248 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mfla_0502 on replicon NC_007947
Organism: Methylobacillus flagellatus KT



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007947  Mfla_0502  outer membrane efflux protein  100 
 
 
433 aa  869    Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0150  Outer membrane efflux protein  43.07 
 
 
415 aa  304  3.0000000000000004e-81  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.921658  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0294  Outer membrane efflux protein  42.36 
 
 
420 aa  294  2e-78  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.757224 
 
 
-
 
NC_003296  RS00407  putative outer membrane cation efflux system protein  43.75 
 
 
451 aa  284  2.0000000000000002e-75  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  decreased coverage  0.00236087  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4120  heavy metal cation tricomponent efflux outer membrane porin HmyC  38.9 
 
 
460 aa  267  2.9999999999999995e-70  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3802  Outer membrane efflux protein  38.86 
 
 
465 aa  264  2e-69  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3607  outer membrane efflux protein  43.98 
 
 
448 aa  254  2.0000000000000002e-66  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.864513 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4684  outer membrane efflux protein  43.98 
 
 
448 aa  254  2.0000000000000002e-66  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.119437  normal  0.307779 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1111  Outer membrane efflux protein  36.32 
 
 
492 aa  202  9.999999999999999e-51  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.33067  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4765  outer membrane efflux protein  34.81 
 
 
485 aa  198  1.0000000000000001e-49  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.55701 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1175  outer membrane efflux protein  30.38 
 
 
416 aa  135  9.999999999999999e-31  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2553  outer membrane efflux protein  25.97 
 
 
421 aa  134  3e-30  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2715  outer membrane protein precursor CzcC  30.03 
 
 
428 aa  124  3e-27  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.727923  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1329  cobalt-zinc-cadmium outer membrane resistance protein  29.67 
 
 
425 aa  121  1.9999999999999998e-26  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2106  Outer membrane efflux protein  28.1 
 
 
471 aa  121  3e-26  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.343125  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2568  outer membrane efflux protein  27.34 
 
 
438 aa  119  9e-26  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.316597 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_31970  CzcC family cobalt/zinc/cadmium efflux transporter outer membrane protein  28.47 
 
 
428 aa  118  1.9999999999999998e-25  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2433  outer membrane efflux protein  27.23 
 
 
440 aa  108  1e-22  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0045  CzcC family cobalt/zinc/cadmium efflux transporter outer membrane protein  26.89 
 
 
423 aa  107  6e-22  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000529043 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0059  outer membrane efflux protein  26.89 
 
 
423 aa  107  6e-22  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.56854 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0062  outer membrane efflux protein  26.89 
 
 
423 aa  107  6e-22  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000405972 
 
 
-
 
NC_007971  Rmet_5982  cation proton antiporter efflux protein CzcC  25.13 
 
 
418 aa  106  9e-22  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00000196082  normal  0.0745476 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1764  outer membrane efflux protein  25.13 
 
 
418 aa  105  2e-21  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.715826  normal  0.306921 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1420  Outer membrane efflux protein  27.27 
 
 
472 aa  103  6e-21  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4801  Outer membrane efflux protein  30.19 
 
 
408 aa  103  9e-21  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00249818 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2137  metal ion efflux outer membrane protein family protein, putative  26.78 
 
 
437 aa  100  4e-20  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0059  outer membrane efflux protein  26.55 
 
 
394 aa  100  5e-20  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00860018 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3845  outer membrane efflux protein  26.58 
 
 
437 aa  99.8  8e-20  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010070  Bmul_6170  outer membrane efflux protein  26.85 
 
 
435 aa  99  2e-19  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.446847 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1847  outer membrane efflux protein  25.13 
 
 
451 aa  97.8  3e-19  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.179966  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4686  outer membrane efflux protein  26.4 
 
 
439 aa  97.1  5e-19  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.432562  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3677  outer membrane efflux protein  26.4 
 
