152 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daci_0017 on replicon NC_010002
Organism: Delftia acidovorans SPH-1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010002  Daci_0017  outer membrane efflux protein  100 
 
 		 473 aa  942    Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1768  outer membrane heavy metal efflux protein, putative  30.63 
 
 		 434 aa  130  5.0000000000000004e-29  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.481614  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3623  Outer membrane efflux protein  25.77 
 
 		 415 aa  107  7e-22  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0045  CzcC family cobalt/zinc/cadmium efflux transporter outer membrane protein  27.25 
 
 		 423 aa  103  6e-21  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000529043 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0059  outer membrane efflux protein  27.25 
 
 		 423 aa  103  6e-21  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.56854 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0062  outer membrane efflux protein  27.25 
 
 		 423 aa  103  6e-21  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000405972 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0059  outer membrane efflux protein  27.5 
 
 		 394 aa  100  6e-20  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00860018 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_31970  CzcC family cobalt/zinc/cadmium efflux transporter outer membrane protein  30.07 
 
 		 428 aa  99.4  1e-19  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1175  outer membrane efflux protein  23.87 
 
 		 416 aa  94.7  3e-18  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2110  outer membrane efflux protein  26.06 
 
 		 437 aa  92.8  1e-17  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.313002  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2715  outer membrane protein precursor CzcC  30.05 
 
 		 428 aa  92.4  1e-17  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.727923  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3362  outer membrane efflux protein  24.75 
 
 		 431 aa  88.6  2e-16  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4801  Outer membrane efflux protein  25.97 
 
 		 408 aa  87.8  4e-16  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00249818 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1641  Outer membrane efflux protein  23.32 
 
 		 479 aa  85.1  0.000000000000003  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3970  Outer membrane efflux protein  25.54 
 
 		 426 aa  84.7  0.000000000000004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.214282  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1847  outer membrane efflux protein  25.51 
 
 		 451 aa  82.8  0.00000000000001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.179966  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0377  metal ion efflux outer membrane protein, putative  25.31 
 
 		 408 aa  81.3  0.00000000000003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0705  RND heavy metal ion efflux pump, outer membrane protein  24.24 
 
 		 458 aa  80.9  0.00000000000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.199067  normal  0.26582 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2433  outer membrane efflux protein  26.65 
 
 		 440 aa  80.1  0.00000000000008  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1714  outer membrane efflux protein  25.93 
 
 		 443 aa  79.3  0.0000000000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.664423 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3802  Outer membrane efflux protein  25.91 
 
 		 465 aa  78.6  0.0000000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1373  heavy metal resistance protein CzcC  28.06 
 
 		 443 aa  78.6  0.0000000000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1089  outer membrane efflux protein  27.36 
 
 		 444 aa  79  0.0000000000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007971  Rmet_5982  cation proton antiporter efflux protein CzcC  25.14 
 
 		 418 aa  77.4  0.0000000000005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00000196082  normal  0.0745476 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6071  outer membrane efflux protein  25.91 
 
 		 486 aa  75.1  0.000000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.362565  normal  0.0749065 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4686  outer membrane efflux protein  27.01 
 
 		 439 aa  75.5  0.000000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.432562  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3677  outer membrane efflux protein  27.01 
 
 		 439 aa  75.5  0.000000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.621392  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3845  outer membrane efflux protein  27.01 
 
 		 437 aa  75.5  0.000000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3287  outer membrane efflux protein  26.4 
 
 		 464 aa  75.9  0.000000000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.7008 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1031  heavy metal resistance protein CzcC  26.59 
 
 		 443 aa  74.7  0.000000000003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.147927  n/a   
 
 
-
 
NC_010070  Bmul_6170  outer membrane efflux protein  26.04 
 
 		 435 aa  74.7  0.000000000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.446847 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2042  outer membrane efflux protein  26.55 
 
 		 417 aa  74.7  0.000000000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.367282  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4596  heavy metal cation tricomponent efflux outer membrane porin  23.94 
 
