101 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rpic12D_5357 on replicon NC_012849
Organism: Ralstonia pickettii 12D



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010682  Rpic_1807  cobalt-zinc-cadmium resistance outer membrane porin  90.99 
 
 
433 aa  737    Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.804371 
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5357  outer membrane efflux protein  100 
 
 
433 aa  864    Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RS05407  putative outer membrane cation efflux protein  72.55 
 
 
434 aa  568  1e-161  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5031  heavy metal cation tricomponent efflux outer membrane porin CusC  68.91 
 
 
433 aa  527  1e-148  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.11545 
 
 
-
 
NC_007971  Rmet_6134  proton antiporter metal efflux protein SilC  53.77 
 
 
435 aa  412  1e-114  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.144513  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1648  outer membrane efflux protein  56.01 
 
 
434 aa  409  1e-113  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5289  outer membrane efflux protein  56.01 
 
 
434 aa  409  1e-113  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0475  putative outer membrane cation efflux protein  47.8 
 
 
437 aa  332  7.000000000000001e-90  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.668446  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1625  putative outer membrane cation efflux protein  45.52 
 
 
438 aa  313  4.999999999999999e-84  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.164606 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3493  outer membrane efflux protein  45.35 
 
 
428 aa  287  2.9999999999999996e-76  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.497066 
 
 
-
 
NC_008758  Pnap_4511  outer membrane efflux protein  43.48 
 
 
428 aa  287  2.9999999999999996e-76  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.336672  normal 
 
 
-
 
NC_010070  Bmul_6284  outer membrane efflux protein  31.95 
 
 
430 aa  196  6e-49  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.524439  normal  0.254062 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5180  outer membrane efflux protein  33.59 
 
 
430 aa  191  2e-47  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3343  outer membrane efflux protein  33.59 
 
 
412 aa  190  4e-47  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1335  CzcC family heavy metal RND efflux outer membrane protein  35.51 
 
 
429 aa  188  2e-46  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5688  outer membrane efflux protein  32.63 
 
 
430 aa  184  2.0000000000000003e-45  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0325821  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4767  outer membrane efflux protein  34.09 
 
 
430 aa  183  4.0000000000000006e-45  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3400  outer membrane efflux protein  34.09 
 
 
430 aa  183  4.0000000000000006e-45  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4116  outer membrane efflux protein  34 
 
 
430 aa  183  5.0000000000000004e-45  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2210  outer membrane efflux protein  33.73 
 
 
420 aa  182  1e-44  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.119249  normal  0.0896895 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6301  outer membrane efflux protein  34.64 
 
 
410 aa  160  5e-38  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0020  outer membrane efflux protein  32.05 
 
 
417 aa  156  7e-37  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.0171536 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0022  outer membrane efflux protein  32.05 
 
 
417 aa  156  7e-37  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0020  outer membrane efflux protein  32.05 
 
 
417 aa  156  7e-37  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.257437  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2394  CzcC family heavy metal RND efflux outer membrane protein  31.42 
 
 
418 aa  156  8e-37  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.794005  hitchhiker  0.00223071 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2892  outer membrane efflux protein  30.12 
 
 
419 aa  154  2.9999999999999998e-36  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3374  outer membrane efflux protein  35.85 
 
 
433 aa  152  1e-35  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3044  outer membrane efflux protein  35.85 
 
 
433 aa  152  1e-35  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2048  outer membrane efflux protein  35.85 
 
 
433 aa  152  1e-35  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2236  outer membrane efflux protein  35.85 
 
 
433 aa  152  1e-35  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1155  hypothetical protein  29.79 
 
 
418 aa  152  1e-35  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0512  outer membrane efflux protein  35.31 
 
 
433 aa  150  6e-35  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0330  outer membrane efflux protein  35.31 
 
 
433 aa  150  6e-35  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0317  outer membrane efflux protein  35.58 
 
 
433 aa  149  8e-35  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4013  CzcC family heavy metal RND efflux outer membrane protein  32.22 
 
 
414 aa  145  1e-33  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.498662  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1167  outer membrane efflux protein  29.62 
 
 
419 aa  143  5e-33  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3073  outer membrane efflux protein  28.57 
 
 
419 aa  141  1.9999999999999998e-32  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1261  outer membrane efflux protein  28.5 
 
 
419 aa  139  1e-31  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3041  outer membrane efflux protein  31.42 
 
 
417 aa  133  5e-30  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.764893  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2050  CzcC family heavy metal RND efflux outer membrane protein  31.65 
 
 
411 aa  133  6e-30  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00202753 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5385  CzcC family heavy metal RND efflux outer membrane protein  32.04 
 
 
417 aa  132  1.0000000000000001e-29  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.899362 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2548  outer membrane efflux protein  33.51 
 
 
408 aa  131  2.0000000000000002e-29  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3364  outer membrane efflux protein  29.85 
 
 
419 aa  129  9.000000000000001e-29  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0128671  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0276  outer membrane efflux protein  29.08 
 
 
449 aa  127  5e-28  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0967709  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0134  outer membrane efflux protein  27.82 
 
 
439 aa  121  1.9999999999999998e-26  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.410876  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4856  putative cation efflux protein  24.09 
 
 
496 aa  115  2.0000000000000002e-24  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001397  heavy metal RND efflux CzcC family  24.89 
 
 
473 aa  107  4e-22  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06364  hypothetical protein  24.6 
 
 
463 aa  106  9e-22  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2326  outer membrane efflux protein  30.26 
 
 
407 aa  106  1e-21  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.347361  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2439  CzcC family heavy metal RND efflux outer membrane protein  30.3 
 
