118 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Maqu_0134 on replicon NC_008740
Organism: Marinobacter aquaeolei VT8



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008740  Maqu_0134  outer membrane efflux protein  100 
 
 
439 aa  885    Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.410876  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1929  outer membrane efflux protein  42.82 
 
 
447 aa  345  8e-94  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.845235  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4856  putative cation efflux protein  43.29 
 
 
496 aa  330  4e-89  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00318  putative cation efflux protein  40.38 
 
 
454 aa  310  2e-83  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2394  outer membrane efflux protein  31.25 
 
 
487 aa  201  1.9999999999999998e-50  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001397  heavy metal RND efflux CzcC family  30.5 
 
 
473 aa  183  5.0000000000000004e-45  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06364  hypothetical protein  30.99 
 
 
463 aa  178  2e-43  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1368  copper/silver resistance outer membrane protein  29.85 
 
 
437 aa  169  9e-41  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0176  outer membrane protein  31.59 
 
 
414 aa  167  2e-40  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0716  hypothetical protein  30.57 
 
 
444 aa  157  3e-37  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1388  outer membrane efflux protein  34.1 
 
 
417 aa  153  7e-36  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.615787 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0276  outer membrane efflux protein  27.32 
 
 
449 aa  143  5e-33  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0967709  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1528  Outer membrane efflux protein  27.63 
 
 
501 aa  128  2.0000000000000002e-28  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008758  Pnap_4511  outer membrane efflux protein  28.97 
 
 
428 aa  126  8.000000000000001e-28  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.336672  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2262  outer membrane heavy metal efflux protein  25.66 
 
 
426 aa  118  1.9999999999999998e-25  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2210  outer membrane efflux protein  28.84 
 
 
420 aa  115  2.0000000000000002e-24  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.119249  normal  0.0896895 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3493  outer membrane efflux protein  26.21 
 
 
428 aa  113  6e-24  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.497066 
 
 
-
 
NC_008607  Ppro_3648  outer membrane efflux protein  23.92 
 
 
446 aa  113  6e-24  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0170  outer membrane efflux protein  27.09 
 
 
436 aa  110  5e-23  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1619  outer membrane efflux protein  29.21 
 
 
427 aa  108  2e-22  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.891221  hitchhiker  0.0000204841 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1949  outer membrane heavy metal efflux protein, putative  29.21 
 
 
427 aa  108  2e-22  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1625  putative outer membrane cation efflux protein  28.13 
 
 
438 aa  108  3e-22  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.164606 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1807  cobalt-zinc-cadmium resistance outer membrane porin  27.75 
 
 
433 aa  107  3e-22  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.804371 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2062  outer membrane efflux protein  26.25 
 
 
436 aa  107  4e-22  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2434  outer membrane efflux protein  26.25 
 
 
433 aa  107  5e-22  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.990538  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2394  CzcC family heavy metal RND efflux outer membrane protein  26.83 
 
 
418 aa  105  1e-21  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.794005  hitchhiker  0.00223071 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6301  outer membrane efflux protein  29.29 
 
 
410 aa  105  2e-21  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5357  outer membrane efflux protein  27.82 
 
 
433 aa  102  1e-20  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2929  outer membrane efflux protein  24.69 
 
 
443 aa  102  1e-20  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2056  outer membrane efflux protein  25.85 
 
 
423 aa  102  2e-20  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000000544389 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2166  outer membrane efflux protein  24.39 
 
 
423 aa  100  6e-20  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS05407  putative outer membrane cation efflux protein  27.93 
 
 
434 aa  99.4  1e-19  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1335  CzcC family heavy metal RND efflux outer membrane protein  27.78 
 
 
429 aa  99.4  1e-19  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1716  outer membrane protein  25.68 
 
 
440 aa  99.4  1e-19  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000584875  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0020  outer membrane efflux protein  27.74 
 
 
417 aa  99  1e-19  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.0171536 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0022  outer membrane efflux protein  27.74 
 
 
417 aa  99  1e-19  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0020  outer membrane efflux protein  27.74 
 
 
417 aa  99  1e-19  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.257437  normal 
 
 
-
 
NC_007971  Rmet_6134  proton antiporter metal efflux protein SilC  26.01 
 
 
435 aa  96.7  7e-19  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.144513  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3041  outer membrane efflux protein  26.28 
 
 
417 aa  95.5  2e-18  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.764893  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0475  putative outer membrane cation efflux protein  26.53 
 
 
437 aa  94.4  4e-18  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.668446  normal 
 
 
-
 
NC_010070  Bmul_6284  outer membrane efflux protein  24.94 
 
 
430 aa  94.4  4e-18  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.524439  normal  0.254062 
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5289  outer membrane efflux protein  25.5 
 
 
434 aa  92.8  1e-17  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1648  outer membrane efflux protein  25.5 
 
 
434 aa  92.8  1e-17  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5385  CzcC family heavy metal RND efflux outer membrane protein  27.07 
 
 
417 aa  92  2e-17  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.899362 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4767  outer membrane efflux protein  26.65 
 
 
430 aa  92  2e-17  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3400  outer membrane efflux protein  26.65 
 
 
430 aa  92  2e-17  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4116  outer membrane efflux protein  26.64 
 
 
430 aa  92  2e-17  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5031  heavy metal cation tricomponent efflux outer membrane porin CusC  27.3 
 
 
433 aa  90.9  4e-17  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.11545 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0087  outer membrane efflux protein  22.34 
 
