132 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sala_2439 on replicon NC_008048
Organism: Sphingopyxis alaskensis RB2256



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008048  Sala_2439  CzcC family heavy metal RND efflux outer membrane protein  100 
 
 		 408 aa  788    Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2395  CzcC family heavy metal RND efflux outer membrane protein  73.3 
 
 		 409 aa  487  1e-136  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.502937  normal  0.0320057 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2548  outer membrane efflux protein  47.04 
 
 		 408 aa  305  1.0000000000000001e-81  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2326  outer membrane efflux protein  43.85 
 
 		 407 aa  271  2e-71  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.347361  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2210  outer membrane efflux protein  38.12 
 
 		 420 aa  240  4e-62  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.119249  normal  0.0896895 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2394  CzcC family heavy metal RND efflux outer membrane protein  37.81 
 
 		 418 aa  215  9.999999999999999e-55  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.794005  hitchhiker  0.00223071 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0020  outer membrane efflux protein  36.88 
 
 		 417 aa  201  9.999999999999999e-51  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.0171536 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0022  outer membrane efflux protein  36.88 
 
 		 417 aa  201  9.999999999999999e-51  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0020  outer membrane efflux protein  36.88 
 
 		 417 aa  201  9.999999999999999e-51  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.257437  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5385  CzcC family heavy metal RND efflux outer membrane protein  36.76 
 
 		 417 aa  201  1.9999999999999998e-50  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.899362 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3041  outer membrane efflux protein  35.93 
 
 		 417 aa  197  3e-49  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.764893  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1335  CzcC family heavy metal RND efflux outer membrane protein  36.59 
 
 		 429 aa  196  6e-49  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4013  CzcC family heavy metal RND efflux outer membrane protein  36.25 
 
 		 414 aa  191  2.9999999999999997e-47  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.498662  n/a   
 
 
-
 
NC_008758  Pnap_4511  outer membrane efflux protein  31.23 
 
 		 428 aa  155  9e-37  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.336672  normal  1 
 
 
-
 
NC_010070  Bmul_6284  outer membrane efflux protein  29.61 
 
 		 430 aa  152  8.999999999999999e-36  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.524439  normal  0.254062 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0475  putative outer membrane cation efflux protein  31.28 
 
 		 437 aa  150  3e-35  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.668446  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3493  outer membrane efflux protein  31.4 
 
 		 428 aa  145  1e-33  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.497066 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5688  outer membrane efflux protein  30.3 
 
 		 430 aa  144  3e-33  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0325821  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1625  putative outer membrane cation efflux protein  31.05 
 
 		 438 aa  144  4e-33  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.164606 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2050  CzcC family heavy metal RND efflux outer membrane protein  33.08 
 
 		 411 aa  143  7e-33  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00202753 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3073  outer membrane efflux protein  30.83 
 
 		 419 aa  140  3e-32  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1261  outer membrane efflux protein  30.37 
 
 		 419 aa  139  8.999999999999999e-32  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3343  outer membrane efflux protein  30.03 
 
 		 412 aa  138  2e-31  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5180  outer membrane efflux protein  29.77 
 
 		 430 aa  137  3.0000000000000003e-31  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4767  outer membrane efflux protein  31.49 
 
 		 430 aa  135  9.999999999999999e-31  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3400  outer membrane efflux protein  31.49 
 
 		 430 aa  135  9.999999999999999e-31  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4116  outer membrane efflux protein  31.68 
 
 		 430 aa  135  9.999999999999999e-31  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2892  outer membrane efflux protein  28.89 
 
 		 419 aa  131  2.0000000000000002e-29  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007971  Rmet_6134  proton antiporter metal efflux protein SilC  30.77 
 
 		 435 aa  131  2.0000000000000002e-29  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.144513  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3364  outer membrane efflux protein  31.65 
 
 		 419 aa  130  5.0000000000000004e-29  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0128671  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1155  hypothetical protein  28.72 
 
 		 418 aa  126  6e-28  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5289  outer membrane efflux protein  31.23 
 
 		 434 aa  124  4e-27  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1648  outer membrane efflux protein  31.23 
 
 		 434 aa  124  4e-27  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6301  outer membrane efflux protein  31.74 
 
 		 410 aa  121  1.9999999999999998e-26  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1167  outer membrane efflux protein  29.07 
 
 		 419 aa  121  1.9999999999999998e-26  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1807  cobalt-zinc-cadmium resistance outer membrane porin  30.52 
 
 		 433 aa  119  7e-26  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.804371 
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5357  outer membrane efflux protein  29.85 
 
 		 433 aa  115  2.0000000000000002e-24  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5031  heavy metal cation tricomponent efflux outer membrane porin CusC  31.65 
 
 		 433 aa  110  3e-23  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.11545 
 
 
-
 
NC_006348  BMA3374  outer membrane efflux protein  31.83 
 
 		 433 aa  110  5e-23  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3044  outer membrane efflux protein  31.83 
 
 		 433 aa  110  5e-23  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2048  outer membrane efflux protein  31.83 
 
 		 433 aa  110  5e-23  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2236  outer membrane efflux protein  31.83 
 
 		 433 aa  110  5e-23  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0317  outer membrane efflux protein  31.83 
 
 		 433 aa  109  7.000000000000001e-23  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0512  outer membrane efflux protein  31.55 
 
 		 433 aa  108  1e-22  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0330  outer membrane efflux protein  31.55 
 
 		 433 aa  108  1e-22  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0176  outer membrane protein  27.63 
 
 		 414 aa  107  3e-22  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS05407  putative outer membrane cation efflux protein  28.48 
 
 		 434 aa  103  5e-21  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00318  putative cation efflux protein  24.82 
 
