174 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MCA1768 on replicon NC_002977
Organism: Methylococcus capsulatus str. Bath



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002977  MCA1768  outer membrane heavy metal efflux protein, putative  100 
 
 		 434 aa  863    Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.481614  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0017  outer membrane efflux protein  31.02 
 
 		 473 aa  154  4e-36  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7266  putative outer membrane cobalt-zinc-cadmium resistance protein czcC precursor  28.33 
 
 		 424 aa  92.8  9e-18  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.217099  normal  0.831215 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7183  putative outer membrane protein precursor CzcC  28.98 
 
 		 422 aa  92  2e-17  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2344  outer membrane efflux protein  27.39 
 
 		 423 aa  89.7  8e-17  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3648  outer membrane efflux protein  26.86 
 
 		 424 aa  87  6e-16  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.856557 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1420  Outer membrane efflux protein  25.9 
 
 		 472 aa  86.3  9e-16  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2142  outer membrane efflux protein  25.78 
 
 		 423 aa  85.9  0.000000000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.143725 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3343  outer membrane efflux protein  27.23 
 
 		 423 aa  85.5  0.000000000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.141208 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2298  outer membrane efflux protein  26.38 
 
 		 423 aa  84.7  0.000000000000003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3981  outer membrane efflux protein  28.53 
 
 		 423 aa  84.7  0.000000000000003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.161912  normal  0.377505 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3362  outer membrane efflux protein  27.19 
 
 		 431 aa  84.7  0.000000000000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4686  outer membrane efflux protein  25.59 
 
 		 439 aa  83.2  0.000000000000008  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.432562  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3677  outer membrane efflux protein  25.59 
 
 		 439 aa  83.2  0.000000000000008  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.621392  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3970  Outer membrane efflux protein  25.13 
 
 		 426 aa  83.2  0.000000000000009  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.214282  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3845  outer membrane efflux protein  25.59 
 
 		 437 aa  81.6  0.00000000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0294  Outer membrane efflux protein  28.93 
 
 		 420 aa  80.9  0.00000000000004  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.757224 
 
 
-
 
NC_003296  RS00407  putative outer membrane cation efflux system protein  28.8 
 
 		 451 aa  79.7  0.0000000000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  decreased coverage  0.00236087  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7201  outer membrane efflux protein  22.39 
 
 		 418 aa  79  0.0000000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010070  Bmul_6170  outer membrane efflux protein  27.32 
 
 		 435 aa  78.6  0.0000000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.446847 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0617  outer membrane efflux protein  27.59 
 
 		 438 aa  78.2  0.0000000000003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1175  outer membrane efflux protein  24.37 
 
 		 416 aa  77  0.0000000000005  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2433  outer membrane efflux protein  26.19 
 
 		 440 aa  77  0.0000000000006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2843  outer membrane efflux protein  25.79 
 
 		 489 aa  77  0.0000000000006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4765  outer membrane efflux protein  28.54 
 
 		 485 aa  76.6  0.0000000000008  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.55701 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3557  outer membrane efflux protein  25.79 
 
 		 442 aa  76.6  0.0000000000009  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1641  Outer membrane efflux protein  25.59 
 
 		 479 aa  76.3  0.000000000001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1848  outer membrane efflux protein  26.63 
 
 		 423 aa  76.3  0.000000000001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3623  Outer membrane efflux protein  22.64 
 
 		 415 aa  75.5  0.000000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007960  Nham_4530  outer membrane efflux protein  25.81 
 
 		 425 aa  74.3  0.000000000004  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4096  outer membrane efflux protein  28.46 
 
 		 414 aa  74.3  0.000000000004  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.592471  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1455  Outer membrane efflux protein  26.53 
 
 		 423 aa  71.6  0.00000000003  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.170729  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0045  CzcC family cobalt/zinc/cadmium efflux transporter outer membrane protein  23.04 
 
 		 423 aa  70.1  0.00000000007  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000529043 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0059  outer membrane efflux protein  23.04 
 
