281 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cag_0986 on replicon NC_007514
Organism: Chlorobium chlorochromatii CaD3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007514  Cag_0986  outer membrane efflux protein, putative  100 
 
 		 484 aa  968    Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1665  outer membrane efflux protein  52.44 
 
 		 464 aa  434  1e-120  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1633  outer membrane efflux protein  48.82 
 
 		 470 aa  419  1e-116  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.788464  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1531  outer membrane efflux protein  51.13 
 
 		 472 aa  391  1e-107  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1482  outer membrane efflux protein  46.99 
 
 		 471 aa  388  1e-106  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.387043 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1333  outer membrane efflux protein, putative  46.58 
 
 		 463 aa  374  1e-102  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0066  outer membrane efflux protein  29.72 
 
 		 436 aa  136  7.000000000000001e-31  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0364  outer membrane channel protein  26.55 
 
 		 500 aa  125  2e-27  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01115  putative outer membrane transport/efflux protein  23.67 
 
 		 443 aa  94.7  3e-18  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0662  outer membrane efflux protein  22.54 
 
 		 483 aa  92  2e-17  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0814  outer membrane efflux protein  24.14 
 
 		 460 aa  88.2  3e-16  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0679  outer membrane efflux protein  23.43 
 
 		 444 aa  87.8  4e-16  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.0368289 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2724  outer membrane efflux protein  23.92 
 
 		 440 aa  83.2  0.00000000000001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.190068  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0242  outer membrane efflux protein  24.4 
 
 		 444 aa  80.1  0.00000000000008  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.231209  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1671  outer membrane efflux protein  22.07 
 
 		 461 aa  79  0.0000000000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_2001  LipD protein, putative  25.7 
 
 		 445 aa  78.2  0.0000000000003  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.538795  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0278  outer membrane efflux protein  23.15 
 
 		 441 aa  78.2  0.0000000000003  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  unclonable  0.000000626538  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0066  outer membrane efflux protein  24.77 
 
 		 443 aa  77.8  0.0000000000004  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2441  outer membrane efflux protein  23.58 
 
 		 453 aa  77.4  0.0000000000005  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0733  outer membrane efflux protein, putative  24.01 
 
 		 463 aa  77.4  0.0000000000005  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0627  outer membrane efflux protein, putative  25.11 
 
 		 470 aa  76.6  0.0000000000009  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.173588  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1804  TolC family type I secretion outer membrane protein  26.81 
 
 		 451 aa  76.6  0.0000000000009  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.894432  normal  0.601876 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0120  outer membrane efflux protein  20.62 
 
 		 448 aa  75.5  0.000000000002  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  unclonable  0.00000000165447  hitchhiker  0.000000000000561163 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2664  outer membrane efflux protein  25.22 
 
 		 1496 aa  74.7  0.000000000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1941  outer membrane efflux protein  22.56 
 
 		 432 aa  74.7  0.000000000003  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2866  outer membrane efflux protein  22.11 
 
 		 480 aa  73.9  0.000000000006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.0685652 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2367  outer membrane efflux protein  25.84 
 
 		 495 aa  73.6  0.000000000007  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0833  outer membrane efflux protein  21.49 
 
 		 496 aa  73.2  0.00000000001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0183  outer membrane efflux protein  22.15 
 
 		 441 aa  73.2  0.00000000001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0162  outer membrane efflux protein  24.32 
 
 		 433 aa  72.4  0.00000000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3625  outer membrane efflux protein  23.51 
 
 		 525 aa  72  0.00000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.262442  normal  0.276667 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0962  outer membrane efflux protein  23.56 
 
 		 464 aa  71.6  0.00000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  unclonable  0.000000066626  normal  0.118679 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2950  TolC family type I secretion outer membrane protein  25.85 
 
 		 479 aa  71.6  0.00000000003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0122  LipD protein, putative  22.77 
 
 		 413 aa  70.9  0.00000000005  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0384  outer membrane efflux protein  22.69 
 
 		 444 aa  70.1  0.00000000008  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.895564  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3628  TolC family type I secretion outer membrane protein  25.85 
 
 		 479 aa  70.1  0.0000000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.93917  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1177  outer membrane efflux protein  21.24 
 
 		 427 aa  69.7  0.0000000001  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2517  Outer membrane efflux protein  24.94 
 
 		 455 aa  69.7  0.0000000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0940003  normal  0.677218 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1203  outer membrane efflux protein  23.87 
 
 		 497 aa  69.7  0.0000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1617  outer membrane efflux protein  21.71 
 
 		 467 aa  69.7  0.0000000001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1126  TolC family type I secretion outer membrane protein  24.21 
 
 		 450 aa  69.3  0.0000000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2822  TolC family type I secretion outer membrane protein  25.85 
 
 		 479 aa  68.6  0.0000000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.390937  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1721  TolC family type I secretion outer membrane protein  25.85 
 
 		 482 aa  68.6  0.0000000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.456925  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3155  TolC family type I secretion outer membrane protein  25.85 
 
 		 482 aa  68.6  0.0000000002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.267117  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0046  TolC family type I secretion outer membrane protein  25.85 
 
 		 471 aa  68.6  0.0000000002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3627  outer membrane efflux protein  23 
 
 		 461 aa  68.9  0.0000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.433273  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2350  outer membrane efflux protein  23.45 
 
 		 441 aa  68.9  0.0000000002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3644  TolC family type I secretion outer membrane protein  25.79 
 
 		 471 aa  68.2  0.0000000003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3626  outer membrane efflux protein  24.06 
 
 		 627 aa  68.2  0.0000000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0887926  normal  0.306741 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3620  TolC family type I secretion outer membrane protein  25.85 
 
