157 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VEA_003318 on replicon NC_013456
Organism: Vibrio sp. Ex25



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013456  VEA_003318  outer membrane protein  100 
 
 		 471 aa  952    Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02434  hypothetical protein  87.69 
 
 		 463 aa  825    Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1211  hypothetical protein  69.21 
 
 		 476 aa  619  1e-176  Vibrio cholerae O395  Bacteria  decreased coverage  0.00000512131  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1839  outer membrane efflux protein  52.83 
 
 		 466 aa  452  1.0000000000000001e-126  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.594597  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0397  outer membrane efflux protein  42.26 
 
 		 473 aa  373  1e-102  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0478  outer membrane efflux protein  43.42 
 
 		 471 aa  374  1e-102  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0411  outer membrane efflux protein  42.4 
 
 		 467 aa  347  3e-94  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0338477  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0582  outer membrane efflux protein  41.76 
 
 		 464 aa  341  2e-92  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4394  outer membrane efflux protein  42.13 
 
 		 465 aa  336  5e-91  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  unclonable  0.000000587559  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4090  outer membrane efflux protein  40.73 
 
 		 473 aa  332  1e-89  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3814  outer membrane efflux protein  41.44 
 
 		 493 aa  329  6e-89  Shewanella baltica OS155  Bacteria  decreased coverage  0.0000440013  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0526  outer membrane efflux protein  41.44 
 
 		 489 aa  328  1.0000000000000001e-88  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00662182  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0530  outer membrane efflux protein  41.44 
 
 		 473 aa  328  2.0000000000000001e-88  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.40399  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0505  outer membrane efflux protein  41.44 
 
 		 489 aa  328  2.0000000000000001e-88  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3730  outer membrane efflux protein  40.49 
 
 		 477 aa  325  1e-87  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0487  outer membrane efflux protein  40.77 
 
 		 489 aa  324  2e-87  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0477  outer membrane efflux protein  39.91 
 
 		 517 aa  322  7e-87  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.0917942 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3640  outer membrane efflux protein  40.77 
 
 		 489 aa  321  1.9999999999999998e-86  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3464  outer membrane efflux protein  40.54 
 
 		 489 aa  320  3e-86  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0566  outer membrane efflux protein  40.48 
 
 		 473 aa  318  2e-85  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.151183 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3746  outer membrane efflux protein  39.28 
 
 		 463 aa  300  4e-80  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.622366  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1174  outer membrane efflux protein  30.6 
 
 		 457 aa  174  2.9999999999999996e-42  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.89041 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0605  outer membrane efflux protein  28.6 
 
 		 470 aa  172  1e-41  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4572  outer membrane efflux protein  31.24 
 
 		 483 aa  167  2.9999999999999998e-40  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.345417  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1027  outer membrane efflux protein  27.17 
 
 		 452 aa  165  2.0000000000000002e-39  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0654  outer membrane efflux protein  27.97 
 
 		 587 aa  158  2e-37  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1040  outer membrane efflux protein  28.9 
 
 		 583 aa  154  2.9999999999999998e-36  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0961  Outer membrane protein-like  24.59 
 
 		 491 aa  102  1e-20  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0234127  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1015  outer membrane protein  24.67 
 
 		 488 aa  101  3e-20  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  decreased coverage  1.22355e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1749  outer membrane efflux protein  21.9 
 
 		 458 aa  97.8  4e-19  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4182  outer membrane efflux protein  24.37 
 
 		 431 aa  94  5e-18  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.256436  normal  1 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1390  outer membrane efflux protein  22.1 
 
 		 463 aa  85.5  0.000000000000002  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.0182398  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1440  outer membrane efflux protein  22.32 
 
 		 503 aa  84  0.000000000000005  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05030  outer membrane efflux protein  22.65 
 
 		 471 aa  79.7  0.0000000000001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.691581  n/a   
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5561  outer membrane efflux protein  23.75 
 
 		 431 aa  77  0.0000000000006  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3465  Outer membrane efflux protein  22.49 
 
 		 441 aa  75.5  0.000000000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2517  Outer membrane efflux protein  23.28 
 
 		 455 aa  74.7  0.000000000003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0940003  normal  0.677218 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0224  outer membrane efflux protein  25.73 
 
 		 419 aa  74.3  0.000000000005  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.000720591  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0831  outer membrane efflux protein  25.94 
 
 		 419 aa  70.5  0.00000000006  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3184  outer membrane efflux protein  27.4 
 
 		 460 aa  67.4  0.0000000005  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0733975  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1376  Outer membrane efflux protein  23.69 
 
 		 435 aa  66.6  0.0000000008  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.109779  hitchhiker  0.00244241 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1924  Outer membrane protein  22.31 
 
 		 494 aa  66.6  0.0000000009  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.0996265 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0814  outer membrane efflux protein  24.76 
 
 		 460 aa  65.1  0.000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3801  outer membrane efflux protein  22.09 
 
 		 449 aa  64.3  0.000000004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.233057 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1482  outer membrane efflux protein  21.49 
 
 		 426 aa  64.3  0.000000005  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.979092  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_4004  acriflavin resistance protein  22.35 
 
 		 1470 aa  62  0.00000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2664  outer membrane efflux protein  24.32 
 
 		 1496 aa  61.6  0.00000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1041  type I secretion outer membrane efflux protein  25.85 
 
 		 451 aa  61.6  0.00000003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1990  outer membrane efflux protein  23.35 
 
 		 471 aa  61.2  0.00000004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.154832  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4230  outer membrane efflux protein  21.99 
 
