More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nmul_A1641 on replicon NC_007614
Organism: Nitrosospira multiformis ATCC 25196



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007614  Nmul_A1641  Outer membrane efflux protein  100 
 
 		 479 aa  967    Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2110  outer membrane efflux protein  44.42 
 
 		 437 aa  332  7.000000000000001e-90  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.313002  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1877  Outer membrane efflux protein  32.05 
 
 		 413 aa  143  6e-33  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0447  outer membrane efflux protein  28.36 
 
 		 438 aa  132  1.0000000000000001e-29  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.109934 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3501  Outer membrane efflux protein  30.57 
 
 		 489 aa  132  2.0000000000000002e-29  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1939  outer membrane efflux protein  27.9 
 
 		 432 aa  124  3e-27  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1176  Outer membrane efflux protein  29.79 
 
 		 429 aa  124  6e-27  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2276  outer membrane efflux protein  27.55 
 
 		 432 aa  121  1.9999999999999998e-26  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0693511 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3836  heavy metal cation tricomponent efflux outer membrane porin HmvC  29.28 
 
 		 445 aa  119  7.999999999999999e-26  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1343  outer membrane efflux protein  25.33 
 
 		 429 aa  117  3.9999999999999997e-25  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0829  outer membrane protein; cation efflux protein  23.43 
 
 		 428 aa  115  2.0000000000000002e-24  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2137  metal ion efflux outer membrane protein family protein, putative  26.09 
 
 		 437 aa  114  3e-24  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3362  outer membrane efflux protein  28.3 
 
 		 431 aa  114  4.0000000000000004e-24  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0828  metal ion efflux outer membrane protein family protein, putative  28.67 
 
 		 428 aa  112  2.0000000000000002e-23  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.885444  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0790  outer membrane efflux protein  25.19 
 
 		 423 aa  110  6e-23  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4293  outer membrane efflux protein  26.09 
 
 		 412 aa  109  1e-22  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.730588  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3623  Outer membrane efflux protein  27.11 
 
 		 415 aa  108  2e-22  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1175  outer membrane efflux protein  25.89 
 
 		 416 aa  106  1e-21  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1614  outer membrane efflux protein  23.02 
 
 		 409 aa  104  3e-21  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2551  outer membrane efflux protein  24.88 
 
 		 422 aa  103  7e-21  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.000963739  normal  0.205494 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0538  outer membrane efflux protein  25.42 
 
 		 432 aa  102  2e-20  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.355565  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4686  outer membrane efflux protein  27.37 
 
 		 439 aa  101  3e-20  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.432562  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3677  outer membrane efflux protein  27.37 
 
 		 439 aa  101  3e-20  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.621392  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2733  outer membrane efflux protein  23.39 
 
 		 415 aa  100  4e-20  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0378376  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3845  outer membrane efflux protein  27.37 
 
 		 437 aa  100  5e-20  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010070  Bmul_6170  outer membrane efflux protein  27.37 
 
 		 435 aa  99.4  1e-19  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.446847 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0150  Outer membrane efflux protein  27.98 
 
 		 415 aa  98.6  2e-19  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.921658  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1551  outer membrane efflux protein  28.18 
 
 		 443 aa  97.8  4e-19  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1811  outer membrane efflux protein  27.32 
 
 		 440 aa  97.4  5e-19  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2433  outer membrane efflux protein  26.12 
 
 		 440 aa  96.7  9e-19  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3398  metal ion efflux outer membrane protein family protein, putative  26.91 
 
 		 434 aa  95.5  2e-18  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3728  outer membrane efflux protein  24.77 
 
 		 433 aa  95.9  2e-18  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0602217  normal  0.0956817 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1293  outer membrane efflux protein  26.22 
 
 		 442 aa  94.7  3e-18  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.803504 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4056  outer membrane efflux protein  25.6 
 
 		 416 aa  94  5e-18  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0705  RND heavy metal ion efflux pump, outer membrane protein  25.12 
 
