245 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RSp0491 on replicon NC_003296
Organism: Ralstonia solanacearum GMI1000



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_003296  RSp0491  cobalt-zinc-cadmium outer membrane resistance protein  100 
 
 		 441 aa  835    Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007971  Rmet_5982  cation proton antiporter efflux protein CzcC  47.82 
 
 		 418 aa  331  1e-89  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00000196082  normal  0.0745476 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1764  outer membrane efflux protein  47.82 
 
 		 418 aa  331  2e-89  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.715826  normal  0.306921 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1329  cobalt-zinc-cadmium outer membrane resistance protein  54.01 
 
 		 425 aa  315  9e-85  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3970  Outer membrane efflux protein  47.48 
 
 		 426 aa  305  1.0000000000000001e-81  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.214282  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1847  outer membrane efflux protein  47.66 
 
 		 451 aa  302  8.000000000000001e-81  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.179966  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4596  heavy metal cation tricomponent efflux outer membrane porin  48.8 
 
 		 431 aa  292  9e-78  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0688687  hitchhiker  0.005842 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2553  outer membrane efflux protein  45.93 
 
 		 421 aa  290  3e-77  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2568  outer membrane efflux protein  45.48 
 
 		 438 aa  283  4.0000000000000003e-75  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.316597 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1714  outer membrane efflux protein  42.86 
 
 		 443 aa  265  2e-69  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.664423 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3557  outer membrane efflux protein  45.07 
 
 		 442 aa  253  7e-66  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2209  outer membrane efflux protein  43.05 
 
 		 433 aa  250  3e-65  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.798472  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2433  outer membrane efflux protein  44.87 
 
 		 440 aa  248  2e-64  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1089  outer membrane efflux protein  44.75 
 
 		 444 aa  246  6.999999999999999e-64  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3623  Outer membrane efflux protein  39.9 
 
 		 415 aa  237  3e-61  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3677  outer membrane efflux protein  44.36 
 
 		 439 aa  236  8e-61  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.621392  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4686  outer membrane efflux protein  44.36 
 
 		 439 aa  236  8e-61  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.432562  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2106  Outer membrane efflux protein  36.98 
 
 		 471 aa  235  1.0000000000000001e-60  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.343125  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3845  outer membrane efflux protein  44.12 
 
 		 437 aa  233  4.0000000000000004e-60  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010070  Bmul_6170  outer membrane efflux protein  44.62 
 
 		 435 aa  232  1e-59  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.446847 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1420  Outer membrane efflux protein  37.53 
 
 		 472 aa  230  4e-59  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0705  RND heavy metal ion efflux pump, outer membrane protein  42.65 
 
 		 458 aa  228  2e-58  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.199067  normal  0.26582 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2715  outer membrane protein precursor CzcC  40.51 
 
 		 428 aa  226  5.0000000000000005e-58  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.727923  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_31970  CzcC family cobalt/zinc/cadmium efflux transporter outer membrane protein  39.51 
 
 		 428 aa  223  4e-57  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1031  heavy metal resistance protein CzcC  43.87 
 
 		 443 aa  223  6e-57  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.147927  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1527  cobalt-zinc-cadmium resistance protein CzcC  43.87 
 
 		 452 aa  223  7e-57  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0013  heavy metal resistance protein CzcC  43.87 
 
 		 461 aa  222  8e-57  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.238799  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0399  heavy metal resistance protein CzcC  43.87 
 
 		 461 aa  222  8e-57  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.132876  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0033  heavy metal resistance protein CzcC  43.87 
 
 		 443 aa  223  8e-57  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.299983  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1442  cobalt-zinc-cadmium resistance efflux protein  43.87 
 
 		 461 aa  222  8e-57  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0705718  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1183  heavy metal resistance protein CzcC  43.87 
 
 		 461 aa  222  8e-57  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.84848  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4801  Outer membrane efflux protein  39.65 
 
 		 408 aa  221  3e-56  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00249818 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1373  heavy metal resistance protein CzcC  42.13 
 
