45 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Phep_1924 on replicon NC_013061
Organism: Pedobacter heparinus DSM 2366



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013061  Phep_1924  Outer membrane protein  100 
 
 		 494 aa  997    Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.0996265 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0605  outer membrane efflux protein  22.49 
 
 		 470 aa  85.9  0.000000000000002  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3937  outer membrane efflux protein  22.06 
 
 		 447 aa  74.7  0.000000000004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00157367 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0397  outer membrane efflux protein  21.58 
 
 		 473 aa  70.9  0.00000000005  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0478  outer membrane efflux protein  21.73 
 
 		 471 aa  69.3  0.0000000001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4394  outer membrane efflux protein  22.22 
 
 		 465 aa  67.4  0.0000000006  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  unclonable  0.000000587559  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1027  outer membrane efflux protein  21.66 
 
 		 452 aa  66.6  0.0000000009  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003318  outer membrane protein  23.01 
 
 		 471 aa  66.2  0.000000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3853  outer membrane efflux protein  22 
 
 		 447 aa  65.5  0.000000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0582  outer membrane efflux protein  21.68 
 
 		 464 aa  65.5  0.000000002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0526  outer membrane efflux protein  22.27 
 
 		 489 aa  65.1  0.000000003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00662182  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0505  outer membrane efflux protein  22.27 
 
 		 489 aa  65.1  0.000000003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3814  outer membrane efflux protein  22.27 
 
 		 493 aa  64.7  0.000000004  Shewanella baltica OS155  Bacteria  decreased coverage  0.0000440013  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0530  outer membrane efflux protein  22.27 
 
 		 473 aa  64.7  0.000000004  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.40399  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4090  outer membrane efflux protein  22.43 
 
 		 473 aa  64.7  0.000000004  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_2001  LipD protein, putative  24.46 
 
 		 445 aa  64.3  0.000000004  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.538795  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3640  outer membrane efflux protein  22.2 
 
 		 489 aa  63.2  0.00000001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02434  hypothetical protein  22.25 
 
 		 463 aa  62.8  0.00000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0487  outer membrane efflux protein  22.2 
 
 		 489 aa  62.8  0.00000002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3464  outer membrane efflux protein  22.2 
 
 		 489 aa  62.8  0.00000002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0477  outer membrane efflux protein  22.37 
 
 		 517 aa  61.6  0.00000003  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.0917942 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3746  outer membrane efflux protein  22.8 
 
 		 463 aa  61.6  0.00000003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.622366  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3730  outer membrane efflux protein  22.4 
 
 		 477 aa  61.2  0.00000005  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4230  outer membrane efflux protein  30.77 
 
 		 458 aa  54.7  0.000004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0431504  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0411  outer membrane efflux protein  22.96 
 
 		 467 aa  53.9  0.000007  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0338477  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2441  outer membrane efflux protein  22.7 
 
 		 453 aa  53.5  0.000007  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0183  outer membrane efflux protein  23.73 
 
 		 441 aa  53.5  0.000008  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3719  outer membrane efflux protein  28.06 
 
 		 444 aa  53.5  0.000009  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.633766  normal  0.0948534 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1174  outer membrane efflux protein  27.84 
 
 		 457 aa  52.4  0.00002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.89041 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0961  Outer membrane protein-like  23.26 
 
 		 491 aa  50.8  0.00005  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0234127  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3627  outer membrane efflux protein  24.89 
 
 		 461 aa  50.4  0.00008  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.433273  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0566  outer membrane efflux protein  20.43 
 
 		 473 aa  50.1  0.00009  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.151183 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1839  outer membrane efflux protein  22.84 
 
 		 466 aa  50.1  0.00009  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.594597  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2350  outer membrane efflux protein  23.78 
 
 		 441 aa  49.7  0.0001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1390  outer membrane efflux protein  20.66 
 
 		 463 aa  48.9  0.0002  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.0182398  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3465  Outer membrane efflux protein  21.17 
 
 		 441 aa  48.5  0.0002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4182  outer membrane efflux protein  21.86 
 
 		 431 aa  48.5  0.0003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.256436  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0096  outer membrane efflux protein  24.05 
 
 		 441 aa  48.1  0.0004  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0066  outer membrane efflux protein  21.4 
 
 		 443 aa  46.6  0.001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3184  outer membrane efflux protein  29.23 
 
 		 460 aa  46.2  0.001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0733975  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0831  outer membrane efflux protein  25.94 
 
 		 419 aa  45.8  0.002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0391  Outer membrane efflux family protein  27.27 
 
 		 437 aa  45.1  0.003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1990  outer membrane efflux protein  21.98 
 
 		 471 aa  44.7  0.004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.154832  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0740  outer membrane efflux protein  23.15 
 
 		 445 aa  43.9  0.007  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.783995  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2365  outer membrane efflux protein  22.73 
 
 		 482 aa  43.5  0.008  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.316372 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>