97 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Slin_6754 on replicon NC_013731
Organism: Spirosoma linguale DSM 74



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013731  Slin_6754  outer membrane efflux protein  100 
 
 		 449 aa  899    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.406805  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1293  outer membrane efflux protein  62.25 
 
 		 442 aa  531  1e-149  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.803504 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3728  outer membrane efflux protein  29.48 
 
 		 433 aa  173  5e-42  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0602217  normal  0.0956817 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1343  outer membrane efflux protein  28.26 
 
 		 429 aa  160  4e-38  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4293  outer membrane efflux protein  29.87 
 
 		 412 aa  149  1.0000000000000001e-34  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.730588  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0829  outer membrane protein; cation efflux protein  27.23 
 
 		 428 aa  147  3e-34  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1811  outer membrane efflux protein  29.93 
 
 		 440 aa  147  3e-34  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2733  outer membrane efflux protein  27.27 
 
 		 415 aa  143  6e-33  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0378376  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2551  outer membrane efflux protein  33.23 
 
 		 422 aa  135  1.9999999999999998e-30  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.000963739  normal  0.205494 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0578  outer membrane efflux protein  27.53 
 
 		 416 aa  130  3e-29  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.0382538 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2745  outer membrane efflux protein  27.56 
 
 		 415 aa  129  1.0000000000000001e-28  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.545193 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4056  outer membrane efflux protein  30.14 
 
 		 416 aa  126  1e-27  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0790  outer membrane efflux protein  23.9 
 
 		 423 aa  87.4  5e-16  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1641  Outer membrane efflux protein  23.08 
 
 		 479 aa  81.6  0.00000000000002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0059  outer membrane efflux protein  25.35 
 
 		 423 aa  80.5  0.00000000000005  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.56854 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0045  CzcC family cobalt/zinc/cadmium efflux transporter outer membrane protein  25.35 
 
 		 423 aa  80.5  0.00000000000005  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000529043 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0062  outer membrane efflux protein  25.35 
 
 		 423 aa  80.5  0.00000000000005  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000405972 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0059  outer membrane efflux protein  26.24 
 
 		 394 aa  77.4  0.0000000000005  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00860018 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4801  Outer membrane efflux protein  28.62 
 
 		 408 aa  75.9  0.000000000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00249818 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3398  metal ion efflux outer membrane protein family protein, putative  29.5 
 
 		 434 aa  74.7  0.000000000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3677  outer membrane efflux protein  23.43 
 
 		 439 aa  70.1  0.00000000007  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.621392  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4686  outer membrane efflux protein  23.43 
 
 		 439 aa  70.1  0.00000000007  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.432562  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2433  outer membrane efflux protein  23.78 
 
 		 440 aa  70.1  0.00000000008  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS00407  putative outer membrane cation efflux system protein  23.51 
 
 		 451 aa  69.3  0.0000000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  decreased coverage  0.00236087  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3845  outer membrane efflux protein  23.43 
 
 		 437 aa  68.2  0.0000000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1847  outer membrane efflux protein  22.86 
 
 		 451 aa  67.8  0.0000000004  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.179966  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0377  metal ion efflux outer membrane protein, putative  25.88 
 
 		 408 aa  65.5  0.000000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2568  outer membrane efflux protein  26.94 
 
 		 438 aa  65.1  0.000000003  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.316597 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1175  outer membrane efflux protein  24.76 
 
 		 416 aa  65.1  0.000000003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010070  Bmul_6170  outer membrane efflux protein  23.24 
 
 		 435 aa  64.7  0.000000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.446847 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4485  outer membrane efflux protein  23.39 
 
 		 417 aa  64.3  0.000000004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0538  outer membrane efflux protein  24.85 
 
 		 432 aa  63.9  0.000000005  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.355565  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1714  outer membrane efflux protein  23.77 
 
 		 443 aa  62.8  0.00000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.664423 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2276  outer membrane efflux protein  27.53 
 
 		 432 aa  62.4  0.00000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0693511 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2110  outer membrane efflux protein  24.31 
 
 		 437 aa  62.4  0.00000001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.313002  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1614  outer membrane efflux protein  20.38 
 
 		 409 aa  62.8  0.00000001  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007971  Rmet_5982  cation proton antiporter efflux protein CzcC  24.69 
 
 		 418 aa  62.4  0.00000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00000196082  normal  0.0745476 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3623  Outer membrane efflux protein  25.63 
 
 		 415 aa  61.6  0.00000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1877  Outer membrane efflux protein  27.25 
 
 		 413 aa  61.6  0.00000003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3970  Outer membrane efflux protein  23.81 
 
 		 426 aa  60.8  0.00000005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.214282  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1764  outer membrane efflux protein  24.94 
 
 		 418 aa  59.3  0.0000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.715826  normal  0.306921 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3362  outer membrane efflux protein  23.65 
 
 		 431 aa  58.9  0.0000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_31970  CzcC family cobalt/zinc/cadmium efflux transporter outer membrane protein  25.9 
 
 		 428 aa  58.2  0.0000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2715  outer membrane protein precursor CzcC  26.27 
 
 		 428 aa  57.8  0.0000004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.727923  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2137  metal ion efflux outer membrane protein family protein, putative  26.32 
 
 		 437 aa  57.8  0.0000004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1939  outer membrane efflux protein  25.56 
 
 		 432 aa  56.2  0.000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2042  outer membrane efflux protein  24.37 
 
 		 417 aa  55.1  0.000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.367282  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3981  outer membrane efflux protein  24.77 
 
 		 423 aa  55.1  0.000003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.161912  normal  0.377505 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3287  outer membrane efflux protein  23.86 
 
