217 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Smal_3956 on replicon NC_011071
Organism: Stenotrophomonas maltophilia R551-3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011071  Smal_3956  outer membrane efflux protein  100 
 
 		 417 aa  788    Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2803  outer membrane efflux protein  57.97 
 
 		 412 aa  339  4e-92  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.887689  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2284  outer membrane efflux protein  43.37 
 
 		 420 aa  221  1.9999999999999999e-56  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.185931  normal  1 
 
 
-
 
NC_007971  Rmet_6148  proton antiporter cation efflux protein NccC  39.18 
 
 		 448 aa  160  3e-38  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007972  Rmet_6208  outer membrane efflux protein  38.98 
 
 		 418 aa  145  1e-33  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0682247 
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5148  outer membrane efflux protein  44.05 
 
 		 435 aa  137  3.0000000000000003e-31  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5135  outer membrane efflux protein  35.84 
 
 		 435 aa  134  3e-30  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.0970024 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2294  outer membrane efflux protein  38.66 
 
 		 409 aa  122  9.999999999999999e-27  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2148  outer membrane efflux protein  36.1 
 
 		 400 aa  120  7e-26  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2577  outer membrane efflux protein  35.58 
 
 		 435 aa  107  3e-22  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.996623 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3970  Outer membrane efflux protein  30.58 
 
 		 426 aa  105  2e-21  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.214282  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0045  CzcC family cobalt/zinc/cadmium efflux transporter outer membrane protein  27.7 
 
 		 423 aa  97.4  4e-19  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000529043 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0059  outer membrane efflux protein  27.7 
 
 		 423 aa  97.4  4e-19  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.56854 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0062  outer membrane efflux protein  27.7 
 
 		 423 aa  97.4  4e-19  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000405972 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_31970  CzcC family cobalt/zinc/cadmium efflux transporter outer membrane protein  29.61 
 
 		 428 aa  97.4  4e-19  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2567  outer membrane efflux protein  30.11 
 
 		 433 aa  96.7  7e-19  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1175  outer membrane efflux protein  28.26 
 
 		 416 aa  94.4  3e-18  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2321  outer membrane efflux protein  31.09 
 
 		 428 aa  94  4e-18  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.760032  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2715  outer membrane protein precursor CzcC  30.38 
 
 		 428 aa  93.6  7e-18  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.727923  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3623  Outer membrane efflux protein  27.62 
 
 		 415 aa  93.6  7e-18  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0059  outer membrane efflux protein  28.76 
 
 		 394 aa  93.2  8e-18  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00860018 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4801  Outer membrane efflux protein  27.75 
 
 		 408 aa  91.7  2e-17  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00249818 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2447  outer membrane efflux protein  32.58 
 
 		 423 aa  89.4  1e-16  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2609  outer membrane efflux protein  32.49 
 
 		 425 aa  88.6  2e-16  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.153251  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2344  outer membrane efflux protein  30.39 
 
 		 423 aa  87  6e-16  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4596  heavy metal cation tricomponent efflux outer membrane porin  30.88 
 
 		 431 aa  85.9  0.000000000000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0688687  hitchhiker  0.005842 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1958  aconitate hydratase 1  30.46 
 
 		 422 aa  84.3  0.000000000000003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0713794  normal  0.321859 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2298  outer membrane efflux protein  28.76 
 
 		 423 aa  84.3  0.000000000000004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2142  outer membrane efflux protein  29.08 
 
 		 423 aa  84.3  0.000000000000004  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.143725 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3981  outer membrane efflux protein  29.32 
 
 		 423 aa  83.6  0.000000000000005  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.161912  normal  0.377505 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7266  putative outer membrane cobalt-zinc-cadmium resistance protein czcC precursor  27.6 
 
 		 424 aa  82.4  0.00000000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.217099  normal  0.831215 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1420  Outer membrane efflux protein  27.03 
 
 		 472 aa  82.8  0.00000000000001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2106  Outer membrane efflux protein  26.93 
 
 		 471 aa  82.8  0.00000000000001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.343125  n/a   
 