 		 458 aa  60.8  0.00000005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0431504  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1217  outer membrane efflux protein  22.63 
 
 		 438 aa  60.8  0.00000005  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.87899  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2441  outer membrane efflux protein  22.43 
 
 		 453 aa  58.9  0.0000002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1629  outer membrane efflux protein  24.14 
 
 		 438 aa  58.5  0.0000003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3937  outer membrane efflux protein  23.91 
 
 		 447 aa  57.8  0.0000004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00157367 
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6770  outer membrane efflux protein  24.3 
 
 		 488 aa  57.8  0.0000004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS00407  putative outer membrane cation efflux system protein  27.24 
 
 		 451 aa  57  0.0000007  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  decreased coverage  0.00236087  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1162  outer membrane efflux protein  22.84 
 
 		 515 aa  56.6  0.0000009  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  unclonable  0.0000199135  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0283  outer membrane efflux protein  22.97 
 
 		 439 aa  56.6  0.0000009  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00367785 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0162  outer membrane efflux protein  22.84 
 
 		 433 aa  56.6  0.0000009  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3343  type I secretion outer membrane protein, TolC family  25.17 
 
 		 452 aa  56.2  0.000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2298  outer membrane efflux protein  21.59 
 
 		 525 aa  56.6  0.000001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0979  outer membrane efflux protein  22.11 
 
 		 375 aa  56.2  0.000001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.2318 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3409  outer membrane efflux protein  22.12 
 
 		 419 aa  55.8  0.000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000000155286  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0056  porin (omp) ABC transporter protein  23.57 
 
 		 460 aa  55.5  0.000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4447  outer membrane efflux protein  21.59 
 
 		 459 aa  55.8  0.000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0559  outer membrane efflux protein  21.94 
 
 		 455 aa  55.8  0.000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1664  Type I secretion outer membrane protein, TolC  23.05 
 
 		 453 aa  54.7  0.000003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1407  TolC family type I secretion outer membrane protein  21.13 
 
 		 471 aa  55.1  0.000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.267158 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1946  outer membrane efflux protein  30.57 
 
 		 431 aa  54.3  0.000004  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1338  type I secretion outer membrane protein, TolC family  21.03 
 
 		 456 aa  54.7  0.000004  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0728783  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3096  outer membrane efflux protein  23.13 
 
 		 497 aa  54.3  0.000004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS03674  putative outer membrane CHANEL lipoprotein  22.08 
 
 		 488 aa  54.3  0.000005  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.119855 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4902  outer membrane efflux protein  22.94 
 
 		 439 aa  54.3  0.000005  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3958  TolC family type I secretion outer membrane protein  24.13 
 
 		 491 aa  54.3  0.000005  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.753849  normal  0.338977 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4130  outer membrane efflux protein  22.2 
 
 		 516 aa  54.3  0.000005  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008607  Ppro_3710  outer membrane efflux protein  24.31 
 
 		 419 aa  53.5  0.000008  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1798  outer membrane efflux protein  21.8 
 
 		 471 aa  52.8  0.00001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.337857  normal  0.0360275 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3853  outer membrane efflux protein  24.3 
 
 		 447 aa  52.8  0.00001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2145  outer membrane efflux protein  19.44 
 
 		 472 aa  53.1  0.00001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0192834 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1266  outer membrane efflux protein  22.83 
 
 		 444 aa  52.8  0.00001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3496  outer membrane efflux protein  22.55 
 
 		 565 aa  52.8  0.00002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4977  outer membrane efflux protein TolC, putative  23.26 
 
 		 479 aa  52  0.00002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0543  Type I secretion outer membrane protein, TolC  23.2 
 
 		 479 aa  52  0.00002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.991736 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0457  SapF  22.43 
 
 		 433 aa  52  0.00002  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  hitchhiker  0.00255245  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1126  TolC family type I secretion outer membrane protein  22.4 
 
 		 450 aa  52  0.00002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0066  outer membrane efflux protein  23.02 
 
 		 443 aa  52.4  0.00002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2704  outer membrane efflux protein  22.67 
 
 		 423 aa  51.6  0.00003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0762  outer membrane efflux protein  18.73 
 
 		 446 aa  51.2  0.00004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG0094  outer membrane efflux protein, putative  21.66 
 
 		 501 aa  50.8  0.00006  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.0379352 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0768  outer membrane efflux protein  31.11 
 
 		 423 aa  50.4  0.00006  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.151036  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2883  TolC family type I secretion outer membrane protein  24.65 
 
 		 442 aa  50.4  0.00006  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.00170075  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2893  RND efflux system outer membrane lipoprotein  23.31 
 
 		 516 aa  50.4  0.00007  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0120  outer membrane efflux protein  18.72 
 
 		 448 aa  50.1  0.00008  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  unclonable  0.00000000165447  hitchhiker  0.000000000000561163 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1380  outer membrane efflux protein  22.25 
 
 		 425 aa  50.1  0.00009  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0532  outer membrane efflux protein  23.48 
 
 		 578 aa  49.7  0.0001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.52231  normal  0.0114882 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0515  outer membrane efflux protein  23.48 
 
 		 578 aa  49.7  0.0001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3627  outer membrane efflux protein  25.17 
 
 		 461 aa  49.7  0.0001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.433273  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0309  outer membrane efflux protein  22.22 
 
 		 458 aa  49.7  0.0001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.729969 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2559  outer membrane efflux protein  21.96 
 
 		 445 aa  49.7  0.0001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.413213  normal  0.217288 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0849  outer membrane efflux protein  22.03 
 
 		 417 aa  48.9  0.0002  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000450472  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>