 		 482 aa  68.6  0.0000000003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0366  outer membrane efflux protein  22.46 
 
 		 437 aa  67.8  0.0000000005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1761  hypothetical protein  26.62 
 
 		 576 aa  67.4  0.0000000005  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0903  outer membrane efflux protein  25.64 
 
 		 436 aa  66.6  0.0000000008  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.331424  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0071  outer membrane efflux protein  24.26 
 
 		 441 aa  66.6  0.0000000009  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1884  outer membrane efflux protein  21.25 
 
 		 483 aa  65.9  0.000000001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3465  Outer membrane efflux protein  24.41 
 
 		 441 aa  65.9  0.000000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2941  outer membrane efflux protein  23.19 
 
 		 436 aa  65.5  0.000000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0140963  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1667  outer membrane efflux protein  25.57 
 
 		 455 aa  64.7  0.000000003  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3801  outer membrane efflux protein  23.88 
 
 		 449 aa  64.7  0.000000004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.233057 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0610  outer membrane efflux protein  22.42 
 
 		 453 aa  64.3  0.000000005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_4004  acriflavin resistance protein  24.77 
 
 		 1470 aa  63.9  0.000000005  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0881  outer membrane efflux protein  22.11 
 
 		 535 aa  63.9  0.000000005  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.705042  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS03674  putative outer membrane CHANEL lipoprotein  26.3 
 
 		 488 aa  63.9  0.000000006  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.119855 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3165  outer membrane efflux protein  27.46 
 
 		 445 aa  63.9  0.000000006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.391786  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3057  outer membrane efflux protein  27.23 
 
 		 440 aa  63.5  0.000000007  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.969203  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2200  outer membrane efflux protein  25.11 
 
 		 495 aa  63.2  0.00000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0041  outer membrane protein, putative  25.17 
 
 		 457 aa  62.8  0.00000001  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.229451  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1990  outer membrane efflux protein  21.4 
 
 		 471 aa  62.8  0.00000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.154832  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4268  outer membrane channel protein  25.13 
 
 		 497 aa  62.4  0.00000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.0102816 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3645  outer membrane efflux protein  25.13 
 
 		 514 aa  62.4  0.00000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.784148  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4722  outer membrane efflux protein  25.13 
 
 		 514 aa  62  0.00000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0674524  decreased coverage  0.00195148 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5578  outer membrane efflux protein  25.13 
 
 		 514 aa  62  0.00000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0232692  hitchhiker  0.00628536 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1727  type I secretion outer membrane protein, TolC family  27.3 
 
 		 452 aa  61.6  0.00000003  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.000000826676  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4181  outer membrane channel protein  22.49 
 
 		 449 aa  62  0.00000003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0430  TolC family type I secretion outer membrane protein  24.25 
 
 		 436 aa  61.6  0.00000003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.0000114483  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1392  TolC family type I secretion outer membrane protein  26.13 
 
 		 452 aa  61.2  0.00000004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1759  outer membrane efflux protein  23.2 
 
 		 738 aa  61.2  0.00000004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02621  outer membrane protein required for AvrXa21 activity C (raxC)  24.24 
 
 		 443 aa  61.2  0.00000004  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1228  agglutination protein  25.11 
 
 		 445 aa  60.8  0.00000005  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000902456  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0574  outer membrane efflux protein  21.04 
 
 		 427 aa  60.1  0.00000008  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  decreased coverage  0.00000581742  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4519  TolC family type I secretion outer membrane protein  25.88 
 
 		 452 aa  59.3  0.0000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4025  TolC family type I secretion outer membrane protein  25.75 
 
 		 452 aa  59.3  0.0000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0350176 
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6770  outer membrane efflux protein  24.6 
 
 		 488 aa  59.3  0.0000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0837  outer membrane efflux protein  22 
 
 		 462 aa  59.7  0.0000001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1634  outer membrane efflux protein  25.76 
 
 		 431 aa  59.3  0.0000002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.194063  normal  0.997182 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0447  Fis family transcriptional regulator  26.33 
 
 		 512 aa  58.9  0.0000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.818927 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1165  Outer membrane efflux protein  27.24 
 
 		 462 aa  58.2  0.0000003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1054  outer membrane efflux protein  24.81 
 
 		 514 aa  58.5  0.0000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.000452487  normal  0.217723 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2027  outer membrane efflux protein  23.63 
 
 		 495 aa  58.2  0.0000004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000179084 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2156  outer membrane export factor  21.67 
 
 		 452 aa  57.8  0.0000004  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_2069  TolC family type I secretion outer membrane protein  22.48 
 
 		 452 aa  57.8  0.0000004  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2145  outer membrane efflux protein  25.07 
 
 		 472 aa  58.2  0.0000004  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0192834 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2969  outer membrane efflux protein  26.51 
 
 		 443 aa  57.4  0.0000005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.725894  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3973  outer membrane efflux protein  24.62 
 
 		 513 aa  57.8  0.0000005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0704049 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3126  outer membrane efflux protein  22.56 
 
 		 444 aa  57.8  0.0000005  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1143  outer membrane efflux protein  24.77 
 
 		 455 aa  57.8  0.0000005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0286987  normal  0.128527 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4897  outer membrane efflux protein  22.64 
 
 		 437 aa  57.4  0.0000006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0861249  normal  0.15922 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3265  outer membrane efflux protein  24.54 
 
 		 476 aa  57.4  0.0000006  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2864  outer membrane efflux protein  24.54 
 
 		 476 aa  57.4  0.0000006  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4696  TolC family type I secretion outer membrane protein  24.11 
 
 		 497 aa  57  0.0000007  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>