 		 423 aa  70.1  0.00000000007  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.56854 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0062  outer membrane efflux protein  23.04 
 
 		 423 aa  70.1  0.00000000007  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000405972 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2715  outer membrane protein precursor CzcC  26.55 
 
 		 428 aa  70.1  0.00000000007  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.727923  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2568  outer membrane efflux protein  24.88 
 
 		 438 aa  70.1  0.00000000008  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.316597 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0538  outer membrane efflux protein  22.74 
 
 		 432 aa  68.9  0.0000000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.355565  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2042  outer membrane efflux protein  24.47 
 
 		 417 aa  67.8  0.0000000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.367282  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0059  outer membrane efflux protein  22.52 
 
 		 394 aa  68.2  0.0000000003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00860018 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_31970  CzcC family cobalt/zinc/cadmium efflux transporter outer membrane protein  25.85 
 
 		 428 aa  67  0.0000000006  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1582  outer membrane efflux protein  28.11 
 
 		 418 aa  66.2  0.000000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0904474  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0292  Outer membrane efflux protein  26.41 
 
 		 432 aa  65.9  0.000000001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.765252  n/a   
 
 
-
 
NC_007971  Rmet_5982  cation proton antiporter efflux protein CzcC  22.4 
 
 		 418 aa  65.9  0.000000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00000196082  normal  0.0745476 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2110  outer membrane efflux protein  24.16 
 
 		 437 aa  65.5  0.000000002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.313002  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2577  outer membrane efflux protein  26.73 
 
 		 435 aa  65.5  0.000000002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.996623 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1764  outer membrane efflux protein  22.4 
 
 		 418 aa  65.1  0.000000003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.715826  normal  0.306921 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3501  Outer membrane efflux protein  26.96 
 
 		 489 aa  64.7  0.000000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2106  Outer membrane efflux protein  24.94 
 
 		 471 aa  64.3  0.000000004  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.343125  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2209  outer membrane efflux protein  28.32 
 
 		 433 aa  64.3  0.000000004  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.798472  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0150  Outer membrane efflux protein  26.6 
 
 		 415 aa  63.9  0.000000005  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.921658  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1582  outer membrane efflux protein  22.28 
 
 		 523 aa  63.9  0.000000005  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2408  cobalt-zinc-cadmium resistance protein CzcC, putative  23.1 
 
 		 425 aa  63.9  0.000000006  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  decreased coverage  0.00195815  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3287  outer membrane efflux protein  23.1 
 
 		 464 aa  63.9  0.000000006  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.7008 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2628  Outer membrane efflux protein  24.93 
 
 		 432 aa  62.8  0.00000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.753633 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1329  cobalt-zinc-cadmium outer membrane resistance protein  25 
 
 		 425 aa  62  0.00000002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1111  Outer membrane efflux protein  26.08 
 
 		 492 aa  62  0.00000002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.33067  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1714  outer membrane efflux protein  24.21 
 
 		 443 aa  61.6  0.00000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.664423 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1847  outer membrane efflux protein  22.74 
 
 		 451 aa  62  0.00000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.179966  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3447  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT family  24.93 
 
 		 477 aa  62.4  0.00000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.689762 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0502  outer membrane efflux protein  23.67 
 
 		 433 aa  61.2  0.00000003  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2553  outer membrane efflux protein  22.46 
 
 		 421 aa  60.8  0.00000004  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1293  outer membrane efflux protein  25.63 
 
 		 442 aa  60.8  0.00000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.803504 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1614  outer membrane efflux protein  20.45 
 
 		 409 aa  60.8  0.00000005  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0516  outer membrane efflux protein  24.56 
 
 		 413 aa  60.5  0.00000006  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1089  outer membrane efflux protein  25.74 
 
 		 444 aa  59.3  0.0000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0705  RND heavy metal ion efflux pump, outer membrane protein  25.14 
 
