250 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gura_0087 on replicon NC_009483
Organism: Geobacter uraniireducens Rf4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009483  Gura_0087  outer membrane efflux protein  100 
 
 
424 aa  862    Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008607  Ppro_3648  outer membrane efflux protein  70.43 
 
 
446 aa  602  1.0000000000000001e-171  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1549  Outer membrane efflux protein  67.25 
 
 
426 aa  588  1e-167  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.069846  normal  0.874867 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2166  outer membrane efflux protein  68.66 
 
 
423 aa  582  1.0000000000000001e-165  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2056  outer membrane efflux protein  68.16 
 
 
423 aa  578  1e-164  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000000544389 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1330  metal ion efflux outer membrane protein family protein, putative  58.35 
 
 
493 aa  502  1e-141  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3077  outer membrane efflux protein  55.83 
 
 
426 aa  469  1.0000000000000001e-131  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.767775  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2929  outer membrane efflux protein  56.39 
 
 
443 aa  455  1e-127  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1716  outer membrane protein  39.58 
 
 
440 aa  308  1.0000000000000001e-82  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000584875  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2435  outer membrane efflux protein  34.6 
 
 
438 aa  234  2.0000000000000002e-60  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1408  Outer membrane efflux protein  33.42 
 
 
466 aa  207  3e-52  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1528  Outer membrane efflux protein  35.03 
 
 
501 aa  200  3e-50  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2363  chemiosmotic efflux system B protein C  29.87 
 
 
419 aa  165  1.0000000000000001e-39  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0863  outer membrane efflux protein  28.02 
 
 
443 aa  157  4e-37  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.0886206  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2185  outer membrane efflux protein  29.72 
 
 
424 aa  155  1e-36  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.685797  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2705  outer membrane efflux protein  30.09 
 
 
424 aa  154  2.9999999999999998e-36  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0425807  normal  0.885603 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2262  outer membrane heavy metal efflux protein  28.93 
 
 
426 aa  150  5e-35  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2478  Outer membrane efflux protein  27.63 
 
 
416 aa  148  2.0000000000000003e-34  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2263  Outer membrane efflux protein  26.89 
 
 
424 aa  145  2e-33  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1481  outer membrane efflux protein  29.01 
 
 
424 aa  143  6e-33  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.103233  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1537  Outer membrane efflux protein  27.86 
 
 
445 aa  133  7.999999999999999e-30  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0828  metal ion efflux outer membrane protein family protein, putative  28.44 
 
 
428 aa  132  1.0000000000000001e-29  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.885444  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3507  Outer membrane efflux protein  28.44 
 
 
435 aa  122  9e-27  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2313  outer membrane efflux protein  28.38 
 
 
457 aa  120  3.9999999999999996e-26  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2137  metal ion efflux outer membrane protein family protein, putative  26.59 
 
 
437 aa  118  1.9999999999999998e-25  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4262  outer membrane efflux protein  26.75 
 
 
477 aa  117  3.9999999999999997e-25  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.495542 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0413  outer membrane efflux protein  26.17 
 
 
423 aa  115  2.0000000000000002e-24  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4856  putative cation efflux protein  24.94 
 
 
496 aa  107  5e-22  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4106  outer membrane efflux protein  27.2 
 
 
473 aa  105  1e-21  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4257  outer membrane efflux protein  26.55 
 
 
473 aa  103  5e-21  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4234  outer membrane efflux protein  26.8 
 
 
473 aa  103  6e-21  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.702007  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2276  outer membrane efflux protein  24.47 
 
 
432 aa  103  8e-21  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0693511 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3362  outer membrane efflux protein  24.81 
 
 
431 aa  102  1e-20  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00318  putative cation efflux protein  24.94 
 
 
454 aa  100  5e-20  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0538  outer membrane efflux protein  22.3 
 
 
432 aa  100  7e-20  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.355565  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1939  outer membrane efflux protein  23.63 
 
 
432 aa  99.8  9e-20  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3398  metal ion efflux outer membrane protein family protein, putative  21.85 
 
 
434 aa  95.5  1e-18  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2062  outer membrane efflux protein  25.72 
 
 
436 aa  95.5  2e-18  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2434  outer membrane efflux protein  25.72 
 
 
433 aa  95.5  2e-18  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.990538  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0170  outer membrane efflux protein  25.72 
 
 
436 aa  94.4  4e-18  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06364  hypothetical protein  21.75 
 
 
463 aa  93.6  6e-18  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001397  heavy metal RND efflux CzcC family  22.01 
 
 
473 aa  93.2  8e-18  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0134  outer membrane efflux protein  22.34 
 
 
439 aa  89.7  9e-17  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.410876  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1949  outer membrane heavy metal efflux protein, putative  26.45 
 
 
427 aa  89.4  1e-16  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1619  outer membrane efflux protein  26.45 
 
 
427 aa  89.4  1e-16  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.891221  hitchhiker  0.0000204841 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1929  outer membrane efflux protein  24.46 
 
 
447 aa  88.6  2e-16  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.845235  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2075  chemiosmotic efflux system protein C-like protein  24.3 
 
 
437 aa  87  5e-16  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2456  outer membrane efflux protein  25.48 
 
 
430 aa  87  6e-16  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0162311  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2065  chemiosmotic efflux system protein C-like protein  24.05 
 
 
441 aa  85.5  0.000000000000001  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2628  Outer membrane efflux protein  22.22 
 
 
432 aa  85.5  0.000000000000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.753633 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1368  copper/silver resistance outer membrane protein  26.89 
 
 
437 aa  86.3  0.000000000000001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1304  outer membrane efflux protein  25.17 
 
 
493 aa  84.7  0.000000000000003  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.0613803 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2353  chemiosmotic efflux system C protein C  23.17 
 
