More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daro_1877 on replicon NC_007298
Organism: Dechloromonas aromatica RCB



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007298  Daro_1877  Outer membrane efflux protein  100 
 
 		 413 aa  808    Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1176  Outer membrane efflux protein  39.3 
 
 		 429 aa  219  6e-56  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3501  Outer membrane efflux protein  38.65 
 
 		 489 aa  219  7.999999999999999e-56  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3836  heavy metal cation tricomponent efflux outer membrane porin HmvC  38.22 
 
 		 445 aa  200  3.9999999999999996e-50  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1641  Outer membrane efflux protein  32.06 
 
 		 479 aa  171  2e-41  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0040  outer membrane efflux protein  37.13 
 
 		 471 aa  156  5.0000000000000005e-37  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2110  outer membrane efflux protein  30.69 
 
 		 437 aa  150  5e-35  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.313002  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2171  outer membrane efflux protein  35.22 
 
 		 415 aa  150  5e-35  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  decreased coverage  0.00952498  normal  1 
 
 
-
 
NC_007971  Rmet_5982  cation proton antiporter efflux protein CzcC  28.47 
 
 		 418 aa  108  2e-22  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00000196082  normal  0.0745476 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1764  outer membrane efflux protein  27.58 
 
 		 418 aa  108  2e-22  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.715826  normal  0.306921 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3970  Outer membrane efflux protein  27.58 
 
 		 426 aa  102  1e-20  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.214282  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1847  outer membrane efflux protein  27.73 
 
 		 451 aa  102  2e-20  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.179966  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2433  outer membrane efflux protein  26.55 
 
 		 440 aa  99  1e-19  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3677  outer membrane efflux protein  27.93 
 
 		 439 aa  98.2  2e-19  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.621392  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3845  outer membrane efflux protein  27.93 
 
 		 437 aa  98.2  2e-19  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4686  outer membrane efflux protein  27.93 
 
 		 439 aa  98.2  2e-19  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.432562  n/a   
 
 
-
 
NC_010070  Bmul_6170  outer membrane efflux protein  28.19 
 
 		 435 aa  97.4  4e-19  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.446847 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1551  outer membrane efflux protein  28.32 
 
 		 443 aa  92  2e-17  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2106  Outer membrane efflux protein  26.19 
 
 		 471 aa  91.7  2e-17  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.343125  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1373  heavy metal resistance protein CzcC  29.07 
 
 		 443 aa  91.7  2e-17  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0705  RND heavy metal ion efflux pump, outer membrane protein  28.75 
 
 		 458 aa  91.3  3e-17  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.199067  normal  0.26582 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4596  heavy metal cation tricomponent efflux outer membrane porin  27.15 
 
 		 431 aa  90.9  4e-17  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0688687  hitchhiker  0.005842 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1714  outer membrane efflux protein  28.22 
 
 		 443 aa  90.5  5e-17  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.664423 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0828  metal ion efflux outer membrane protein family protein, putative  28.33 
 
 		 428 aa  88.6  2e-16  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.885444  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2553  outer membrane efflux protein  25.99 
 
 		 421 aa  87.8  3e-16  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1293  outer membrane efflux protein  25.81 
 
 		 442 aa  87  6e-16  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.803504 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1527  cobalt-zinc-cadmium resistance protein CzcC  28.57 
 
 		 452 aa  86.7  7e-16  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1183  heavy metal resistance protein CzcC  28.57 
 
 		 461 aa  86.3  8e-16  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.84848  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0013  heavy metal resistance protein CzcC  28.57 
 
 		 461 aa  86.3  8e-16  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.238799  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0399  heavy metal resistance protein CzcC  28.57 
 
 		 461 aa  86.3  8e-16  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.132876  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1442  cobalt-zinc-cadmium resistance efflux protein  28.57 
 
 		 461 aa  86.3  8e-16  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0705718  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1031  heavy metal resistance protein CzcC  28.57 
 