 		 458 aa  59.3  0.0000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.199067  normal  0.26582 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2284  outer membrane efflux protein  24.87 
 
 		 420 aa  59.7  0.0000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.185931  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1077  outer membrane efflux protein  28.38 
 
 		 407 aa  58.9  0.0000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.610352  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0773  outer membrane efflux protein  22.88 
 
 		 387 aa  58.5  0.0000002  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00492916  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4485  outer membrane efflux protein  19.6 
 
 		 417 aa  58.5  0.0000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3371  outer membrane efflux protein  27.55 
 
 		 407 aa  57.8  0.0000003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.252246  normal  0.409086 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3157  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT family  24.22 
 
 		 480 aa  57.8  0.0000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6027  nodulation protein T precursor  26.33 
 
 		 483 aa  57.8  0.0000004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3802  Outer membrane efflux protein  23.28 
 
 		 465 aa  57.4  0.0000005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2435  outer membrane efflux protein  23.13 
 
 		 438 aa  57.4  0.0000005  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4801  Outer membrane efflux protein  22.74 
 
 		 408 aa  56.6  0.0000009  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00249818 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6200  multidrug efflux system outer membrane subunit  24.58 
 
 		 504 aa  56.6  0.0000009  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.584656  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2225  outer membrane efflux protein  25.4 
 
 		 547 aa  55.5  0.000002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.17933 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0013  heavy metal resistance protein CzcC  24.44 
 
 		 461 aa  55.1  0.000002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.238799  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0399  heavy metal resistance protein CzcC  24.44 
 
 		 461 aa  55.1  0.000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.132876  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1442  cobalt-zinc-cadmium resistance efflux protein  24.44 
 
 		 461 aa  55.1  0.000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0705718  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1183  heavy metal resistance protein CzcC  24.44 
 
 		 461 aa  55.1  0.000002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.84848  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1031  heavy metal resistance protein CzcC  24.44 
 
 		 443 aa  55.1  0.000003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.147927  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1373  heavy metal resistance protein CzcC  25.99 
 
 		 443 aa  54.7  0.000003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4120  heavy metal cation tricomponent efflux outer membrane porin HmyC  22.6 
 
 		 460 aa  54.7  0.000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1527  cobalt-zinc-cadmium resistance protein CzcC  24.44 
 
 		 452 aa  54.7  0.000003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0828  metal ion efflux outer membrane protein family protein, putative  22.87 
 
 		 428 aa  54.3  0.000004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.885444  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1155  hypothetical protein  25.06 
 
 		 418 aa  54.3  0.000004  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0033  heavy metal resistance protein CzcC  24.44 
 
 		 443 aa  53.9  0.000005  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.299983  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1941  RND efflux system outer membrane lipoprotein  21.77 
 
 		 497 aa  54.3  0.000005  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.211357  normal  0.0401761 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0276  outer membrane efflux protein  23.54 
 
 		 449 aa  53.5  0.000006  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0967709  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2254  Outer membrane efflux protein  27.56 
 
 		 436 aa  53.9  0.000006  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1549  Outer membrane efflux protein  21.97 
 
 		 426 aa  53.9  0.000006  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.069846  normal  0.874867 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4596  heavy metal cation tricomponent efflux outer membrane porin  21.94 
 
 		 431 aa  53.9  0.000006  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0688687  hitchhiker  0.005842 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2035  RND efflux system outer membrane lipoprotein  21.77 
 
 		 486 aa  53.5  0.000008  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.152355  normal  0.152355 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4389  outer membrane efflux protein  27.32 
 
 		 439 aa  53.5  0.000008  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2056  outer membrane efflux protein  20.86 
 
 		 423 aa  53.1  0.000008  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000000544389 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1217  outer membrane efflux protein  23.45 
 
 		 438 aa  52.8  0.00001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.87899  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1267  RND efflux system outer membrane lipoprotein NodT  27.57 
 
 		 512 aa  52.4  0.00002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0522165  normal  0.0121166 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>