More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcenmc03_3845 on replicon NC_010515
Organism: Burkholderia cenocepacia MC0-3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008543  Bcen2424_3677  outer membrane efflux protein  98.39 
 
 		 439 aa  832    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.621392  normal  1 
 
 
-
 
NC_010070  Bmul_6170  outer membrane efflux protein  92.91 
 
 		 435 aa  745    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.446847 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2433  outer membrane efflux protein  91.22 
 
 		 440 aa  751    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3845  outer membrane efflux protein  100 
 
 		 437 aa  849    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4686  outer membrane efflux protein  98.39 
 
 		 439 aa  832    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.432562  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0705  RND heavy metal ion efflux pump, outer membrane protein  66.44 
 
 		 458 aa  522  1e-147  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.199067  normal  0.26582 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1373  heavy metal resistance protein CzcC  67.66 
 
 		 443 aa  486  1e-136  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1031  heavy metal resistance protein CzcC  66.39 
 
 		 443 aa  468  1.0000000000000001e-131  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.147927  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0033  heavy metal resistance protein CzcC  66.67 
 
 		 443 aa  469  1.0000000000000001e-131  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.299983  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1527  cobalt-zinc-cadmium resistance protein CzcC  65.85 
 
 		 452 aa  469  1.0000000000000001e-131  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0013  heavy metal resistance protein CzcC  66.39 
 
 		 461 aa  468  9.999999999999999e-131  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.238799  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0399  heavy metal resistance protein CzcC  66.39 
 
 		 461 aa  468  9.999999999999999e-131  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.132876  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1442  cobalt-zinc-cadmium resistance efflux protein  66.39 
 
 		 461 aa  468  9.999999999999999e-131  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0705718  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1183  heavy metal resistance protein CzcC  66.39 
 
 		 461 aa  468  9.999999999999999e-131  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.84848  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1714  outer membrane efflux protein  40.99 
 
 		 443 aa  274  3e-72  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.664423 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1329  cobalt-zinc-cadmium outer membrane resistance protein  46.34 
 
 		 425 aa  272  1e-71  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2553  outer membrane efflux protein  40.31 
 
 		 421 aa  271  2e-71  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1089  outer membrane efflux protein  43.58 
 
 		 444 aa  264  2e-69  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1847  outer membrane efflux protein  40.69 
 
 		 451 aa  255  1.0000000000000001e-66  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.179966  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2568  outer membrane efflux protein  42.22 
 
 		 438 aa  254  2.0000000000000002e-66  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.316597 
 
 
-
 
NC_007971  Rmet_5982  cation proton antiporter efflux protein CzcC  40.94 
 
 		 418 aa  253  6e-66  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00000196082  normal  0.0745476 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1764  outer membrane efflux protein  40.94 
 
 		 418 aa  253  6e-66  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.715826  normal  0.306921 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3623  Outer membrane efflux protein  41.21 
 
 		 415 aa  252  7e-66  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3970  Outer membrane efflux protein  40.53 
 
 		 426 aa  252  1e-65  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.214282  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2209  outer membrane efflux protein  41.13 
 
 		 433 aa  244  3e-63  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.798472  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2715  outer membrane protein precursor CzcC  38.73 
 
 		 428 aa  239  9e-62  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.727923  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3557  outer membrane efflux protein  39.54 
 
 		 442 aa  236  5.0000000000000005e-61  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_31970  CzcC family cobalt/zinc/cadmium efflux transporter outer membrane protein  38.73 
 
 		 428 aa  236  7e-61  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2106  Outer membrane efflux protein  38.43 
 
 		 471 aa  234  2.0000000000000002e-60  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.343125  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0045  CzcC family cobalt/zinc/cadmium efflux transporter outer membrane protein  38.14 
 
 		 423 aa  227  2e-58  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000529043 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0059  outer membrane efflux protein  38.14 
 
 		 423 aa  227  2e-58  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.56854 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0062  outer membrane efflux protein  38.14 
 