 		 431 aa  75.1  0.000000000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0688687  hitchhiker  0.005842 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0013  heavy metal resistance protein CzcC  26.59 
 
 		 461 aa  74.7  0.000000000003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.238799  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2344  outer membrane efflux protein  25.92 
 
 		 423 aa  74.7  0.000000000003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0399  heavy metal resistance protein CzcC  26.59 
 
 		 461 aa  74.7  0.000000000003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.132876  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1442  cobalt-zinc-cadmium resistance efflux protein  26.59 
 
 		 461 aa  74.7  0.000000000003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0705718  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1183  heavy metal resistance protein CzcC  26.59 
 
 		 461 aa  74.7  0.000000000003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.84848  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1764  outer membrane efflux protein  24.86 
 
 		 418 aa  74.7  0.000000000003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.715826  normal  0.306921 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1527  cobalt-zinc-cadmium resistance protein CzcC  26.59 
 
 		 452 aa  74.7  0.000000000004  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2553  outer membrane efflux protein  23.42 
 
 		 421 aa  73.2  0.000000000009  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2408  cobalt-zinc-cadmium resistance protein CzcC, putative  26.4 
 
 		 425 aa  73.2  0.00000000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  decreased coverage  0.00195815  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0033  heavy metal resistance protein CzcC  26.28 
 
 		 443 aa  72.8  0.00000000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.299983  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3557  outer membrane efflux protein  24.94 
 
 		 442 aa  72.8  0.00000000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1329  cobalt-zinc-cadmium outer membrane resistance protein  25.68 
 
 		 425 aa  71.2  0.00000000004  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2628  Outer membrane efflux protein  23.5 
 
 		 432 aa  70.5  0.00000000006  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.753633 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4120  heavy metal cation tricomponent efflux outer membrane porin HmyC  25.88 
 
 		 460 aa  70.5  0.00000000006  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3343  outer membrane efflux protein  24.93 
 
 		 423 aa  70.5  0.00000000007  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.141208 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4765  outer membrane efflux protein  26.29 
 
 		 485 aa  70.5  0.00000000007  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.55701 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2142  outer membrane efflux protein  24.87 
 
 		 423 aa  70.1  0.00000000008  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.143725 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2284  outer membrane efflux protein  29.62 
 
 		 420 aa  70.1  0.00000000009  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.185931  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RSp0491  cobalt-zinc-cadmium outer membrane resistance protein  23.18 
 
 		 441 aa  69.3  0.0000000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7183  putative outer membrane protein precursor CzcC  24.55 
 
 		 422 aa  69.3  0.0000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2298  outer membrane efflux protein  24.93 
 
 		 423 aa  68.9  0.0000000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2568  outer membrane efflux protein  25.14 
 
 		 438 aa  68.6  0.0000000002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.316597 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7266  putative outer membrane cobalt-zinc-cadmium resistance protein czcC precursor  26.03 
 
 		 424 aa  68.9  0.0000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.217099  normal  0.831215 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1848  outer membrane efflux protein  25.71 
 
 		 423 aa  67.8  0.0000000004  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0294  Outer membrane efflux protein  25 
 
 		 420 aa  67.4  0.0000000005  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.757224 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2295  putative outer membrane efflux protein involved in copper resistance  24.94 
 
 		 476 aa  67  0.0000000008  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.332291  normal  0.176348 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0617  outer membrane efflux protein  27.36 
 
 		 438 aa  66.2  0.000000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1455  Outer membrane efflux protein  25.33 
 
 		 423 aa  64.7  0.000000003  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.170729  normal  1 
 
 
-
 
NC_007960  Nham_4530  outer membrane efflux protein  26.09 
 
 		 425 aa  64.3  0.000000004  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0502  outer membrane efflux protein  24.86 
 
 		 433 aa  63.9  0.000000005  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS00407  putative outer membrane cation efflux system protein  25.62 
 