 		 464 aa  54.3  0.000005  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.7008 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1329  cobalt-zinc-cadmium outer membrane resistance protein  21.33 
 
 		 425 aa  53.9  0.000005  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1848  outer membrane efflux protein  22.43 
 
 		 423 aa  53.5  0.000007  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7266  putative outer membrane cobalt-zinc-cadmium resistance protein czcC precursor  22.87 
 
 		 424 aa  52.8  0.00001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.217099  normal  0.831215 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2408  cobalt-zinc-cadmium resistance protein CzcC, putative  23.86 
 
 		 425 aa  53.1  0.00001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  decreased coverage  0.00195815  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2106  Outer membrane efflux protein  23.15 
 
 		 471 aa  52.8  0.00001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.343125  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4120  heavy metal cation tricomponent efflux outer membrane porin HmyC  21.59 
 
 		 460 aa  52  0.00002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0828  metal ion efflux outer membrane protein family protein, putative  24.17 
 
 		 428 aa  52  0.00002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.885444  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3607  outer membrane efflux protein  25.3 
 
 		 448 aa  51.2  0.00003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.864513 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0185  outer membrane efflux protein  24.21 
 
 		 485 aa  51.6  0.00003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4684  outer membrane efflux protein  25.3 
 
 		 448 aa  51.2  0.00003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.119437  normal  0.307779 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1420  Outer membrane efflux protein  22.69 
 
 		 472 aa  51.2  0.00004  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3501  Outer membrane efflux protein  23.63 
 
 		 489 aa  50.8  0.00005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2298  outer membrane efflux protein  20.85 
 
 		 423 aa  50.8  0.00005  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3507  Outer membrane efflux protein  24.87 
 
 		 435 aa  50.8  0.00005  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0033  heavy metal resistance protein CzcC  23.85 
 
 		 443 aa  50.1  0.00008  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.299983  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7201  outer membrane efflux protein  25.66 
 
 		 418 aa  49.7  0.0001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0013  heavy metal resistance protein CzcC  23.39 
 
 		 461 aa  48.5  0.0002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.238799  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1183  heavy metal resistance protein CzcC  23.39 
 
 		 461 aa  48.5  0.0002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.84848  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1373  heavy metal resistance protein CzcC  22.78 
 
 		 443 aa  48.9  0.0002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1442  cobalt-zinc-cadmium resistance efflux protein  23.39 
 
 		 461 aa  48.5  0.0002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0705718  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2553  outer membrane efflux protein  25.78 
 
 		 421 aa  48.9  0.0002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1527  cobalt-zinc-cadmium resistance protein CzcC  23.39 
 
 		 452 aa  48.5  0.0002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0399  heavy metal resistance protein CzcC  23.39 
 
 		 461 aa  48.5  0.0002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.132876  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1031  heavy metal resistance protein CzcC  23.39 
 
 		 443 aa  48.5  0.0002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.147927  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7183  putative outer membrane protein precursor CzcC  20.52 
 
 		 422 aa  48.1  0.0003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0447  outer membrane efflux protein  27.45 
 
 		 438 aa  48.1  0.0003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.109934 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3836  heavy metal cation tricomponent efflux outer membrane porin HmvC  27.67 
 
 		 445 aa  48.5  0.0003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6550  outer membrane efflux protein  24.36 
 
 		 433 aa  48.1  0.0003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.125608  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3465  Outer membrane efflux protein  28.63 
 
 		 441 aa  47.8  0.0004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1089  outer membrane efflux protein  21.95 
 
 		 444 aa  47.8  0.0004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013731  Slin_6757  heavy metal efflux pump, CzcA family  28.7 
 
 		 1480 aa  47.4  0.0005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.603059  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3648  outer membrane efflux protein  21.77 
 
 		 424 aa  46.2  0.001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.856557 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0705  RND heavy metal ion efflux pump, outer membrane protein  22.55 
 
 		 458 aa  46.2  0.001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.199067  normal  0.26582 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3081  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT  23.94 
 
 		 496 aa  45.4  0.002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.703187  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0665  outer membrane efflux protein  24 
 
 		 453 aa  45.4  0.002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000306808  hitchhiker  0.00231848 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0502  outer membrane efflux protein  24.05 
 
 		 433 aa  45.8  0.002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0808  RND efflux system outer membrane lipoprotein  29.75 
 
 		 502 aa  45.4  0.002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.378671 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1768  outer membrane heavy metal efflux protein, putative  23.97 
 
 		 434 aa  45.1  0.003  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.481614  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1176  Outer membrane efflux protein  24.73 
 
 		 429 aa  45.1  0.003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1455  Outer membrane efflux protein  21 
 
 		 423 aa  45.1  0.003  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.170729  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0150  Outer membrane efflux protein  21.54 
 
 		 415 aa  44.7  0.003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.921658  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2142  outer membrane efflux protein  22.28 
 
 		 423 aa  44.3  0.004  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.143725 
 
 
-
 
NC_007971  Rmet_6134  proton antiporter metal efflux protein SilC  31.73 
 
 		 435 aa  44.3  0.004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.144513  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1111  Outer membrane efflux protein  23.45 
 
 		 492 aa  43.9  0.006  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.33067  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3956  outer membrane efflux protein  30.7 
 
 		 417 aa  43.9  0.006  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4596  heavy metal cation tricomponent efflux outer membrane porin  22.57 
 
 		 431 aa  43.9  0.007  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0688687  hitchhiker  0.005842 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0617  outer membrane efflux protein  23.98 
 
 		 438 aa  43.5  0.007  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1630  outer membrane efflux protein  24.44 
 
 		 483 aa  43.1  0.01  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.0405994 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>