221 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Adeh_4106 on replicon NC_007760
Organism: Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011145  AnaeK_4234  outer membrane efflux protein  90.54 
 
 
473 aa  647    Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.702007  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4106  outer membrane efflux protein  100 
 
 
473 aa  887    Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4257  outer membrane efflux protein  90.5 
 
 
473 aa  642    Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4262  outer membrane efflux protein  62.16 
 
 
477 aa  420  1e-116  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.495542 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2166  outer membrane efflux protein  28.82 
 
 
423 aa  140  7e-32  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3077  outer membrane efflux protein  29.8 
 
 
426 aa  138  2e-31  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.767775  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2056  outer membrane efflux protein  28.86 
 
 
423 aa  135  9.999999999999999e-31  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000000544389 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1549  Outer membrane efflux protein  29.51 
 
 
426 aa  134  3e-30  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.069846  normal  0.874867 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1330  metal ion efflux outer membrane protein family protein, putative  31.92 
 
 
493 aa  132  1.0000000000000001e-29  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008607  Ppro_3648  outer membrane efflux protein  28.21 
 
 
446 aa  131  2.0000000000000002e-29  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0087  outer membrane efflux protein  27.5 
 
 
424 aa  130  7.000000000000001e-29  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2185  outer membrane efflux protein  32.99 
 
 
424 aa  129  8.000000000000001e-29  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.685797  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2929  outer membrane efflux protein  29.34 
 
 
443 aa  125  2e-27  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1481  outer membrane efflux protein  33.61 
 
 
424 aa  123  6e-27  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.103233  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2262  outer membrane heavy metal efflux protein  30.36 
 
 
426 aa  119  9e-26  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1716  outer membrane protein  28.87 
 
 
440 aa  117  5e-25  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000584875  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2263  Outer membrane efflux protein  33.71 
 
 
424 aa  117  6e-25  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2705  outer membrane efflux protein  32.25 
 
 
424 aa  116  8.999999999999998e-25  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0425807  normal  0.885603 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2363  chemiosmotic efflux system B protein C  27.01 
 
 
419 aa  115  2.0000000000000002e-24  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2478  Outer membrane efflux protein  32.03 
 
 
416 aa  110  5e-23  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1528  Outer membrane efflux protein  27.21 
 
 
501 aa  107  6e-22  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2435  outer membrane efflux protein  26.71 
 
 
438 aa  102  1e-20  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1408  Outer membrane efflux protein  27.82 
 
 
466 aa  102  2e-20  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0170  outer membrane efflux protein  33.97 
 
 
436 aa  98.2  3e-19  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2062  outer membrane efflux protein  33.12 
 
 
436 aa  97.8  4e-19  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2434  outer membrane efflux protein  33.12 
 
 
433 aa  97.4  5e-19  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.990538  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1537  Outer membrane efflux protein  29.74 
 
 
445 aa  92.4  2e-17  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1949  outer membrane heavy metal efflux protein, putative  32.19 
 
 
427 aa  89.4  1e-16  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1619  outer membrane efflux protein  32.19 
 
 
427 aa  89.4  1e-16  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.891221  hitchhiker  0.0000204841 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0863  outer membrane efflux protein  24.73 
 
 
443 aa  83.6  0.000000000000007  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.0886206  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2456  outer membrane efflux protein  32.09 
 
 
430 aa  82.8  0.00000000000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0162311  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0413  outer membrane efflux protein  31.39 
 
 
423 aa  81.6  0.00000000000003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0045  CzcC family cobalt/zinc/cadmium efflux transporter outer membrane protein  27.85 
 
 
423 aa  75.5  0.000000000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000529043 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0059  outer membrane efflux protein  27.85 
 
 
423 aa  75.5  0.000000000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.56854 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0062  outer membrane efflux protein  27.85 
 
 
423 aa  75.5  0.000000000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000405972 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0059  outer membrane efflux protein  27.35 
 
 
394 aa  75.1  0.000000000003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00860018 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0705  RND heavy metal ion efflux pump, outer membrane protein  31.64 
 
 
458 aa  72.8  0.00000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.199067  normal  0.26582 
 
 
-
 
NC_007971  Rmet_6134  proton antiporter metal efflux protein SilC  31.9 
 
 
435 aa  73.2  0.00000000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.144513  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2967  outer membrane efflux protein  30.18 
 
 
433 aa  70.9  0.00000000005  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2106  Outer membrane efflux protein  28.21 
 
 
471 aa  70.5  0.00000000007  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.343125  n/a   
 
 
-
 
NC_010070  Bmul_6170  outer membrane efflux protein  31.15 
 
 
435 aa  69.7  0.0000000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.446847 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2433  outer membrane efflux protein  29.4 
 
 
440 aa  69.3  0.0000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1625  putative outer membrane cation efflux protein  30.61 
 
 
438 aa  68.9  0.0000000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.164606 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2353  chemiosmotic efflux system C protein C  24.3 
 
 
437 aa  68.2  0.0000000003  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2065  chemiosmotic efflux system protein C-like protein  25.25 
 
 
441 aa  68.2  0.0000000003  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1877  Outer membrane efflux protein  29.49 
 
 
413 aa  68.2  0.0000000003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1335  CzcC family heavy metal RND efflux outer membrane protein  32.29 
 
 
429 aa  68.2  0.0000000003  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0134  outer membrane efflux protein  28.35 
 
 
439 aa  68.2  0.0000000003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.410876  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2075  chemiosmotic efflux system protein C-like protein  24.24 
 
 
437 aa  67.8  0.0000000004  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11753  metal ion efflux outer membrane protein family protein, putative  22.95 
 
