103 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hneap_0740 on replicon NC_013422
Organism: Halothiobacillus neapolitanus c2



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013422  Hneap_0740  outer membrane efflux protein  100 
 
 		 445 aa  899    Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.783995  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0375  hypothetical protein  34.73 
 
 		 443 aa  217  4e-55  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.271379  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0317  outer membrane efflux protein  34.27 
 
 		 443 aa  206  5e-52  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.156949  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0524  Outer membrane efflux protein  35.39 
 
 		 457 aa  192  8e-48  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.125027  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2116  hypothetical protein  34.64 
 
 		 420 aa  169  8e-41  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.771032  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0288  outer membrane efflux protein  29.63 
 
 		 464 aa  163  6e-39  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.708573  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0162  outer membrane efflux protein  28.29 
 
 		 433 aa  73.6  0.000000000007  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2517  Outer membrane efflux protein  25.51 
 
 		 455 aa  68.6  0.0000000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0940003  normal  0.677218 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2629  outer membrane efflux protein  24.27 
 
 		 421 aa  68.9  0.0000000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.111539  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1606  outer membrane efflux protein  24.88 
 
 		 421 aa  65.1  0.000000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3409  outer membrane efflux protein  25.42 
 
 		 419 aa  64.7  0.000000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000000155286  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2362  outer membrane efflux protein  26.57 
 
 		 455 aa  63.5  0.000000006  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.102907  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1698  outer membrane efflux protein  29.94 
 
 		 433 aa  63.2  0.000000008  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.572085  normal  0.0641673 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0397  outer membrane efflux protein  25.24 
 
 		 473 aa  63.2  0.000000009  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2664  outer membrane efflux protein  25.09 
 
 		 1496 aa  62.8  0.00000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_4004  acriflavin resistance protein  24.18 
 
 		 1470 aa  62.4  0.00000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0224  outer membrane efflux protein  23.67 
 
 		 419 aa  61.6  0.00000003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.000720591  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0066  outer membrane efflux protein  25.06 
 
 		 443 aa  60.5  0.00000005  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0814  outer membrane efflux protein  23.75 
 
 		 460 aa  59.7  0.00000009  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0096  outer membrane efflux protein  23.91 
 
 		 441 aa  58.9  0.0000002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3356  TolC family type I secretion outer membrane protein  28.98 
 
 		 442 aa  58.5  0.0000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.431157  normal  0.886803 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0831  outer membrane efflux protein  25.25 
 
 		 419 aa  58.9  0.0000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1727  type I secretion outer membrane protein, TolC family  23.6 
 
 		 452 aa  58.5  0.0000002  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.000000826676  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0762  outer membrane efflux protein  22.83 
 
 		 446 aa  58.2  0.0000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3157  TolC family type I secretion outer membrane protein  30.58 
 
 		 442 aa  58.2  0.0000003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.262509 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2558  TolC family type I secretion outer membrane protein  30.17 
 
 		 452 aa  57.8  0.0000004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.431388  normal  0.101058 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1798  Type I secretion outer membrane protein, TolC  24.73 
 
 		 538 aa  57.4  0.0000005  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.99988  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0802  TolC family type I secretion outer membrane protein  26.52 
 
 		 453 aa  57.4  0.0000005  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1482  outer membrane efflux protein  24.34 
 
 		 426 aa  55.1  0.000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.979092  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2830  TolC family type I secretion outer membrane protein  28.24 
 
 		 455 aa  55.1  0.000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0538261  hitchhiker  0.00247347 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2156  outer membrane export factor  27.4 
 
 		 452 aa  54.7  0.000003  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2367  outer membrane efflux protein  22.86 
 
 		 495 aa  54.3  0.000005  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0323  outer membrane channel protein  21.92 
 
 		 463 aa  53.9  0.000006  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  unclonable  0.00000673159  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_2069  TolC family type I secretion outer membrane protein  26.61 
 
 		 452 aa  53.5  0.000008  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2697  type I secretion outer membrane protein, TolC  28.08 
 
 		 437 aa  52.8  0.00001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3648  outer membrane efflux protein  29.19 
 
 		 424 aa  52.8  0.00001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.856557 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2145  outer membrane efflux protein  22.79 
 
 		 472 aa  52.8  0.00001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0192834 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3802  Outer membrane efflux protein  27.56 
 
 		 465 aa  52.4  0.00002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4268  outer membrane channel protein  24.51 
 
 		 497 aa  52  0.00002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.0102816 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1629  outer membrane efflux protein  27.56 
 
 		 438 aa  52  0.00002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0791  outer membrane efflux protein  24.23 
 
 		 454 aa  52  0.00002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.670065  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004522  type I secretion TolC precursor  27.4 
 
 		 442 aa  52  0.00002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.000000301167  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1633  outer membrane efflux protein  24.1 
 
 		 420 aa  50.8  0.00005  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.159543  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1746  TolC family type I secretion outer membrane protein  23.45 
 
 		 446 aa  50.4  0.00006  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0071  outer membrane efflux protein  22.02 
 
 		 441 aa  50.4  0.00007  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0943  TolC family type I secretion outer membrane protein  24.43 
 
 		 481 aa  50.1  0.00008  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.359214  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3926  Type I secretion outer membrane protein, TolC  24.53 
 
 		 441 aa  49.3  0.0001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0313  outer membrane channel protein  22.53 
 
 		 463 aa  49.3  0.0001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1376  Outer membrane efflux protein  26.75 
 
 		 435 aa  48.5  0.0002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.109779  hitchhiker  0.00244241 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3448  outer membrane channel protein  22.08 
 
 		 494 aa  48.9  0.0002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.203909 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2883  TolC family type I secretion outer membrane protein  23.47 
 
