191 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpha266_0183 on replicon NC_008639
Organism: Chlorobium phaeobacteroides DSM 266



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011060  Ppha_2724  outer membrane efflux protein  72.37 
 
 
440 aa  660    Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.190068  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2350  outer membrane efflux protein  71.2 
 
 
441 aa  649    Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0183  outer membrane efflux protein  100 
 
 
441 aa  907    Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0122  LipD protein, putative  61.22 
 
 
413 aa  530  1e-149  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_2001  LipD protein, putative  58.04 
 
 
445 aa  521  1e-147  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.538795  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0278  outer membrane efflux protein  47.06 
 
 
441 aa  396  1e-109  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  unclonable  0.000000626538  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0242  outer membrane efflux protein  49.88 
 
 
444 aa  398  1e-109  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.231209  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4230  outer membrane efflux protein  25.17 
 
 
458 aa  115  2.0000000000000002e-24  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0431504  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3853  outer membrane efflux protein  25.12 
 
 
447 aa  109  1e-22  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1749  outer membrane efflux protein  25.69 
 
 
458 aa  107  6e-22  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3937  outer membrane efflux protein  24.64 
 
 
447 aa  105  1e-21  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00157367 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3129  Outer membrane efflux protein  24.26 
 
 
446 aa  104  3e-21  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.000215977  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0066  outer membrane efflux protein  23.68 
 
 
443 aa  102  1e-20  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2517  Outer membrane efflux protein  24.13 
 
 
455 aa  96.7  7e-19  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0940003  normal  0.677218 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0096  outer membrane efflux protein  24.28 
 
 
441 aa  95.5  2e-18  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0881  outer membrane efflux protein  22.48 
 
 
535 aa  94.4  4e-18  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.705042  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0391  Outer membrane efflux family protein  23.89 
 
 
437 aa  92.4  1e-17  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0071  outer membrane efflux protein  26.52 
 
 
441 aa  92.4  2e-17  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2664  outer membrane efflux protein  24.06 
 
 
1496 aa  91.3  3e-17  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1162  outer membrane efflux protein  21.35 
 
 
515 aa  90.9  4e-17  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  unclonable  0.0000199135  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3468  outer membrane efflux protein  24.65 
 
 
448 aa  89.7  8e-17  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  decreased coverage  0.000163735  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0453  Outer membrane efflux protein  23.97 
 
 
470 aa  85.1  0.000000000000002  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0814  outer membrane efflux protein  20.82 
 
 
460 aa  85.5  0.000000000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2154  outer membrane protein CyaE, putative  22.97 
 
 
453 aa  84.7  0.000000000000003  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1617  outer membrane efflux protein  22.27 
 
 
467 aa  84.7  0.000000000000003  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2629  outer membrane efflux protein  23.45 
 
 
421 aa  82  0.00000000000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.111539  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0627  outer membrane efflux protein, putative  23.46 
 
 
470 aa  81.3  0.00000000000003  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.173588  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1990  outer membrane efflux protein  23.8 
 
 
471 aa  81.6  0.00000000000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.154832  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1633  outer membrane efflux protein  26.3 
 
 
420 aa  81.3  0.00000000000003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.159543  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0057  outer membrane protein, putative  22.78 
 
 
470 aa  81.3  0.00000000000004  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1177  outer membrane efflux protein  21.88 
 
 
427 aa  80.9  0.00000000000005  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1456  outer membrane efflux protein  25.42 
 
 
446 aa  80.9  0.00000000000005  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.974754  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2001  outer membrane efflux protein  22.89 
 
 
473 aa  79.3  0.0000000000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.612283  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1884  outer membrane efflux protein  22.45 
 
 
483 aa  79.3  0.0000000000001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0954  outer membrane efflux protein  23.45 
 
 
463 aa  79.3  0.0000000000001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2368  outer membrane efflux protein  22.89 
 
 
473 aa  79.3  0.0000000000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.0254327  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2441  outer membrane efflux protein  24 
 
 
453 aa  78.6  0.0000000000002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1606  outer membrane efflux protein  22.62 
 
 
421 aa  78.6  0.0000000000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0733  outer membrane efflux protein, putative  21.94 
 
 
463 aa  77.8  0.0000000000003  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1390  outer membrane efflux protein  22.6 
 
 
463 aa  75.1  0.000000000002  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.0182398  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3378  outer membrane efflux protein  22.14 
 
 
498 aa  74.7  0.000000000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.106709 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0427  outer membrane efflux protein  24.59 
 
 
455 aa  74.3  0.000000000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.410338  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4505  outer membrane efflux protein  24.26 
 
 
972 aa  73.6  0.000000000007  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.300614  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0207  outer membrane efflux protein  21.77 
 
 
523 aa  73.6  0.000000000007  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0456  outer membrane efflux protein  24.93 
 
 
456 aa  72.4  0.00000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0455  outer membrane efflux protein  24.93 
 
 
463 aa  72.4  0.00000000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.236814  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2819  outer membrane efflux protein  21.58 
 
 
438 aa  71.6  0.00000000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0986  outer membrane efflux protein, putative  21.54 
 
 
484 aa  67.4  0.0000000005  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0041  outer membrane protein, putative  23.58 
 
 
457 aa  67  0.0000000006  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.229451  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1665  outer membrane efflux protein  21.48 
 
 
464 aa  67  0.0000000006  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1174  outer membrane efflux protein  26.25 
 
