89 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Slin_2551 on replicon NC_013730
Organism: Spirosoma linguale DSM 74



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013730  Slin_2551  outer membrane efflux protein  100 
 
 		 422 aa  843    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.000963739  normal  0.205494 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4056  outer membrane efflux protein  65.87 
 
 		 416 aa  534  1e-150  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2745  outer membrane efflux protein  46.21 
 
 		 415 aa  389  1e-107  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.545193 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0578  outer membrane efflux protein  46.97 
 
 		 416 aa  365  1e-100  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.0382538 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2733  outer membrane efflux protein  33.67 
 
 		 415 aa  258  2e-67  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0378376  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1343  outer membrane efflux protein  35.66 
 
 		 429 aa  256  6e-67  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3728  outer membrane efflux protein  35.36 
 
 		 433 aa  250  3e-65  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0602217  normal  0.0956817 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0829  outer membrane protein; cation efflux protein  33.1 
 
 		 428 aa  250  3e-65  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4293  outer membrane efflux protein  28.54 
 
 		 412 aa  181  2e-44  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.730588  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1811  outer membrane efflux protein  31 
 
 		 440 aa  173  5e-42  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1293  outer membrane efflux protein  25.81 
 
 		 442 aa  144  2e-33  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.803504 
 
 
-
 
NC_013731  Slin_6754  outer membrane efflux protein  33.23 
 
 		 449 aa  127  4.0000000000000003e-28  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.406805  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2110  outer membrane efflux protein  26.78 
 
 		 437 aa  117  3.9999999999999997e-25  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.313002  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1641  Outer membrane efflux protein  24.59 
 
 		 479 aa  106  9e-22  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0447  outer membrane efflux protein  24.63 
 
 		 438 aa  92.4  1e-17  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.109934 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0828  metal ion efflux outer membrane protein family protein, putative  26.37 
 
 		 428 aa  87.8  3e-16  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.885444  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0790  outer membrane efflux protein  24.81 
 
 		 423 aa  83.2  0.000000000000008  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4485  outer membrane efflux protein  23.66 
 
 		 417 aa  81.3  0.00000000000003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7201  outer membrane efflux protein  24.86 
 
 		 418 aa  79.3  0.0000000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2137  metal ion efflux outer membrane protein family protein, putative  26.22 
 
 		 437 aa  76.6  0.0000000000007  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2276  outer membrane efflux protein  26.42 
 
 		 432 aa  75.5  0.000000000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0693511 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0538  outer membrane efflux protein  25.42 
 
 		 432 aa  74.3  0.000000000004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.355565  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1614  outer membrane efflux protein  22.11 
 
 		 409 aa  73.9  0.000000000006  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1939  outer membrane efflux protein  25.85 
 
 		 432 aa  73.2  0.000000000009  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0045  CzcC family cobalt/zinc/cadmium efflux transporter outer membrane protein  25.19 
 
 		 423 aa  71.6  0.00000000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000529043 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0062  outer membrane efflux protein  25.19 
 
 		 423 aa  71.6  0.00000000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000405972 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0059  outer membrane efflux protein  25.19 
 
 		 423 aa  71.6  0.00000000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.56854 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0059  outer membrane efflux protein  25.19 
 
 		 394 aa  71.6  0.00000000003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00860018 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3362  outer membrane efflux protein  24.52 
 
 		 431 aa  68.9  0.0000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2628  Outer membrane efflux protein  25.94 
 
 		 432 aa  68.9  0.0000000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.753633 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3398  metal ion efflux outer membrane protein family protein, putative  25.32 
 
 		 434 aa  67.4  0.0000000005  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3623  Outer membrane efflux protein  25.27 
 
 		 415 aa  66.6  0.0000000007  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0502  outer membrane efflux protein  23.06 
 
 		 433 aa  65.9  0.000000001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1175  outer membrane efflux protein  23.1 
 
 		 416 aa  64.3  0.000000004  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007971  Rmet_5982  cation proton antiporter efflux protein CzcC  25.76 
 
 		 418 aa  63.9  0.000000005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00000196082  normal  0.0745476 
 
 
-
 
NC_003296  RS00407  putative outer membrane cation efflux system protein  23.38 
 
 		 451 aa  62  0.00000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  decreased coverage  0.00236087  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4596  heavy metal cation tricomponent efflux outer membrane porin  24.63 
 
 		 431 aa  58.9  0.0000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0688687  hitchhiker  0.005842 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7266  putative outer membrane cobalt-zinc-cadmium resistance protein czcC precursor  27.94 
 
 		 424 aa  58.9  0.0000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.217099  normal  0.831215 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6550  outer membrane efflux protein  25.81 
 
 		 433 aa  58.9  0.0000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.125608  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1764  outer membrane efflux protein  25.25 
 
 		 418 aa  58.5  0.0000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.715826  normal  0.306921 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2254  Outer membrane efflux protein  23.65 
 
 		 436 aa  58.2  0.0000003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2715  outer membrane protein precursor CzcC  23.12 
 
 		 428 aa  57.4  0.0000005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.727923  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3970  Outer membrane efflux protein  27.49 
 