 		 443 aa  221  3e-56  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0045  CzcC family cobalt/zinc/cadmium efflux transporter outer membrane protein  37.47 
 
 		 423 aa  214  2.9999999999999995e-54  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000529043 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0059  outer membrane efflux protein  37.47 
 
 		 423 aa  214  2.9999999999999995e-54  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.56854 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0062  outer membrane efflux protein  37.47 
 
 		 423 aa  214  2.9999999999999995e-54  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000405972 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0059  outer membrane efflux protein  37.47 
 
 		 394 aa  213  4.9999999999999996e-54  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00860018 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2504  outer membrane efflux protein  43.47 
 
 		 436 aa  211  2e-53  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.10477  normal  0.0160345 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0377  metal ion efflux outer membrane protein, putative  40.15 
 
 		 408 aa  206  7e-52  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1175  outer membrane efflux protein  37.18 
 
 		 416 aa  204  2e-51  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3287  outer membrane efflux protein  40.97 
 
 		 464 aa  187  3e-46  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.7008 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2408  cobalt-zinc-cadmium resistance protein CzcC, putative  41.81 
 
 		 425 aa  186  5e-46  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  decreased coverage  0.00195815  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2042  outer membrane efflux protein  40.97 
 
 		 417 aa  184  2.0000000000000003e-45  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.367282  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3343  outer membrane efflux protein  30.54 
 
 		 423 aa  117  5e-25  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.141208 
 
 
-
 
NC_007960  Nham_4530  outer membrane efflux protein  31.27 
 
 		 425 aa  117  5e-25  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0617  outer membrane efflux protein  31.36 
 
 		 438 aa  116  8.999999999999998e-25  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2567  outer membrane efflux protein  33.49 
 
 		 433 aa  115  1.0000000000000001e-24  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7183  putative outer membrane protein precursor CzcC  30 
 
 		 422 aa  112  1.0000000000000001e-23  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3997  outer membrane efflux protein  26.18 
 
 		 427 aa  111  3e-23  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1848  outer membrane efflux protein  29 
 
 		 423 aa  111  3e-23  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7266  putative outer membrane cobalt-zinc-cadmium resistance protein czcC precursor  27.83 
 
 		 424 aa  110  6e-23  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.217099  normal  0.831215 
 
 
-
 
NC_008573  Shewana3_4386  outer membrane efflux protein  26.42 
 
 		 427 aa  108  1e-22  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.438421 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3648  outer membrane efflux protein  28.64 
 
 		 424 aa  109  1e-22  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.856557 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3371  outer membrane efflux protein  29.7 
 
 		 407 aa  106  6e-22  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.252246  normal  0.409086 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2344  outer membrane efflux protein  29.19 
 
 		 423 aa  106  9e-22  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2284  outer membrane efflux protein  31.75 
 
 		 420 aa  105  1e-21  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.185931  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2339  outer membrane efflux protein  28.61 
 
 		 437 aa  103  4e-21  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.884796  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3870  Co/Zn/Cd efflux system component  26.77 
 
 		 448 aa  100  4e-20  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2142  outer membrane efflux protein  27.65 
 
 		 423 aa  100  5e-20  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.143725 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0665  outer membrane efflux protein  24.94 
 
 		 453 aa  100  6e-20  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000306808  hitchhiker  0.00231848 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3981  outer membrane efflux protein  30.52 
 
 		 423 aa  100  7e-20  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.161912  normal  0.377505 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2298  outer membrane efflux protein  27.16 
 
 		 423 aa  99.4  1e-19  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1455  Outer membrane efflux protein  29.9 
 
 		 423 aa  97.1  6e-19  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.170729  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2447  outer membrane efflux protein  32.53 
 
 		 423 aa  94.4  4e-18  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02027  putative RND efflux system protein  25.71 
 
 		 413 aa  93.6  7e-18  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00372  putative RND efflux system protein  26.13 
 
