78 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TK90_0288 on replicon NC_013889
Organism: Thioalkalivibrio sp. K90mix



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013889  TK90_0288  outer membrane efflux protein  100 
 
 		 464 aa  913    Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.708573  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0375  hypothetical protein  45.99 
 
 		 443 aa  301  1e-80  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.271379  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0317  outer membrane efflux protein  45.01 
 
 		 443 aa  292  8e-78  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.156949  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0740  outer membrane efflux protein  29.63 
 
 		 445 aa  163  6e-39  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.783995  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2116  hypothetical protein  35.47 
 
 		 420 aa  161  2e-38  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.771032  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0524  Outer membrane efflux protein  28.54 
 
 		 457 aa  135  1.9999999999999998e-30  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.125027  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0224  outer membrane efflux protein  26.42 
 
 		 419 aa  66.2  0.000000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.000720591  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1165  Outer membrane efflux protein  28.88 
 
 		 462 aa  63.2  0.000000009  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0831  outer membrane efflux protein  27.15 
 
 		 419 aa  60.5  0.00000007  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2883  TolC family type I secretion outer membrane protein  23.23 
 
 		 442 aa  58.5  0.0000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.00170075  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3409  outer membrane efflux protein  27.49 
 
 		 419 aa  58.5  0.0000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000000155286  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS03674  putative outer membrane CHANEL lipoprotein  26.98 
 
 		 488 aa  57.4  0.0000005  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.119855 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3343  type I secretion outer membrane protein, TolC family  31.4 
 
 		 452 aa  57.4  0.0000005  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1162  outer membrane efflux protein  24.45 
 
 		 515 aa  57.4  0.0000006  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  unclonable  0.0000199135  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_2069  TolC family type I secretion outer membrane protein  28.93 
 
 		 452 aa  57  0.0000007  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3457  type I secretion outer membrane protein, TolC family  31 
 
 		 434 aa  55.8  0.000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1727  type I secretion outer membrane protein, TolC family  25.09 
 
 		 452 aa  55.5  0.000002  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.000000826676  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2156  outer membrane export factor  28.51 
 
 		 452 aa  54.7  0.000004  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1211  hypothetical protein  30.41 
 
 		 496 aa  53.5  0.000008  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.65199  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0802  TolC family type I secretion outer membrane protein  28.98 
 
 		 453 aa  52  0.00002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2367  outer membrane efflux protein  25.14 
 
 		 495 aa  52.4  0.00002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_13520  putative outer membrane protein  29.82 
 
 		 496 aa  52.4  0.00002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.620918  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1629  outer membrane efflux protein  28.65 
 
 		 438 aa  51.2  0.00004  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1263  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT family  31.54 
 
 		 509 aa  50.8  0.00005  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4460  RND efflux system outer membrane lipoprotein  31.54 
 
 		 509 aa  50.8  0.00005  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4120  heavy metal cation tricomponent efflux outer membrane porin HmyC  24.76 
 
 		 460 aa  50.1  0.00009  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0176  outer membrane protein  34.95 
 
 		 414 aa  49.7  0.0001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1304  Type I secretion outer membrane protein, TolC  27.48 
 
 		 446 aa  49.3  0.0001  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000151154  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2517  Outer membrane efflux protein  25.77 
 
 		 455 aa  49.3  0.0001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0940003  normal  0.677218 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4583  RND efflux system outer membrane lipoprotein  31.54 
 
 		 509 aa  50.1  0.0001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.244926  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0979  outer membrane efflux protein  28.22 
 
 		 375 aa  49.7  0.0001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.2318 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4278  NodT family outer membrane lipoprotein  28.74 
 
 		 483 aa  49.3  0.0001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0872817  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0866  RND efflux system outer membrane lipoprotein  31.54 
 
 		 509 aa  48.9  0.0002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1929  outer membrane efflux protein  27.32 
 
 		 447 aa  48.1  0.0003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.845235  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1376  Outer membrane efflux protein  27.89 
 
 		 435 aa  48.5  0.0003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.109779  hitchhiker  0.00244241 
 
 
-
 
NC_008607  Ppro_3710  outer membrane efflux protein  26.51 
 
 		 419 aa  47.8  0.0004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3318  type I secretion outer membrane protein, TolC family  25.46 
 
 		 470 aa  47.8  0.0004  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1265  outer membrane efflux protein  25.88 
 
 		 481 aa  47.4  0.0005  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000567174 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2559  RND efflux system outer membrane lipoprotein  27.88 
 
