105 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MADE_00372 on replicon NC_011138
Organism: Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011138  MADE_00372  putative RND efflux system protein  100 
 
 		 426 aa  853    Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3455  outer membrane efflux protein  37.22 
 
 		 449 aa  237  4e-61  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.414344  n/a   
 
 
-
 
NC_008573  Shewana3_4156  outer membrane efflux protein  38.34 
 
 		 446 aa  234  2.0000000000000002e-60  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.283296 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1970  outer membrane efflux protein  36.86 
 
 		 414 aa  233  7.000000000000001e-60  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0227  outer membrane efflux protein  36.34 
 
 		 414 aa  230  5e-59  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1958  aconitate hydratase 1  36.92 
 
 		 422 aa  228  2e-58  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0713794  normal  0.321859 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0385  outer membrane efflux protein  36.76 
 
 		 474 aa  221  1.9999999999999999e-56  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1957  putative RND efflux system protein  33.59 
 
 		 444 aa  211  3e-53  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02027  putative RND efflux system protein  33.25 
 
 		 413 aa  197  4.0000000000000005e-49  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3766  cation efflux system protein  33.5 
 
 		 415 aa  192  9e-48  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2029  outer membrane efflux protein  31.95 
 
 		 422 aa  184  2.0000000000000003e-45  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.769975  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_08520  Outer membrane efflux protein  31.09 
 
 		 424 aa  150  4e-35  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.504267  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2356  RND OM export protein  29.7 
 
 		 421 aa  138  2e-31  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_31040  putative cation efflux system protein  28.15 
 
 		 415 aa  126  6e-28  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000919684  unclonable  5.14474e-22 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2106  Outer membrane efflux protein  28.5 
 
 		 471 aa  124  3e-27  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.343125  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00307  Outer membrane efflux protein  28.21 
 
 		 400 aa  122  9.999999999999999e-27  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2097  Outer membrane efflux protein  27.36 
 
 		 435 aa  115  1.0000000000000001e-24  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.771655  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3997  outer membrane efflux protein  23.64 
 
 		 427 aa  107  3e-22  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008573  Shewana3_4386  outer membrane efflux protein  25.12 
 
 		 427 aa  107  4e-22  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.438421 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0665  outer membrane efflux protein  26.79 
 
 		 453 aa  101  3e-20  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000306808  hitchhiker  0.00231848 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3970  Outer membrane efflux protein  27.51 
 
 		 426 aa  100  4e-20  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.214282  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0045  CzcC family cobalt/zinc/cadmium efflux transporter outer membrane protein  25.3 
 
 		 423 aa  95.5  1e-18  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000529043 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0059  outer membrane efflux protein  25.3 
 
 		 423 aa  95.5  1e-18  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.56854 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0062  outer membrane efflux protein  25.3 
 
 		 423 aa  95.5  1e-18  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000405972 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2553  outer membrane efflux protein  24.34 
 
 		 421 aa  95.1  2e-18  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3870  Co/Zn/Cd efflux system component  25.41 
 
 		 448 aa  94.7  3e-18  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0059  outer membrane efflux protein  25.91 
 
 		 394 aa  94.4  4e-18  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00860018 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4596  heavy metal cation tricomponent efflux outer membrane porin  28.69 
 
 		 431 aa  92.4  1e-17  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0688687  hitchhiker  0.005842 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7266  putative outer membrane cobalt-zinc-cadmium resistance protein czcC precursor  24.16 
 
 		 424 aa  90.1  6e-17  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.217099  normal  0.831215 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_31970  CzcC family cobalt/zinc/cadmium efflux transporter outer membrane protein  24.2 
 
 		 428 aa  88.6  2e-16  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3371  outer membrane efflux protein  24.62 
 
 		 407 aa  88.6  2e-16  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.252246  normal  0.409086 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4801  Outer membrane efflux protein  25.81 
 
