259 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Xaut_0617 on replicon NC_009720
Organism: Xanthobacter autotrophicus Py2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009720  Xaut_0617  outer membrane efflux protein  100 
 
 		 438 aa  854    Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3981  outer membrane efflux protein  81.8 
 
 		 423 aa  619  1e-176  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.161912  normal  0.377505 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7266  putative outer membrane cobalt-zinc-cadmium resistance protein czcC precursor  52.83 
 
 		 424 aa  416  9.999999999999999e-116  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.217099  normal  0.831215 
 
 
-
 
NC_007960  Nham_4530  outer membrane efflux protein  52.87 
 
 		 425 aa  406  1.0000000000000001e-112  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1848  outer membrane efflux protein  52.15 
 
 		 423 aa  397  1e-109  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2344  outer membrane efflux protein  49.65 
 
 		 423 aa  389  1e-107  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7183  putative outer membrane protein precursor CzcC  52.03 
 
 		 422 aa  390  1e-107  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2298  outer membrane efflux protein  50.51 
 
 		 423 aa  377  1e-103  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2142  outer membrane efflux protein  50.26 
 
 		 423 aa  377  1e-103  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.143725 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3648  outer membrane efflux protein  49.88 
 
 		 424 aa  376  1e-103  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.856557 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3343  outer membrane efflux protein  49.75 
 
 		 423 aa  374  1e-102  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.141208 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1455  Outer membrane efflux protein  49.87 
 
 		 423 aa  362  6e-99  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.170729  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1420  Outer membrane efflux protein  36.15 
 
 		 472 aa  240  2.9999999999999997e-62  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2106  Outer membrane efflux protein  34.57 
 
 		 471 aa  212  1e-53  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.343125  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2553  outer membrane efflux protein  34.22 
 
 		 421 aa  182  9.000000000000001e-45  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1329  cobalt-zinc-cadmium outer membrane resistance protein  35.68 
 
 		 425 aa  178  1e-43  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3371  outer membrane efflux protein  33.59 
 
 		 407 aa  177  2e-43  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.252246  normal  0.409086 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2568  outer membrane efflux protein  32.47 
 
 		 438 aa  174  2.9999999999999996e-42  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.316597 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1714  outer membrane efflux protein  31.51 
 
 		 443 aa  169  1e-40  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.664423 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3970  Outer membrane efflux protein  32.39 
 
 		 426 aa  164  2.0000000000000002e-39  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.214282  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2433  outer membrane efflux protein  33.84 
 
 		 440 aa  162  9e-39  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1764  outer membrane efflux protein  31.25 
 
 		 418 aa  162  1e-38  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.715826  normal  0.306921 
 
 
-
 
NC_007971  Rmet_5982  cation proton antiporter efflux protein CzcC  31.25 
 
 		 418 aa  161  3e-38  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00000196082  normal  0.0745476 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1089  outer membrane efflux protein  33.33 
 
 		 444 aa  156  9e-37  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3287  outer membrane efflux protein  33.85 
 
 		 464 aa  154  2.9999999999999998e-36  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.7008 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1373  heavy metal resistance protein CzcC  31.65 
 
 		 443 aa  153  5e-36  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2408  cobalt-zinc-cadmium resistance protein CzcC, putative  33.59 
 
 		 425 aa  153  5.9999999999999996e-36  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  decreased coverage  0.00195815  normal  1 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1442  cobalt-zinc-cadmium resistance efflux protein  32.69 
 
 		 461 aa  153  7e-36  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0705718  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0399  heavy metal resistance protein CzcC  32.69 
 
 		 461 aa  153  7e-36  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.132876  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0013  heavy metal resistance protein CzcC  32.69 
 
 		 461 aa  153  7e-36  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.238799  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2715  outer membrane protein precursor CzcC  31.65 
 
 		 428 aa  153  7e-36  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.727923  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1183  heavy metal resistance protein CzcC  32.69 
 