 
439 aa  97.1  5e-19  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.621392  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0377  metal ion efflux outer membrane protein, putative  27.64 
 
 
408 aa  97.1  6e-19  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3970  Outer membrane efflux protein  25.38 
 
 
426 aa  96.3  1e-18  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.214282  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0705  RND heavy metal ion efflux pump, outer membrane protein  27.03 
 
 
458 aa  96.3  1e-18  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.199067  normal  0.26582 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2042  outer membrane efflux protein  27.3 
 
 
417 aa  95.1  2e-18  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.367282  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3623  Outer membrane efflux protein  25.12 
 
 
415 aa  94.7  3e-18  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4596  heavy metal cation tricomponent efflux outer membrane porin  25 
 
 
431 aa  94.7  3e-18  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0688687  hitchhiker  0.005842 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0538  outer membrane efflux protein  25.7 
 
 
432 aa  94.4  4e-18  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.355565  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0828  metal ion efflux outer membrane protein family protein, putative  27.75 
 
 
428 aa  92.8  1e-17  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.885444  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2408  cobalt-zinc-cadmium resistance protein CzcC, putative  27.08 
 
 
425 aa  92.4  1e-17  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  decreased coverage  0.00195815  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3287  outer membrane efflux protein  27.08 
 
 
464 aa  92.8  1e-17  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.7008 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1714  outer membrane efflux protein  24.03 
 
 
443 aa  91.7  2e-17  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.664423 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3362  outer membrane efflux protein  26.62 
 
 
431 aa  90.5  5e-17  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0013  heavy metal resistance protein CzcC  26.98 
 
 
461 aa  89.4  1e-16  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.238799  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1031  heavy metal resistance protein CzcC  26.98 
 
 
443 aa  89.4  1e-16  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.147927  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1183  heavy metal resistance protein CzcC  26.98 
 
 
461 aa  89.4  1e-16  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.84848  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1527  cobalt-zinc-cadmium resistance protein CzcC  26.74 
 
 
452 aa  89.7  1e-16  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0033  heavy metal resistance protein CzcC  27.52 
 
 
443 aa  89.4  1e-16  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.299983  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1442  cobalt-zinc-cadmium resistance efflux protein  26.98 
 
 
461 aa  89.4  1e-16  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0705718  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0399  heavy metal resistance protein CzcC  26.98 
 
 
461 aa  89.4  1e-16  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.132876  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1939  outer membrane efflux protein  27.71 
 
 
432 aa  87  5e-16  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1641  Outer membrane efflux protein  23.5 
 
 
479 aa  87.4  5e-16  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1373  heavy metal resistance protein CzcC  27.11 
 
 
443 aa  87.4  5e-16  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3557  outer membrane efflux protein  26.08 
 
 
442 aa  84.3  0.000000000000004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2276  outer membrane efflux protein  27.15 
 
 
432 aa  81.3  0.00000000000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0693511 
 
 
-
 
NC_003296  RSp0491  cobalt-zinc-cadmium outer membrane resistance protein  25.9 
 
 
441 aa  80.9  0.00000000000005  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2628  Outer membrane efflux protein  26.62 
 
 
432 aa  79.7  0.0000000000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.753633 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2209  outer membrane efflux protein  23.06 
 
 
433 aa  78.6  0.0000000000002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.798472  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2504  outer membrane efflux protein  26.67 
 
 
436 aa  78.2  0.0000000000003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.10477  normal  0.0160345 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2254  Outer membrane efflux protein  23.97 
 
 
436 aa  78.2  0.0000000000003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2298  outer membrane efflux protein  24.09 
 
 
423 aa  78.2  0.0000000000003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0516  outer membrane efflux protein  24.06 
 
 
413 aa  76.6  0.0000000000008  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2142  outer membrane efflux protein  24.58 
 
 
423 aa  76.6  0.0000000000008  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.143725 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7201  outer membrane efflux protein  23.17 
 