 		 408 aa  87.8  3e-16  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00249818 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2715  outer membrane protein precursor CzcC  24.6 
 
 		 428 aa  88.2  3e-16  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.727923  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1420  Outer membrane efflux protein  25.67 
 
 		 472 aa  87.8  4e-16  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0617  outer membrane efflux protein  25.5 
 
 		 438 aa  87.4  4e-16  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3981  outer membrane efflux protein  24.59 
 
 		 423 aa  87.8  4e-16  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.161912  normal  0.377505 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3623  Outer membrane efflux protein  25.76 
 
 		 415 aa  84.7  0.000000000000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RSp0491  cobalt-zinc-cadmium outer membrane resistance protein  26.74 
 
 		 441 aa  84  0.000000000000005  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1764  outer membrane efflux protein  25 
 
 		 418 aa  83.6  0.000000000000006  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.715826  normal  0.306921 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2142  outer membrane efflux protein  25.51 
 
 		 423 aa  82.8  0.00000000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.143725 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2344  outer membrane efflux protein  25.76 
 
 		 423 aa  82.8  0.00000000000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007971  Rmet_5982  cation proton antiporter efflux protein CzcC  24.79 
 
 		 418 aa  81.6  0.00000000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00000196082  normal  0.0745476 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1847  outer membrane efflux protein  25.91 
 
 		 451 aa  81.6  0.00000000000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.179966  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0705  RND heavy metal ion efflux pump, outer membrane protein  27.98 
 
 		 458 aa  80.5  0.00000000000005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.199067  normal  0.26582 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3557  outer membrane efflux protein  26.91 
 
 		 442 aa  79  0.0000000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3845  outer membrane efflux protein  23.78 
 
 		 437 aa  77.8  0.0000000000004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2433  outer membrane efflux protein  24.46 
 
 		 440 aa  77  0.0000000000005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2568  outer membrane efflux protein  23.68 
 
 		 438 aa  77.4  0.0000000000005  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.316597 
 
 
-
 
NC_007960  Nham_4530  outer membrane efflux protein  23.46 
 
 		 425 aa  77  0.0000000000005  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2321  outer membrane efflux protein  26.91 
 
 		 428 aa  77.4  0.0000000000005  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.760032  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1714  outer membrane efflux protein  25 
 
 		 443 aa  77  0.0000000000005  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.664423 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2298  outer membrane efflux protein  23.98 
 
 		 423 aa  76.6  0.0000000000007  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010070  Bmul_6170  outer membrane efflux protein  23.78 
 
 		 435 aa  75.5  0.000000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.446847 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2284  outer membrane efflux protein  27.68 
 
 		 420 aa  74.7  0.000000000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.185931  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1175  outer membrane efflux protein  24.68 
 
 		 416 aa  74.3  0.000000000004  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1848  outer membrane efflux protein  24.29 
 
 		 423 aa  73.9  0.000000000005  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2567  outer membrane efflux protein  27.04 
 
 		 433 aa  73.6  0.000000000006  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1373  heavy metal resistance protein CzcC  24.61 
 
 		 443 aa  72.8  0.00000000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3343  outer membrane efflux protein  23.64 
 
 		 423 aa  71.6  0.00000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.141208 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4686  outer membrane efflux protein  23.24 
 
 		 439 aa  72  0.00000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.432562  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3677  outer membrane efflux protein  23.24 
 
 		 439 aa  72  0.00000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.621392  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0377  metal ion efflux outer membrane protein, putative  25.07 
 
 		 408 aa  71.6  0.00000000003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7183  putative outer membrane protein precursor CzcC  23.98 
 
 		 422 aa  71.2  0.00000000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1455  Outer membrane efflux protein  24.03 
 
 		 423 aa  70.9  0.00000000004  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.170729  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2504  outer membrane efflux protein  27.81 
 
 		 436 aa  70.1  0.00000000008  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.10477  normal  0.0160345 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3287  outer membrane efflux protein  25.33 
 