 		 451 aa  63.2  0.00000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  decreased coverage  0.00236087  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2209  outer membrane efflux protein  23.66 
 
 		 433 aa  62.8  0.00000001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.798472  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3648  outer membrane efflux protein  24.49 
 
 		 424 aa  62.8  0.00000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.856557 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0150  Outer membrane efflux protein  27.9 
 
 		 415 aa  61.2  0.00000004  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.921658  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1343  outer membrane efflux protein  21.66 
 
 		 429 aa  61.2  0.00000004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1541  Outer membrane efflux protein  28.42 
 
 		 486 aa  60.5  0.00000007  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7201  outer membrane efflux protein  23.58 
 
 		 418 aa  60.5  0.00000007  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2254  Outer membrane efflux protein  23.68 
 
 		 436 aa  58.5  0.0000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1111  Outer membrane efflux protein  24.41 
 
 		 492 aa  58.9  0.0000002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.33067  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2166  outer membrane efflux protein  21.47 
 
 		 423 aa  57.8  0.0000004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1939  outer membrane efflux protein  23.85 
 
 		 432 aa  57.8  0.0000004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6027  nodulation protein T precursor  24.67 
 
 		 483 aa  57.4  0.0000005  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0087  outer membrane efflux protein  21.28 
 
 		 424 aa  57.4  0.0000005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3447  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT family  26.21 
 
 		 477 aa  57.4  0.0000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.689762 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3371  outer membrane efflux protein  25.63 
 
 		 407 aa  57.4  0.0000005  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.252246  normal  0.409086 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3157  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT family  25.32 
 
 		 480 aa  57.4  0.0000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2276  outer membrane efflux protein  24.08 
 
 		 432 aa  56.2  0.000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0693511 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1420  Outer membrane efflux protein  23.12 
 
 		 472 aa  56.6  0.000001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4485  outer membrane efflux protein  19.15 
 
 		 417 aa  56.2  0.000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3398  metal ion efflux outer membrane protein family protein, putative  25.51 
 
 		 434 aa  55.8  0.000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3501  Outer membrane efflux protein  24 
 
 		 489 aa  55.5  0.000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2056  outer membrane efflux protein  21.88 
 
 		 423 aa  55.5  0.000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000000544389 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2137  metal ion efflux outer membrane protein family protein, putative  21.18 
 
 		 437 aa  54.3  0.000004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2577  outer membrane efflux protein  27.18 
 
 		 435 aa  54.7  0.000004  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.996623 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2843  outer membrane efflux protein  25.82 
 
 		 489 aa  54.3  0.000004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3981  outer membrane efflux protein  25.75 
 
 		 423 aa  54.7  0.000004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.161912  normal  0.377505 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05030  outer membrane efflux protein  21.11 
 
 		 471 aa  53.5  0.000008  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.691581  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0580  putative outer membrane transport protein  24.94 
 
 		 451 aa  53.5  0.000009  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2551  outer membrane efflux protein  25.67 
 
 		 422 aa  52.8  0.00001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.000963739  normal  0.205494 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1727  type I secretion outer membrane protein, TolC family  24.62 
 
 		 452 aa  53.1  0.00001  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.000000826676  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2950  TolC family type I secretion outer membrane protein  24.71 
 
 		 479 aa  53.1  0.00001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2041  outer membrane efflux protein  23.89 
 
 		 501 aa  53.1  0.00001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.628466  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2765  outer membrane efflux protein  24.38 
 
 		 498 aa  52.4  0.00002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3956  outer membrane efflux protein  30.9 
 
 		 417 aa  52.4  0.00002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010070  Bmul_6292  outer membrane efflux protein  22.68 
 
 		 498 aa  51.6  0.00003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.260908 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0447  outer membrane efflux protein  23.56 
 
 		 438 aa  51.2  0.00004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.109934 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0713  outer membrane efflux protein  23.13 
 
 		 554 aa  51.2  0.00004  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>