 		 423 aa  227  2e-58  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000405972 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0059  outer membrane efflux protein  38.14 
 
 		 394 aa  227  3e-58  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00860018 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4596  heavy metal cation tricomponent efflux outer membrane porin  40.19 
 
 		 431 aa  226  6e-58  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0688687  hitchhiker  0.005842 
 
 
-
 
NC_003296  RSp0491  cobalt-zinc-cadmium outer membrane resistance protein  44.1 
 
 		 441 aa  224  3e-57  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2504  outer membrane efflux protein  40.44 
 
 		 436 aa  217  4e-55  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.10477  normal  0.0160345 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1420  Outer membrane efflux protein  35.98 
 
 		 472 aa  216  5.9999999999999996e-55  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1175  outer membrane efflux protein  36.13 
 
 		 416 aa  215  9.999999999999999e-55  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4801  Outer membrane efflux protein  37.98 
 
 		 408 aa  202  7e-51  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00249818 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0377  metal ion efflux outer membrane protein, putative  38.3 
 
 		 408 aa  195  1e-48  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3287  outer membrane efflux protein  39.95 
 
 		 464 aa  194  3e-48  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.7008 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2408  cobalt-zinc-cadmium resistance protein CzcC, putative  39.39 
 
 		 425 aa  193  6e-48  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  decreased coverage  0.00195815  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2042  outer membrane efflux protein  39.84 
 
 		 417 aa  192  7e-48  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.367282  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2344  outer membrane efflux protein  34.24 
 
 		 423 aa  167  2e-40  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1848  outer membrane efflux protein  34 
 
 		 423 aa  167  2.9999999999999998e-40  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007960  Nham_4530  outer membrane efflux protein  34.79 
 
 		 425 aa  161  2e-38  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3648  outer membrane efflux protein  32.69 
 
 		 424 aa  159  9e-38  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.856557 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7183  putative outer membrane protein precursor CzcC  33.25 
 
 		 422 aa  158  2e-37  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0617  outer membrane efflux protein  33.01 
 
 		 438 aa  153  5.9999999999999996e-36  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3981  outer membrane efflux protein  34.76 
 
 		 423 aa  151  2e-35  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.161912  normal  0.377505 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1455  Outer membrane efflux protein  32.63 
 
 		 423 aa  150  3e-35  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.170729  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2142  outer membrane efflux protein  31.76 
 
 		 423 aa  148  2.0000000000000003e-34  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.143725 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2298  outer membrane efflux protein  32.66 
 
 		 423 aa  147  5e-34  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7266  putative outer membrane cobalt-zinc-cadmium resistance protein czcC precursor  30.98 
 
 		 424 aa  144  3e-33  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.217099  normal  0.831215 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3343  outer membrane efflux protein  30.75 
 
 		 423 aa  143  6e-33  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.141208 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3802  Outer membrane efflux protein  30.32 
 
 		 465 aa  135  9.999999999999999e-31  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2567  outer membrane efflux protein  33.89 
 
 		 433 aa  126  9e-28  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4120  heavy metal cation tricomponent efflux outer membrane porin HmyC  28.86 
 
 		 460 aa  122  9.999999999999999e-27  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3371  outer membrane efflux protein  31.25 
 
 		 407 aa  117  5e-25  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.252246  normal  0.409086 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1582  outer membrane efflux protein  26.86 
 
 		 523 aa  114  2.0000000000000002e-24  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008573  Shewana3_4156  outer membrane efflux protein  28.08 
 
 		 446 aa  112  1.0000000000000001e-23  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.283296 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2110  outer membrane efflux protein  25.38 
 
 		 437 aa  109  9.000000000000001e-23  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.313002  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0538  outer membrane efflux protein  28.17 
 
 		 432 aa  108  1e-22  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.355565  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0516  outer membrane efflux protein  27.14 
 
