coverage  0.0037798  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3490  RND efflux system outer membrane lipoprotein  40.64 
 
 
503 aa  328  9e-89  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.350691 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0321  RND efflux system outer membrane lipoprotein  44.54 
 
 
480 aa  327  2.0000000000000001e-88  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.877077 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4429  RND efflux system outer membrane lipoprotein  41.96 
 
 
484 aa  327  2.0000000000000001e-88  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.305214  normal  0.0579633 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1384  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT family  41.96 
 
 
484 aa  327  3e-88  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.285433 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4339  RND efflux system outer membrane lipoprotein  41.96 
 
 
484 aa  327  3e-88  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0952934  normal  0.254961 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0682  RND efflux system outer membrane lipoprotein  42.64 
 
 
519 aa  327  3e-88  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.323921  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0532  RND efflux system outer membrane lipoprotein  42.61 
 
 
475 aa  327  4.0000000000000003e-88  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.17075 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4027  RND efflux system outer membrane lipoprotein  45.14 
 
 
467 aa  327  4.0000000000000003e-88  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.296212  normal  0.401422 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1286  RND efflux system outer membrane lipoprotein  42.64 
 
 
543 aa  327  4.0000000000000003e-88  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.556611  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0317  RND efflux system outer membrane lipoprotein  42.43 
 
 
514 aa  325  1e-87  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.34053  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0381  outer membrane efflux protein OprB  42.43 
 
 
553 aa  325  1e-87  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3466  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT family  44.26 
 
 
461 aa  325  1e-87  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1278  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT  42.68 
 
 
486 aa  325  1e-87  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.00202436  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2636  RND efflux system outer membrane lipoprotein  41.94 
 
 
507 aa  325  1e-87  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0612  RND efflux system outer membrane lipoprotein  42.43 
 
 
514 aa  325  1e-87  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.904611  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2654  RND efflux system outer membrane lipoprotein  41.32 
 
 
507 aa  325  1e-87  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0354944  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RSp0311  outer membrane CHANEL lipoprotein  43.8 
 
 
476 aa  324  2e-87  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.564157  normal  0.11877 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1046  RND efflux system outer membrane lipoprotein  42.43 
 
 
512 aa  324  2e-87  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0861  outer membrane efflux protein OprB  42.43 
 
 
514 aa  325  2e-87  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.89354  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1020  outer membrane efflux protein  42.43 
 
 
514 aa  325  2e-87  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.224609  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0080  RND efflux system outer membrane lipoprotein  42.43 
 
 
551 aa  324  2e-87  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1582  outer membrane efflux protein OprB  42.43 
 
 
512 aa  324  2e-87  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1203  outer membrane efflux protein OprB  42.43 
 
 
512 aa  324  2e-87  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.21076  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2527  RND efflux system outer membrane lipoprotein  41.12 
 
 
507 aa  324  2e-87  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.10146 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0856  outer membrane efflux protein OprB  42.43 
 
 
514 aa  325  2e-87  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0033  outer membrane efflux protein OprB  42.43 
 
 
512 aa  324  2e-87  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0387  Fis family transcriptional regulator  45.91 
 
 
492 aa  323  3e-87  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4305  outer membrane efflux protein  41.44 
 
 
486 aa  323  4e-87  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1951  RND efflux system outer membrane lipoprotein  41.58 
 
 
480 aa  323  5e-87  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1499  outer membrane efflux protein OprB  42.22 
 
 
512 aa  323  5e-87  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.112473  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS01890  outer membrane drug efflux lipoprotein  44.29 
 
 
491 aa  323  6e-87  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0642226  normal  0.753424 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0383  outer membrane protein OprM  43.23 
 
 
485 aa  322  7e-87  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0060  RND efflux system outer membrane lipoprotein  42.22 
 
 
514 aa  322  8e-87  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0428433  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2447  RND efflux system outer membrane lipoprotein  42.22 
 
 
514 aa  322  8e-87  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>