More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Acid345_0447 on replicon NC_008009
Organism: Candidatus Koribacter versatilis Ellin345



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008009  Acid345_0447  outer membrane efflux protein  100 
 
 
438 aa  881    Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.109934 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1641  Outer membrane efflux protein  28.36 
 
 
479 aa  134  3.9999999999999996e-30  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7201  outer membrane efflux protein  27.83 
 
 
418 aa  119  9e-26  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2110  outer membrane efflux protein  26.67 
 
 
437 aa  110  7.000000000000001e-23  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.313002  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4485  outer membrane efflux protein  23.81 
 
 
417 aa  109  1e-22  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0828  metal ion efflux outer membrane protein family protein, putative  27.29 
 
 
428 aa  106  1e-21  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.885444  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6550  outer membrane efflux protein  23.77 
 
 
433 aa  100  4e-20  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.125608  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1939  outer membrane efflux protein  25.35 
 
 
432 aa  98.6  2e-19  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2137  metal ion efflux outer membrane protein family protein, putative  25.74 
 
 
437 aa  97.8  3e-19  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4056  outer membrane efflux protein  26.84 
 
 
416 aa  94.4  3e-18  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2276  outer membrane efflux protein  24.42 
 
 
432 aa  93.2  7e-18  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0693511 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2551  outer membrane efflux protein  25.37 
 
 
422 aa  92.4  1e-17  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.000963739  normal  0.205494 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1614  outer membrane efflux protein  23.5 
 
 
409 aa  91.7  2e-17  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3507  Outer membrane efflux protein  25.28 
 
 
435 aa  91.3  3e-17  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2353  chemiosmotic efflux system C protein C  24.35 
 
 
437 aa  90.1  7e-17  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1343  outer membrane efflux protein  24.21 
 
 
429 aa  90.1  7e-17  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1551  outer membrane efflux protein  25.5 
 
 
443 aa  89.7  9e-17  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0790  outer membrane efflux protein  23.85 
 
 
423 aa  85.9  0.000000000000001  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1716  outer membrane protein  24.17 
 
 
440 aa  84.3  0.000000000000004  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000584875  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0045  CzcC family cobalt/zinc/cadmium efflux transporter outer membrane protein  26.29 
 
 
423 aa  83.2  0.000000000000008  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000529043 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0062  outer membrane efflux protein  26.29 
 
 
423 aa  83.2  0.000000000000008  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000405972 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0059  outer membrane efflux protein  26.29 
 
 
423 aa  83.2  0.000000000000008  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.56854 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3398  metal ion efflux outer membrane protein family protein, putative  24.31 
 
 
434 aa  82.4  0.00000000000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3362  outer membrane efflux protein  23.51 
 
 
431 aa  82.4  0.00000000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2065  chemiosmotic efflux system protein C-like protein  23.47 
 
 
441 aa  81.3  0.00000000000003  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2628  Outer membrane efflux protein  25.6 
 
 
432 aa  81.3  0.00000000000003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.753633 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0829  outer membrane protein; cation efflux protein  22.9 
 
 
428 aa  80.9  0.00000000000004  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0059  outer membrane efflux protein  26.52 
 
 
394 aa  79.7  0.0000000000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00860018 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0502  outer membrane efflux protein  21.62 
 
 
433 aa  77.8  0.0000000000003  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RS00407  putative outer membrane cation efflux system protein  25 
 
 
451 aa  77.4  0.0000000000004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  decreased coverage  0.00236087  normal 
 
 
-
 
NC_008607  Ppro_3648  outer membrane efflux protein  21.21 
 
 
446 aa  77  0.0000000000006  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2106  Outer membrane efflux protein  22.98 
 
 
471 aa  77  0.0000000000006  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.343125  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0578  outer membrane efflux protein  24.4 
 
 
416 aa  77  0.0000000000006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.0382538 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1549  Outer membrane efflux protein  21.24 
 
 
426 aa  77  0.0000000000007  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.069846  normal  0.874867 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1811  outer membrane efflux protein  26.12 
 
 
440 aa  76.3  0.0000000000009  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2075  chemiosmotic efflux system protein C-like protein  22.25 
 
 
437 aa  75.9  0.000000000001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3802  Outer membrane efflux protein  26.49 
 
 
465 aa  75.5  0.000000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4293  outer membrane efflux protein  24.62 
 
 
412 aa  75.5  0.000000000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.730588  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2715  outer membrane protein precursor CzcC  25.32 
 
 
428 aa  75.1  0.000000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.727923  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1877  Outer membrane efflux protein  26.49 
 
 
413 aa  74.7  0.000000000003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4120  heavy metal cation tricomponent efflux outer membrane porin HmyC  27.14 
 
 
460 aa  73.9  0.000000000005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2254  Outer membrane efflux protein  26.38 
 
 
436 aa  72.8  0.00000000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0538  outer membrane efflux protein  22.56 
 
 
432 aa  73.2  0.00000000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.355565  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1749  outer membrane efflux protein  23.93 
 
 
458 aa  71.6  0.00000000003  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1293  outer membrane efflux protein  24.35 
 
 
442 aa  71.6  0.00000000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.803504 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0150  Outer membrane efflux protein  24.2 
 
 
415 aa  70.9  0.00000000004  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.921658  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1847  outer membrane efflux protein  22.81 
 
 
451 aa  70.9  0.00000000004  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.179966  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2733  outer membrane efflux protein  23.86 
 
 
415 aa  70.5  0.00000000006  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0378376  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_31970  CzcC family cobalt/zinc/cadmium efflux transporter outer membrane protein  24.87 
 
