50 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tgr7_0375 on replicon NC_011901
Organism: Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011901  Tgr7_0375  hypothetical protein  100 
 
 		 443 aa  872    Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.271379  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0317  outer membrane efflux protein  92.55 
 
 		 443 aa  789    Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.156949  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0288  outer membrane efflux protein  45.99 
 
 		 464 aa  311  1e-83  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.708573  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2116  hypothetical protein  40.8 
 
 		 420 aa  226  5.0000000000000005e-58  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.771032  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0740  outer membrane efflux protein  34.73 
 
 		 445 aa  219  6e-56  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.783995  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0524  Outer membrane efflux protein  32.42 
 
 		 457 aa  182  1e-44  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.125027  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2362  outer membrane efflux protein  26.97 
 
 		 455 aa  77.4  0.0000000000004  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.102907  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3318  type I secretion outer membrane protein, TolC family  25.98 
 
 		 470 aa  57.8  0.0000004  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2830  TolC family type I secretion outer membrane protein  31.75 
 
 		 455 aa  57.4  0.0000005  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0538261  hitchhiker  0.00247347 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0162  outer membrane efflux protein  25.62 
 
 		 433 aa  57  0.0000006  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3120  TolC family type I secretion outer membrane protein  24.28 
 
 		 467 aa  53.5  0.000007  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.893346  normal  0.154573 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3457  type I secretion outer membrane protein, TolC family  26.35 
 
 		 434 aa  53.5  0.000007  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0096  outer membrane efflux protein  22.78 
 
 		 441 aa  52  0.00002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2664  outer membrane efflux protein  28.37 
 
 		 1496 aa  52  0.00002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4008  TolC family type I secretion outer membrane protein  24.33 
 
 		 562 aa  51.6  0.00003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0831  outer membrane efflux protein  24.78 
 
 		 419 aa  50.8  0.00004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1482  outer membrane efflux protein  25.93 
 
 		 426 aa  51.2  0.00004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.979092  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0993  type I secretion outer membrane protein, TolC family  26.85 
 
 		 475 aa  50.4  0.00006  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2883  TolC family type I secretion outer membrane protein  24.3 
 
 		 442 aa  50.4  0.00007  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.00170075  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3124  outer membrane efflux protein  25.26 
 
 		 448 aa  48.9  0.0002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1165  Outer membrane efflux protein  28 
 
 		 462 aa  48.5  0.0003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0652  TolC family type I secretion outer membrane protein  25.09 
 
 		 428 aa  47.4  0.0005  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000000458305  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0366  putative secretion protein  28.64 
 
 		 454 aa  47  0.0006  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.676066  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3343  type I secretion outer membrane protein, TolC family  29.74 
 
 		 452 aa  47.4  0.0006  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0585  TolC family type I secretion outer membrane protein  29.69 
 
 		 456 aa  47  0.0007  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.449084  normal  0.127961 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2697  type I secretion outer membrane protein, TolC  25.99 
 
 		 437 aa  46.2  0.001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1338  type I secretion outer membrane protein, TolC family  26.29 
 
 		 456 aa  46.6  0.001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0728783  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4144  alkaline protease secretion protein AprF  27.54 
 
 		 477 aa  46.2  0.001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0485622  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0224  outer membrane efflux protein  24.64 
 
 		 419 aa  45.8  0.002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.000720591  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2630  Type I secretion outer membrane protein, TolC  25.18 
 
 		 489 aa  45.4  0.002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4306  outer membrane efflux protein  27.41 
 
 		 447 aa  45.4  0.002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_48090  alkaline protease secretion outer membrane protein AprF precursor  27.62 
 
 		 481 aa  45.1  0.002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.0152412 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_4004  acriflavin resistance protein  24.36 
 
 		 1470 aa  45.4  0.002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2024  TolC family type I secretion outer membrane protein  25.34 
 
 		 465 aa  45.8  0.002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2243  TolC family type I secretion outer membrane protein  25.09 
 
 		 455 aa  45.1  0.002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2367  outer membrane efflux protein  23.17 
 
 		 495 aa  45.4  0.002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4268  outer membrane channel protein  25.22 
 
 		 497 aa  44.7  0.003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.0102816 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1304  Type I secretion outer membrane protein, TolC  24.87 
 
 		 446 aa  45.1  0.003  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000151154  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3409  outer membrane efflux protein  26.82 
 
 		 419 aa  44.7  0.003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000000155286  n/a   
 
 
-
 
NC_010335  Caul_5123  RND efflux system outer membrane lipoprotein  28.16 
 
 		 510 aa  44.3  0.004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR0945  outer membrane efflux family protein  22.95 
 
 		 456 aa  44.3  0.004  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.681331  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2457  type I secretion outer membrane protein, TolC family  28.22 
 
 		 449 aa  44.3  0.004  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_2069  TolC family type I secretion outer membrane protein  26.83 
 
 		 452 aa  44.3  0.005  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2534  Type I secretion outer membrane protein, TolC  27.11 
 
 		 468 aa  43.9  0.005  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0814  outer membrane efflux protein  24.6 
 
 		 460 aa  43.9  0.006  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1162  outer membrane efflux protein  23.35 
 
 		 515 aa  43.9  0.006  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  unclonable  0.0000199135  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0938  outer membrane efflux family protein  22.95 
 
 		 452 aa  43.5  0.007  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02621  outer membrane protein required for AvrXa21 activity C (raxC)  24.82 
 
 		 443 aa  43.5  0.008  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_65750  putative outer membrane efflux protein precursor  25.42 
 
 		 482 aa  43.1  0.009  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3619  outer membrane channel protein  28.57 
 
 		 469 aa  43.1  0.01  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>