18 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tcr_0524 on replicon NC_007520
Organism: Thiomicrospira crunogena XCL-2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007520  Tcr_0524  Outer membrane efflux protein  100 
 
 		 457 aa  927    Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.125027  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0740  outer membrane efflux protein  33.65 
 
 		 445 aa  199  7e-50  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.783995  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0317  outer membrane efflux protein  33.67 
 
 		 443 aa  182  8.000000000000001e-45  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.156949  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0375  hypothetical protein  32.42 
 
 		 443 aa  179  8e-44  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.271379  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0288  outer membrane efflux protein  28.54 
 
 		 464 aa  140  6e-32  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.708573  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2116  hypothetical protein  30.91 
 
 		 420 aa  123  6e-27  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.771032  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3318  type I secretion outer membrane protein, TolC family  25.89 
 
 		 470 aa  64.3  0.000000004  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2367  outer membrane efflux protein  24.09 
 
 		 495 aa  57.8  0.0000004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0993  type I secretion outer membrane protein, TolC family  26.88 
 
 		 475 aa  56.6  0.0000009  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2362  outer membrane efflux protein  25.93 
 
 		 455 aa  54.7  0.000003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.102907  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1727  type I secretion outer membrane protein, TolC family  21.98 
 
 		 452 aa  53.1  0.000009  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.000000826676  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0224  outer membrane efflux protein  21.73 
 
 		 419 aa  50.4  0.00006  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.000720591  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2830  TolC family type I secretion outer membrane protein  26.05 
 
 		 455 aa  49.7  0.0001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0538261  hitchhiker  0.00247347 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1629  outer membrane efflux protein  21.41 
 
 		 438 aa  46.6  0.001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1217  outer membrane efflux protein  25.11 
 
 		 438 aa  45.4  0.002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.87899  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2225  outer membrane efflux protein  28.57 
 
 		 547 aa  45.1  0.003  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.17933 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1165  Outer membrane efflux protein  22.96 
 
 		 462 aa  43.9  0.005  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2697  type I secretion outer membrane protein, TolC  26.25 
 
 		 437 aa  43.9  0.006  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>