More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rmar_0516 on replicon NC_013501
Organism: Rhodothermus marinus DSM 4252



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013501  Rmar_0516  outer membrane efflux protein  100 
 
 		 413 aa  805    Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1714  outer membrane efflux protein  28.07 
 
 		 443 aa  118  1.9999999999999998e-25  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.664423 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2433  outer membrane efflux protein  27.29 
 
 		 440 aa  115  1.0000000000000001e-24  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3845  outer membrane efflux protein  27.09 
 
 		 437 aa  110  4.0000000000000004e-23  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3677  outer membrane efflux protein  27.09 
 
 		 439 aa  108  1e-22  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.621392  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4686  outer membrane efflux protein  27.09 
 
 		 439 aa  108  1e-22  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.432562  n/a   
 
 
-
 
NC_010070  Bmul_6170  outer membrane efflux protein  28.14 
 
 		 435 aa  108  2e-22  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.446847 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2373  HelC protein  25.13 
 
 		 414 aa  105  2e-21  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0045  CzcC family cobalt/zinc/cadmium efflux transporter outer membrane protein  25.77 
 
 		 423 aa  104  3e-21  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000529043 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0062  outer membrane efflux protein  25.77 
 
 		 423 aa  104  3e-21  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000405972 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0059  outer membrane efflux protein  25.77 
 
 		 423 aa  104  3e-21  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.56854 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0059  outer membrane efflux protein  25.77 
 
 		 394 aa  104  4e-21  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00860018 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0705  RND heavy metal ion efflux pump, outer membrane protein  26.11 
 
 		 458 aa  103  7e-21  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.199067  normal  0.26582 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1373  heavy metal resistance protein CzcC  25.13 
 
 		 443 aa  98.2  3e-19  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2553  outer membrane efflux protein  26.02 
 
 		 421 aa  94  4e-18  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1175  outer membrane efflux protein  27.75 
 
 		 416 aa  94  5e-18  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1031  heavy metal resistance protein CzcC  25.6 
 
 		 443 aa  92  1e-17  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.147927  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1527  cobalt-zinc-cadmium resistance protein CzcC  25.6 
 
 		 452 aa  92  2e-17  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0013  heavy metal resistance protein CzcC  25.6 
 
 		 461 aa  92  2e-17  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.238799  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1442  cobalt-zinc-cadmium resistance efflux protein  25.6 
 
 		 461 aa  92  2e-17  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0705718  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1183  heavy metal resistance protein CzcC  25.6 
 
 		 461 aa  92  2e-17  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.84848  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4765  outer membrane efflux protein  28.49 
 
 		 485 aa  91.7  2e-17  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.55701 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0399  heavy metal resistance protein CzcC  25.6 
 
 		 461 aa  92  2e-17  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.132876  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0033  heavy metal resistance protein CzcC  25.6 
 
 		 443 aa  90.5  4e-17  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.299983  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0377  metal ion efflux outer membrane protein, putative  27.34 
 
 		 408 aa  89.4  1e-16  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_31970  CzcC family cobalt/zinc/cadmium efflux transporter outer membrane protein  26.02 
 
 		 428 aa  89.4  1e-16  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2106  Outer membrane efflux protein  26.16 
 
 		 471 aa  89  2e-16  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.343125  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1847  outer membrane efflux protein  25.19 
 
 		 451 aa  87.8  3e-16  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.179966  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3623  Outer membrane efflux protein  24.44 
 
 		 415 aa  87  5e-16  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1044  HelC protein  25.56 
 
 		 416 aa  87  6e-16  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1420  Outer membrane efflux protein  24.94 
 
 		 472 aa  87  6e-16  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4801  Outer membrane efflux protein  26.67 
 
 		 408 aa  84.3  0.000000000000003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00249818 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0538  outer membrane efflux protein  26.54 
 
 		 432 aa  84  0.000000000000005  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.355565  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS00407  putative outer membrane cation efflux system protein  27.06 
 
