More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gmet_3465 on replicon NC_007517
Organism: Geobacter metallireducens GS-15



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007517  Gmet_3465  Outer membrane efflux protein  100 
 
 		 441 aa  887    Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0831  outer membrane efflux protein  28.11 
 
 		 419 aa  141  3e-32  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1177  outer membrane efflux protein  24.02 
 
 		 427 aa  140  3.9999999999999997e-32  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0961  Outer membrane protein-like  29.25 
 
 		 491 aa  139  1e-31  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0234127  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1633  outer membrane efflux protein  28.89 
 
 		 420 aa  138  2e-31  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.159543  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2441  outer membrane efflux protein  25.57 
 
 		 453 aa  130  3e-29  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0574  outer membrane efflux protein  24.71 
 
 		 427 aa  128  2.0000000000000002e-28  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  decreased coverage  0.00000581742  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05030  outer membrane efflux protein  22.91 
 
 		 471 aa  123  8e-27  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.691581  n/a   
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4182  outer membrane efflux protein  29.41 
 
 		 431 aa  121  1.9999999999999998e-26  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.256436  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0224  outer membrane efflux protein  25.81 
 
 		 419 aa  122  1.9999999999999998e-26  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.000720591  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2704  outer membrane efflux protein  27.85 
 
 		 423 aa  120  3.9999999999999996e-26  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0162  outer membrane efflux protein  28.42 
 
 		 433 aa  120  4.9999999999999996e-26  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3409  outer membrane efflux protein  27.01 
 
 		 419 aa  120  6e-26  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000000155286  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1376  Outer membrane efflux protein  29.5 
 
 		 435 aa  119  7.999999999999999e-26  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.109779  hitchhiker  0.00244241 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5330  outer membrane efflux protein  23.42 
 
 		 429 aa  119  9.999999999999999e-26  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.757466 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1990  outer membrane efflux protein  25.66 
 
 		 471 aa  118  1.9999999999999998e-25  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.154832  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2633  outer membrane efflux protein  28.57 
 
 		 424 aa  118  3e-25  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5561  outer membrane efflux protein  28.28 
 
 		 431 aa  116  6.9999999999999995e-25  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0096  outer membrane efflux protein  25.06 
 
 		 441 aa  115  2.0000000000000002e-24  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0066  outer membrane efflux protein  25.97 
 
 		 443 aa  114  4.0000000000000004e-24  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0954  outer membrane efflux protein  24.58 
 
 		 463 aa  112  1.0000000000000001e-23  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2629  outer membrane efflux protein  26.24 
 
 		 421 aa  112  2.0000000000000002e-23  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.111539  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2517  Outer membrane efflux protein  27.41 
 
 		 455 aa  110  3e-23  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0940003  normal  0.677218 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1606  outer membrane efflux protein  26.48 
 
 		 421 aa  110  4.0000000000000004e-23  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1482  outer membrane efflux protein  26.75 
 
 		 426 aa  110  6e-23  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.979092  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0733  outer membrane efflux protein, putative  24.45 
 
 		 463 aa  110  7.000000000000001e-23  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008607  Ppro_3710  outer membrane efflux protein  25.3 
 
 		 419 aa  108  1e-22  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0094  outer membrane efflux protein, putative  25 
 
 		 501 aa  108  2e-22  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.0379352 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2664  outer membrane efflux protein  26.45 
 
 		 1496 aa  107  4e-22  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2799  outer membrane efflux protein  23.49 
 
 		 435 aa  107  4e-22  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  unclonable  0.0000000194078  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0627  outer membrane efflux protein, putative  24.4 
 
 		 470 aa  107  6e-22  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.173588  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1282  outer membrane efflux protein  30.34 
 
 		 446 aa  105  1e-21  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.0406152  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1456  outer membrane efflux protein  27.34 
 
 		 446 aa  105  2e-21  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.974754  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1884  outer membrane efflux protein  25.84 
 
 		 483 aa  104  3e-21  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1617  outer membrane efflux protein  22.35 
 
 		 467 aa  104  3e-21  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0863  outer membrane efflux protein  23.04 
 
 		 476 aa  104  3e-21  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.0409869  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1162  outer membrane efflux protein  24.26 
 
 		 515 aa  103  6e-21  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  unclonable  0.0000199135  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0071  outer membrane efflux protein  26.28 
 
 		 441 aa  102  1e-20  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2639  TolC family type I secretion outer membrane protein  27.02 
 
 		 461 aa  101  2e-20  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0283  outer membrane efflux protein  24.15 
 
 		 439 aa  101  3e-20  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00367785 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3444  RND efflux system outer membrane lipoprotein  26.42 
 
 		 495 aa  100  4e-20  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.960604 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3429  outer membrane efflux protein  24.94 
 
 		 442 aa  99.8  8e-20  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.437271  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0950  outer membrane efflux protein  28.24 
 
 		 424 aa  99  2e-19  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2154  outer membrane protein CyaE, putative  27.6 
 
 		 453 aa  98.6  2e-19  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0814  outer membrane efflux protein  26.45 
 
 		 460 aa  97.8  4e-19  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0057  outer membrane protein, putative  27.17 
 
 		 470 aa  97.1  6e-19  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3627  outer membrane efflux protein  21.88 
 
 		 461 aa  95.9  1e-18  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.433273  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2365  outer membrane efflux protein  25.93 
 
 		 482 aa  95.1  2e-18  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.316372 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0833  outer membrane efflux protein  23.23 
 
 		 496 aa  94.7  3e-18  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1415  Type I secretion outer membrane protein, TolC  23.52 
 
 		 472 aa  93.6  6e-18  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.000000596226  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2866  outer membrane efflux protein  21.34 
 