 		 461 aa  153  7e-36  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.84848  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1031  heavy metal resistance protein CzcC  32.69 
 
 		 443 aa  152  8e-36  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.147927  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4596  heavy metal cation tricomponent efflux outer membrane porin  32.44 
 
 		 431 aa  152  8e-36  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0688687  hitchhiker  0.005842 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1527  cobalt-zinc-cadmium resistance protein CzcC  32.69 
 
 		 452 aa  152  8.999999999999999e-36  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0033  heavy metal resistance protein CzcC  33.15 
 
 		 443 aa  152  8.999999999999999e-36  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.299983  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0665  outer membrane efflux protein  28.82 
 
 		 453 aa  151  2e-35  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000306808  hitchhiker  0.00231848 
 
 
-
 
NC_008573  Shewana3_4156  outer membrane efflux protein  28.5 
 
 		 446 aa  150  6e-35  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.283296 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1175  outer membrane efflux protein  30.61 
 
 		 416 aa  149  7e-35  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1847  outer membrane efflux protein  32.89 
 
 		 451 aa  149  8e-35  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.179966  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0045  CzcC family cobalt/zinc/cadmium efflux transporter outer membrane protein  29.77 
 
 		 423 aa  149  9e-35  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000529043 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0062  outer membrane efflux protein  29.77 
 
 		 423 aa  149  9e-35  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000405972 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0059  outer membrane efflux protein  29.77 
 
 		 423 aa  149  9e-35  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.56854 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2042  outer membrane efflux protein  32.51 
 
 		 417 aa  149  1.0000000000000001e-34  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.367282  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_31970  CzcC family cobalt/zinc/cadmium efflux transporter outer membrane protein  31.39 
 
 		 428 aa  148  1.0000000000000001e-34  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0059  outer membrane efflux protein  29.77 
 
 		 394 aa  148  2.0000000000000003e-34  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00860018 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3845  outer membrane efflux protein  33.01 
 
 		 437 aa  148  2.0000000000000003e-34  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0705  RND heavy metal ion efflux pump, outer membrane protein  31.12 
 
 		 458 aa  147  4.0000000000000006e-34  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.199067  normal  0.26582 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4686  outer membrane efflux protein  32.76 
 
 		 439 aa  146  9e-34  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.432562  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3677  outer membrane efflux protein  32.76 
 
 		 439 aa  146  9e-34  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.621392  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02027  putative RND efflux system protein  29.63 
 
 		 413 aa  145  1e-33  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010070  Bmul_6170  outer membrane efflux protein  33.08 
 
 		 435 aa  144  4e-33  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.446847 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3557  outer membrane efflux protein  35.82 
 
 		 442 aa  141  1.9999999999999998e-32  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3870  Co/Zn/Cd efflux system component  30.19 
 
 		 448 aa  142  1.9999999999999998e-32  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0385  outer membrane efflux protein  29.22 
 
 		 474 aa  136  9e-31  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0377  metal ion efflux outer membrane protein, putative  32.38 
 
 		 408 aa  135  9.999999999999999e-31  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3623  Outer membrane efflux protein  30.23 
 
 		 415 aa  135  9.999999999999999e-31  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1958  aconitate hydratase 1  29.21 
 
 		 422 aa  134  1.9999999999999998e-30  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0713794  normal  0.321859 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4801  Outer membrane efflux protein  32.56 
 
 		 408 aa  132  2.0000000000000002e-29  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00249818 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2321  outer membrane efflux protein  30.95 
 
 		 428 aa  130  3e-29  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.760032  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3455  outer membrane efflux protein  27.75 
 
 		 449 aa  127  4.0000000000000003e-28  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.414344  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1970  outer membrane efflux protein  29.29 
 
 		 414 aa  125  2e-27  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2209  outer membrane efflux protein  30.09 
 
 		 433 aa  125  2e-27  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.798472  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_31040  putative cation efflux system protein  30.67 
 
 		 415 aa  122  1.9999999999999998e-26  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000919684  unclonable  5.14474e-22 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2577  outer membrane efflux protein  32.3 
 