 		 451 aa  83.2  0.000000000000007  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  decreased coverage  0.00236087  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2715  outer membrane protein precursor CzcC  26.21 
 
 		 428 aa  83.2  0.000000000000008  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.727923  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3970  Outer membrane efflux protein  25.62 
 
 		 426 aa  82.8  0.000000000000009  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.214282  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0617  outer membrane efflux protein  24.25 
 
 		 438 aa  82.4  0.00000000000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2110  outer membrane efflux protein  21.69 
 
 		 437 aa  80.1  0.00000000000007  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.313002  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2504  outer membrane efflux protein  28.99 
 
 		 436 aa  78.6  0.0000000000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.10477  normal  0.0160345 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3362  outer membrane efflux protein  26.32 
 
 		 431 aa  79  0.0000000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2042  outer membrane efflux protein  27.09 
 
 		 417 aa  78.2  0.0000000000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.367282  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3557  outer membrane efflux protein  28.11 
 
 		 442 aa  77  0.0000000000006  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0502  outer membrane efflux protein  23.9 
 
 		 433 aa  77  0.0000000000006  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1537  Outer membrane efflux protein  23.84 
 
 		 445 aa  76.6  0.0000000000007  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1617  outer membrane efflux protein  23.99 
 
 		 467 aa  76.6  0.0000000000007  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2628  Outer membrane efflux protein  26.13 
 
 		 432 aa  75.9  0.000000000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.753633 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4120  heavy metal cation tricomponent efflux outer membrane porin HmyC  24.45 
 
 		 460 aa  75.1  0.000000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3981  outer membrane efflux protein  25.68 
 
 		 423 aa  74.7  0.000000000003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.161912  normal  0.377505 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1329  cobalt-zinc-cadmium outer membrane resistance protein  27.79 
 
 		 425 aa  74.7  0.000000000003  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7183  putative outer membrane protein precursor CzcC  24.05 
 
 		 422 aa  74.7  0.000000000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3409  outer membrane efflux protein  25.78 
 
 		 419 aa  73.9  0.000000000005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000000155286  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4235  TolC family type I secretion outer membrane protein  25.42 
 
 		 463 aa  73.6  0.000000000006  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.902691  normal  0.529157 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0224  outer membrane efflux protein  24.14 
 
 		 419 aa  73.6  0.000000000006  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.000720591  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2408  cobalt-zinc-cadmium resistance protein CzcC, putative  26.33 
 
 		 425 aa  73.2  0.000000000007  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  decreased coverage  0.00195815  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1177  outer membrane efflux protein  25.45 
 
 		 427 aa  73.6  0.000000000007  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3287  outer membrane efflux protein  26.48 
 
 		 464 aa  72.4  0.00000000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.7008 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1990  outer membrane efflux protein  23.61 
 
 		 471 aa  72.4  0.00000000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.154832  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2137  metal ion efflux outer membrane protein family protein, putative  23.54 
 
 		 437 aa  71.6  0.00000000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3997  outer membrane efflux protein  23.15 
 
 		 427 aa  72  0.00000000002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1641  Outer membrane efflux protein  20.96 
 
 		 479 aa  71.2  0.00000000003  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1111  Outer membrane efflux protein  26.22 
 
 		 492 aa  69.7  0.0000000001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.33067  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0831  outer membrane efflux protein  25.93 
 
 		 419 aa  69.3  0.0000000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3802  Outer membrane efflux protein  24.07 
 
 		 465 aa  68.2  0.0000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0733  outer membrane efflux protein, putative  21.27 
 
 		 463 aa  68.9  0.0000000002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2013  type I secretion outer membrane protein, TolC family  23.11 
 
 		 472 aa  68.2  0.0000000003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.226354  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2683  heavy metal efflux pump, CzcA family  20.62 
 
 		 1458 aa  67.8  0.0000000004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.858123  normal  0.311516 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2209  outer membrane efflux protein  25.19 
 
 		 433 aa  67  0.0000000006  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.798472  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1582  outer membrane efflux protein  26.69 
 
