208 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BBta_7266 on replicon NC_009485
Organism: Bradyrhizobium sp. BTAi1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009485  BBta_7266  putative outer membrane cobalt-zinc-cadmium resistance protein czcC precursor  100 
 
 		 424 aa  832    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.217099  normal  0.831215 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1848  outer membrane efflux protein  61.61 
 
 		 423 aa  512  1e-144  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2298  outer membrane efflux protein  60.43 
 
 		 423 aa  502  1e-141  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7183  putative outer membrane protein precursor CzcC  62.69 
 
 		 422 aa  498  1e-140  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007960  Nham_4530  outer membrane efflux protein  62.59 
 
 		 425 aa  498  1e-140  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2344  outer membrane efflux protein  59.48 
 
 		 423 aa  496  1e-139  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2142  outer membrane efflux protein  59.48 
 
 		 423 aa  496  1e-139  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.143725 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3648  outer membrane efflux protein  60.14 
 
 		 424 aa  497  1e-139  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.856557 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3343  outer membrane efflux protein  58.77 
 
 		 423 aa  486  1e-136  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.141208 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1455  Outer membrane efflux protein  60.53 
 
 		 423 aa  477  1e-133  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.170729  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0617  outer membrane efflux protein  52.83 
 
 		 438 aa  405  1e-111  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3981  outer membrane efflux protein  54.16 
 
 		 423 aa  390  1e-107  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.161912  normal  0.377505 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1420  Outer membrane efflux protein  35.38 
 
 		 472 aa  233  5e-60  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2106  Outer membrane efflux protein  32.1 
 
 		 471 aa  196  9e-49  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.343125  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2553  outer membrane efflux protein  30.79 
 
 		 421 aa  173  5e-42  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3371  outer membrane efflux protein  31.82 
 
 		 407 aa  172  9e-42  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.252246  normal  0.409086 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1329  cobalt-zinc-cadmium outer membrane resistance protein  32.99 
 
 		 425 aa  167  4e-40  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2568  outer membrane efflux protein  28.64 
 
 		 438 aa  164  3e-39  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.316597 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0045  CzcC family cobalt/zinc/cadmium efflux transporter outer membrane protein  30.05 
 
 		 423 aa  162  8.000000000000001e-39  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000529043 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0062  outer membrane efflux protein  30.05 
 
 		 423 aa  162  8.000000000000001e-39  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000405972 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0059  outer membrane efflux protein  30.05 
 
 		 423 aa  162  8.000000000000001e-39  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.56854 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0059  outer membrane efflux protein  30.05 
 
 		 394 aa  162  1e-38  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00860018 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0665  outer membrane efflux protein  31.34 
 
 		 453 aa  157  3e-37  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000306808  hitchhiker  0.00231848 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1714  outer membrane efflux protein  28.39 
 
 		 443 aa  157  3e-37  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.664423 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2715  outer membrane protein precursor CzcC  29.92 
 
 		 428 aa  156  5.0000000000000005e-37  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.727923  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1373  heavy metal resistance protein CzcC  32.98 
 
 		 443 aa  154  2.9999999999999998e-36  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_31970  CzcC family cobalt/zinc/cadmium efflux transporter outer membrane protein  29.92 
 
 		 428 aa  154  4e-36  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1175  outer membrane efflux protein  30.18 
 
 		 416 aa  151  2e-35  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4801  Outer membrane efflux protein  32.36 
 
 		 408 aa  149  9e-35  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00249818 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1527  cobalt-zinc-cadmium resistance protein CzcC  32.26 
 
 		 452 aa  149  1.0000000000000001e-34  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1089  outer membrane efflux protein  29.56 
 
 		 444 aa  148  2.0000000000000003e-34  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1031  heavy metal resistance protein CzcC  32.26 
 
 		 443 aa  148  2.0000000000000003e-34  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.147927  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0033  heavy metal resistance protein CzcC  31.99 
 