 		 458 aa  92  2e-17  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.199067  normal  0.26582 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2745  outer membrane efflux protein  24.07 
 
 		 415 aa  90.9  4e-17  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.545193 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0045  CzcC family cobalt/zinc/cadmium efflux transporter outer membrane protein  25.98 
 
 		 423 aa  90.9  5e-17  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000529043 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2715  outer membrane protein precursor CzcC  25.43 
 
 		 428 aa  90.9  5e-17  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.727923  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0059  outer membrane efflux protein  25.98 
 
 		 423 aa  90.9  5e-17  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.56854 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0062  outer membrane efflux protein  25.98 
 
 		 423 aa  90.9  5e-17  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000405972 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_31970  CzcC family cobalt/zinc/cadmium efflux transporter outer membrane protein  25.93 
 
 		 428 aa  90.5  7e-17  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS00407  putative outer membrane cation efflux system protein  26.82 
 
 		 451 aa  89.4  1e-16  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  decreased coverage  0.00236087  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0059  outer membrane efflux protein  25.98 
 
 		 394 aa  89.7  1e-16  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00860018 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2254  Outer membrane efflux protein  27.58 
 
 		 436 aa  88.6  2e-16  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1714  outer membrane efflux protein  25.59 
 
 		 443 aa  89  2e-16  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.664423 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4120  heavy metal cation tricomponent efflux outer membrane porin HmyC  25.39 
 
 		 460 aa  88.6  2e-16  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3557  outer membrane efflux protein  28.07 
 
 		 442 aa  88.2  3e-16  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0578  outer membrane efflux protein  24.35 
 
 		 416 aa  88.2  3e-16  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.0382538 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3802  Outer membrane efflux protein  25.54 
 
 		 465 aa  87.8  4e-16  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4485  outer membrane efflux protein  22.04 
 
 		 417 aa  87.4  5e-16  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3507  Outer membrane efflux protein  28.06 
 
 		 435 aa  87  6e-16  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1089  outer membrane efflux protein  27.25 
 
 		 444 aa  86.7  8e-16  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0294  Outer membrane efflux protein  23.76 
 
 		 420 aa  85.9  0.000000000000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.757224 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1373  heavy metal resistance protein CzcC  26.08 
 
 		 443 aa  85.5  0.000000000000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1031  heavy metal resistance protein CzcC  26.9 
 
 		 443 aa  83.6  0.000000000000008  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.147927  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1527  cobalt-zinc-cadmium resistance protein CzcC  26.9 
 
 		 452 aa  83.6  0.000000000000008  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0013  heavy metal resistance protein CzcC  26.9 
 
 		 461 aa  83.6  0.000000000000008  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.238799  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0399  heavy metal resistance protein CzcC  26.9 
 
 		 461 aa  83.6  0.000000000000008  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.132876  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1183  heavy metal resistance protein CzcC  26.9 
 
 		 461 aa  83.6  0.000000000000008  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.84848  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1442  cobalt-zinc-cadmium resistance efflux protein  26.9 
 
 		 461 aa  83.6  0.000000000000008  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0705718  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0377  metal ion efflux outer membrane protein, putative  24.45 
 
 		 408 aa  82.8  0.00000000000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2628  Outer membrane efflux protein  26.56 
 
 		 432 aa  82.8  0.00000000000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.753633 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1528  Outer membrane efflux protein  25.84 
 
 		 501 aa  82.8  0.00000000000001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0502  outer membrane efflux protein  24.35 
 
 		 433 aa  82  0.00000000000002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0033  heavy metal resistance protein CzcC  26.63 
 
 		 443 aa  81.6  0.00000000000003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.299983  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0017  outer membrane efflux protein  23.47 
 
 		 473 aa  81.3  0.00000000000004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1111  Outer membrane efflux protein  27.27 
 
 		 492 aa  81.3  0.00000000000004  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.33067  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1847  outer membrane efflux protein  24.03 
 
