60 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SYO3AOP1_0773 on replicon NC_010730
Organism: Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010730  SYO3AOP1_0773  outer membrane efflux protein  100 
 
 		 387 aa  770    Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00492916  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4120  heavy metal cation tricomponent efflux outer membrane porin HmyC  22.19 
 
 		 460 aa  84.7  0.000000000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3802  Outer membrane efflux protein  22.13 
 
 		 465 aa  85.1  0.000000000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2553  outer membrane efflux protein  23.18 
 
 		 421 aa  72  0.00000000002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1175  outer membrane efflux protein  17.65 
 
 		 416 aa  68.2  0.0000000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3623  Outer membrane efflux protein  18.67 
 
 		 415 aa  66.2  0.0000000009  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS00407  putative outer membrane cation efflux system protein  19.89 
 
 		 451 aa  66.2  0.000000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  decreased coverage  0.00236087  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1373  heavy metal resistance protein CzcC  20 
 
 		 443 aa  65.5  0.000000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2715  outer membrane protein precursor CzcC  20 
 
 		 428 aa  61.6  0.00000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.727923  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_31970  CzcC family cobalt/zinc/cadmium efflux transporter outer membrane protein  20.57 
 
 		 428 aa  60.1  0.00000006  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0294  Outer membrane efflux protein  20.28 
 
 		 420 aa  58.2  0.0000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.757224 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0538  outer membrane efflux protein  21.24 
 
 		 432 aa  57.8  0.0000003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.355565  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2042  outer membrane efflux protein  18.09 
 
 		 417 aa  55.5  0.000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.367282  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1939  outer membrane efflux protein  21.43 
 
 		 432 aa  55.1  0.000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2568  outer membrane efflux protein  18.14 
 
 		 438 aa  54.3  0.000003  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.316597 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2408  cobalt-zinc-cadmium resistance protein CzcC, putative  18.92 
 
 		 425 aa  53.9  0.000005  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  decreased coverage  0.00195815  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4801  Outer membrane efflux protein  20 
 
 		 408 aa  53.1  0.000009  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00249818 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3287  outer membrane efflux protein  18.92 
 
 		 464 aa  52.8  0.00001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.7008 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3362  outer membrane efflux protein  20.39 
 
 		 431 aa  52.4  0.00001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1847  outer membrane efflux protein  19.53 
 
 		 451 aa  52  0.00002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.179966  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0502  outer membrane efflux protein  18.44 
 
 		 433 aa  52  0.00002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2137  metal ion efflux outer membrane protein family protein, putative  20.74 
 
 		 437 aa  52  0.00002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4684  outer membrane efflux protein  19.12 
 
 		 448 aa  51.2  0.00003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.119437  normal  0.307779 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3607  outer membrane efflux protein  19.12 
 
 		 448 aa  51.2  0.00003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.864513 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0062  outer membrane efflux protein  18.27 
 
 		 423 aa  50.8  0.00004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000405972 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0059  outer membrane efflux protein  18.27 
 
 		 423 aa  50.8  0.00004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.56854 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0045  CzcC family cobalt/zinc/cadmium efflux transporter outer membrane protein  18.27 
 
 		 423 aa  50.8  0.00004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000529043 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0578  outer membrane efflux protein  24.21 
 
 		 416 aa  50.4  0.00005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.0382538 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0377  metal ion efflux outer membrane protein, putative  19.55 
 
 		 408 aa  50.4  0.00005  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0059  outer membrane efflux protein  18.77 
 
 		 394 aa  50.4  0.00006  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00860018 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1768  outer membrane heavy metal efflux protein, putative  23.46 
 
 		 434 aa  50.1  0.00006  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.481614  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3970  Outer membrane efflux protein  18.48 
 
 		 426 aa  49.7  0.00009  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.214282  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0399  heavy metal resistance protein CzcC  18.59 
 
 		 461 aa  48.9  0.0001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.132876  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7266  putative outer membrane cobalt-zinc-cadmium resistance protein czcC precursor  20.95 
 
 		 424 aa  49.7  0.0001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.217099  normal  0.831215 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1183  heavy metal resistance protein CzcC  18.59 
 
 		 461 aa  48.9  0.0001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.84848  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1442  cobalt-zinc-cadmium resistance efflux protein  18.59 
 
 		 461 aa  48.9  0.0001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0705718  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0013  heavy metal resistance protein CzcC  18.59 
 
 		 461 aa  48.9  0.0001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.238799  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1031  heavy metal resistance protein CzcC  18.59 
 
 		 443 aa  48.9  0.0001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.147927  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1527  cobalt-zinc-cadmium resistance protein CzcC  18.59 
 
 		 452 aa  48.9  0.0002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3677  outer membrane efflux protein  18.37 
 
 		 439 aa  48.9  0.0002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.621392  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4686  outer membrane efflux protein  18.37 
 
 		 439 aa  48.9  0.0002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.432562  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0705  RND heavy metal ion efflux pump, outer membrane protein  20.21 
 
 		 458 aa  48.9  0.0002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.199067  normal  0.26582 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0033  heavy metal resistance protein CzcC  18.32 
 
 		 443 aa  48.5  0.0002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.299983  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1614  outer membrane efflux protein  23.01 
 
 		 409 aa  48.5  0.0002  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010070  Bmul_6170  outer membrane efflux protein  18.07 
 
 		 435 aa  48.1  0.0003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.446847 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1582  outer membrane efflux protein  21.39 
 
 		 523 aa  47.8  0.0003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2106  Outer membrane efflux protein  18.55 
 
 		 471 aa  48.1  0.0003  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.343125  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3845  outer membrane efflux protein  18.78 
 
 		 437 aa  47.8  0.0004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0150  Outer membrane efflux protein  19.61 
 
 		 415 aa  47.4  0.0005  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.921658  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2733  outer membrane efflux protein  24.74 
 
 		 415 aa  47  0.0006  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0378376  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2276  outer membrane efflux protein  20.05 
 
 		 432 aa  45.1  0.002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0693511 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2433  outer membrane efflux protein  16.58 
 
 		 440 aa  44.7  0.003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1617  Outer membrane protein-like protein  24.21 
 
 		 378 aa  44.3  0.004  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2745  outer membrane efflux protein  23.2 
 
 		 415 aa  44.3  0.004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.545193 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1111  Outer membrane efflux protein  19.16 
 
 		 492 aa  43.9  0.005  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.33067  n/a   
 
 
-
 
NC_007971  Rmet_5982  cation proton antiporter efflux protein CzcC  19.13 
 
 		 418 aa  43.9  0.005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00000196082  normal  0.0745476 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1764  outer membrane efflux protein  19.46 
 
 		 418 aa  43.1  0.008  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.715826  normal  0.306921 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2191  outer membrane efflux protein  26.32 
 
 		 492 aa  43.1  0.008  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1044  HelC protein  19.13 
 
 		 416 aa  43.1  0.009  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1343  outer membrane efflux protein  20.95 
 
 		 429 aa  43.1  0.009  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>