 		 454 aa  101  2e-20  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4856  putative cation efflux protein  23.4 
 
 		 496 aa  97.8  3e-19  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1929  outer membrane efflux protein  25.47 
 
 		 447 aa  97.8  3e-19  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.845235  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0134  outer membrane efflux protein  26.06 
 
 		 439 aa  95.9  1e-18  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.410876  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0276  outer membrane efflux protein  30.94 
 
 		 449 aa  95.5  2e-18  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0967709  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2262  outer membrane heavy metal efflux protein  28.93 
 
 		 426 aa  91.3  3e-17  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2166  outer membrane efflux protein  26.68 
 
 		 423 aa  88.2  2e-16  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2394  outer membrane efflux protein  23.22 
 
 		 487 aa  86.7  8e-16  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2435  outer membrane efflux protein  26.15 
 
 		 438 aa  82.4  0.00000000000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1388  outer membrane efflux protein  33.23 
 
 		 417 aa  82  0.00000000000002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.615787 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2056  outer membrane efflux protein  25.46 
 
 		 423 aa  80.9  0.00000000000004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000000544389 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1716  outer membrane protein  26.1 
 
 		 440 aa  80.1  0.00000000000007  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000584875  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1330  metal ion efflux outer membrane protein family protein, putative  27 
 
 		 493 aa  78.6  0.0000000000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008607  Ppro_3648  outer membrane efflux protein  24.94 
 
 		 446 aa  77.8  0.0000000000003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1408  Outer membrane efflux protein  26.84 
 
 		 466 aa  77  0.0000000000005  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0087  outer membrane efflux protein  24.76 
 
 		 424 aa  77  0.0000000000005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3077  outer membrane efflux protein  23.72 
 
 		 426 aa  75.1  0.000000000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.767775  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1619  outer membrane efflux protein  26.9 
 
 		 427 aa  74.7  0.000000000003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.891221  hitchhiker  0.0000204841 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1949  outer membrane heavy metal efflux protein, putative  26.9 
 
 		 427 aa  74.7  0.000000000003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1848  outer membrane efflux protein  26.3 
 
 		 423 aa  73.9  0.000000000005  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1549  Outer membrane efflux protein  24.58 
 
 		 426 aa  70.9  0.00000000004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.069846  normal  0.874867 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3648  outer membrane efflux protein  26.18 
 
 		 424 aa  70.5  0.00000000006  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.856557 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4234  outer membrane efflux protein  30.09 
 
 		 473 aa  70.1  0.00000000007  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.702007  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7183  putative outer membrane protein precursor CzcC  26.68 
 
 		 422 aa  70.1  0.00000000007  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4257  outer membrane efflux protein  30.09 
 
 		 473 aa  70.1  0.00000000007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4106  outer membrane efflux protein  30.58 
 
 		 473 aa  69.7  0.00000000009  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0170  outer membrane efflux protein  26.02 
 
 		 436 aa  67.8  0.0000000003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2628  Outer membrane efflux protein  26.2 
 
 		 432 aa  67  0.0000000005  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.753633 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1528  Outer membrane efflux protein  23.82 
 
 		 501 aa  67  0.0000000006  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06364  hypothetical protein  22.98 
 
 		 463 aa  66.6  0.0000000008  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2929  outer membrane efflux protein  22.9 
 
 		 443 aa  66.2  0.0000000009  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0716  hypothetical protein  22.35 
 
 		 444 aa  66.2  0.000000001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2062  outer membrane efflux protein  25.84 
 
 		 436 aa  65.9  0.000000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2434  outer membrane efflux protein  25.84 
 
 		 433 aa  65.5  0.000000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.990538  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7266  putative outer membrane cobalt-zinc-cadmium resistance protein czcC precursor  24.94 
 
 		 424 aa  64.3  0.000000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.217099  normal  0.831215 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1368  copper/silver resistance outer membrane protein  23.79 
 
 		 437 aa  63.2  0.000000009  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2185  outer membrane efflux protein  25.18 
 
 		 424 aa  62.4  0.00000001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.685797  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3343  outer membrane efflux protein  26.06 
 
 		 423 aa  61.6  0.00000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.141208 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2344  outer membrane efflux protein  26.8 
 
 		 423 aa  61.2  0.00000003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1481  outer membrane efflux protein  25.24 
 
 		 424 aa  60.5  0.00000005  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.103233  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001397  heavy metal RND efflux CzcC family  23.1 
 
 		 473 aa  60.1  0.00000006  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007960  Nham_4530  outer membrane efflux protein  27.15 
 
 		 425 aa  58.9  0.0000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1958  aconitate hydratase 1  25.93 
 
 		 422 aa  57.8  0.0000004  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0713794  normal  0.321859 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2142  outer membrane efflux protein  26.99 
 
 		 423 aa  57.4  0.0000005  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.143725 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1537  Outer membrane efflux protein  25.8 
 
 		 445 aa  56.6  0.0000008  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3383  hypothetical protein  23.31 
 
 		 405 aa  55.1  0.000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2705  outer membrane efflux protein  23.98 
 
 		 424 aa  55.5  0.000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0425807  normal  0.885603 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2276  outer membrane efflux protein  26.45 
 
 		 432 aa  55.5  0.000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0693511 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0863  outer membrane efflux protein  22.02 
 
 		 443 aa  53.9  0.000006  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.0886206  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1044  HelC protein  22.86 
 
 		 416 aa  53.5  0.000007  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1939  outer membrane efflux protein  25.67 
 
 		 432 aa  52  0.00002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2298  outer membrane efflux protein  25 
 
 		 423 aa  52  0.00002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3398  metal ion efflux outer membrane protein family protein, putative  27.58 
 
 		 434 aa  51.6  0.00003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>