 		 480 aa  93.2  8e-18  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.0685652 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1482  outer membrane efflux protein  23.08 
 
 		 471 aa  92.8  1e-17  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.387043 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3298  outer membrane efflux protein  23.17 
 
 		 418 aa  92  2e-17  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000000531453  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1525  outer membrane efflux protein  26.56 
 
 		 442 aa  92  2e-17  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.000580745  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5506  outer membrane efflux protein  22.55 
 
 		 451 aa  92  2e-17  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.307266  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0066  outer membrane efflux protein  24.17 
 
 		 436 aa  91.3  3e-17  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1015  outer membrane protein  23.36 
 
 		 488 aa  91.3  3e-17  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  decreased coverage  1.22355e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01115  putative outer membrane transport/efflux protein  22.65 
 
 		 443 aa  91.3  3e-17  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0837  outer membrane efflux protein  25.56 
 
 		 462 aa  91.3  3e-17  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1165  Outer membrane efflux protein  25.42 
 
 		 462 aa  90.9  4e-17  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4230  outer membrane efflux protein  25.83 
 
 		 458 aa  90.9  4e-17  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0431504  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2145  outer membrane efflux protein  24.83 
 
 		 472 aa  90.1  7e-17  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0192834 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1723  outer membrane efflux protein  24.17 
 
 		 436 aa  90.1  8e-17  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0562  type I secretion outer membrane protein, TolC family  23.73 
 
 		 450 aa  89.7  8e-17  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4923  TolC family type I secretion outer membrane protein  22.83 
 
 		 477 aa  88.6  2e-16  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4326  RND efflux system outer membrane lipoprotein  25.81 
 
 		 484 aa  88.6  2e-16  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4799  TolC family type I secretion outer membrane protein  22.52 
 
 		 477 aa  87.8  3e-16  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.125067  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1749  outer membrane efflux protein  19.73 
 
 		 458 aa  88.2  3e-16  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_5078  outer membrane efflux protein  22.97 
 
 		 635 aa  87.8  3e-16  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.851054  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3853  outer membrane efflux protein  24.82 
 
 		 447 aa  88.2  3e-16  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4715  TolC family type I secretion outer membrane protein  22.52 
 
 		 477 aa  87.8  4e-16  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.133912 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2135  putative outer membrane channel lipoprotein  26.53 
 
 		 483 aa  87  5e-16  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0693732  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4505  outer membrane efflux protein  22.79 
 
 		 972 aa  86.7  7e-16  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.300614  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1440  outer membrane efflux protein  24.13 
 
 		 503 aa  87  7e-16  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4696  TolC family type I secretion outer membrane protein  24.94 
 
 		 497 aa  86.7  8e-16  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5161  type I secretion outer membrane protein, TolC family  24.94 
 
 		 488 aa  86.7  8e-16  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.451764  normal  0.264948 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4976  TolC family type I secretion outer membrane protein  22.89 
 
 		 478 aa  86.3  9e-16  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1380  outer membrane efflux protein  21.75 
 
 		 425 aa  85.9  0.000000000000001  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0042  outer membrane efflux protein  22.2 
 
 		 454 aa  86.3  0.000000000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.293166 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2630  Type I secretion outer membrane protein, TolC  25.17 
 
 		 489 aa  86.3  0.000000000000001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1919  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT family  24.17 
 
 		 482 aa  85.9  0.000000000000001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.328582  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3801  outer membrane efflux protein  24.2 
 
 		 449 aa  86.3  0.000000000000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.233057 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1390  outer membrane efflux protein  23.7 
 
 		 463 aa  85.5  0.000000000000002  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.0182398  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1126  TolC family type I secretion outer membrane protein  23.68 
 
 		 450 aa  85.5  0.000000000000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1967  outer membrane efflux protein  21.2 
 
 		 443 aa  85.5  0.000000000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  unclonable  0.0000000399706  normal  0.35271 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5239  type I secretion outer membrane protein, TolC family  25.42 
 
 		 488 aa  85.5  0.000000000000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0762  outer membrane efflux protein  23.84 
 
 		 446 aa  85.5  0.000000000000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1353  outer membrane efflux protein  21.04 
 
 		 451 aa  84.7  0.000000000000003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.678572  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3626  outer membrane efflux protein  23.37 
 
 		 627 aa  84  0.000000000000005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0887926  normal  0.306741 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0544  outer membrane channel protein  24.32 
 
 		 448 aa  84  0.000000000000005  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  0.000000576987  normal  0.601769 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6215  outer membrane efflux protein  29.13 
 
 		 493 aa  84  0.000000000000005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.811282  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4394  outer membrane efflux protein  25.78 
 
 		 465 aa  84  0.000000000000005  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  unclonable  0.000000587559  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2616  Type I secretion outer membrane protein, TolC  24.59 
 
 		 450 aa  83.6  0.000000000000006  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.930678  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1384  outer membrane efflux protein  25.52 
 
 		 435 aa  83.6  0.000000000000007  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.642492  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1642  TolC family type I secretion outer membrane protein  23.87 
 
 		 446 aa  83.2  0.000000000000008  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.779397 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004522  type I secretion TolC precursor  23.99 
 
 		 442 aa  83.2  0.000000000000009  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.000000301167  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0610  outer membrane efflux protein  21.88 
 
 		 453 aa  83.2  0.00000000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2013  outer membrane channel protein  23.44 
 
 		 438 aa  82.8  0.00000000000001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  unclonable  0.000000000000158125  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3746  outer membrane efflux protein  24.58 
 
 		 463 aa  82.4  0.00000000000001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.622366  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3004  TolC family type I secretion outer membrane protein  25.36 
 
 		 464 aa  82.4  0.00000000000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.599739 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>