76 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Slin_6550 on replicon NC_013730
Organism: Spirosoma linguale DSM 74



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013730  Slin_6550  outer membrane efflux protein  100 
 
 		 433 aa  863    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.125608  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4485  outer membrane efflux protein  37.83 
 
 		 417 aa  295  8e-79  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7201  outer membrane efflux protein  38.52 
 
 		 418 aa  283  3.0000000000000004e-75  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3231  outer membrane protein  27.1 
 
 		 416 aa  176  6e-43  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0447  outer membrane efflux protein  23.77 
 
 		 438 aa  98.2  3e-19  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.109934 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1551  outer membrane efflux protein  26.21 
 
 		 443 aa  86.7  8e-16  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1939  outer membrane efflux protein  23.41 
 
 		 432 aa  78.6  0.0000000000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1641  Outer membrane efflux protein  24.55 
 
 		 479 aa  75.1  0.000000000002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1175  outer membrane efflux protein  21.69 
 
 		 416 aa  74.7  0.000000000003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2276  outer membrane efflux protein  24.49 
 
 		 432 aa  73.2  0.00000000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0693511 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1614  outer membrane efflux protein  18.59 
 
 		 409 aa  72  0.00000000002  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4293  outer membrane efflux protein  21.61 
 
 		 412 aa  69.7  0.00000000009  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.730588  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1343  outer membrane efflux protein  20.83 
 
 		 429 aa  68.2  0.0000000003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0829  outer membrane protein; cation efflux protein  21.89 
 
 		 428 aa  67.4  0.0000000004  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0828  metal ion efflux outer membrane protein family protein, putative  22.9 
 
 		 428 aa  66.2  0.000000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.885444  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3507  Outer membrane efflux protein  22.53 
 
 		 435 aa  65.5  0.000000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2110  outer membrane efflux protein  25.18 
 
 		 437 aa  62.8  0.00000001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.313002  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0538  outer membrane efflux protein  22.27 
 
 		 432 aa  62  0.00000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.355565  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0578  outer membrane efflux protein  24.56 
 
 		 416 aa  62.4  0.00000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.0382538 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4056  outer membrane efflux protein  25.95 
 
 		 416 aa  59.3  0.0000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2171  outer membrane efflux protein  26.22 
 
 		 415 aa  58.2  0.0000003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  decreased coverage  0.00952498  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4162  outer membrane efflux protein  25.08 
 
 		 443 aa  58.2  0.0000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  decreased coverage  0.00000533026  normal  0.288124 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2551  outer membrane efflux protein  26.1 
 
 		 422 aa  58.2  0.0000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.000963739  normal  0.205494 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3362  outer membrane efflux protein  21.09 
 
 		 431 aa  57.4  0.0000004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3677  outer membrane efflux protein  24.23 
 
 		 439 aa  57.8  0.0000004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.621392  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4686  outer membrane efflux protein  24.23 
 
 		 439 aa  57.8  0.0000004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.432562  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2433  outer membrane efflux protein  24.15 
 
 		 440 aa  57.4  0.0000005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2137  metal ion efflux outer membrane protein family protein, putative  22.51 
 
 		 437 aa  55.8  0.000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010070  Bmul_6170  outer membrane efflux protein  23.75 
 
 		 435 aa  54.7  0.000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.446847 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3398  metal ion efflux outer membrane protein family protein, putative  23.22 
 
 		 434 aa  55.1  0.000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3728  outer membrane efflux protein  24.58 
 
 		 433 aa  54.3  0.000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0602217  normal  0.0956817 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1165  Outer membrane efflux protein  28.45 
 
 		 462 aa  53.5  0.000007  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3623  Outer membrane efflux protein  23.02 
 
 		 415 aa  52.4  0.00001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3845  outer membrane efflux protein  23.47 
 
 		 437 aa  52.4  0.00001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0516  outer membrane efflux protein  23.86 
 
 		 413 aa  52.8  0.00001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2745  outer membrane efflux protein  34.38 
 
 		 415 aa  51.2  0.00003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.545193 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1847  outer membrane efflux protein  23.21 
 
 		 451 aa  51.6  0.00003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.179966  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4492  outer membrane efflux protein  26.05 
 
 		 455 aa  50.8  0.00004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.685781 
 