 
428 aa  70.5  0.00000000006  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1330  metal ion efflux outer membrane protein family protein, putative  24 
 
 
493 aa  69.3  0.0000000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4765  outer membrane efflux protein  23.4 
 
 
485 aa  69.3  0.0000000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.55701 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3728  outer membrane efflux protein  23.91 
 
 
433 aa  69.3  0.0000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0602217  normal  0.0956817 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2843  outer membrane efflux protein  24.63 
 
 
489 aa  69.3  0.0000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1420  Outer membrane efflux protein  24.43 
 
 
472 aa  68.9  0.0000000002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2329  outer membrane efflux family protein, putative  27.68 
 
 
335 aa  67.8  0.0000000004  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3970  Outer membrane efflux protein  22.11 
 
 
426 aa  67.4  0.0000000005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.214282  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1373  heavy metal resistance protein CzcC  24.05 
 
 
443 aa  67.4  0.0000000005  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2568  outer membrane efflux protein  22.06 
 
 
438 aa  67  0.0000000007  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.316597 
 
 
-
 
NC_008573  Shewana3_4156  outer membrane efflux protein  24.68 
 
 
446 aa  66.6  0.0000000008  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.283296 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0087  outer membrane efflux protein  20.95 
 
 
424 aa  66.2  0.000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3623  Outer membrane efflux protein  21.88 
 
 
415 aa  65.9  0.000000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2745  outer membrane efflux protein  22.57 
 
 
415 aa  66.2  0.000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.545193 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2166  outer membrane efflux protein  19.5 
 
 
423 aa  65.1  0.000000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3501  Outer membrane efflux protein  25.66 
 
 
489 aa  64.7  0.000000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3371  outer membrane efflux protein  26.8 
 
 
407 aa  64.7  0.000000003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.252246  normal  0.409086 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0705  RND heavy metal ion efflux pump, outer membrane protein  22.91 
 
 
458 aa  64.3  0.000000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.199067  normal  0.26582 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2096  outer membrane efflux protein  23.48 
 
 
419 aa  63.9  0.000000005  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3077  outer membrane efflux protein  20.96 
 
 
426 aa  63.9  0.000000006  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.767775  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1175  outer membrane efflux protein  21.41 
 
 
416 aa  63.5  0.000000007  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1714  outer membrane efflux protein  22.2 
 
 
443 aa  61.6  0.00000003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.664423 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2433  outer membrane efflux protein  23.21 
 
 
440 aa  61.2  0.00000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2056  outer membrane efflux protein  19.75 
 
 
423 aa  61.6  0.00000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000000544389 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4684  outer membrane efflux protein  24.08 
 
 
448 aa  60.8  0.00000005  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.119437  normal  0.307779 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0377  metal ion efflux outer membrane protein, putative  24.08 
 
 
408 aa  60.8  0.00000005  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3607  outer membrane efflux protein  24.08 
 
 
448 aa  60.8  0.00000005  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.864513 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4801  Outer membrane efflux protein  22.96 
 
 
408 aa  60.5  0.00000006  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00249818 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0294  Outer membrane efflux protein  23.99 
 
 
420 aa  60.1  0.00000008  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.757224 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0185  outer membrane efflux protein  27.03 
 
 
485 aa  60.1  0.00000008  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2553  outer membrane efflux protein  21.96 
 
 
421 aa  60.1  0.00000009  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0066  outer membrane efflux protein  23.5 
 
 
436 aa  59.7  0.0000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3157  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT family  26.42 
 
 
480 aa  59.3  0.0000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3231  outer membrane protein  22.88 
 
 
416 aa  59.3  0.0000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3447  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT family  27.21 
 
 
477 aa  59.3  0.0000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.689762 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6027  nodulation protein T precursor  25.21 
 
 
483 aa  59.7  0.0000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1582  outer membrane efflux protein  24.33 
 
 
523 aa  58.9  0.0000002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1919  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT family  24.04 
 
 
482 aa  58.5  0.0000002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.328582  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0475  putative outer membrane cation efflux protein  23.86 
 
 
437 aa  58.2  0.0000003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.668446  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0040  outer membrane efflux protein  25.95 
 
 
471 aa  58.2  0.0000003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2577  outer membrane efflux protein  22.7 
 
 
435 aa  58.2  0.0000003  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.996623 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0013  heavy metal resistance protein CzcC  24.32 
 
 
461 aa  57.8  0.0000004  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.238799  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1031  heavy metal resistance protein CzcC  24.32 
 
 
443 aa  57.8  0.0000004  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.147927  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1176  Outer membrane efflux protein  25.4 
 
 
429 aa  57.4  0.0000004  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1183  heavy metal resistance protein CzcC  24.32 
 
 
461 aa  57.8  0.0000004  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.84848  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1527  cobalt-zinc-cadmium resistance protein CzcC  24.32 
 
 
452 aa  57.8  0.0000004  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0399  heavy metal resistance protein CzcC  24.32 
 
 
461 aa  57.8  0.0000004  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.132876  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1442  cobalt-zinc-cadmium resistance efflux protein  24.32 
 
 
461 aa  57.8  0.0000004  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0705718  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2670  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT family  25.33 
 
 
532 aa  57.4  0.0000005  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0133401  normal  0.268883 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1537  Outer membrane efflux protein  22.09 
 
 
445 aa  57.4  0.0000005  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00372  putative RND efflux system protein  24.74 
 
 
426 aa  57  0.0000006  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1165  Outer membrane efflux protein  24.73 
 
 
462 aa  56.6  0.0000008  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>