 		 527 aa  47.4  0.0005  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0543  Type I secretion outer membrane protein, TolC  28.64 
 
 		 479 aa  47.4  0.0006  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.991736 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0585  TolC family type I secretion outer membrane protein  28.9 
 
 		 456 aa  47  0.0007  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.449084  normal  0.127961 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3802  Outer membrane efflux protein  24.21 
 
 		 465 aa  47  0.0007  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2630  Type I secretion outer membrane protein, TolC  24.87 
 
 		 489 aa  47  0.0008  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_10330  putative outer membrane protein precursor  25.89 
 
 		 471 aa  46.6  0.0009  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.339948  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0134  outer membrane efflux protein  28.63 
 
 		 439 aa  46.6  0.0009  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.410876  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0491  Type I secretion outer membrane protein, TolC  28.86 
 
 		 477 aa  46.6  0.001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.00611692  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1724  RND efflux system outer membrane lipoprotein  27.75 
 
 		 515 aa  46.6  0.001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1617  outer membrane efflux protein  23.62 
 
 		 467 aa  46.6  0.001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2675  outer membrane channel protein  26.78 
 
 		 441 aa  46.2  0.001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2362  outer membrane efflux protein  25.9 
 
 		 455 aa  46.6  0.001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.102907  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0744  Type I secretion outer membrane protein, TolC  24.26 
 
 		 449 aa  45.1  0.002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.291612  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4268  outer membrane channel protein  24.02 
 
 		 497 aa  45.1  0.003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.0102816 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1600  OMF family outer membrane efflux protein  35.85 
 
 		 514 aa  44.7  0.003  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  decreased coverage  0.00101188  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1124  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT family  32.46 
 
 		 509 aa  44.7  0.004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.405736 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02621  outer membrane protein required for AvrXa21 activity C (raxC)  27.8 
 
 		 443 aa  44.7  0.004  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4977  outer membrane efflux protein TolC, putative  28.57 
 
 		 479 aa  44.7  0.004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3165  outer membrane efflux protein  28.77 
 
 		 445 aa  44.7  0.004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.391786  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4976  TolC family type I secretion outer membrane protein  28.29 
 
 		 478 aa  44.3  0.005  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0945  secretion protein  25.83 
 
 		 472 aa  44.3  0.005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0938  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT  27.52 
 
 		 499 aa  43.9  0.005  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3620  TolC family type I secretion outer membrane protein  25.43 
 
 		 482 aa  43.9  0.005  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2765  outer membrane efflux protein  26.7 
 
 		 498 aa  43.9  0.006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4754  outer membrane efflux protein  26.7 
 
 		 500 aa  43.9  0.006  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.203593  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3413  outer membrane efflux protein  26.7 
 
 		 500 aa  43.9  0.006  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1721  TolC family type I secretion outer membrane protein  25.43 
 
 		 482 aa  43.9  0.006  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.456925  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3155  TolC family type I secretion outer membrane protein  25.43 
 
 		 482 aa  43.9  0.006  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.267117  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3120  TolC family type I secretion outer membrane protein  30.56 
 
 		 467 aa  43.9  0.006  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.893346  normal  0.154573 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0046  TolC family type I secretion outer membrane protein  25.43 
 
 		 471 aa  43.5  0.007  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2822  TolC family type I secretion outer membrane protein  25.43 
 
 		 479 aa  43.9  0.007  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.390937  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3628  TolC family type I secretion outer membrane protein  25.43 
 
 		 479 aa  43.5  0.007  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.93917  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2912  hypothetical protein  28.28 
 
 		 533 aa  43.5  0.008  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2352  TolC family type I secretion outer membrane protein  27.97 
 
 		 446 aa  43.1  0.009  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5330  outer membrane efflux protein  20.27 
 
 		 429 aa  43.1  0.009  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.757466 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1282  outer membrane efflux protein  35.48 
 
 		 446 aa  43.1  0.009  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.0406152  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4103  outer membrane efflux protein  26.7 
 
 		 500 aa  43.5  0.009  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.733493  normal  0.726802 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0483  type I secretion outer membrane protein, TolC  29.03 
 
 		 440 aa  43.1  0.01  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0993  type I secretion outer membrane protein, TolC family  24.61 
 
 		 475 aa  43.1  0.01  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2866  outer membrane efflux protein  24.76 
 
 		 480 aa  43.1  0.01  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.0685652 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>