 
457 aa  66.6  0.0000000008  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.89041 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3465  Outer membrane efflux protein  21.31 
 
 
441 aa  66.6  0.0000000009  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0961  Outer membrane protein-like  22.95 
 
 
491 aa  66.2  0.000000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0234127  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2704  outer membrane efflux protein  21.28 
 
 
423 aa  65.9  0.000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0837  outer membrane efflux protein  21.53 
 
 
462 aa  65.9  0.000000001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1482  outer membrane efflux protein  22.25 
 
 
426 aa  65.1  0.000000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.979092  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0063  outer membrane efflux protein  20.19 
 
 
408 aa  65.5  0.000000002  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.0180654  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1027  outer membrane efflux protein  20.98 
 
 
452 aa  63.9  0.000000006  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2479  outer membrane efflux protein  32.46 
 
 
454 aa  63.2  0.000000009  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1333  outer membrane efflux protein, putative  21.71 
 
 
463 aa  63.2  0.00000001  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1477  outer membrane efflux protein  32.46 
 
 
454 aa  62.8  0.00000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.107599  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1531  outer membrane efflux protein  21.13 
 
 
472 aa  62.8  0.00000001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2391  outer membrane efflux protein  32.46 
 
 
454 aa  63.2  0.00000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0837575  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0833  outer membrane efflux protein  19.56 
 
 
496 aa  62  0.00000002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1165  Outer membrane efflux protein  25.1 
 
 
462 aa  62  0.00000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1633  outer membrane efflux protein  20.35 
 
 
470 aa  61.6  0.00000003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.788464  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2560  outer membrane efflux protein  22.71 
 
 
438 aa  61.6  0.00000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3801  outer membrane efflux protein  20.88 
 
 
449 aa  61.2  0.00000003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.233057 
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5561  outer membrane efflux protein  20.61 
 
 
431 aa  60.8  0.00000004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4182  outer membrane efflux protein  21.4 
 
 
431 aa  60.8  0.00000004  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.256436  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3409  outer membrane efflux protein  21.97 
 
 
419 aa  61.2  0.00000004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000000155286  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0617  outer membrane efflux protein  27.35 
 
 
447 aa  60.5  0.00000005  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2633  outer membrane efflux protein  21.36 
 
 
424 aa  60.5  0.00000006  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2799  outer membrane efflux protein  21.93 
 
 
435 aa  60.1  0.00000007  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  unclonable  0.0000000194078  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5578  outer membrane efflux protein  23.08 
 
 
451 aa  60.1  0.00000008  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.46516 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1690  outer membrane efflux protein  35.42 
 
 
448 aa  60.1  0.00000008  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3429  outer membrane efflux protein  22.65 
 
 
442 aa  59.7  0.0000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.437271  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0791  outer membrane efflux protein  24.74 
 
 
454 aa  59.3  0.0000001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.670065  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1376  Outer membrane efflux protein  21.99 
 
 
435 aa  58.5  0.0000003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.109779  hitchhiker  0.00244241 
 
 
-
 
NC_002950  PG0538  outer membrane efflux protein  24.65 
 
 
462 aa  57.4  0.0000005  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05030  outer membrane efflux protein  18.67 
 
 
471 aa  57.4  0.0000005  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.691581  n/a   
 
 
-
 
NC_008607  Ppro_3710  outer membrane efflux protein  22.03 
 
 
419 aa  57.4  0.0000005  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4142  outer membrane efflux protein  19.9 
 
 
497 aa  56.6  0.0000008  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.958426  hitchhiker  0.00365026 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4260  outer membrane efflux protein  22.6 
 
 
438 aa  56.6  0.0000009  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0162  outer membrane efflux protein  20.13 
 
 
433 aa  55.8  0.000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3627  outer membrane efflux protein  20.99 
 
 
461 aa  56.2  0.000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.433273  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0849  outer membrane efflux protein  19.72 
 
 
417 aa  55.8  0.000001  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000450472  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1217  outer membrane efflux protein  23.83 
 
 
438 aa  55.8  0.000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.87899  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0120  outer membrane efflux protein  23.61 
 
 
448 aa  56.2  0.000001  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  unclonable  0.00000000165447  hitchhiker  0.000000000000561163 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0605  outer membrane efflux protein  23.41 
 
 
470 aa  55.1  0.000002  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_4004  acriflavin resistance protein  22.62 
 
 
1470 aa  55.5  0.000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1761  hypothetical protein  25.7 
 
 
576 aa  54.3  0.000004  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0364  outer membrane channel protein  21.69 
 
 
500 aa  53.9  0.000005  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1440  outer membrane efflux protein  22.75 
 
 
503 aa  53.9  0.000005  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_5078  outer membrane efflux protein  23.5 
 
 
635 aa  53.9  0.000005  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.851054  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0831  outer membrane efflux protein  20.62 
 
 
419 aa  53.9  0.000006  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3165  outer membrane efflux protein  25.78 
 
 
445 aa  53.5  0.000007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.391786  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1143  outer membrane efflux protein  21.98 
 
 
455 aa  53.5  0.000007  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0286987  normal  0.128527 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1924  Outer membrane protein  23.73 
 
 
494 aa  53.5  0.000007  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.0996265 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0762  outer membrane efflux protein  21.28 
 
 
446 aa  52.8  0.00001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>