 
437 aa  83.2  0.000000000000009  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0399  heavy metal resistance protein CzcC  23.5 
 
 
461 aa  80.1  0.00000000000006  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.132876  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1442  cobalt-zinc-cadmium resistance efflux protein  23.5 
 
 
461 aa  80.1  0.00000000000006  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0705718  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1183  heavy metal resistance protein CzcC  23.5 
 
 
461 aa  80.1  0.00000000000006  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.84848  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0013  heavy metal resistance protein CzcC  23.5 
 
 
461 aa  80.1  0.00000000000006  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.238799  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1031  heavy metal resistance protein CzcC  23.5 
 
 
443 aa  80.1  0.00000000000007  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.147927  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1527  cobalt-zinc-cadmium resistance protein CzcC  23.5 
 
 
452 aa  80.1  0.00000000000008  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008758  Pnap_4511  outer membrane efflux protein  24.68 
 
 
428 aa  79.3  0.0000000000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.336672  normal 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0033  heavy metal resistance protein CzcC  23.5 
 
 
443 aa  79  0.0000000000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.299983  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2433  outer membrane efflux protein  21.65 
 
 
440 aa  77.8  0.0000000000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1625  putative outer membrane cation efflux protein  24.64 
 
 
438 aa  76.6  0.0000000000007  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.164606 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0176  outer membrane protein  23.86 
 
 
414 aa  76.6  0.0000000000008  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2210  outer membrane efflux protein  25.07 
 
 
420 aa  75.5  0.000000000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.119249  normal  0.0896895 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0705  RND heavy metal ion efflux pump, outer membrane protein  23.72 
 
 
458 aa  75.5  0.000000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.199067  normal  0.26582 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0045  CzcC family cobalt/zinc/cadmium efflux transporter outer membrane protein  21.62 
 
 
423 aa  74.3  0.000000000004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000529043 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0059  outer membrane efflux protein  21.62 
 
 
423 aa  74.3  0.000000000004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.56854 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0062  outer membrane efflux protein  21.62 
 
 
423 aa  74.3  0.000000000004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000405972 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0059  outer membrane efflux protein  21.62 
 
 
394 aa  73.9  0.000000000005  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00860018 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3493  outer membrane efflux protein  25 
 
 
428 aa  73.2  0.000000000008  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.497066 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1764  outer membrane efflux protein  24.03 
 
 
418 aa  73.2  0.000000000008  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.715826  normal  0.306921 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2254  Outer membrane efflux protein  21.93 
 
 
436 aa  72.8  0.00000000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007971  Rmet_5982  cation proton antiporter efflux protein CzcC  24.03 
 
 
418 aa  72.8  0.00000000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00000196082  normal  0.0745476 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1388  outer membrane efflux protein  23 
 
 
417 aa  72.8  0.00000000001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.615787 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3978  outer membrane efflux protein  21.88 
 
 
446 aa  71.6  0.00000000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007971  Rmet_6134  proton antiporter metal efflux protein SilC  21.97 
 
 
435 aa  71.2  0.00000000004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.144513  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4686  outer membrane efflux protein  21.61 
 
 
439 aa  70.5  0.00000000005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.432562  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3677  outer membrane efflux protein  21.61 
 
 
439 aa  70.5  0.00000000005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.621392  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3845  outer membrane efflux protein  21.61 
 
 
437 aa  70.5  0.00000000006  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_31970  CzcC family cobalt/zinc/cadmium efflux transporter outer membrane protein  23.31 
 
 
428 aa  70.1  0.00000000006  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1714  outer membrane efflux protein  21.53 
 
 
443 aa  69.7  0.00000000009  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.664423 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11753  metal ion efflux outer membrane protein family protein, putative  22.2 
 
 
405 aa  68.9  0.0000000001  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1373  heavy metal resistance protein CzcC  22.19 
 
 
443 aa  68.9  0.0000000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010070  Bmul_6170  outer membrane efflux protein  22.13 
 
 
435 aa  67.8  0.0000000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.446847 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0377  metal ion efflux outer membrane protein, putative  22.19 
 
 
408 aa  68.2  0.0000000003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4801  Outer membrane efflux protein  23 
 
 
408 aa  68.2  0.0000000003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00249818 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1420  Outer membrane efflux protein  20.46 
 
 
472 aa  68.2  0.0000000003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2568  outer membrane efflux protein  21.39 
 
 
438 aa  67.4  0.0000000005  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.316597 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3627  outer membrane efflux protein  24.51 
 
 
461 aa  67  0.0000000006  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.433273  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1582  outer membrane efflux protein  24.34 
 
 
523 aa  67  0.0000000006  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7266  putative outer membrane cobalt-zinc-cadmium resistance protein czcC precursor  22.05 
 
 
424 aa  67  0.0000000006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.217099  normal  0.831215 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0617  outer membrane efflux protein  21.5 
 
 
438 aa  66.6  0.0000000007  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4285  outer membrane efflux protein  23.26 
 
 
456 aa  66.6  0.0000000008  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010070  Bmul_6284  outer membrane efflux protein  23.47 
 
 
430 aa  65.9  0.000000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.524439  normal  0.254062 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0716  hypothetical protein  21.49 
 
 
444 aa  65.9  0.000000001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4395  outer membrane efflux protein  23.26 
 
 
417 aa  66.2  0.000000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0762591  normal  0.909511 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11378  hypothetical protein  22.63 
 
 
406 aa  65.9  0.000000002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3981  outer membrane efflux protein  23.44 
 
 
423 aa  64.3  0.000000003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.161912  normal  0.377505 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2733  outer membrane efflux protein  27.24 
 
 
415 aa  64.7  0.000000003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0378376  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>