 		 443 aa  86.3  9e-16  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.147927  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2564  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT family  29.07 
 
 		 495 aa  85.9  0.000000000000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.248386  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0033  heavy metal resistance protein CzcC  28.31 
 
 		 443 aa  85.1  0.000000000000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.299983  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0447  outer membrane efflux protein  26.05 
 
 		 438 aa  85.1  0.000000000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.109934 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0150  Outer membrane efflux protein  26.59 
 
 		 415 aa  84.7  0.000000000000003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.921658  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5135  RND efflux system outer membrane lipoprotein  29.05 
 
 		 493 aa  84.3  0.000000000000004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.523851  normal  0.980288 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2568  outer membrane efflux protein  26.54 
 
 		 438 aa  83.6  0.000000000000006  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.316597 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3623  Outer membrane efflux protein  27.29 
 
 		 415 aa  83.2  0.000000000000007  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1420  Outer membrane efflux protein  25.62 
 
 		 472 aa  82.8  0.00000000000001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4801  Outer membrane efflux protein  28.64 
 
 		 408 aa  82  0.00000000000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00249818 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3362  outer membrane efflux protein  24.57 
 
 		 431 aa  82  0.00000000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3427  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT  27.79 
 
 		 470 aa  79.3  0.0000000000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0045  CzcC family cobalt/zinc/cadmium efflux transporter outer membrane protein  25.95 
 
 		 423 aa  78.6  0.0000000000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000529043 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0062  outer membrane efflux protein  25.95 
 
 		 423 aa  78.6  0.0000000000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000405972 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0059  outer membrane efflux protein  25.95 
 
 		 423 aa  78.6  0.0000000000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.56854 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0377  metal ion efflux outer membrane protein, putative  28.64 
 
 		 408 aa  77.4  0.0000000000005  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0538  outer membrane efflux protein  25.6 
 
 		 432 aa  77  0.0000000000006  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.355565  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2577  outer membrane efflux protein  31.37 
 
 		 435 aa  77  0.0000000000006  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.996623 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2435  outer membrane efflux protein  22.81 
 
 		 438 aa  76.6  0.0000000000008  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2209  outer membrane efflux protein  27.8 
 
 		 433 aa  76.3  0.0000000000009  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.798472  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0059  outer membrane efflux protein  25.27 
 
 		 394 aa  75.9  0.000000000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00860018 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0276  outer membrane efflux protein  26.46 
 
 		 449 aa  75.5  0.000000000002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0967709  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3398  metal ion efflux outer membrane protein family protein, putative  28.57 
 
 		 434 aa  74.7  0.000000000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS01780  outer membrane CHANEL lipoprotein  29.21 
 
 		 522 aa  74.7  0.000000000003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1614  outer membrane efflux protein  21.45 
 
 		 409 aa  74.7  0.000000000003  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4536  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT family  28.47 
 
 		 533 aa  73.9  0.000000000004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.748568  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RSp0491  cobalt-zinc-cadmium outer membrane resistance protein  28.24 
 
 		 441 aa  73.9  0.000000000005  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3557  outer membrane efflux protein  31.63 
 
 		 442 aa  73.6  0.000000000007  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0790  outer membrane efflux protein  23.39 
 
 		 423 aa  73.2  0.000000000008  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0294  Outer membrane efflux protein  25.36 
 
 		 420 aa  72.8  0.00000000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.757224 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1175  outer membrane efflux protein  24.46 
 
 		 416 aa  72.8  0.00000000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4636  RND efflux system outer membrane lipoprotein  28.1 
 
 		 521 aa  72.4  0.00000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  decreased coverage  0.00362376  normal  0.387542 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1343  outer membrane efflux protein  21.96 
 
 		 429 aa  71.6  0.00000000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2715  outer membrane protein precursor CzcC  26.33 
 
 		 428 aa  72.4  0.00000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.727923  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1089  outer membrane efflux protein  26.9 
 
 		 444 aa  71.2  0.00000000003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2733  outer membrane efflux protein  20.98 
 
