More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daro_1165 on replicon NC_007298
Organism: Dechloromonas aromatica RCB



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007298  Daro_1165  Outer membrane efflux protein  100 
 
 
462 aa  907    Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1727  type I secretion outer membrane protein, TolC family  45.37 
 
 
452 aa  358  8e-98  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.000000826676  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2822  TolC family type I secretion outer membrane protein  42.83 
 
 
479 aa  280  5e-74  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.390937  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3155  TolC family type I secretion outer membrane protein  42.83 
 
 
482 aa  280  5e-74  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.267117  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1721  TolC family type I secretion outer membrane protein  42.83 
 
 
482 aa  280  5e-74  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.456925  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0046  TolC family type I secretion outer membrane protein  42.83 
 
 
471 aa  280  6e-74  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3620  TolC family type I secretion outer membrane protein  42.83 
 
 
482 aa  279  7e-74  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3628  TolC family type I secretion outer membrane protein  42.6 
 
 
479 aa  278  1e-73  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.93917  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3644  TolC family type I secretion outer membrane protein  42.38 
 
 
471 aa  277  3e-73  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2950  TolC family type I secretion outer membrane protein  42.16 
 
 
479 aa  276  8e-73  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0945  secretion protein  42.55 
 
 
472 aa  257  3e-67  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_10330  putative outer membrane protein precursor  41.98 
 
 
471 aa  257  4e-67  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.339948  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1955  outer membrane efflux protein  42.02 
 
 
476 aa  253  5.000000000000001e-66  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.223795  normal  0.557378 
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6770  outer membrane efflux protein  39.43 
 
 
488 aa  246  6.999999999999999e-64  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3056  outer membrane efflux protein  34.66 
 
 
485 aa  238  2e-61  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.111107 
 
 
-
 
NC_003296  RS03674  putative outer membrane CHANEL lipoprotein  37.82 
 
 
488 aa  223  8e-57  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.119855 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2367  outer membrane efflux protein  33.89 
 
 
495 aa  193  5e-48  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1021  outer membrane efflux protein  34.18 
 
 
528 aa  183  5.0000000000000004e-45  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1789  outer membrane efflux protein  41.19 
 
 
493 aa  171  2e-41  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1759  outer membrane efflux protein  30.32 
 
 
738 aa  160  7e-38  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5155  outer membrane efflux protein  37.15 
 
 
481 aa  154  2.9999999999999998e-36  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.239334  normal  0.865316 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1943  outer membrane efflux protein  39.34 
 
 
490 aa  148  2.0000000000000003e-34  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.261377  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5005  outer membrane efflux protein  36.6 
 
 
485 aa  147  5e-34  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.844775 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1858  outer membrane efflux protein  39.09 
 
 
490 aa  145  1e-33  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.514737  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1054  outer membrane efflux protein  31.64 
 
 
514 aa  135  1.9999999999999998e-30  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.000452487  normal  0.217723 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4114  outer membrane efflux protein  31.52 
 
 
519 aa  133  7.999999999999999e-30  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.865486  normal  0.0282956 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2020  outer membrane efflux protein  38.01 
 
 
492 aa  131  2.0000000000000002e-29  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4579  outer membrane efflux protein  31.04 
 
 
515 aa  131  3e-29  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0188996  decreased coverage  0.000000771093 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3645  outer membrane efflux protein  30.87 
 
 
514 aa  130  5.0000000000000004e-29  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.784148  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2864  outer membrane efflux protein  30.2 
 
 
476 aa  130  6e-29  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3265  outer membrane efflux protein  30.2 
 
 
476 aa  130  6e-29  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3973  outer membrane efflux protein  31.34 
 
 
513 aa  130  7.000000000000001e-29  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.0704049 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4722  outer membrane efflux protein  30.87 
 
 
514 aa  130  7.000000000000001e-29  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0674524  decreased coverage  0.00195148 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5578  outer membrane efflux protein  30.87 
 
 
514 aa  130  7.000000000000001e-29  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0232692  hitchhiker  0.00628536 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0831  outer membrane efflux protein  29.8 
 
 
419 aa  124  2e-27  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2121  Outer membrane efflux protein  28.32 
 
 
509 aa  121  3e-26  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2169  outer membrane toxin secretion efflux protein, putative  28.24 
 
 
496 aa  119  9.999999999999999e-26  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3409  outer membrane efflux protein  30.52 
 
 
419 aa  119  9.999999999999999e-26  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000000155286  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1827  outer membrane efflux protein  28.24 
 
 
496 aa  119  9.999999999999999e-26  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.115006  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3343  type I secretion outer membrane protein, TolC family  31.81 
 
 
452 aa  117  6e-25  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008607  Ppro_3710  outer membrane efflux protein  29.78 
 
 
419 aa  116  7.999999999999999e-25  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2191  outer membrane efflux protein  28.24 
 
 
508 aa  116  8.999999999999998e-25  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4512  outer membrane efflux protein  27.15 
 
 
520 aa  115  2.0000000000000002e-24  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.0572559 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1177  outer membrane efflux protein  27.17 
 
 
427 aa  114  4.0000000000000004e-24  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_2069  TolC family type I secretion outer membrane protein  28.31 
 
 
452 aa  112  2.0000000000000002e-23  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0224  outer membrane efflux protein  28.85 
 
 
419 aa  111  3e-23  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.000720591  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0096  outer membrane efflux protein  24.84 
 
 
441 aa  110  6e-23  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0594  outer membrane efflux protein  28.81 
 
 
508 aa  110  7.000000000000001e-23  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1063  hypothetical protein  28.76 
 