 		 464 aa  69.7  0.00000000009  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.7008 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2408  cobalt-zinc-cadmium resistance protein CzcC, putative  24.5 
 
 		 425 aa  69.3  0.0000000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  decreased coverage  0.00195815  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3648  outer membrane efflux protein  23.68 
 
 		 424 aa  69.3  0.0000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.856557 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0033  heavy metal resistance protein CzcC  23.49 
 
 		 443 aa  67.4  0.0000000004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.299983  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0013  heavy metal resistance protein CzcC  24.38 
 
 		 461 aa  67.8  0.0000000004  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.238799  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0399  heavy metal resistance protein CzcC  24.38 
 
 		 461 aa  67.8  0.0000000004  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.132876  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1442  cobalt-zinc-cadmium resistance efflux protein  24.38 
 
 		 461 aa  67.8  0.0000000004  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0705718  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1183  heavy metal resistance protein CzcC  24.38 
 
 		 461 aa  67.8  0.0000000004  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.84848  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1031  heavy metal resistance protein CzcC  24.38 
 
 		 443 aa  67.4  0.0000000005  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.147927  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1527  cobalt-zinc-cadmium resistance protein CzcC  24.38 
 
 		 452 aa  67  0.0000000005  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1329  cobalt-zinc-cadmium outer membrane resistance protein  25.13 
 
 		 425 aa  67  0.0000000007  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5400  outer membrane efflux protein  24.83 
 
 		 355 aa  67  0.0000000007  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0772872  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2209  outer membrane efflux protein  24.61 
 
 		 433 aa  66.6  0.0000000007  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.798472  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1044  HelC protein  23.86 
 
 		 416 aa  65.1  0.000000002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2609  outer membrane efflux protein  27.08 
 
 		 425 aa  65.1  0.000000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.153251  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2042  outer membrane efflux protein  24.34 
 
 		 417 aa  65.5  0.000000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.367282  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1089  outer membrane efflux protein  24.38 
 
 		 444 aa  63.9  0.000000005  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2447  outer membrane efflux protein  26.2 
 
 		 423 aa  60.5  0.00000005  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2577  outer membrane efflux protein  25.07 
 
 		 435 aa  60.5  0.00000005  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.996623 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2373  HelC protein  23.98 
 
 		 414 aa  59.3  0.0000001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0447  outer membrane efflux protein  24.74 
 
 		 438 aa  57.4  0.0000005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.109934 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1939  outer membrane efflux protein  24.26 
 
 		 432 aa  51.6  0.00003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3931  multidrug efflux system outer membrane subunit  24.75 
 
 		 507 aa  50.8  0.00005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.436202 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2339  outer membrane efflux protein  21.94 
 
 		 437 aa  49.3  0.0001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.884796  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3343  outer membrane efflux protein  23.71 
 
 		 412 aa  48.9  0.0002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5180  outer membrane efflux protein  23.71 
 
 		 430 aa  48.1  0.0003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0538  outer membrane efflux protein  23.83 
 
 		 432 aa  47.4  0.0005  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.355565  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1390  outer membrane efflux protein  27.5 
 
 		 463 aa  46.2  0.001  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.0182398  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1099  RND efflux system outer membrane lipoprotein  24.09 
 
 		 460 aa  45.8  0.002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2294  outer membrane efflux protein  22.32 
 
 		 409 aa  45.4  0.002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2276  outer membrane efflux protein  24.16 
 
 		 432 aa  45.4  0.002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0693511 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3226  RND efflux system outer membrane lipoprotein  22.4 
 
 		 469 aa  44.7  0.003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2841  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT family  23.44 
 
 		 482 aa  44.7  0.003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.114938  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2903  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT  23.31 
 
 		 482 aa  44.7  0.004  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1629  outer membrane efflux protein  25.23 
 
 		 438 aa  44.3  0.004  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>