 		 426 aa  57.4  0.0000005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.214282  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1549  Outer membrane efflux protein  22.3 
 
 		 426 aa  56.6  0.0000009  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.069846  normal  0.874867 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2075  chemiosmotic efflux system protein C-like protein  22.7 
 
 		 437 aa  55.8  0.000001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1877  Outer membrane efflux protein  23.43 
 
 		 413 aa  56.2  0.000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3507  Outer membrane efflux protein  22.85 
 
 		 435 aa  56.2  0.000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_31970  CzcC family cobalt/zinc/cadmium efflux transporter outer membrane protein  21.64 
 
 		 428 aa  55.8  0.000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1420  Outer membrane efflux protein  24.76 
 
 		 472 aa  55.5  0.000002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4686  outer membrane efflux protein  25.5 
 
 		 439 aa  55.5  0.000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.432562  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3677  outer membrane efflux protein  25.5 
 
 		 439 aa  55.5  0.000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.621392  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3607  outer membrane efflux protein  22.56 
 
 		 448 aa  54.7  0.000003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.864513 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4684  outer membrane efflux protein  22.56 
 
 		 448 aa  54.7  0.000003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.119437  normal  0.307779 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2065  chemiosmotic efflux system protein C-like protein  22.68 
 
 		 441 aa  54.3  0.000004  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2353  chemiosmotic efflux system C protein C  24.58 
 
 		 437 aa  54.3  0.000004  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4801  Outer membrane efflux protein  24.61 
 
 		 408 aa  54.3  0.000005  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00249818 
 
 
-
 
NC_010070  Bmul_6170  outer membrane efflux protein  26.27 
 
 		 435 aa  53.9  0.000005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.446847 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2568  outer membrane efflux protein  27.59 
 
 		 438 aa  53.9  0.000006  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.316597 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0087  outer membrane efflux protein  22.35 
 
 		 424 aa  53.5  0.000007  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3845  outer membrane efflux protein  25.5 
 
 		 437 aa  53.1  0.000008  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2166  outer membrane efflux protein  25 
 
 		 423 aa  52.4  0.00001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0377  metal ion efflux outer membrane protein, putative  24.02 
 
 		 408 aa  52  0.00002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2339  outer membrane efflux protein  26.97 
 
 		 437 aa  52.4  0.00002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.884796  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0863  outer membrane efflux protein  25.71 
 
 		 443 aa  52.4  0.00002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.0886206  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2056  outer membrane efflux protein  24.36 
 
 		 423 aa  51.6  0.00003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000000544389 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1714  outer membrane efflux protein  23.76 
 
 		 443 aa  50.4  0.00006  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.664423 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3870  Co/Zn/Cd efflux system component  23.72 
 
 		 448 aa  50.4  0.00006  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1176  Outer membrane efflux protein  22.19 
 
 		 429 aa  50.1  0.00007  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0150  Outer membrane efflux protein  21.25 
 
 		 415 aa  50.1  0.00007  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.921658  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1177  outer membrane efflux protein  21.43 
 
 		 427 aa  49.3  0.0001  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3501  Outer membrane efflux protein  26.23 
 
 		 489 aa  49.3  0.0001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1847  outer membrane efflux protein  21.52 
 
 		 451 aa  49.3  0.0001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.179966  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0705  RND heavy metal ion efflux pump, outer membrane protein  23.95 
 
 		 458 aa  48.5  0.0002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.199067  normal  0.26582 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3077  outer membrane efflux protein  24.59 
 
 		 426 aa  48.5  0.0002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.767775  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2433  outer membrane efflux protein  26.42 
 
 		 440 aa  48.9  0.0002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0017  outer membrane efflux protein  25.13 
 
 		 473 aa  48.1  0.0003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3981  outer membrane efflux protein  24.69 
 
 		 423 aa  47  0.0006  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.161912  normal  0.377505 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1541  Outer membrane efflux protein  24.23 
 
 		 486 aa  45.8  0.001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2577  outer membrane efflux protein  26.98 
 
 		 435 aa  46.2  0.001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.996623 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1373  heavy metal resistance protein CzcC  22.03 
 
 		 443 aa  46.6  0.001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3371  outer membrane efflux protein  23.33 
 
 		 407 aa  46.2  0.001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.252246  normal  0.409086 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3231  outer membrane protein  21.59 
 
 		 416 aa  45.1  0.002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5958  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT family  25.58 
 
 		 506 aa  45.1  0.002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.821949  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1455  Outer membrane efflux protein  24.15 
 
 		 423 aa  45.1  0.002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.170729  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0185  outer membrane efflux protein  22.87 
 
 		 485 aa  44.7  0.004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1848  outer membrane efflux protein  23.99 
 
 		 423 aa  44.3  0.004  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2298  outer membrane efflux protein  24.24 
 
 		 423 aa  43.9  0.005  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2042  outer membrane efflux protein  23.86 
 
 		 417 aa  43.5  0.006  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.367282  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1111  Outer membrane efflux protein  22.31 
 
 		 492 aa  43.5  0.008  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.33067  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>