 		 415 aa  71.2  0.00000000003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0378376  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0851  RND efflux system outer membrane lipoprotein  28.83 
 
 		 537 aa  70.9  0.00000000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0238751  hitchhiker  0.00377502 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_31970  CzcC family cobalt/zinc/cadmium efflux transporter outer membrane protein  27.37 
 
 		 428 aa  70.5  0.00000000005  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0617  outer membrane efflux protein  26.27 
 
 		 438 aa  70.5  0.00000000006  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2628  Outer membrane efflux protein  27.74 
 
 		 432 aa  69.3  0.0000000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.753633 
 
 
-
 
NC_013731  Slin_6754  outer membrane efflux protein  26.02 
 
 		 449 aa  69.3  0.0000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.406805  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1329  cobalt-zinc-cadmium outer membrane resistance protein  25.41 
 
 		 425 aa  68.9  0.0000000002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1111  Outer membrane efflux protein  28.03 
 
 		 492 aa  68.2  0.0000000002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.33067  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1638  30S ribosomal protein S12  25.26 
 
 		 460 aa  68.2  0.0000000003  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.240044  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2338  efflux ABC transporter outer membrane protein  30.32 
 
 		 470 aa  67  0.0000000005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1582  outer membrane efflux protein  25.63 
 
 		 523 aa  66.6  0.0000000008  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2254  Outer membrane efflux protein  27.38 
 
 		 436 aa  66.2  0.000000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3981  outer membrane efflux protein  24.72 
 
 		 423 aa  66.2  0.000000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.161912  normal  0.377505 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4765  outer membrane efflux protein  34.19 
 
 		 485 aa  65.9  0.000000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.55701 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1304  outer membrane efflux protein  24.85 
 
 		 493 aa  65.9  0.000000001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.0613803 
 
 
-
 
NC_003296  RS00407  putative outer membrane cation efflux system protein  28.37 
 
 		 451 aa  65.5  0.000000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  decreased coverage  0.00236087  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2148  outer membrane efflux protein  28.02 
 
 		 400 aa  65.5  0.000000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7183  putative outer membrane protein precursor CzcC  27.11 
 
 		 422 aa  65.5  0.000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1450  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT  29.06 
 
 		 471 aa  64.7  0.000000003  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2551  outer membrane efflux protein  23.69 
 
 		 422 aa  63.9  0.000000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.000963739  normal  0.205494 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1407  RND efflux system outer membrane lipoprotein  26.52 
 
 		 488 aa  63.9  0.000000005  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.380774 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4056  outer membrane efflux protein  22.86 
 
 		 416 aa  63.5  0.000000006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1716  outer membrane protein  25.38 
 
 		 440 aa  63.5  0.000000007  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000584875  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2504  outer membrane efflux protein  28.35 
 
 		 436 aa  63.5  0.000000007  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.10477  normal  0.0160345 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1562  RND efflux system outer membrane lipoprotein  25 
 
 		 478 aa  63.2  0.000000008  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3093  outer membrane protein  25.54 
 
 		 503 aa  63.2  0.000000008  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  7.56103e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3077  outer membrane efflux protein  24.88 
 
 		 426 aa  63.2  0.000000009  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.767775  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_31920  putative outer membrane protein  25.54 
 
 		 498 aa  62.4  0.00000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.964531  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3465  Outer membrane efflux protein  27.1 
 
 		 441 aa  62.4  0.00000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3184  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT  28.12 
 
 		 475 aa  62.4  0.00000001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6550  outer membrane efflux protein  25.49 
 
 		 433 aa  62.8  0.00000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.125608  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4120  heavy metal cation tricomponent efflux outer membrane porin HmyC  25.72 
 
 		 460 aa  62.8  0.00000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2799  RND efflux system outer membrane lipoprotein  26.84 
 
 		 495 aa  62.4  0.00000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1848  outer membrane efflux protein  24.45 
 
 		 423 aa  62  0.00000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>