 
405 aa  67.8  0.0000000004  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1847  outer membrane efflux protein  26.13 
 
 
451 aa  67.4  0.0000000005  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.179966  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4441  outer membrane efflux protein  29.97 
 
 
431 aa  67  0.0000000006  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0413947  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4686  outer membrane efflux protein  30.75 
 
 
439 aa  67  0.0000000007  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.432562  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3677  outer membrane efflux protein  30.75 
 
 
439 aa  67  0.0000000007  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.621392  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3362  outer membrane efflux protein  27.91 
 
 
431 aa  65.9  0.000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0828  metal ion efflux outer membrane protein family protein, putative  27.85 
 
 
428 aa  64.7  0.000000004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.885444  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4801  Outer membrane efflux protein  28.44 
 
 
408 aa  64.7  0.000000004  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00249818 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3623  Outer membrane efflux protein  28.37 
 
 
415 aa  64.3  0.000000004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1373  heavy metal resistance protein CzcC  29.78 
 
 
443 aa  64.3  0.000000004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3845  outer membrane efflux protein  30.33 
 
 
437 aa  64.7  0.000000004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2439  CzcC family heavy metal RND efflux outer membrane protein  31.71 
 
 
408 aa  64.3  0.000000005  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1031  heavy metal resistance protein CzcC  28.53 
 
 
443 aa  63.9  0.000000006  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.147927  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0538  outer membrane efflux protein  26.32 
 
 
432 aa  63.9  0.000000006  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.355565  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3343  outer membrane efflux protein  29.77 
 
 
412 aa  63.9  0.000000006  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5031  heavy metal cation tricomponent efflux outer membrane porin CusC  29.27 
 
 
433 aa  63.9  0.000000006  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.11545 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1527  cobalt-zinc-cadmium resistance protein CzcC  28.53 
 
 
452 aa  63.9  0.000000006  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0399  heavy metal resistance protein CzcC  28.53 
 
 
461 aa  63.5  0.000000007  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.132876  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1442  cobalt-zinc-cadmium resistance efflux protein  28.53 
 
 
461 aa  63.5  0.000000007  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0705718  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1183  heavy metal resistance protein CzcC  28.53 
 
 
461 aa  63.5  0.000000007  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.84848  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0013  heavy metal resistance protein CzcC  28.53 
 
 
461 aa  63.5  0.000000007  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.238799  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1175  outer membrane efflux protein  26.15 
 
 
416 aa  63.5  0.000000008  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4081  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT  30.86 
 
 
517 aa  63.5  0.000000008  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0033  heavy metal resistance protein CzcC  28.53 
 
 
443 aa  63.2  0.000000009  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.299983  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5180  outer membrane efflux protein  29.45 
 
 
430 aa  63.2  0.000000009  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2553  outer membrane efflux protein  27.61 
 
 
421 aa  63.2  0.00000001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2344  outer membrane efflux protein  27.8 
 
 
423 aa  62.8  0.00000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2137  metal ion efflux outer membrane protein family protein, putative  25.56 
 
 
437 aa  62.4  0.00000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2715  outer membrane protein precursor CzcC  28.36 
 
 
428 aa  62.4  0.00000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.727923  n/a   
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5289  outer membrane efflux protein  29.33 
 
 
434 aa  62.4  0.00000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1648  outer membrane efflux protein  29.33 
 
 
434 aa  62.4  0.00000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2313  outer membrane efflux protein  29.22 
 
 
457 aa  62.4  0.00000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_31970  CzcC family cobalt/zinc/cadmium efflux transporter outer membrane protein  27.46 
 
 
428 aa  62  0.00000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3002  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT family  25.56 
 
 
516 aa  61.6  0.00000003  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1929  outer membrane efflux protein  24.23 
 
 
447 aa  60.8  0.00000004  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.845235  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2548  outer membrane efflux protein  30.49 
 
 
408 aa  61.2  0.00000004  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008758  Pnap_4511  outer membrane efflux protein  24.62 
 
 
428 aa  60.8  0.00000005  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.336672  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4790  NodT family outer membrane lipoprotein  28.34 
 
 
496 aa  60.5  0.00000007  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.031941  normal  0.791068 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0377  metal ion efflux outer membrane protein, putative  28.03 
 
 
408 aa  60.1  0.00000008  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0276  outer membrane efflux protein  27.09 
 
 
449 aa  60.1  0.00000008  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0967709  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3157  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT family  26.34 
 
 
480 aa  60.1  0.00000008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7183  putative outer membrane protein precursor CzcC  27.76 
 
 
422 aa  59.7  0.0000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RS05407  putative outer membrane cation efflux protein  28.02 
 
 
434 aa  58.9  0.0000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0648  outer membrane efflux protein  24.78 
 
 
328 aa  59.3  0.0000002  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0502  outer membrane efflux protein  27.13 
 
 
433 aa  58.9  0.0000002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1304  outer membrane efflux protein  25.17 
 
 
493 aa  58.2  0.0000003  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.0613803 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00318  putative cation efflux protein  26.34 
 
 
454 aa  58.2  0.0000003  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7266  putative outer membrane cobalt-zinc-cadmium resistance protein czcC precursor  25.44 
 
 
424 aa  57.8  0.0000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.217099  normal  0.831215 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3493  outer membrane efflux protein  24.44 
 
 
428 aa  58.2  0.0000004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.497066 
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5357  outer membrane efflux protein  30.69 
 
 
433 aa  57.8  0.0000004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0176  outer membrane protein  27.11 
 
 
414 aa  57.8  0.0000004  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>