 
-
 
NC_007971  Rmet_5982  cation proton antiporter efflux protein CzcC  28.87 
 
 		 418 aa  82.4  0.00000000000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00000196082  normal  0.0745476 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0377  metal ion efflux outer membrane protein, putative  28.02 
 
 		 408 aa  81.3  0.00000000000003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3343  outer membrane efflux protein  30.92 
 
 		 423 aa  81.6  0.00000000000003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.141208 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3648  outer membrane efflux protein  31.34 
 
 		 424 aa  81.3  0.00000000000003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.856557 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3287  outer membrane efflux protein  29.43 
 
 		 464 aa  80.9  0.00000000000004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.7008 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1847  outer membrane efflux protein  26.37 
 
 		 451 aa  80.5  0.00000000000005  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.179966  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2553  outer membrane efflux protein  25.36 
 
 		 421 aa  80.5  0.00000000000005  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1764  outer membrane efflux protein  28.57 
 
 		 418 aa  80.1  0.00000000000006  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.715826  normal  0.306921 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2408  cobalt-zinc-cadmium resistance protein CzcC, putative  29.43 
 
 		 425 aa  80.1  0.00000000000007  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  decreased coverage  0.00195815  normal  1 
 
 
-
 
NC_007960  Nham_4530  outer membrane efflux protein  30.68 
 
 		 425 aa  79.3  0.0000000000001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1089  outer membrane efflux protein  30.63 
 
 		 444 aa  78.2  0.0000000000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2042  outer membrane efflux protein  28.69 
 
 		 417 aa  78.6  0.0000000000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.367282  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1455  Outer membrane efflux protein  30.51 
 
 		 423 aa  78.6  0.0000000000002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.170729  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0617  outer membrane efflux protein  28.16 
 
 		 438 aa  78.2  0.0000000000003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5400  outer membrane efflux protein  29.02 
 
 		 355 aa  78.2  0.0000000000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0772872  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2339  outer membrane efflux protein  30.45 
 
 		 437 aa  77  0.0000000000006  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.884796  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1044  HelC protein  26.35 
 
 		 416 aa  75.9  0.000000000001  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7183  putative outer membrane protein precursor CzcC  30.48 
 
 		 422 aa  75.9  0.000000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1714  outer membrane efflux protein  26.2 
 
 		 443 aa  75.9  0.000000000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.664423 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1848  outer membrane efflux protein  30.97 
 
 		 423 aa  75.5  0.000000000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1373  heavy metal resistance protein CzcC  33.1 
 
 		 443 aa  74.7  0.000000000003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2568  outer membrane efflux protein  28.88 
 
 		 438 aa  73.9  0.000000000005  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.316597 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1124  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT family  27.22 
 
 		 509 aa  73.9  0.000000000005  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.405736 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1329  cobalt-zinc-cadmium outer membrane resistance protein  29.81 
 
 		 425 aa  71.6  0.00000000003  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1215  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT family  26.28 
 
 		 509 aa  70.5  0.00000000005  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.156046  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0294  Outer membrane efflux protein  29.76 
 
 		 420 aa  69.7  0.00000000009  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.757224 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2899  RND efflux system outer membrane lipoprotein  28.7 
 
 		 504 aa  69.3  0.0000000001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2026  RND efflux system outer membrane lipoprotein NodT  27.01 
 
 		 519 aa  69.3  0.0000000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.192262 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0033  heavy metal resistance protein CzcC  29.1 
 
 		 443 aa  68.9  0.0000000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.299983  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2478  Outer membrane efflux protein  26.19 
 
 		 416 aa  67.8  0.0000000003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4686  outer membrane efflux protein  29.04 
 
 		 439 aa  67.8  0.0000000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.432562  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3677  outer membrane efflux protein  29.04 
 
 		 439 aa  67.8  0.0000000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.621392  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3371  outer membrane efflux protein  30.33 
 
 		 407 aa  67.4  0.0000000004  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.252246  normal  0.409086 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2504  outer membrane efflux protein  28.61 
 
