89 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Fjoh_4293 on replicon NC_009441
Organism: Flavobacterium johnsoniae UW101



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009441  Fjoh_4293  outer membrane efflux protein  100 
 
 		 412 aa  828    Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.730588  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1811  outer membrane efflux protein  40.29 
 
 		 440 aa  332  5e-90  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3728  outer membrane efflux protein  34.48 
 
 		 433 aa  219  5e-56  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0602217  normal  0.0956817 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1343  outer membrane efflux protein  33.25 
 
 		 429 aa  208  1e-52  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2745  outer membrane efflux protein  32.03 
 
 		 415 aa  195  1e-48  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.545193 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2551  outer membrane efflux protein  28.54 
 
 		 422 aa  181  2e-44  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.000963739  normal  0.205494 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0829  outer membrane protein; cation efflux protein  29.66 
 
 		 428 aa  179  7e-44  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0578  outer membrane efflux protein  27.79 
 
 		 416 aa  169  7e-41  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.0382538 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2733  outer membrane efflux protein  28.91 
 
 		 415 aa  168  2e-40  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0378376  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4056  outer membrane efflux protein  27.27 
 
 		 416 aa  164  2.0000000000000002e-39  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1293  outer membrane efflux protein  29.93 
 
 		 442 aa  158  2e-37  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.803504 
 
 
-
 
NC_013731  Slin_6754  outer membrane efflux protein  29.87 
 
 		 449 aa  136  7.000000000000001e-31  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.406805  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1641  Outer membrane efflux protein  26.09 
 
 		 479 aa  109  1e-22  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2110  outer membrane efflux protein  25.68 
 
 		 437 aa  98.6  2e-19  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.313002  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1614  outer membrane efflux protein  27.18 
 
 		 409 aa  92  2e-17  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1175  outer membrane efflux protein  24.1 
 
 		 416 aa  80.5  0.00000000000005  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7201  outer membrane efflux protein  23.51 
 
 		 418 aa  80.1  0.00000000000006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0790  outer membrane efflux protein  24.94 
 
 		 423 aa  75.1  0.000000000002  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2715  outer membrane protein precursor CzcC  26.18 
 
 		 428 aa  75.5  0.000000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.727923  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0828  metal ion efflux outer membrane protein family protein, putative  25.45 
 
 		 428 aa  74.3  0.000000000004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.885444  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4485  outer membrane efflux protein  24.17 
 
 		 417 aa  72.4  0.00000000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0447  outer membrane efflux protein  24.62 
 
 		 438 aa  72  0.00000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.109934 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_31970  CzcC family cobalt/zinc/cadmium efflux transporter outer membrane protein  24.67 
 
 		 428 aa  72  0.00000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1714  outer membrane efflux protein  20.69 
 
 		 443 aa  70.1  0.00000000007  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.664423 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6550  outer membrane efflux protein  21.61 
 
 		 433 aa  69.7  0.00000000009  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.125608  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3557  outer membrane efflux protein  26.09 
 
 		 442 aa  67  0.0000000006  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0538  outer membrane efflux protein  24.86 
 
 		 432 aa  66.6  0.0000000008  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.355565  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3623  Outer membrane efflux protein  23.04 
 
 		 415 aa  64.7  0.000000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4801  Outer membrane efflux protein  23.91 
 
 		 408 aa  64.3  0.000000004  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00249818 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2065  chemiosmotic efflux system protein C-like protein  24.79 
 
 		 441 aa  63.9  0.000000005  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0059  outer membrane efflux protein  21.27 
 
 		 423 aa  63.5  0.000000007  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.56854 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0045  CzcC family cobalt/zinc/cadmium efflux transporter outer membrane protein  21.27 
 
 		 423 aa  63.5  0.000000007  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000529043 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0062  outer membrane efflux protein  21.27 
 
 		 423 aa  63.5  0.000000007  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000405972 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0059  outer membrane efflux protein  21.27 
 
 		 394 aa  62.8  0.00000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00860018 
 
 
-
 
NC_003296  RS00407  putative outer membrane cation efflux system protein  20.11 
 
 		 451 aa  62.8  0.00000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  decreased coverage  0.00236087  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3231  outer membrane protein  23.27 
 
 		 416 aa  62  0.00000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2353  chemiosmotic efflux system C protein C  24.4 
 
 		 437 aa  61.6  0.00000003  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3287  outer membrane efflux protein  24.3 
 
 		 464 aa  61.2  0.00000003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.7008 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2408  cobalt-zinc-cadmium resistance protein CzcC, putative  24.3 
 
 		 425 aa  61.2  0.00000004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  decreased coverage  0.00195815  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2553  outer membrane efflux protein  24.07 
 
 		 421 aa  60.8  0.00000004  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3398  metal ion efflux outer membrane protein family protein, putative  23.75 
 
 		 434 aa  60.8  0.00000005  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2042  outer membrane efflux protein  25.07 
 
 		 417 aa  59.3  0.0000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.367282  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2075  chemiosmotic efflux system protein C-like protein  24.86 
 
 		 437 aa  58.2  0.0000003  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3507  Outer membrane efflux protein  25.69 
 