 
408 aa  105  2e-21  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00318  putative cation efflux protein  25.27 
 
 
454 aa  98.6  2e-19  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1929  outer membrane efflux protein  27.57 
 
 
447 aa  97.1  6e-19  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.845235  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2394  outer membrane efflux protein  25.93 
 
 
487 aa  95.9  1e-18  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1619  outer membrane efflux protein  29.3 
 
 
427 aa  95.9  1e-18  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.891221  hitchhiker  0.0000204841 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1949  outer membrane heavy metal efflux protein, putative  29.3 
 
 
427 aa  95.9  1e-18  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2062  outer membrane efflux protein  29.78 
 
 
436 aa  95.1  2e-18  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0716  hypothetical protein  24.16 
 
 
444 aa  94.7  2e-18  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2434  outer membrane efflux protein  29.78 
 
 
433 aa  95.1  2e-18  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.990538  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0170  outer membrane efflux protein  29.78 
 
 
436 aa  94  4e-18  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0176  outer membrane protein  29.23 
 
 
414 aa  92.8  1e-17  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2395  CzcC family heavy metal RND efflux outer membrane protein  29.61 
 
 
409 aa  88.6  2e-16  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.502937  normal  0.0320057 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1388  outer membrane efflux protein  32.02 
 
 
417 aa  87.4  4e-16  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.615787 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2262  outer membrane heavy metal efflux protein  25.32 
 
 
426 aa  80.1  0.00000000000007  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1408  Outer membrane efflux protein  25.96 
 
 
466 aa  77.4  0.0000000000005  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2478  Outer membrane efflux protein  27.99 
 
 
416 aa  70.9  0.00000000004  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1549  Outer membrane efflux protein  23.94 
 
 
426 aa  70.1  0.00000000008  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.069846  normal  0.874867 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2166  outer membrane efflux protein  24.94 
 
 
423 aa  68.6  0.0000000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1528  Outer membrane efflux protein  25.22 
 
 
501 aa  68.2  0.0000000003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2056  outer membrane efflux protein  25.32 
 
 
423 aa  68.2  0.0000000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000000544389 
 
 
-
 
NC_008607  Ppro_3648  outer membrane efflux protein  24.05 
 
 
446 aa  67.8  0.0000000004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1368  copper/silver resistance outer membrane protein  23.51 
 
 
437 aa  66.6  0.0000000007  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0087  outer membrane efflux protein  23.46 
 
 
424 aa  65.9  0.000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4234  outer membrane efflux protein  28.87 
 
 
473 aa  65.1  0.000000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.702007  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4257  outer membrane efflux protein  28.87 
 
 
473 aa  65.1  0.000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1330  metal ion efflux outer membrane protein family protein, putative  25.14 
 
 
493 aa  62  0.00000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1716  outer membrane protein  22.55 
 
 
440 aa  61.6  0.00000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000584875  n/a   
 
 
-
 
NC_013732  Slin_6877  Outer membrane protein-like protein  20.68 
 
 
453 aa  60.8  0.00000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2929  outer membrane efflux protein  24.39 
 
 
443 aa  58.5  0.0000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4106  outer membrane efflux protein  29.08 
 
 
473 aa  58.2  0.0000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1537  Outer membrane efflux protein  24.18 
 
 
445 aa  57.8  0.0000004  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0447  outer membrane efflux protein  26.64 
 
 
438 aa  55.8  0.000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.109934 
 
 
-
 
NC_013731  Slin_6822  Outer membrane protein-like protein  22.98 
 
 
441 aa  54.7  0.000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2263  Outer membrane efflux protein  25.19 
 
 
424 aa  53.9  0.000005  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4262  outer membrane efflux protein  26.48 
 
 
477 aa  53.1  0.000008  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.495542 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2185  outer membrane efflux protein  22.78 
 
 
424 aa  52.8  0.00001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.685797  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3383  hypothetical protein  25.17 
 
 
405 aa  52  0.00002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4430  outer membrane efflux protein  26.43 
 
 
443 aa  51.2  0.00003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.78082  normal  0.657626 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3077  outer membrane efflux protein  22.88 
 
 
426 aa  50.1  0.00007  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.767775  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0828  metal ion efflux outer membrane protein family protein, putative  24.02 
 
 
428 aa  48.1  0.0003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.885444  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11693  cation efflux system protein, AcrB/AcrD/AcrF family protein  20.65 
 
 
1481 aa  47.8  0.0004  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2705  outer membrane efflux protein  22.35 
 
 
424 aa  47  0.0007  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0425807  normal  0.885603 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2733  outer membrane efflux protein  25.81 
 
 
415 aa  44.7  0.003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0378376  n/a   
 
 
-
 
NC_013731  Slin_6757  heavy metal efflux pump, CzcA family  25.44 
 
 
1480 aa  44.7  0.003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.603059  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0045  CzcC family cobalt/zinc/cadmium efflux transporter outer membrane protein  24.44 
 
 
423 aa  44.3  0.004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000529043 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0059  outer membrane efflux protein  24.44 
 
 
423 aa  44.3  0.004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.56854 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0062  outer membrane efflux protein  24.44 
 
 
423 aa  44.3  0.004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000405972 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2137  metal ion efflux outer membrane protein family protein, putative  23.48 
 
 
437 aa  43.5  0.007  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1554  outer membrane efflux protein  25 
 
 
477 aa  43.5  0.008  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1617  outer membrane efflux protein  23.1 
 
 
467 aa  43.5  0.008  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3978  outer membrane efflux protein  25.78 
 
 
446 aa  43.1  0.009  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>