 		 451 aa  80.9  0.00000000000004  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.179966  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3970  Outer membrane efflux protein  23.86 
 
 		 426 aa  80.9  0.00000000000005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.214282  n/a   
 
 
-
 
NC_007971  Rmet_5982  cation proton antiporter efflux protein CzcC  23.15 
 
 		 418 aa  80.5  0.00000000000006  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00000196082  normal  0.0745476 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4596  heavy metal cation tricomponent efflux outer membrane porin  25.27 
 
 		 431 aa  80.5  0.00000000000006  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0688687  hitchhiker  0.005842 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1420  Outer membrane efflux protein  24.29 
 
 		 472 aa  80.1  0.00000000000008  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1764  outer membrane efflux protein  23.74 
 
 		 418 aa  79.3  0.0000000000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.715826  normal  0.306921 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4801  Outer membrane efflux protein  24.21 
 
 		 408 aa  77  0.0000000000008  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00249818 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7201  outer membrane efflux protein  22.37 
 
 		 418 aa  75.5  0.000000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2171  outer membrane efflux protein  27.65 
 
 		 415 aa  75.9  0.000000000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  decreased coverage  0.00952498  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6550  outer membrane efflux protein  24.55 
 
 		 433 aa  75.1  0.000000000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.125608  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1099  RND efflux system outer membrane lipoprotein  27.24 
 
 		 460 aa  74.3  0.000000000004  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RSp0491  cobalt-zinc-cadmium outer membrane resistance protein  27.25 
 
 		 441 aa  73.9  0.000000000005  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1549  Outer membrane efflux protein  24.41 
 
 		 426 aa  73.6  0.000000000007  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.069846  normal  0.874867 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2344  outer membrane efflux protein  25.25 
 
 		 423 aa  72.8  0.00000000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4684  outer membrane efflux protein  25.84 
 
 		 448 aa  73.2  0.00000000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.119437  normal  0.307779 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1582  outer membrane efflux protein  20.46 
 
 		 523 aa  72.8  0.00000000001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3607  outer membrane efflux protein  25.84 
 
 		 448 aa  73.2  0.00000000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.864513 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3923  outer membrane efflux protein  26.95 
 
 		 569 aa  72  0.00000000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.19723 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0185  outer membrane efflux protein  25.83 
 
 		 485 aa  72  0.00000000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3981  outer membrane efflux protein  25.06 
 
 		 423 aa  71.2  0.00000000003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.161912  normal  0.377505 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2042  outer membrane efflux protein  23.75 
 
 		 417 aa  71.2  0.00000000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.367282  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1330  metal ion efflux outer membrane protein family protein, putative  23.06 
 
 		 493 aa  70.5  0.00000000007  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2435  outer membrane efflux protein  22.06 
 
 		 438 aa  70.5  0.00000000007  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2692  outer membrane efflux protein  24.69 
 
 		 442 aa  70.1  0.00000000007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.922433  normal  0.254416 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2564  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT family  25.17 
 
 		 495 aa  70.1  0.00000000008  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.248386  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7266  putative outer membrane cobalt-zinc-cadmium resistance protein czcC precursor  25.48 
 
 		 424 aa  70.1  0.00000000008  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.217099  normal  0.831215 
 
 
-
 
NC_013731  Slin_6754  outer membrane efflux protein  23.08 
 
 		 449 aa  69.3  0.0000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.406805  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2298  outer membrane efflux protein  25 
 
 		 423 aa  69.3  0.0000000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2568  outer membrane efflux protein  25.54 
 
 		 438 aa  69.7  0.0000000001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.316597 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4096  outer membrane efflux protein  27.88 
 
 		 414 aa  68.9  0.0000000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.592471  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3427  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT  26.82 
 
 		 470 aa  69.3  0.0000000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2609  outer membrane efflux protein  26.19 
 
 		 425 aa  68.6  0.0000000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.153251  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3371  outer membrane efflux protein  27.09 
 
 		 407 aa  67.8  0.0000000004  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.252246  normal  0.409086 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>