 		 443 aa  148  2.0000000000000003e-34  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.299983  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1183  heavy metal resistance protein CzcC  32.26 
 
 		 461 aa  148  2.0000000000000003e-34  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.84848  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0399  heavy metal resistance protein CzcC  32.26 
 
 		 461 aa  148  2.0000000000000003e-34  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.132876  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1442  cobalt-zinc-cadmium resistance efflux protein  32.26 
 
 		 461 aa  148  2.0000000000000003e-34  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0705718  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0013  heavy metal resistance protein CzcC  32.26 
 
 		 461 aa  148  2.0000000000000003e-34  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.238799  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2433  outer membrane efflux protein  30.23 
 
 		 440 aa  147  3e-34  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1957  putative RND efflux system protein  30.47 
 
 		 444 aa  147  5e-34  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2042  outer membrane efflux protein  31.89 
 
 		 417 aa  146  7.0000000000000006e-34  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.367282  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2408  cobalt-zinc-cadmium resistance protein CzcC, putative  32.32 
 
 		 425 aa  145  1e-33  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  decreased coverage  0.00195815  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3287  outer membrane efflux protein  32.32 
 
 		 464 aa  145  1e-33  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.7008 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3623  Outer membrane efflux protein  31.31 
 
 		 415 aa  145  1e-33  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008573  Shewana3_4156  outer membrane efflux protein  28.68 
 
 		 446 aa  145  1e-33  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.283296 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_31040  putative cation efflux system protein  29.85 
 
 		 415 aa  143  5e-33  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000919684  unclonable  5.14474e-22 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0377  metal ion efflux outer membrane protein, putative  31.63 
 
 		 408 aa  142  9.999999999999999e-33  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1847  outer membrane efflux protein  29.02 
 
 		 451 aa  141  1.9999999999999998e-32  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.179966  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3870  Co/Zn/Cd efflux system component  29.81 
 
 		 448 aa  140  3e-32  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1764  outer membrane efflux protein  28.61 
 
 		 418 aa  140  3e-32  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.715826  normal  0.306921 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02027  putative RND efflux system protein  27.85 
 
 		 413 aa  140  6e-32  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1970  outer membrane efflux protein  28.22 
 
 		 414 aa  139  7.999999999999999e-32  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0705  RND heavy metal ion efflux pump, outer membrane protein  31.39 
 
 		 458 aa  139  7.999999999999999e-32  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.199067  normal  0.26582 
 
 
-
 
NC_007971  Rmet_5982  cation proton antiporter efflux protein CzcC  28.35 
 
 		 418 aa  139  1e-31  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00000196082  normal  0.0745476 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0227  outer membrane efflux protein  28.22 
 
 		 414 aa  136  6.0000000000000005e-31  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010070  Bmul_6170  outer membrane efflux protein  31.41 
 
 		 435 aa  135  9.999999999999999e-31  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.446847 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3970  Outer membrane efflux protein  28.91 
 
 		 426 aa  134  1.9999999999999998e-30  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.214282  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3845  outer membrane efflux protein  30.98 
 
 		 437 aa  135  1.9999999999999998e-30  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4596  heavy metal cation tricomponent efflux outer membrane porin  28.76 
 
 		 431 aa  134  1.9999999999999998e-30  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0688687  hitchhiker  0.005842 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3455  outer membrane efflux protein  28.34 
 
 		 449 aa  134  3e-30  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.414344  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4686  outer membrane efflux protein  30.73 
 
 		 439 aa  132  7.999999999999999e-30  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.432562  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3677  outer membrane efflux protein  30.73 
 
 		 439 aa  132  7.999999999999999e-30  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.621392  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0385  outer membrane efflux protein  27.15 
 
 		 474 aa  130  3e-29  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3557  outer membrane efflux protein  32.17 
 
 		 442 aa  130  5.0000000000000004e-29  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2284  outer membrane efflux protein  31.74 
 
 		 420 aa  127  5e-28  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.185931  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2321  outer membrane efflux protein  31.17 
 