 		 426 aa  92.8  1e-17  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1957  putative RND efflux system protein  27.76 
 
 		 444 aa  89.4  1e-16  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_31040  putative cation efflux system protein  28.25 
 
 		 415 aa  88.6  2e-16  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000919684  unclonable  5.14474e-22 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2321  outer membrane efflux protein  29 
 
 		 428 aa  87.8  4e-16  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.760032  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2609  outer membrane efflux protein  34.33 
 
 		 425 aa  86.7  7e-16  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.153251  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3802  Outer membrane efflux protein  27.87 
 
 		 465 aa  84.7  0.000000000000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0502  outer membrane efflux protein  26.7 
 
 		 433 aa  84.7  0.000000000000003  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0017  outer membrane efflux protein  26.32 
 
 		 473 aa  84  0.000000000000005  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS00407  putative outer membrane cation efflux system protein  29.23 
 
 		 451 aa  82  0.00000000000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  decreased coverage  0.00236087  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1641  Outer membrane efflux protein  28.7 
 
 		 479 aa  79.3  0.0000000000001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0385  outer membrane efflux protein  26.4 
 
 		 474 aa  79  0.0000000000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008573  Shewana3_4156  outer membrane efflux protein  26.22 
 
 		 446 aa  76.6  0.0000000000007  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.283296 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1811  outer membrane efflux protein  27.74 
 
 		 440 aa  75.9  0.000000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2097  Outer membrane efflux protein  23.5 
 
 		 435 aa  75.5  0.000000000002  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.771655  n/a   
 
 
-
 
NC_007972  Rmet_6208  outer membrane efflux protein  29.65 
 
 		 418 aa  73.9  0.000000000005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0682247 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2353  chemiosmotic efflux system C protein C  26.04 
 
 		 437 aa  72.8  0.00000000001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3362  outer membrane efflux protein  22.82 
 
 		 431 aa  72.8  0.00000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0516  outer membrane efflux protein  24.87 
 
 		 413 aa  72  0.00000000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2577  outer membrane efflux protein  32.04 
 
 		 435 aa  71.2  0.00000000003  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.996623 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2294  outer membrane efflux protein  33.51 
 
 		 409 aa  70.9  0.00000000005  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5400  outer membrane efflux protein  31.52 
 
 		 355 aa  70.5  0.00000000006  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0772872  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3501  Outer membrane efflux protein  26.59 
 
 		 489 aa  70.5  0.00000000006  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2148  outer membrane efflux protein  31.7 
 
 		 400 aa  70.1  0.00000000007  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1582  outer membrane efflux protein  24.15 
 
 		 523 aa  69.7  0.0000000001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2029  outer membrane efflux protein  26.88 
 
 		 422 aa  69.7  0.0000000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.769975  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3507  Outer membrane efflux protein  24.82 
 
 		 435 aa  68.9  0.0000000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0294  Outer membrane efflux protein  26.8 
 
 		 420 aa  68.2  0.0000000003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.757224 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2628  Outer membrane efflux protein  27.52 
 
 		 432 aa  67.8  0.0000000003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.753633 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0828  metal ion efflux outer membrane protein family protein, putative  25.54 
 
 		 428 aa  67.4  0.0000000005  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.885444  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2110  outer membrane efflux protein  23.39 
 
 		 437 aa  67  0.0000000006  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.313002  n/a   
 
 
-
 
NC_013731  Slin_6771  heavy metal efflux pump, CzcA family  27.67 
 
 		 1469 aa  66.6  0.0000000008  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1176  Outer membrane efflux protein  27.27 
 
 		 429 aa  66.6  0.0000000008  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2065  chemiosmotic efflux system protein C-like protein  25.19 
 
 		 441 aa  65.9  0.000000001  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2254  Outer membrane efflux protein  27.14 
 
 		 436 aa  66.2  0.000000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1330  metal ion efflux outer membrane protein family protein, putative  25.98 
 
 		 493 aa  65.5  0.000000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>