 
424 aa  89.7  9e-17  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3343  outer membrane efflux protein  25.62 
 
 
412 aa  88.6  2e-16  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5180  outer membrane efflux protein  25.37 
 
 
430 aa  88.2  3e-16  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5688  outer membrane efflux protein  25.41 
 
 
430 aa  88.2  3e-16  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0325821  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1549  Outer membrane efflux protein  22.52 
 
 
426 aa  87.8  4e-16  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.069846  normal  0.874867 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2548  outer membrane efflux protein  28.57 
 
 
408 aa  87.4  4e-16  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4013  CzcC family heavy metal RND efflux outer membrane protein  26.76 
 
 
414 aa  87.4  5e-16  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.498662  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1408  Outer membrane efflux protein  22.11 
 
 
466 aa  84.3  0.000000000000003  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3077  outer membrane efflux protein  24.25 
 
 
426 aa  82.4  0.00000000000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.767775  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1330  metal ion efflux outer membrane protein family protein, putative  24.39 
 
 
493 aa  82  0.00000000000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2363  chemiosmotic efflux system B protein C  23.17 
 
 
419 aa  75.9  0.000000000001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2892  outer membrane efflux protein  25.65 
 
 
419 aa  76.3  0.000000000001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3073  outer membrane efflux protein  25.89 
 
 
419 aa  76.3  0.000000000001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1167  outer membrane efflux protein  25.12 
 
 
419 aa  73.6  0.000000000006  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0863  outer membrane efflux protein  22.6 
 
 
443 aa  73.9  0.000000000006  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.0886206  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2439  CzcC family heavy metal RND efflux outer membrane protein  25.92 
 
 
408 aa  73.2  0.000000000008  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2326  outer membrane efflux protein  25.07 
 
 
407 aa  70.9  0.00000000005  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.347361  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1261  outer membrane efflux protein  24.87 
 
 
419 aa  68.2  0.0000000003  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3364  outer membrane efflux protein  28.17 
 
 
419 aa  66.6  0.0000000008  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0128671  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2395  CzcC family heavy metal RND efflux outer membrane protein  24.11 
 
 
409 aa  63.5  0.000000007  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.502937  normal  0.0320057 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2478  Outer membrane efflux protein  25.87 
 
 
416 aa  62.8  0.00000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA3374  outer membrane efflux protein  27.07 
 
 
433 aa  59.7  0.00000009  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3044  outer membrane efflux protein  27.07 
 
 
433 aa  59.7  0.00000009  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2048  outer membrane efflux protein  27.07 
 
 
433 aa  59.7  0.00000009  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2236  outer membrane efflux protein  27.07 
 
 
433 aa  59.7  0.00000009  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0512  outer membrane efflux protein  26.69 
 
 
433 aa  59.3  0.0000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0330  outer membrane efflux protein  26.69 
 
 
433 aa  59.3  0.0000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1155  hypothetical protein  25.39 
 
 
418 aa  59.3  0.0000001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2050  CzcC family heavy metal RND efflux outer membrane protein  24.49 
 
 
411 aa  59.3  0.0000001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00202753 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4106  outer membrane efflux protein  26.17 
 
 
473 aa  58.5  0.0000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03275  putative cation efflux protein  30.34 
 
 
117 aa  57.8  0.0000004  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0317  outer membrane efflux protein  26.69 
 
 
433 aa  57  0.0000006  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4257  outer membrane efflux protein  25.85 
 
 
473 aa  57  0.0000006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4234  outer membrane efflux protein  25.85 
 
 
473 aa  57  0.0000007  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.702007  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2435  outer membrane efflux protein  21.61 
 
 
438 aa  56.6  0.0000009  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1537  Outer membrane efflux protein  22.4 
 
 
445 aa  51.2  0.00004  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0549  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT family  32.12 
 
 
501 aa  50.8  0.00005  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.569542  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2604  Type I secretion outer membrane protein, TolC  26.57 
 
 
442 aa  50.4  0.00006  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0545  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT family  31.39 
 
 
470 aa  50.4  0.00007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.540838  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0516  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT  30.66 
 
 
500 aa  48.9  0.0002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0482869  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2843  outer membrane efflux protein  27.95 
 
 
489 aa  48.9  0.0002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0745  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT  27.27 
 
 
477 aa  48.1  0.0003  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.321053 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2185  outer membrane efflux protein  24.07 
 
 
424 aa  48.1  0.0003  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.685797  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1793  outer membrane efflux protein  25.77 
 
 
463 aa  47.4  0.0006  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.314198  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1481  outer membrane efflux protein  22.94 
 
 
424 aa  47  0.0006  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.103233  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2711  outer membrane lipoprotein precursor  24.03 
 
 
499 aa  47.4  0.0006  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.299078  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0288  outer membrane efflux protein  28.63 
 
 
464 aa  46.6  0.0008  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.708573  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0066  outer membrane efflux protein  37.5 
 
 
436 aa  46.6  0.0008  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2428  RND efflux system outer membrane lipoprotein  26.79 
 
 
509 aa  46.6  0.0008  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.440095 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4745  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT family  27.63 
 
 
502 aa  46.6  0.0009  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.222051  normal  0.460518 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2263  Outer membrane efflux protein  24.27 
 
 
424 aa  46.6  0.001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_31920  putative outer membrane protein  23.64 
 
 
498 aa  46.2  0.001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.964531  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>