 
453 aa  109  1e-22  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.45317 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0533  outer membrane efflux protein  28.81 
 
 
453 aa  109  1e-22  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0239  outer membrane efflux protein  28.02 
 
 
521 aa  109  1e-22  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.368646  normal 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2156  outer membrane export factor  28.05 
 
 
452 aa  108  2e-22  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0193  outer membrane efflux protein  28.47 
 
 
527 aa  106  9e-22  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.339929  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4354  Outer membrane efflux protein  27.98 
 
 
517 aa  102  1e-20  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2321  putative secretion protein  34.26 
 
 
461 aa  102  1e-20  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02621  outer membrane protein required for AvrXa21 activity C (raxC)  29.9 
 
 
443 aa  100  4e-20  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1698  outer membrane efflux protein  29.54 
 
 
433 aa  99.4  1e-19  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.572085  normal  0.0641673 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3801  outer membrane efflux protein  26.89 
 
 
449 aa  97.4  4e-19  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.233057 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3165  outer membrane efflux protein  31.28 
 
 
445 aa  97.1  7e-19  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.391786  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3057  outer membrane efflux protein  31.03 
 
 
440 aa  94.4  4e-18  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.969203  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3157  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT family  30.08 
 
 
480 aa  94  6e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1723  outer membrane efflux protein  28.21 
 
 
436 aa  93.2  9e-18  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0066  outer membrane efflux protein  27.1 
 
 
443 aa  92.8  1e-17  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2969  outer membrane efflux protein  30.95 
 
 
443 aa  92  2e-17  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.725894  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1126  TolC family type I secretion outer membrane protein  28.42 
 
 
450 aa  91.3  3e-17  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1376  Outer membrane efflux protein  28.13 
 
 
435 aa  90.1  8e-17  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.109779  hitchhiker  0.00244241 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1633  outer membrane efflux protein  26.18 
 
 
470 aa  89.4  1e-16  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.788464  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1664  Type I secretion outer membrane protein, TolC  28.95 
 
 
453 aa  89.4  1e-16  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2704  outer membrane efflux protein  24.93 
 
 
423 aa  87.4  5e-16  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3465  Outer membrane efflux protein  26.41 
 
 
441 aa  87  6e-16  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0057  outer membrane protein, putative  27.91 
 
 
470 aa  86.7  8e-16  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0527  outer membrane protein OprM precursor  29.74 
 
 
485 aa  85.9  0.000000000000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.71666  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2510  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT family  29.71 
 
 
465 aa  86.3  0.000000000000001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_05550  major intrinsic multiple antibiotic resistance efflux outer membrane protein OprM precursor  29.74 
 
 
485 aa  85.9  0.000000000000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.203755  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0950  outer membrane efflux protein  28.67 
 
 
424 aa  85.5  0.000000000000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1482  outer membrane efflux protein  26.25 
 
 
426 aa  85.9  0.000000000000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.979092  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3447  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT family  28.37 
 
 
477 aa  85.5  0.000000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.689762 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0733  outer membrane efflux protein, putative  27.31 
 
 
463 aa  85.1  0.000000000000002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0071  outer membrane efflux protein  25.47 
 
 
441 aa  85.5  0.000000000000002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6515  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT family  30.62 
 
 
477 aa  84.7  0.000000000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.0241936 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0610  TolC family type I secretion outer membrane protein  27.58 
 
 
480 aa  85.1  0.000000000000003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1929  multidrug efflux outer membrane protein EefC  28.27 
 
 
457 aa  84.7  0.000000000000003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000583054 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3129  Outer membrane efflux protein  26.39 
 
 
446 aa  84.3  0.000000000000004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.000215977  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0480  RND efflux system outer membrane lipoprotein  25.66 
 
 
505 aa  84.3  0.000000000000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.0104002 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1834  multidrug efflux outer membrane protein EefC  28.48 
 
 
457 aa  84  0.000000000000005  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000044393 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3841  RND efflux system outer membrane lipoprotein  30.79 
 
 
490 aa  83.6  0.000000000000006  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.626052  normal  0.467321 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0611  TolC family type I secretion outer membrane protein  23.29 
 
 
464 aa  83.6  0.000000000000007  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1617  outer membrane efflux protein  26.95 
 
 
467 aa  83.6  0.000000000000007  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3717  RND efflux system outer membrane lipoprotein  29.66 
 
 
477 aa  83.2  0.000000000000009  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0491  Type I secretion outer membrane protein, TolC  25.62 
 
 
477 aa  83.2  0.00000000000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.00611692  normal 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4373  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT family  28.89 
 
 
483 aa  82.8  0.00000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2517  Outer membrane efflux protein  28.25 
 
 
455 aa  82  0.00000000000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0940003  normal  0.677218 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1749  outer membrane efflux protein  24.55 
 
 
458 aa  81.6  0.00000000000002  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS01890  outer membrane drug efflux lipoprotein  28.61 
 
 
491 aa  81.6  0.00000000000003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0642226  normal  0.753424 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4976  TolC family type I secretion outer membrane protein  25.31 
 
 
478 aa  80.5  0.00000000000006  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2298  outer membrane efflux protein  29.75 
 
 
525 aa  80.1  0.00000000000007  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1633  outer membrane efflux protein  27.38 
 
 
420 aa  79.7  0.00000000000009  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.159543  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0066  outer membrane efflux protein  31.6 
 
 
436 aa  79.7  0.00000000000009  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4923  TolC family type I secretion outer membrane protein  25.58 
 
 
477 aa  79.7  0.0000000000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4799  TolC family type I secretion outer membrane protein  25.58 
 
 
477 aa  79.7  0.0000000000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.125067  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>