 
418 aa  75.9  0.000000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0447  outer membrane efflux protein  22.03 
 
 
438 aa  74.3  0.000000000004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.109934 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2551  outer membrane efflux protein  24.29 
 
 
422 aa  73.6  0.000000000007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.000963739  normal  0.205494 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2843  outer membrane efflux protein  25.97 
 
 
489 aa  73.2  0.000000000008  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0665  outer membrane efflux protein  23.62 
 
 
453 aa  72  0.00000000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000306808  hitchhiker  0.00231848 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3465  Outer membrane efflux protein  26.11 
 
 
441 aa  72  0.00000000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3343  outer membrane efflux protein  24.76 
 
 
423 aa  70.5  0.00000000005  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.141208 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2110  outer membrane efflux protein  21.77 
 
 
437 aa  69.7  0.00000000009  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.313002  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1089  outer membrane efflux protein  25.07 
 
 
444 aa  69.7  0.00000000009  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0162  outer membrane efflux protein  26.67 
 
 
433 aa  69.3  0.0000000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2148  outer membrane efflux protein  35.66 
 
 
400 aa  69.3  0.0000000001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2733  outer membrane efflux protein  21.69 
 
 
415 aa  69.7  0.0000000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0378376  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3398  metal ion efflux outer membrane protein family protein, putative  26.15 
 
 
434 aa  67.8  0.0000000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3870  Co/Zn/Cd efflux system component  21.56 
 
 
448 aa  68.2  0.0000000003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2344  outer membrane efflux protein  23.82 
 
 
423 aa  67.8  0.0000000004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3507  Outer membrane efflux protein  31.97 
 
 
435 aa  67.4  0.0000000005  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1551  outer membrane efflux protein  24.17 
 
 
443 aa  67  0.0000000006  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1293  outer membrane efflux protein  23.66 
 
 
442 aa  67  0.0000000006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.803504 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0802  TolC family type I secretion outer membrane protein  25.07 
 
 
453 aa  67  0.0000000007  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7183  putative outer membrane protein precursor CzcC  23.61 
 
 
422 aa  65.9  0.000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1582  outer membrane efflux protein  25.86 
 
 
523 aa  65.9  0.000000002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1537  Outer membrane efflux protein  23.13 
 
 
445 aa  65.1  0.000000002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1614  outer membrane efflux protein  21.02 
 
 
409 aa  64.7  0.000000003  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2284  outer membrane efflux protein  27.4 
 
 
420 aa  65.1  0.000000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.185931  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2689  heavy metal efflux pump, CzcA family  23.31 
 
 
1459 aa  63.9  0.000000005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.812811  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3077  outer membrane efflux protein  22.74 
 
 
426 aa  63.9  0.000000005  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.767775  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0017  outer membrane efflux protein  24.08 
 
 
473 aa  63.9  0.000000005  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2675  outer membrane channel protein  23.04 
 
 
441 aa  63.9  0.000000005  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013731  Slin_6757  heavy metal efflux pump, CzcA family  26.3 
 
 
1480 aa  63.9  0.000000006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.603059  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3648  outer membrane efflux protein  24.76 
 
 
424 aa  63.5  0.000000007  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.856557 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03690  outer membrane channel precursor protein  20.93 
 
 
462 aa  62.8  0.00000001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  unclonable  0.0000344286  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1549  Outer membrane efflux protein  22.3 
 
 
426 aa  62.4  0.00000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.069846  normal  0.874867 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2534  Type I secretion outer membrane protein, TolC  23.92 
 
 
468 aa  62.4  0.00000002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0814  outer membrane efflux protein  24.48 
 
 
460 aa  61.6  0.00000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1716  outer membrane protein  22.79 
 
 
440 aa  61.2  0.00000003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000584875  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0829  outer membrane protein; cation efflux protein  20.84 
 
 
428 aa  60.8  0.00000004  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>