 		 435 aa  118  1.9999999999999998e-25  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.996623 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2029  outer membrane efflux protein  28.39 
 
 		 422 aa  118  1.9999999999999998e-25  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.769975  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2339  outer membrane efflux protein  30.48 
 
 		 437 aa  118  1.9999999999999998e-25  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.884796  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3398  metal ion efflux outer membrane protein family protein, putative  31.19 
 
 		 434 aa  117  3.9999999999999997e-25  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0227  outer membrane efflux protein  28.5 
 
 		 414 aa  117  3.9999999999999997e-25  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_08520  Outer membrane efflux protein  31.57 
 
 		 424 aa  115  2.0000000000000002e-24  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.504267  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2567  outer membrane efflux protein  28.99 
 
 		 433 aa  112  2.0000000000000002e-23  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RSp0491  cobalt-zinc-cadmium outer membrane resistance protein  31.33 
 
 		 441 aa  111  3e-23  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2284  outer membrane efflux protein  30.75 
 
 		 420 aa  111  3e-23  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.185931  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2097  Outer membrane efflux protein  24.68 
 
 		 435 aa  110  4.0000000000000004e-23  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.771655  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1957  putative RND efflux system protein  26.03 
 
 		 444 aa  106  7e-22  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2137  metal ion efflux outer membrane protein family protein, putative  26.09 
 
 		 437 aa  105  2e-21  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2148  outer membrane efflux protein  33.73 
 
 		 400 aa  104  3e-21  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3766  cation efflux system protein  24.81 
 
 		 415 aa  104  3e-21  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2504  outer membrane efflux protein  32.1 
 
 		 436 aa  104  4e-21  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.10477  normal  0.0160345 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1044  HelC protein  25.38 
 
 		 416 aa  103  5e-21  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0538  outer membrane efflux protein  27.07 
 
 		 432 aa  103  7e-21  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.355565  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0828  metal ion efflux outer membrane protein family protein, putative  27.05 
 
 		 428 aa  100  4e-20  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.885444  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2356  RND OM export protein  28.83 
 
 		 421 aa  98.2  2e-19  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2609  outer membrane efflux protein  29.78 
 
 		 425 aa  98.2  3e-19  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.153251  normal  1 
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5400  outer membrane efflux protein  31.15 
 
 		 355 aa  96.7  8e-19  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0772872  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2373  HelC protein  24.21 
 
 		 414 aa  93.6  7e-18  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2628  Outer membrane efflux protein  28.75 
 
 		 432 aa  92.8  1e-17  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.753633 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3501  Outer membrane efflux protein  29.53 
 
 		 489 aa  92.8  1e-17  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3362  outer membrane efflux protein  28.54 
 
 		 431 aa  92.8  1e-17  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2447  outer membrane efflux protein  30.94 
 
 		 423 aa  90.1  7e-17  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3997  outer membrane efflux protein  22.69 
 
 		 427 aa  90.1  8e-17  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00372  putative RND efflux system protein  25.79 
 
 		 426 aa  89.7  9e-17  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2294  outer membrane efflux protein  32.76 
 
 		 409 aa  89.4  1e-16  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1939  outer membrane efflux protein  26.62 
 
 		 432 aa  89.4  1e-16  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008573  Shewana3_4386  outer membrane efflux protein  24.01 
 
 		 427 aa  87.8  3e-16  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.438421 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2166  outer membrane efflux protein  24.24 
 
 		 423 aa  87  6e-16  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2254  Outer membrane efflux protein  29.38 
 
 		 436 aa  85.9  0.000000000000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1582  outer membrane efflux protein  26.47 
 
 		 523 aa  84.3  0.000000000000004  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0516  outer membrane efflux protein  25.13 
 
 		 413 aa  82.4  0.00000000000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2056  outer membrane efflux protein  23.74 
 
 		 423 aa  81.3  0.00000000000004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000000544389 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>