 		 442 aa  48.9  0.0002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.00170075  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2001  outer membrane efflux protein  25.97 
 
 		 473 aa  48.9  0.0002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.612283  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2368  outer membrane efflux protein  25.97 
 
 		 473 aa  48.9  0.0002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.0254327  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1384  outer membrane efflux protein  26.32 
 
 		 435 aa  48.9  0.0002  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.642492  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1304  Type I secretion outer membrane protein, TolC  24.49 
 
 		 446 aa  48.5  0.0003  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000151154  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1063  hypothetical protein  22.73 
 
 		 453 aa  48.1  0.0003  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.45317 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0594  outer membrane efflux protein  22.73 
 
 		 508 aa  48.1  0.0003  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3723  type I secretion outer membrane protein, TolC family  22.11 
 
 		 512 aa  48.1  0.0003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_1020  putative outer membrane protein TolC  21.71 
 
 		 423 aa  47.8  0.0004  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.808388  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1664  Type I secretion outer membrane protein, TolC  23.33 
 
 		 453 aa  47.8  0.0004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3261  type I secretion outer membrane protein, TolC  24.01 
 
 		 469 aa  47.8  0.0004  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.537181 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0533  outer membrane efflux protein  22.73 
 
 		 453 aa  47.8  0.0004  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0045  CzcC family cobalt/zinc/cadmium efflux transporter outer membrane protein  21.36 
 
 		 423 aa  45.8  0.001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000529043 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0059  outer membrane efflux protein  21.36 
 
 		 423 aa  45.8  0.001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.56854 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0062  outer membrane efflux protein  21.36 
 
 		 423 aa  45.8  0.001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000405972 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1177  outer membrane efflux protein  21.91 
 
 		 427 aa  46.2  0.001  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0251  Outer membrane efflux protein  23.59 
 
 		 466 aa  45.4  0.002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.608595  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1848  outer membrane efflux protein  24.08 
 
 		 423 aa  45.4  0.002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1990  outer membrane efflux protein  22.64 
 
 		 471 aa  45.4  0.002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.154832  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1894  TolC family type I secretion outer membrane protein  23.59 
 
 		 466 aa  45.4  0.002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.170185  normal  0.445756 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0573  outer membrane channel protein  22.22 
 
 		 464 aa  45.4  0.002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0654  outer membrane channel protein  22.22 
 
 		 464 aa  45.4  0.002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.945309  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2166  outer membrane efflux protein  24.29 
 
 		 423 aa  45.8  0.002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2630  Type I secretion outer membrane protein, TolC  21.81 
 
 		 489 aa  45.1  0.003  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1617  outer membrane efflux protein  21.81 
 
 		 467 aa  45.1  0.003  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2013  outer membrane channel protein  23.43 
 
 		 438 aa  44.3  0.004  Vibrio cholerae O395  Bacteria  unclonable  0.000000000000158125  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3444  outer membrane channel protein  20.99 
 
 		 489 aa  44.3  0.004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.606184  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3437  outer membrane channel protein  20.99 
 
 		 489 aa  44.3  0.004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3372  outer membrane channel protein  20.99 
 
 		 489 aa  44.3  0.004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.258775 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3367  outer membrane channel protein  20.99 
 
 		 489 aa  44.3  0.004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1214  type I secretion outer membrane protein, TolC family  21.82 
 
 		 450 aa  44.7  0.004  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.227292  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0544  outer membrane channel protein  22.41 
 
 		 448 aa  43.9  0.005  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  0.000000576987  normal  0.601769 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3343  type I secretion outer membrane protein, TolC family  26.47 
 
 		 452 aa  43.9  0.005  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4686  outer membrane efflux protein  28.57 
 
 		 439 aa  43.9  0.006  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.432562  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3677  outer membrane efflux protein  28.57 
 
 		 439 aa  43.9  0.006  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.621392  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2024  TolC family type I secretion outer membrane protein  28.26 
 
 		 465 aa  43.9  0.006  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4715  TolC family type I secretion outer membrane protein  23.16 
 
 		 477 aa  43.9  0.006  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.133912 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3539  outer membrane channel protein  20.99 
 
 		 489 aa  43.9  0.006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.735558  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1924  Outer membrane protein  23.15 
 
 		 494 aa  43.9  0.006  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.0996265 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2433  outer membrane efflux protein  26.87 
 
 		 440 aa  43.5  0.007  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4977  outer membrane efflux protein TolC, putative  23.79 
 
 		 479 aa  43.5  0.008  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0543  Type I secretion outer membrane protein, TolC  23.13 
 
 		 479 aa  43.5  0.008  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.991736 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0430  TolC family type I secretion outer membrane protein  24.9 
 
 		 436 aa  43.5  0.008  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.0000114483  n/a   
 
 
-
 
NC_010070  Bmul_6170  outer membrane efflux protein  28.57 
 
 		 435 aa  43.5  0.008  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.446847 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2056  outer membrane efflux protein  22.22 
 
 		 423 aa  43.5  0.008  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000000544389 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0891  outer membrane efflux protein  30.21 
 
 		 508 aa  43.1  0.009  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.116406  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02621  outer membrane protein required for AvrXa21 activity C (raxC)  24.76 
 
 		 443 aa  43.1  0.009  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1839  outer membrane efflux protein  21 
 
 		 466 aa  43.1  0.01  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.594597  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0620  outer membrane efflux protein  24.59 
 
 		 435 aa  43.1  0.01  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  decreased coverage  0.0000193694  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0610  TolC family type I secretion outer membrane protein  23.79 
 
 		 480 aa  43.1  0.01  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>