140 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Fjoh_2733 on replicon NC_009441
Organism: Flavobacterium johnsoniae UW101



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009441  Fjoh_2733  outer membrane efflux protein  100 
 
 
415 aa  835    Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0378376  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3728  outer membrane efflux protein  39.47 
 
 
433 aa  278  1e-73  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0602217  normal  0.0956817 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2551  outer membrane efflux protein  33.67 
 
 
422 aa  257  3e-67  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.000963739  normal  0.205494 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0578  outer membrane efflux protein  35.25 
 
 
416 aa  256  6e-67  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.0382538 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2745  outer membrane efflux protein  33.98 
 
 
415 aa  250  3e-65  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.545193 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4056  outer membrane efflux protein  34.53 
 
 
416 aa  238  2e-61  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0829  outer membrane protein; cation efflux protein  31.76 
 
 
428 aa  212  7.999999999999999e-54  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1343  outer membrane efflux protein  31.33 
 
 
429 aa  208  1e-52  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4293  outer membrane efflux protein  28.91 
 
 
412 aa  168  2e-40  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.730588  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1293  outer membrane efflux protein  29.23 
 
 
442 aa  150  4e-35  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.803504 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1811  outer membrane efflux protein  25.56 
 
 
440 aa  137  3.0000000000000003e-31  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013731  Slin_6754  outer membrane efflux protein  27.52 
 
 
449 aa  132  7.999999999999999e-30  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.406805  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1641  Outer membrane efflux protein  23.39 
 
 
479 aa  100  3e-20  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2110  outer membrane efflux protein  23.51 
 
 
437 aa  94.4  3e-18  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.313002  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4485  outer membrane efflux protein  24.8 
 
 
417 aa  85.5  0.000000000000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2353  chemiosmotic efflux system C protein C  24.71 
 
 
437 aa  80.1  0.00000000000007  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1614  outer membrane efflux protein  24.5 
 
 
409 aa  78.6  0.0000000000002  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_31970  CzcC family cobalt/zinc/cadmium efflux transporter outer membrane protein  22.41 
 
 
428 aa  77  0.0000000000006  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7266  putative outer membrane cobalt-zinc-cadmium resistance protein czcC precursor  22.22 
 
 
424 aa  75.5  0.000000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.217099  normal  0.831215 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2344  outer membrane efflux protein  21.03 
 
 
423 aa  75.1  0.000000000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2065  chemiosmotic efflux system protein C-like protein  24.56 
 
 
441 aa  73.9  0.000000000005  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1373  heavy metal resistance protein CzcC  22.47 
 
 
443 aa  73.2  0.000000000009  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010070  Bmul_6170  outer membrane efflux protein  21.53 
 
 
435 aa  72.8  0.00000000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.446847 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2715  outer membrane protein precursor CzcC  21.1 
 
 
428 aa  72  0.00000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.727923  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0790  outer membrane efflux protein  23.43 
 
 
423 aa  70.5  0.00000000005  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0045  CzcC family cobalt/zinc/cadmium efflux transporter outer membrane protein  22.22 
 
 
423 aa  70.1  0.00000000006  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000529043 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4596  heavy metal cation tricomponent efflux outer membrane porin  22.01 
 
 
431 aa  70.1  0.00000000006  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0688687  hitchhiker  0.005842 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0059  outer membrane efflux protein  22.22 
 
 
423 aa  70.1  0.00000000006  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.56854 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0062  outer membrane efflux protein  22.22 
 
 
423 aa  70.1  0.00000000006  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000405972 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7201  outer membrane efflux protein  24.64 
 
 
418 aa  68.9  0.0000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3343  outer membrane efflux protein  20.73 
 
 
423 aa  69.3  0.0000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.141208 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1175  outer membrane efflux protein  23.19 
 
 
416 aa  69.3  0.0000000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3648  outer membrane efflux protein  20.25 
 
 
424 aa  68.9  0.0000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.856557 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7183  putative outer membrane protein precursor CzcC  20.66 
 
 
422 aa  68.6  0.0000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2106  Outer membrane efflux protein  21.11 
 
 
471 aa  68.2  0.0000000003  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.343125  n/a   
 
 
-
 
NC_007960  Nham_4530  outer membrane efflux protein  21.08 
 
 
425 aa  68.2  0.0000000003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3845  outer membrane efflux protein  21.31 
 
 
437 aa  67.8  0.0000000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4686  outer membrane efflux protein  21.41 
 
 
439 aa  67.8  0.0000000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.432562  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3677  outer membrane efflux protein  21.41 
 
 
439 aa  67.8  0.0000000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.621392  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0059  outer membrane efflux protein  21.75 
 
 
394 aa  67.8  0.0000000003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00860018 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2435  outer membrane efflux protein  22.53 
 
 
438 aa  67.4  0.0000000004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2075  chemiosmotic efflux system protein C-like protein  23.51 
 
 
437 aa  67.4  0.0000000005  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1420  Outer membrane efflux protein  23.92 
 
 
472 aa  66.6  0.0000000007  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3371  outer membrane efflux protein  20.58 
 
 
407 aa  65.9  0.000000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.252246  normal  0.409086 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2298  outer membrane efflux protein  19.56 
 
 
423 aa  65.5  0.000000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0538  outer membrane efflux protein  19.03 
 
 
432 aa  65.1  0.000000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.355565  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0087  outer membrane efflux protein  27.24 
 
 
424 aa  65.1  0.000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3970  Outer membrane efflux protein  21.45 
 
 
426 aa  64.3  0.000000004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.214282  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2142  outer membrane efflux protein  19.55 
 
 
423 aa  63.9  0.000000005  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.143725 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1764  outer membrane efflux protein  22.94 
 