 		 436 aa  67.4  0.0000000004  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.10477  normal  0.0160345 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3845  outer membrane efflux protein  28.77 
 
 		 437 aa  67  0.0000000005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0399  heavy metal resistance protein CzcC  29.1 
 
 		 461 aa  67  0.0000000006  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.132876  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1183  heavy metal resistance protein CzcC  29.1 
 
 		 461 aa  67  0.0000000006  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.84848  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0013  heavy metal resistance protein CzcC  29.1 
 
 		 461 aa  67  0.0000000006  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.238799  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1527  cobalt-zinc-cadmium resistance protein CzcC  29.1 
 
 		 452 aa  67  0.0000000006  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1442  cobalt-zinc-cadmium resistance efflux protein  29.1 
 
 		 461 aa  67  0.0000000006  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0705718  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1031  heavy metal resistance protein CzcC  29.1 
 
 		 443 aa  66.6  0.0000000007  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.147927  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2433  outer membrane efflux protein  27.57 
 
 		 440 aa  66.6  0.0000000007  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0117  RND efflux system, outer membrane lipoprotein CmeC  25.08 
 
 		 482 aa  65.5  0.000000002  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0705  RND heavy metal ion efflux pump, outer membrane protein  29.57 
 
 		 458 aa  65.5  0.000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.199067  normal  0.26582 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2373  HelC protein  25.26 
 
 		 414 aa  64.7  0.000000003  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0538  outer membrane efflux protein  25.97 
 
 		 432 aa  63.2  0.000000008  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.355565  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2276  outer membrane efflux protein  27.78 
 
 		 432 aa  62.8  0.00000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0693511 
 
 
-
 
NC_002950  PG0094  outer membrane efflux protein, putative  25.2 
 
 		 501 aa  62.4  0.00000001  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.0379352 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1294  putative outer membrane CHANEL lipoprotein  25.43 
 
 		 489 aa  62.8  0.00000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.567151  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0017  outer membrane efflux protein  27.07 
 
 		 473 aa  62.4  0.00000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1111  Outer membrane efflux protein  28.8 
 
 		 492 aa  62.8  0.00000001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.33067  n/a   
 
 
-
 
NC_010070  Bmul_6170  outer membrane efflux protein  28.49 
 
 		 435 aa  62.8  0.00000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.446847 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_31040  putative cation efflux system protein  29.33 
 
 		 415 aa  62.8  0.00000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000919684  unclonable  5.14474e-22 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0563  RND efflux system, outer membrane lipoprotein CmeC  23.78 
 
 		 482 aa  62  0.00000002  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.0291463  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3557  outer membrane efflux protein  30.55 
 
 		 442 aa  61.2  0.00000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4120  heavy metal cation tricomponent efflux outer membrane porin HmyC  28.24 
 
 		 460 aa  60.5  0.00000006  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0773  outer membrane efflux protein  20.45 
 
 		 387 aa  60.1  0.00000008  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00492916  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2023  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT  25.26 
 
 		 514 aa  58.9  0.0000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1854  putative outer membrane multidrug resistance lipoprotein  27.19 
 
 		 475 aa  58.9  0.0000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.100642 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3802  Outer membrane efflux protein  27.7 
 
 		 465 aa  58.2  0.0000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4765  outer membrane efflux protein  29.29 
 
 		 485 aa  58.5  0.0000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.55701 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1099  RND efflux system outer membrane lipoprotein  28.23 
 
 		 460 aa  58.9  0.0000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3455  outer membrane efflux protein  24.16 
 
 		 449 aa  58.5  0.0000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.414344  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2052  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT  25.62 
 
 		 499 aa  58.2  0.0000003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1939  outer membrane efflux protein  26.3 
 
 		 432 aa  57.4  0.0000004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3978  outer membrane efflux protein  29.38 
 
 		 446 aa  57.4  0.0000005  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RSp0491  cobalt-zinc-cadmium outer membrane resistance protein  28.75 
 
 		 441 aa  56.6  0.0000008  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>