 		 523 aa  66.6  0.0000000008  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2568  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT  23.75 
 
 		 482 aa  66.6  0.0000000009  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.0985785 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3398  metal ion efflux outer membrane protein family protein, putative  26.04 
 
 		 434 aa  65.9  0.000000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0162  outer membrane efflux protein  24.83 
 
 		 433 aa  66.2  0.000000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2262  Type I secretion outer membrane protein, TolC  25.6 
 
 		 497 aa  66.2  0.000000001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0148702  normal  0.873765 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11693  cation efflux system protein, AcrB/AcrD/AcrF family protein  24.37 
 
 		 1481 aa  65.1  0.000000002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2424  outer membrane efflux protein  26.86 
 
 		 814 aa  65.5  0.000000002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.700417  decreased coverage  0.000000025063 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1214  type I secretion outer membrane protein, TolC family  25 
 
 		 450 aa  65.5  0.000000002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.227292  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1695  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT family  23.62 
 
 		 512 aa  65.1  0.000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2568  outer membrane efflux protein  25.19 
 
 		 438 aa  65.5  0.000000002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.316597 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1089  outer membrane efflux protein  29.56 
 
 		 444 aa  65.1  0.000000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001579  agglutination protein  21.78 
 
 		 437 aa  65.1  0.000000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.582339  n/a   
 
 
-
 
NC_008607  Ppro_3710  outer membrane efflux protein  27.08 
 
 		 419 aa  65.5  0.000000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2127  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT family  23.62 
 
 		 513 aa  64.7  0.000000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RSp0491  cobalt-zinc-cadmium outer membrane resistance protein  25.13 
 
 		 441 aa  64.7  0.000000003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1804  TolC family type I secretion outer membrane protein  24.36 
 
 		 451 aa  64.7  0.000000003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.894432  normal  0.601876 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_4004  acriflavin resistance protein  25.78 
 
 		 1470 aa  64.7  0.000000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3378  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT family  25.95 
 
 		 470 aa  63.9  0.000000004  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.469197 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1907  Type I secretion outer membrane protein, TolC  23.04 
 
 		 472 aa  64.3  0.000000004  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2254  Outer membrane efflux protein  26.57 
 
 		 436 aa  63.9  0.000000005  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0833  outer membrane efflux protein  26.06 
 
 		 496 aa  63.9  0.000000005  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1958  aconitate hydratase 1  25.51 
 
 		 422 aa  63.9  0.000000005  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0713794  normal  0.321859 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1848  outer membrane efflux protein  23.1 
 
 		 423 aa  63.9  0.000000005  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2243  TolC family type I secretion outer membrane protein  23.57 
 
 		 455 aa  63.5  0.000000006  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1582  outer membrane efflux protein  28.8 
 
 		 418 aa  63.5  0.000000007  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0904474  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3177  heavy metal efflux pump, CzcA family  26.49 
 
 		 1462 aa  63.2  0.000000007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.452268  normal  1 
 
 
-
 
NC_008573  Shewana3_4386  outer membrane efflux protein  22.97 
 
 		 427 aa  63.2  0.000000009  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.438421 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0474  TolC family type I secretion outer membrane protein  22.36 
 
 		 470 aa  63.2  0.000000009  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0171025  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4596  heavy metal cation tricomponent efflux outer membrane porin  24.73 
 
 		 431 aa  63.2  0.000000009  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0688687  hitchhiker  0.005842 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0828  metal ion efflux outer membrane protein family protein, putative  24.75 
 
 		 428 aa  62.4  0.00000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.885444  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1764  outer membrane efflux protein  23.77 
 
 		 418 aa  63.2  0.00000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.715826  normal  0.306921 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3558  Type I secretion outer membrane protein, TolC  23.53 
 
 		 472 aa  62.8  0.00000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.445028  normal  0.560368 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3931  multidrug efflux system outer membrane subunit  25 
 
 		 507 aa  62.4  0.00000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.436202 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>