47 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dfer_0578 on replicon NC_013037
Organism: Dyadobacter fermentans DSM 18053



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013037  Dfer_0578  outer membrane efflux protein  100 
 
 		 416 aa  841    Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.0382538 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2745  outer membrane efflux protein  67.71 
 
 		 415 aa  580  1e-164  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.545193 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4056  outer membrane efflux protein  52.77 
 
 		 416 aa  410  1e-113  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2551  outer membrane efflux protein  46.97 
 
 		 422 aa  366  1e-100  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.000963739  normal  0.205494 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3728  outer membrane efflux protein  35.97 
 
 		 433 aa  255  1.0000000000000001e-66  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0602217  normal  0.0956817 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2733  outer membrane efflux protein  35.48 
 
 		 415 aa  250  3e-65  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0378376  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1343  outer membrane efflux protein  33.33 
 
 		 429 aa  235  9e-61  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0829  outer membrane protein; cation efflux protein  32.3 
 
 		 428 aa  228  1e-58  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1811  outer membrane efflux protein  31.05 
 
 		 440 aa  183  4.0000000000000006e-45  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4293  outer membrane efflux protein  27.79 
 
 		 412 aa  169  7e-41  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.730588  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1293  outer membrane efflux protein  26.72 
 
 		 442 aa  142  9.999999999999999e-33  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.803504 
 
 
-
 
NC_013731  Slin_6754  outer membrane efflux protein  27.53 
 
 		 449 aa  123  6e-27  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.406805  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2110  outer membrane efflux protein  22.54 
 
 		 437 aa  88.2  2e-16  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.313002  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1641  Outer membrane efflux protein  24.35 
 
 		 479 aa  88.2  3e-16  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0447  outer membrane efflux protein  24.26 
 
 		 438 aa  70.9  0.00000000004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.109934 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4485  outer membrane efflux protein  25.58 
 
 		 417 aa  70.1  0.00000000007  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2276  outer membrane efflux protein  23.51 
 
 		 432 aa  66.6  0.0000000008  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0693511 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1939  outer membrane efflux protein  21.65 
 
 		 432 aa  66.6  0.0000000008  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3623  Outer membrane efflux protein  27.85 
 
 		 415 aa  63.9  0.000000005  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0045  CzcC family cobalt/zinc/cadmium efflux transporter outer membrane protein  25.99 
 
 		 423 aa  63.5  0.000000006  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000529043 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0062  outer membrane efflux protein  25.99 
 
 		 423 aa  63.5  0.000000006  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000405972 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0059  outer membrane efflux protein  25.99 
 
 		 423 aa  63.5  0.000000006  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.56854 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2715  outer membrane protein precursor CzcC  27.27 
 
 		 428 aa  63.2  0.000000008  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.727923  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0059  outer membrane efflux protein  26.38 
 
 		 394 aa  63.2  0.000000009  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00860018 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2137  metal ion efflux outer membrane protein family protein, putative  23.16 
 
 		 437 aa  63.2  0.00000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7266  putative outer membrane cobalt-zinc-cadmium resistance protein czcC precursor  24 
 
 		 424 aa  62  0.00000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.217099  normal  0.831215 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3362  outer membrane efflux protein  25.7 
 
 		 431 aa  61.6  0.00000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6550  outer membrane efflux protein  24.56 
 
 		 433 aa  62.4  0.00000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.125608  normal  1 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0790  outer membrane efflux protein  23.75 
 
 		 423 aa  62  0.00000002  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3231  outer membrane protein  23.06 
 
 		 416 aa  62  0.00000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_31970  CzcC family cobalt/zinc/cadmium efflux transporter outer membrane protein  25.82 
 
 		 428 aa  60.8  0.00000005  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3507  Outer membrane efflux protein  23.94 
 
 		 435 aa  59.7  0.00000008  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1614  outer membrane efflux protein  18.33 
 
 		 409 aa  57.4  0.0000004  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7201  outer membrane efflux protein  22.07 
 
 		 418 aa  55.8  0.000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0828  metal ion efflux outer membrane protein family protein, putative  24.42 
 
 		 428 aa  54.7  0.000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.885444  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0377  metal ion efflux outer membrane protein, putative  24.36 
 
 		 408 aa  50.8  0.00004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0773  outer membrane efflux protein  24.21 
 
 		 387 aa  50.4  0.00006  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00492916  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0538  outer membrane efflux protein  20.94 
 
 		 432 aa  49.3  0.0001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.355565  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4801  Outer membrane efflux protein  23.81 
 
 		 408 aa  48.1  0.0003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00249818 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1848  outer membrane efflux protein  21.08 
 
 		 423 aa  47.4  0.0004  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2065  chemiosmotic efflux system protein C-like protein  21.82 
 
 		 441 aa  45.1  0.002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7183  putative outer membrane protein precursor CzcC  23.13 
 
 		 422 aa  45.4  0.002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1175  outer membrane efflux protein  22.19 
 
 		 416 aa  44.7  0.003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2075  chemiosmotic efflux system protein C-like protein  22.17 
 
 		 437 aa  44.7  0.003  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2344  outer membrane efflux protein  23.95 
 
 		 423 aa  43.9  0.005  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2838  RND efflux system outer membrane lipoprotein  33 
 
 		 528 aa  43.1  0.008  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.207275 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2327  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT family  33 
 
 		 528 aa  43.1  0.008  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.356993  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>