 		 435 aa  57.4  0.0000004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1420  Outer membrane efflux protein  21.97 
 
 		 472 aa  57.4  0.0000004  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3970  Outer membrane efflux protein  21.67 
 
 		 426 aa  57  0.0000007  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.214282  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0377  metal ion efflux outer membrane protein, putative  22.86 
 
 		 408 aa  55.8  0.000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2137  metal ion efflux outer membrane protein family protein, putative  24.23 
 
 		 437 aa  54.7  0.000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2106  Outer membrane efflux protein  21.95 
 
 		 471 aa  54.7  0.000003  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.343125  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0150  Outer membrane efflux protein  21.31 
 
 		 415 aa  54.7  0.000003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.921658  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7266  putative outer membrane cobalt-zinc-cadmium resistance protein czcC precursor  21.22 
 
 		 424 aa  54.7  0.000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.217099  normal  0.831215 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1582  outer membrane efflux protein  22.18 
 
 		 418 aa  54.3  0.000004  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0904474  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2339  outer membrane efflux protein  27.27 
 
 		 437 aa  53.9  0.000005  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.884796  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0502  outer membrane efflux protein  21.9 
 
 		 433 aa  53.5  0.000007  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3607  outer membrane efflux protein  24.72 
 
 		 448 aa  53.5  0.000007  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.864513 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4684  outer membrane efflux protein  24.72 
 
 		 448 aa  53.5  0.000007  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.119437  normal  0.307779 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0617  outer membrane efflux protein  21.12 
 
 		 438 aa  52.4  0.00001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3126  outer membrane efflux protein  31.02 
 
 		 444 aa  52.8  0.00001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1847  outer membrane efflux protein  21.57 
 
 		 451 aa  52  0.00002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.179966  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1939  outer membrane efflux protein  23.77 
 
 		 432 aa  52  0.00002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3362  outer membrane efflux protein  24.48 
 
 		 431 aa  51.2  0.00003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0705  RND heavy metal ion efflux pump, outer membrane protein  21.79 
 
 		 458 aa  51.2  0.00003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.199067  normal  0.26582 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3371  outer membrane efflux protein  22.65 
 
 		 407 aa  51.2  0.00004  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.252246  normal  0.409086 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3981  outer membrane efflux protein  21.28 
 
 		 423 aa  50.8  0.00004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.161912  normal  0.377505 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2276  outer membrane efflux protein  23.44 
 
 		 432 aa  50.4  0.00005  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0693511 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2191  outer membrane efflux protein  22.99 
 
 		 492 aa  50.4  0.00006  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1551  outer membrane efflux protein  21.9 
 
 		 443 aa  50.1  0.00007  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0665  outer membrane efflux protein  23.36 
 
 		 453 aa  48.1  0.0002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000306808  hitchhiker  0.00231848 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2628  Outer membrane efflux protein  21.73 
 
 		 432 aa  48.5  0.0002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.753633 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0786  outer membrane efflux protein  27.71 
 
 		 452 aa  48.9  0.0002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2254  Outer membrane efflux protein  24.2 
 
 		 436 aa  48.1  0.0003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2096  outer membrane efflux protein  18.87 
 
 		 419 aa  47.8  0.0004  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1877  Outer membrane efflux protein  20.63 
 
 		 413 aa  47.4  0.0005  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1155  hypothetical protein  23.28 
 
 		 418 aa  47  0.0006  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1167  outer membrane efflux protein  21.71 
 
 		 419 aa  46.6  0.0008  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007971  Rmet_5982  cation proton antiporter efflux protein CzcC  20.98 
 
 		 418 aa  46.2  0.001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00000196082  normal  0.0745476 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1329  cobalt-zinc-cadmium outer membrane resistance protein  21.78 
 
 		 425 aa  46.2  0.001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1089  outer membrane efflux protein  22.57 
 
 		 444 aa  45.8  0.001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3870  Co/Zn/Cd efflux system component  21.8 
 
 		 448 aa  45.4  0.002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RSp0491  cobalt-zinc-cadmium outer membrane resistance protein  32.35 
 
 		 441 aa  45.4  0.002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0066  outer membrane efflux protein  25.83 
 
 		 436 aa  44.7  0.003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1764  outer membrane efflux protein  20.98 
 
 		 418 aa  44.3  0.004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.715826  normal  0.306921 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2485  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT  21.62 
 
 		 487 aa  43.9  0.005  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.072827  normal  0.13209 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2692  outer membrane efflux protein  23.98 
 
 		 442 aa  43.9  0.006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.922433  normal  0.254416 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2756  outer membrane efflux protein  21.61 
 
 		 490 aa  43.9  0.006  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.158368  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3802  Outer membrane efflux protein  21.21 
 
 		 465 aa  43.5  0.007  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4223  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT family  22.04 
 
 		 510 aa  43.1  0.01  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  decreased coverage  0.00337155  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2568  outer membrane efflux protein  30.26 
 
 		 438 aa  42.7  0.01  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.316597 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4333  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT family  22.04 
 
 		 510 aa  43.1  0.01  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0379784  normal  0.0805194 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>