 		 428 aa  127  5e-28  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.760032  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2209  outer membrane efflux protein  28.24 
 
 		 433 aa  124  5e-27  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.798472  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2567  outer membrane efflux protein  30.95 
 
 		 433 aa  122  1.9999999999999998e-26  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1958  aconitate hydratase 1  26.83 
 
 		 422 aa  120  6e-26  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0713794  normal  0.321859 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1044  HelC protein  25.12 
 
 		 416 aa  119  9.999999999999999e-26  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3766  cation efflux system protein  26.15 
 
 		 415 aa  117  3.9999999999999997e-25  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RSp0491  cobalt-zinc-cadmium outer membrane resistance protein  27.65 
 
 		 441 aa  110  5e-23  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_08520  Outer membrane efflux protein  27.2 
 
 		 424 aa  110  5e-23  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.504267  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2577  outer membrane efflux protein  30.36 
 
 		 435 aa  109  7.000000000000001e-23  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.996623 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2504  outer membrane efflux protein  29 
 
 		 436 aa  108  2e-22  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.10477  normal  0.0160345 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2148  outer membrane efflux protein  32.13 
 
 		 400 aa  107  4e-22  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2097  Outer membrane efflux protein  23.72 
 
 		 435 aa  105  2e-21  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.771655  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2373  HelC protein  24.81 
 
 		 414 aa  103  4e-21  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2356  RND OM export protein  27.27 
 
 		 421 aa  101  3e-20  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5400  outer membrane efflux protein  29.66 
 
 		 355 aa  100  4e-20  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0772872  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2609  outer membrane efflux protein  28.65 
 
 		 425 aa  99.4  1e-19  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.153251  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2029  outer membrane efflux protein  25.73 
 
 		 422 aa  96.7  7e-19  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.769975  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3997  outer membrane efflux protein  24.88 
 
 		 427 aa  95.5  1e-18  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2447  outer membrane efflux protein  28.45 
 
 		 423 aa  95.1  2e-18  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2137  metal ion efflux outer membrane protein family protein, putative  25.84 
 
 		 437 aa  94.4  4e-18  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2294  outer membrane efflux protein  31.74 
 
 		 409 aa  92.4  1e-17  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1582  outer membrane efflux protein  25.47 
 
 		 523 aa  91.7  2e-17  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00372  putative RND efflux system protein  24.16 
 
 		 426 aa  90.1  6e-17  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008573  Shewana3_4386  outer membrane efflux protein  23.39 
 
 		 427 aa  87.4  4e-16  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.438421 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2339  outer membrane efflux protein  27.63 
 
 		 437 aa  87  6e-16  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.884796  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1768  outer membrane heavy metal efflux protein, putative  27.57 
 
 		 434 aa  83.6  0.000000000000007  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.481614  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3398  metal ion efflux outer membrane protein family protein, putative  27.34 
 
 		 434 aa  82.4  0.00000000000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0538  outer membrane efflux protein  26.38 
 
 		 432 aa  80.9  0.00000000000004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.355565  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0828  metal ion efflux outer membrane protein family protein, putative  26.73 
 
 		 428 aa  80.1  0.00000000000007  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.885444  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3362  outer membrane efflux protein  26.17 
 
 		 431 aa  80.1  0.00000000000008  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2628  Outer membrane efflux protein  27.41 
 
 		 432 aa  79.3  0.0000000000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.753633 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00307  Outer membrane efflux protein  23.54 
 
 		 400 aa  78.2  0.0000000000003  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2096  outer membrane efflux protein  26.96 
 
 		 419 aa  77.8  0.0000000000004  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2110  outer membrane efflux protein  24.23 
 
 		 437 aa  77  0.0000000000007  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.313002  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1330  metal ion efflux outer membrane protein family protein, putative  25.17 
 
 		 493 aa  75.1  0.000000000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1549  Outer membrane efflux protein  24.38 
 
 		 426 aa  74.7  0.000000000003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.069846  normal  0.874867 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>