 
-
 
NC_003296  RS00407  putative outer membrane cation efflux system protein  24.62 
 
 		 451 aa  51.2  0.00004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  decreased coverage  0.00236087  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1811  outer membrane efflux protein  21.17 
 
 		 440 aa  50.8  0.00005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0790  outer membrane efflux protein  25.9 
 
 		 423 aa  50.8  0.00005  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2326  hypothetical protein  33.33 
 
 		 122 aa  50.4  0.00006  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0096  outer membrane efflux protein  21.88 
 
 		 441 aa  50.1  0.00007  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4120  heavy metal cation tricomponent efflux outer membrane porin HmyC  25.51 
 
 		 460 aa  49.7  0.0001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2353  chemiosmotic efflux system C protein C  29.77 
 
 		 437 aa  48.9  0.0002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1293  outer membrane efflux protein  24.22 
 
 		 442 aa  48.5  0.0003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.803504 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1714  outer membrane efflux protein  22.03 
 
 		 443 aa  48.1  0.0003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.664423 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2254  RND efflux system outer membrane lipoprotein  26.91 
 
 		 487 aa  47.8  0.0003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2075  chemiosmotic efflux system protein C-like protein  29.01 
 
 		 437 aa  48.1  0.0003  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2065  chemiosmotic efflux system protein C-like protein  24.29 
 
 		 441 aa  47.4  0.0005  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2568  outer membrane efflux protein  23.47 
 
 		 438 aa  47  0.0006  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.316597 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0040  outer membrane efflux protein  26.15 
 
 		 471 aa  47  0.0006  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0705  RND heavy metal ion efflux pump, outer membrane protein  22.6 
 
 		 458 aa  47  0.0006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.199067  normal  0.26582 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0057  outer membrane protein, putative  21.06 
 
 		 470 aa  47  0.0007  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1373  heavy metal resistance protein CzcC  22.89 
 
 		 443 aa  47  0.0007  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0017  outer membrane efflux protein  24.79 
 
 		 473 aa  46.6  0.0009  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013731  Slin_6754  outer membrane efflux protein  24.58 
 
 		 449 aa  45.1  0.002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.406805  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_31970  CzcC family cobalt/zinc/cadmium efflux transporter outer membrane protein  28.8 
 
 		 428 aa  45.4  0.002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3802  Outer membrane efflux protein  24.14 
 
 		 465 aa  45.4  0.002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2715  outer membrane protein precursor CzcC  24.31 
 
 		 428 aa  45.8  0.002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.727923  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0377  metal ion efflux outer membrane protein, putative  20.19 
 
 		 408 aa  45.1  0.003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2553  outer membrane efflux protein  20.05 
 
 		 421 aa  45.1  0.003  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2064  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT  29.11 
 
 		 499 aa  44.7  0.003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3539  outer membrane channel protein  29.69 
 
 		 489 aa  44.3  0.004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.735558  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3367  outer membrane channel protein  29.69 
 
 		 489 aa  44.3  0.004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3372  outer membrane channel protein  29.69 
 
 		 489 aa  44.3  0.004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.258775 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3437  outer membrane channel protein  29.69 
 
 		 489 aa  44.3  0.004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3444  outer membrane channel protein  29.69 
 
 		 489 aa  44.3  0.004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.606184  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1967  outer membrane efflux protein  26.76 
 
 		 443 aa  44.3  0.005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  unclonable  0.0000000399706  normal  0.35271 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0387  Fis family transcriptional regulator  27.46 
 
 		 492 aa  43.9  0.006  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0729  type I secretion outer membrane protein, TolC family  30.22 
 
 		 444 aa  43.5  0.006  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000668163 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0575  type I secretion outer membrane protein, TolC family  30.22 
 
 		 444 aa  43.5  0.006  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0059  outer membrane efflux protein  26.42 
 
 		 423 aa  43.1  0.009  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.56854 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0045  CzcC family cobalt/zinc/cadmium efflux transporter outer membrane protein  26.42 
 
 		 423 aa  43.1  0.009  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000529043 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0062  outer membrane efflux protein  26.42 
 
 		 423 aa  43.1  0.009  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000405972 
 
 
-
 
NC_003296  RSp0491  cobalt-zinc-cadmium outer membrane resistance protein  23.46 
 
 		 441 aa  43.1  0.009  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>