 
418 aa  63.5  0.000000006  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.715826  normal  0.306921 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2628  Outer membrane efflux protein  21.35 
 
 
432 aa  63.5  0.000000007  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.753633 
 
 
-
 
NC_003296  RS00407  putative outer membrane cation efflux system protein  18.33 
 
 
451 aa  63.2  0.000000008  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  decreased coverage  0.00236087  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0502  outer membrane efflux protein  21.96 
 
 
433 aa  63.2  0.000000008  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0617  outer membrane efflux protein  20.53 
 
 
438 aa  63.2  0.000000008  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RSp0491  cobalt-zinc-cadmium outer membrane resistance protein  24.52 
 
 
441 aa  63.2  0.000000009  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007971  Rmet_5982  cation proton antiporter efflux protein CzcC  22.45 
 
 
418 aa  63.2  0.000000009  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00000196082  normal  0.0745476 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2433  outer membrane efflux protein  21.41 
 
 
440 aa  62.4  0.00000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1848  outer membrane efflux protein  18.98 
 
 
423 aa  62.8  0.00000001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0447  outer membrane efflux protein  23.86 
 
 
438 aa  62.4  0.00000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.109934 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3981  outer membrane efflux protein  21.05 
 
 
423 aa  61.6  0.00000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.161912  normal  0.377505 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2339  outer membrane efflux protein  18.84 
 
 
437 aa  61.2  0.00000003  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.884796  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0828  metal ion efflux outer membrane protein family protein, putative  25.56 
 
 
428 aa  60.8  0.00000004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.885444  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1455  Outer membrane efflux protein  19.16 
 
 
423 aa  58.5  0.0000002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.170729  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2568  outer membrane efflux protein  19.15 
 
 
438 aa  58.2  0.0000002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.316597 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3362  outer membrane efflux protein  20.72 
 
 
431 aa  58.9  0.0000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0033  heavy metal resistance protein CzcC  20.14 
 
 
443 aa  57.8  0.0000004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.299983  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0150  Outer membrane efflux protein  24.56 
 
 
415 aa  57.8  0.0000004  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.921658  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3801  outer membrane efflux protein  21.98 
 
 
449 aa  57.8  0.0000004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.233057 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1176  Outer membrane efflux protein  20.33 
 
 
429 aa  57.4  0.0000005  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1939  outer membrane efflux protein  22.85 
 
 
432 aa  57.4  0.0000005  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3398  metal ion efflux outer membrane protein family protein, putative  20.68 
 
 
434 aa  57  0.0000006  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0013  heavy metal resistance protein CzcC  20.14 
 
 
461 aa  57  0.0000006  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.238799  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0399  heavy metal resistance protein CzcC  20.14 
 
 
461 aa  57  0.0000006  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.132876  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1527  cobalt-zinc-cadmium resistance protein CzcC  20.14 
 
 
452 aa  57  0.0000006  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1442  cobalt-zinc-cadmium resistance efflux protein  20.14 
 
 
461 aa  57  0.0000006  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0705718  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1183  heavy metal resistance protein CzcC  20.14 
 
 
461 aa  57  0.0000006  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.84848  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1031  heavy metal resistance protein CzcC  20.14 
 
 
443 aa  57  0.0000007  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.147927  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1877  Outer membrane efflux protein  21.15 
 
 
413 aa  56.6  0.0000007  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0705  RND heavy metal ion efflux pump, outer membrane protein  20.7 
 
 
458 aa  56.6  0.0000008  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.199067  normal  0.26582 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1551  outer membrane efflux protein  19.46 
 
 
443 aa  56.6  0.0000008  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2166  outer membrane efflux protein  24.5 
 
 
423 aa  56.6  0.0000009  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0377  metal ion efflux outer membrane protein, putative  21.25 
 
 
408 aa  56.2  0.000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4801  Outer membrane efflux protein  21.28 
 
 
408 aa  55.8  0.000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00249818 
 
 
-
 
NC_008607  Ppro_3648  outer membrane efflux protein  21.9 
 
 
446 aa  56.2  0.000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2137  metal ion efflux outer membrane protein family protein, putative  21.59 
 
 
437 aa  55.5  0.000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1329  cobalt-zinc-cadmium outer membrane resistance protein  25.49 
 
 
425 aa  55.1  0.000002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1714  outer membrane efflux protein  18.8 
 
 
443 aa  55.1  0.000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.664423 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1847  outer membrane efflux protein  19.34 
 
 
451 aa  54.7  0.000003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.179966  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2276  outer membrane efflux protein  20.53 
 
 
432 aa  53.5  0.000006  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0693511 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3802  Outer membrane efflux protein  16.96 
 
 
465 aa  53.1  0.000008  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1549  Outer membrane efflux protein  23.45 
 
 
426 aa  52.8  0.00001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.069846  normal  0.874867 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2056  outer membrane efflux protein  24.6 
 
 
423 aa  52.8  0.00001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000000544389 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4447  outer membrane efflux protein  21.86 
 
 
459 aa  52  0.00002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3623  Outer membrane efflux protein  21.37 
 
 
415 aa  51.6  0.00002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1330  metal ion efflux outer membrane protein family protein, putative  22.79 
 
 
493 aa  51.6  0.00003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0364  outer membrane channel protein  24.13 
 
 
500 aa  51.2  0.00003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2254  Outer membrane efflux protein  20 
 
 
436 aa  50.8  0.00004  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2209  outer membrane efflux protein  20.6 
 
 
433 aa  50.8  0.00004  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.798472  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1582  outer membrane efflux protein  24.29 
 
 
523 aa  51.2  0.00004  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0665  outer membrane efflux protein  26.3 
 
 
453 aa  50.8  0.00004  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000306808  hitchhiker  0.00231848 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>