 		 413 aa  108  2e-22  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3362  outer membrane efflux protein  27.11 
 
 		 431 aa  108  2e-22  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2373  HelC protein  27.02 
 
 		 414 aa  106  6e-22  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1641  Outer membrane efflux protein  27.61 
 
 		 479 aa  107  6e-22  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3398  metal ion efflux outer membrane protein family protein, putative  29.93 
 
 		 434 aa  106  8e-22  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0150  Outer membrane efflux protein  29.37 
 
 		 415 aa  104  3e-21  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.921658  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2339  outer membrane efflux protein  31.7 
 
 		 437 aa  104  3e-21  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.884796  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2843  outer membrane efflux protein  29.49 
 
 		 489 aa  103  5e-21  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1176  Outer membrane efflux protein  30.56 
 
 		 429 aa  103  7e-21  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1939  outer membrane efflux protein  27.59 
 
 		 432 aa  102  1e-20  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2065  chemiosmotic efflux system protein C-like protein  28.02 
 
 		 441 aa  102  2e-20  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1957  putative RND efflux system protein  25.77 
 
 		 444 aa  100  4e-20  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0294  Outer membrane efflux protein  28.22 
 
 		 420 aa  100  4e-20  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.757224 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2137  metal ion efflux outer membrane protein family protein, putative  26.89 
 
 		 437 aa  100  5e-20  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2075  chemiosmotic efflux system protein C-like protein  26.97 
 
 		 437 aa  99.4  1e-19  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2609  outer membrane efflux protein  34.23 
 
 		 425 aa  98.2  3e-19  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.153251  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0665  outer membrane efflux protein  25.68 
 
 		 453 aa  97.1  5e-19  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000306808  hitchhiker  0.00231848 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1044  HelC protein  24.81 
 
 		 416 aa  96.3  1e-18  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1549  Outer membrane efflux protein  24.64 
 
 		 426 aa  95.9  1e-18  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.069846  normal  0.874867 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2353  chemiosmotic efflux system C protein C  27.65 
 
 		 437 aa  95.5  2e-18  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3507  Outer membrane efflux protein  27.27 
 
 		 435 aa  95.5  2e-18  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2321  outer membrane efflux protein  30.79 
 
 		 428 aa  94  5e-18  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.760032  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0828  metal ion efflux outer membrane protein family protein, putative  28.37 
 
 		 428 aa  93.6  7e-18  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.885444  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2097  Outer membrane efflux protein  24.03 
 
 		 435 aa  93.2  8e-18  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.771655  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0502  outer membrane efflux protein  26.79 
 
 		 433 aa  92.8  1e-17  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_31040  putative cation efflux system protein  29.88 
 
 		 415 aa  92.8  1e-17  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000919684  unclonable  5.14474e-22 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2284  outer membrane efflux protein  29.1 
 
 		 420 aa  92  2e-17  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.185931  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1877  Outer membrane efflux protein  27.85 
 
 		 413 aa  90.5  5e-17  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2276  outer membrane efflux protein  26.65 
 
 		 432 aa  90.1  8e-17  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0693511 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2254  Outer membrane efflux protein  26.25 
 
 		 436 aa  89.4  1e-16  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1528  Outer membrane efflux protein  27.45 
 
 		 501 aa  89.4  1e-16  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2148  outer membrane efflux protein  32.88 
 
 		 400 aa  89.4  1e-16  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1614  outer membrane efflux protein  22.55 
 
 		 409 aa  88.6  2e-16  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3870  Co/Zn/Cd efflux system component  26.49 
 
 		 448 aa  88.6  2e-16  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_08520  Outer membrane efflux protein  30.68 
 
 		 424 aa  87.8  4e-16  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.504267  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1330  metal ion efflux outer membrane protein family protein, putative  25.56 
 
 		 493 aa  87  7e-16  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2262  outer membrane heavy metal efflux protein  26.26 
 
 		 426 aa  85.9  0.000000000000001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>